Protein Common Interface Database

Domain Clusters with M>=20,SeqId<90 and diff Pfam relation

Pfam Architecture	Cluster#	#CFs/Cluster	#Entries/Cluster	#CFs/Group	#Entries/Group	Minimum Seq Identity	Surface Area	In PDBBA(%)	In PISABA(%)	CFs Cluster/Group(%)
(FKBP_C);(RYDR_ITPR)	1	58	60	58	60	75	322	100	0	100
(FKBP_C);(SPRY)	1	57	59	58	60	73	267	100	0	98
(FRB_dom);(PI3_PI4_kinase)	1	22	27	23	29	15	242	100	56	96
(FXa_inhibition);(Trypsin)	1	47	269	48	278	22	422	96	99	98
(F_actin_cap_B);(F-actin_cap_A)	1	24	26	26	30	36	3095	100	73	92
(Fapy_DNA_glyco);(H2TH)	1	22	114	22	117	11	545	99	99	100
(Fcf1);(Ribosomal_S4)	1	25	25	27	27	63	298	100	4	93
(Fcf1);(Ribosomal_S8)	1	29	29	31	31	63	236	100	3	94
(Fe_dep_repr_C);(Fe_dep_repress)	1	27	64	27	64	14	625	100	97	100
(Fer2);(Fer2_2)	1	20	79	19	79	24	729	100	100	105
(Fer2_4);(NADH_4Fe-4S)	1	84	90	87	95	24	282	98	33	97
(Fer4_7);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	80	88	85	93	21	165	100	33	94
(Fer4_7);(Oxidored_q6)	1	96	102	98	106	25	378	100	27	98
(Fer4_7);(PSI_PsaE)	1	39	44	39	44	52	511	100	25	100
(Fer4_7);(PsaA_PsaB)	1	38	43	40	45	45	243	100	37	95
(Fer4_7);(PsaD)	1	39	44	39	44	52	1036	100	36	100
(Fibrillarin);(NOP5NT)	1	34	34	34	34	28	343	100	6	100
(Fibrillarin);(Nop)	1	27	27	40	44	46	156	100	4	68
(Fibrillarin);(Nop)	2	23	23	40	44	45	123	96	4	57
(Fibrillarin);(Ribosomal_L7Ae)	1	32	32	38	41	41	333	100	3	84
(Filo_glycop);(TLV_coat)	1	32	52	32	52	29	444	88	69	100
(Filo_glycop);(TLV_coat)	2	32	52	32	52	29	1942	98	71	100
(Filo_glycop);(TLV_coat)	3	23	26	32	52	29	394	81	58	72
(PCI);(RPN7)	1	36	36	64	65	20	129	100	25	56
(HEAT_2);(MitMem_reg)	1	22	22	49	49	51	125	91	14	45
(Fimbrial);(FimH_man-bind)	1	35	76	40	82	20	1125	100	100	88
(Fimbrial);(PapD_C)	1	22	27	22	27	10	292	100	81	100
(Fimbrial);(PapD_N)	1	22	27	22	27	10	1348	100	81	100
(Flagellin_C);(Flagellin_N)	1	36	36	36	36	7	1820	100	50	100
(Flavi_NS2B);(Peptidase_S7)	1	28	55	29	58	23	1811	93	89	97
(Flavi_NS5);(FtsJ)	1	37	81	37	81	20	721	100	99	100
(Flavi_glycop_C);(Flavi_glycoprot)	1	88	94	129	140	14	696	100	47	68
(Flavi_glycop_C);(Flavi_glycoprot)	2	71	76	129	140	27	272	86	39	55
(Flavi_glycop_C);(Flavi_glycoprot)	3	37	38	129	140	29	505	87	3	29
(Flavi_glycop_C);(V-set)	1	20	21	73	79	17	382	100	38	27
(Flavi_glycoprot);(Flavi_M)	1	54	54	55	55	15	683	100	6	98
(Flavi_glycoprot);(Flavi_M)	2	31	31	55	55	15	391	100	0	56
(Flu_PA);(Flu_PB1)	1	68	78	68	78	24	7934	100	73	100
(Flu_PA);(Flu_PB2)	1	64	74	66	76	22	1563	100	74	97
(Flu_PB1);(Flu_PB2)	1	66	77	66	77	22	5757	100	74	100
(Fn3-like);(Glyco_hydro_3)	1	30	61	30	64	14	694	100	100	100
(Fn3-like);(Glyco_hydro_3_C)	1	29	58	30	64	14	555	100	100	97
(Formyl_trans_C);(Formyl_trans_N)	1	26	48	28	52	5	664	100	100	93
(Mt_ATP-synt_B);(Mt_ATP-synt_D)	1	43	43	43	43	18	1302	100	35	100
(Mt_ATP-synt_B);(OSCP)	1	22	22	35	35	86	446	100	18	63
(FtsZ_C);(Tubulin)	1	30	69	32	73	7	485	100	100	94
(FtsZ_C);(Tubulin)	2	20	57	32	73	10	420	2	14	62
(FumaraseC_C);(Lyase_1)	1	25	50	25	54	22	253	100	100	100
(FumaraseC_C);(Lyase_1)	2	23	45	25	54	27	247	98	100	92
(FumaraseC_C);(Lyase_1)	3	23	43	25	54	22	296	98	100	92
(Furin-like);(Recep_L_domain)	1	63	68	74	81	15	990	100	79	85
(G-alpha);(V-set)	1	92	95	159	162	30	836	100	6	58
(ATP-synt_C);(ATP-synt_Eps)	1	33	33	79	79	38	117	100	91	42
(G-alpha);(V-set)	2	65	65	159	162	39	253	100	6	41
(G-alpha);(WD40)	1	207	211	207	211	6	289	100	10	100
(G-gamma);(WD40)	1	232	256	232	256	11	346	100	23	100
(G-gamma);(WD40)	2	219	228	232	256	12	304	100	18	94
(G10);(PRO8NT)	1	34	34	35	35	53	1099	100	9	97
(G10);(PROCN)	1	29	29	34	34	53	222	76	7	85
(RAG1);(RAG2)	1	32	36	32	36	49	1560	100	22	100
(RNA_polI_A14);(SHS2_Rpb7-N)	1	36	40	36	40	2	723	100	72	100
(GAF);(PAS_2)	1	38	77	38	89	14	1881	100	97	100
(GAF);(PHY)	1	25	43	26	51	12	631	100	98	96
(GBP);(GBP_C)	1	22	28	22	28	9	1441	100	93	100
(GFO_IDH_MocA);(GFO_IDH_MocA_C)	1	71	92	71	116	2	1253	100	100	100
(JAB);(MitMem_reg)	1	78	81	85	88	13	247	99	35	92
(JAB);(PC_rep)	1	51	51	57	57	21	179	100	25	89
(JAB);(VWA_2)	1	57	57	57	57	48	614	100	26	100
(GF_recep_IV);(Recep_L_domain)	1	47	55	50	59	29	535	100	87	94
(GHMP_kinases_C);(GHMP_kinases_N)	1	37	71	42	81	5	142	100	97	88
(NusG);(RNA_pol_Rpb2_2)	1	35	35	37	37	18	258	100	6	95
(NusG);(RNA_pol_Rpb2_1)	1	21	21	37	37	18	200	100	10	57
(NusG);(RNA_pol_Rpb1_1)	1	36	36	38	38	18	575	100	6	95
(ATP-synt_A);(Mt_ATP-synt_D)	1	32	32	32	32	21	370	100	19	100
(MitMem_reg);(Rpn9_C)	1	29	29	33	33	33	1063	100	41	88
(IATP);(T3SS_ATPase_C)	1	24	26	24	27	20	430	100	27	100
(RNA_polI_A14);(RPA43_OB)	1	29	33	35	39	70	258	100	67	83
(Proteasome);(RPN6_N)	1	21	21	32	32	24	275	100	24	66
(eIF3m_C_helix);(MitMem_reg)	1	27	27	27	27	3	975	93	11	100
(NUC);(RuvC_1)	1	20	24	25	30	27	966	100	71	80
(ATP-synt_8);(Mt_ATP-synt_D)	1	22	22	25	25	56	280	100	23	88
(ATP-synt_A);(WRW)	1	25	25	25	25	80	470	100	24	100
(ATP-synt_8);(ATP-synt_A)	1	25	25	25	25	56	908	100	24	100
(Prot_ATP_ID_OB);(ZapB)	1	28	28	32	32	2	449	75	29	88
(HEAT_2);(ZapB)	1	23	23	23	23	2	296	100	26	100
(RPN1_RPN2_N);(ZapB)	1	22	22	23	23	2	382	100	27	96
(GMC_oxred_C);(GMC_oxred_N)	1	40	114	40	129	1	4051	100	99	100
(ATP-synt_A);(VBS)	1	27	27	27	27	51	945	100	89	100
(ATP-synt_E);(ATP-synt_G)	1	20	20	20	20	76	646	100	30	100
(ATP-synt_G);(WRW)	1	20	20	20	20	82	233	100	30	100
(ATP-synt_A);(Mit_proteolip)	1	20	20	20	20	80	288	100	30	100
(MitMem_reg);(PCI)	1	53	54	74	75	12	239	100	22	72
(MitMem_reg);(Rpn3_C)	1	40	40	59	59	27	635	100	15	68
(GP120);(GP41)	1	129	153	129	153	51	1203	99	33	100
(GP120);(V-set)	1	113	155	225	285	9	419	99	39	50
(GP120);(V-set)	2	27	39	225	285	17	537	95	44	12
(GP120);(V-set)	3	20	36	225	285	28	282	72	19	9
(JmjC);(JmjN)	1	24	457	25	462	23	682	100	100	96
(Spermine_synt_N);(Spermine_synth)	1	26	60	26	60	12	1006	100	100	100
(MitMem_reg);(RPN6_C_helix)	1	38	38	59	59	10	491	100	34	64
(MitMem_reg);(RPN5_C)	1	44	44	59	59	12	877	82	32	75
(JAB);(RPN5_C)	1	35	35	55	55	40	186	86	34	64
(AAA_lid_3);(Proteasome)	1	51	51	56	56	19	244	88	25	91
(AAA_lid_3);(Proteasome)	2	29	29	56	56	61	245	100	14	52
(GP120);(ig)	1	32	41	34	44	25	1032	95	32	94
(GP41);(V-set)	1	28	40	89	125	8	393	95	70	31
(GST_C);(GST_N)	1	84	101	89	115	5	251	89	92	94
(GST_C);(GST_N)	2	82	102	89	115	6	532	99	99	92
(GST_C);(GST_N_3)	1	26	57	26	58	6	741	100	100	100
(GST_C);(GST_N_3)	2	24	54	26	58	6	375	94	93	92
(GST_C_2);(GST_N)	1	22	44	23	45	5	521	100	100	96
(GST_C_2);(GST_N_3)	1	74	113	74	117	4	581	100	100	100
(GST_C_2);(GST_N_3)	2	37	51	74	117	5	289	88	84	50
(GST_C_3);(GST_N)	1	94	267	96	289	7	756	99	99	98
(GST_C_3);(GST_N)	2	91	264	96	289	7	243	96	95	95
(GTP_EFTU);(GTP_EFTU_D2)	1	96	146	138	232	2	599	100	92	70
(GTP_EFTU);(GTP_EFTU_D3)	1	31	53	60	103	18	573	100	100	52
(GTP_EFTU);(GTP_EFTU_D3)	2	23	35	60	103	4	603	100	89	38
(GTP_EFTU);(LSM)	1	33	33	43	43	14	207	100	15	77
(GTP_EFTU);(PROCN)	1	48	48	50	50	17	560	79	19	96
(GTP_EFTU);(Ribosomal_L6)	1	21	21	73	91	53	140	100	5	29
(GTP_EFTU_D2);(GTP_EFTU_D3)	1	58	92	62	103	2	447	100	93	94
(GTP_EFTU_D2);(Ribosom_S12_S23)	1	24	24	41	43	9	193	100	4	59
(GalKase_gal_bdg);(GHMP_kinases_C)	1	23	46	22	46	2	498	100	98	105
(GalKase_gal_bdg);(GHMP_kinases_N)	1	23	45	22	46	2	1170	100	98	105
(Gal_mutarotas_2);(Glyco_hydro_31)	1	40	126	40	127	9	2092	100	90	100
(Gln-synt_C);(Gln-synt_N)	1	21	45	21	45	11	1083	100	96	100
(ATP-synt);(IATP)	1	24	26	24	27	25	289	100	27	100
(ATP-synt_A);(Mt_ATP-synt_B)	1	40	40	42	42	20	609	100	32	95
(ATP-synt_DE);(ATP-synt_Eps)	1	21	30	21	31	2	427	100	87	100
(ATP-synt_DE_N);(ATP-synt_Eps)	1	96	107	102	113	21	362	100	73	94
(ATP-synt_ab_C);(IATP)	1	23	25	24	27	25	253	100	28	96
(Glyco_hydro_2);(Glyco_hydro_2_C)	1	72	167	72	168	6	822	100	92	100
(Glyco_hydro_2);(Glyco_hydro_2_N)	1	77	168	80	191	6	219	100	93	96
(Glyco_hydro_2_C);(Glyco_hydro_2_N)	1	72	183	74	186	8	1616	100	93	97
(Glyco_hydro_3);(Glyco_hydro_3_C)	1	41	123	41	126	4	1832	100	100	100
(Glyco_hydro_30);(Glyco_hydro_30C)	1	22	62	22	62	6	816	100	89	100
(Glyco_hydro_32C);(Glyco_hydro_32N)	1	22	62	24	69	8	1556	100	100	92
(Glyco_tran_28_C);(Glyco_transf_28)	1	25	32	25	35	2	573	100	100	100
(Glyco_transf_4);(Glycos_transf_1)	1	28	52	28	52	6	672	100	100	100
(Glycos_trans_3N);(Glycos_transf_3)	1	29	89	29	89	6	1048	100	99	100
(Glycos_trans_3N);(Glycos_transf_3)	2	29	88	29	89	6	267	89	95	100
(Gp_dh_C);(Gp_dh_N)	1	95	194	96	195	6	464	91	97	99
(Gp_dh_C);(Gp_dh_N)	2	94	193	96	195	6	234	91	95	98
(Gp_dh_C);(Gp_dh_N)	3	92	189	96	195	6	152	100	100	96
(H2TH);(zf-FPG_IleRS)	1	20	90	19	92	16	603	99	99	105
(HA2);(Helicase_C)	1	20	37	35	59	18	288	100	97	57
(HA2);(OB_NTP_bind)	1	34	57	34	58	11	1088	100	96	100
(HABP4_PAI-RBP1);(KH_2)	1	20	21	26	39	60	122	100	24	77
(HABP4_PAI-RBP1);(Ribosomal_S3_C)	1	30	31	32	45	6	783	100	26	94
(HABP4_PAI-RBP1);(Ribosomal_S5)	1	30	32	31	44	6	232	100	28	97
(HATPase_c);(HSP90)	1	70	397	75	464	2	1094	100	96	93
(HATPase_c);(HisKA)	1	26	36	29	44	12	418	100	100	90
(HH_signal);(Hint)	1	23	28	23	28	20	289	100	71	100
(Anoct_dimer);(Anoctamin)	1	31	32	31	32	3	2025	100	72	100
(HTH_9);(RNA_pol_Rpb1_1)	1	27	27	27	27	27	342	100	56	100
(Helicase_C);(OB_NTP_bind)	1	26	44	32	56	12	295	100	98	81
(Helicase_C);(ResIII)	1	36	45	43	53	10	475	100	89	84
(Helicase_C_2);(Ssl1)	1	32	35	32	35	41	488	100	37	100
(Hexokinase_1);(Hexokinase_2)	1	41	79	41	79	12	3512	100	95	100
(Histone);(Histone_H2A_C)	1	236	390	245	421	11	245	96	60	96
(Histone);(Histone_H2A_C)	2	213	363	245	421	10	612	100	58	87
(Histone);(Histone_H2A_C)	3	49	68	245	421	13	538	100	69	20
(Histone);(TAF)	1	229	400	229	412	5	1355	100	64	100
(Histone_H2A_C);(TAF)	1	198	349	203	378	7	230	100	58	98
(Hormone_2);(HRM)	1	22	30	23	31	5	303	100	37	96
(Hormone_recep);(SRC-1)	1	23	57	25	60	17	457	96	100	92
(Hydrolase_6);(Hydrolase_like)	1	28	41	28	43	11	1204	100	100	100
(1-cysPrx_C);(AhpC-TSA)	1	63	124	63	124	10	258	100	98	100
(2Fe-2S_thioredx);(Complex1_51K)	1	89	109	92	112	17	1266	100	44	97
(2Fe-2S_thioredx);(NADH_4Fe-4S)	1	85	105	90	110	17	345	81	46	94
(2Fe-2S_thioredx);(SLBB)	1	88	108	90	110	14	238	81	44	98
(2OG-FeII_Oxy);(DIOX_N)	1	35	122	35	122	10	1821	100	100	100
(3HCDH);(3HCDH_N)	1	34	72	36	79	13	419	99	90	94
(40S_SA_C);(Ribosomal_S17e)	1	140	140	148	148	20	192	71	9	95
(IBN_N);(Ras)	1	31	91	32	92	5	395	100	69	97
(IBN_N);(Xpo1)	1	20	23	26	35	9	892	100	96	77
(IF-2B);(NTP_transferase)	1	28	28	29	30	32	445	100	21	97
(7tm_1);(G-alpha)	1	141	141	141	141	11	509	99	9	100
(7tm_1);(Phage_lysozyme)	1	22	38	49	87	17	812	100	95	45
(7tm_1);(WD40)	1	20	20	117	117	20	132	100	20	17
(A2M);(A2M_recep)	1	32	36	52	60	33	211	100	94	62
(A2M);(A2M_recep)	2	21	25	52	60	17	524	96	80	40
(AAA);(AAA_2)	1	44	48	48	52	35	248	96	29	92
(AAA);(Lon_C)	1	28	28	29	29	42	305	100	39	97
(AAA);(Vps4_C)	1	56	65	64	77	10	437	100	32	88
(AAA_16);(ORC3_N)	1	24	24	24	24	9	473	96	4	100
(AAA_16);(ORC4_C)	1	25	25	25	25	11	603	88	8	100
(AAA_2);(ClpB_D2-small)	1	80	98	90	109	8	354	82	32	89
(AAA_2);(ClpB_D2-small)	2	69	82	90	109	15	213	100	48	77
(ABC_membrane);(ABC_tran)	1	134	179	135	183	6	516	100	59	99
(ABC_tran);(ABC2_membrane)	1	36	39	36	39	7	965	100	36	100
(ABC_tran);(BCA_ABC_TP_C)	1	21	26	21	26	8	245	100	100	100
(ABC_tran);(BPD_transp_1)	1	22	36	24	38	11	810	100	83	92
(ACP_syn_III);(ACP_syn_III_C)	1	52	106	55	110	10	1259	100	99	95
(IMS);(IMS_C)	1	30	266	46	417	8	429	100	100	65
(IMS);(IMS_HHH)	1	38	208	38	208	9	303	100	100	100
(IN_DBD_C);(rve)	1	24	24	31	32	19	190	100	29	77
(Ig_3);(I-set)	1	53	58	95	104	10	265	100	95	56
(IlvC);(IlvN)	1	38	50	38	51	13	605	100	66	100
(IlvC);(IlvN)	2	36	48	38	51	14	425	96	65	95
(IlvC);(IlvN)	3	20	23	38	51	25	263	83	4	53
(Img2);(MRP-63)	1	55	60	55	60	66	508	100	15	100
(Img2);(Ribosomal_L27A)	1	57	62	71	76	21	114	94	13	80
(Img2);(Ribosomal_L4)	1	57	62	72	77	17	164	100	15	79
(Inhibitor_I29);(Peptidase_C1)	1	21	26	21	26	18	737	100	96	100
(Inhibitor_I9);(Peptidase_S8)	1	35	60	38	69	12	1142	95	100	92
(Ins145_P3_rec);(MIR)	1	77	88	88	100	15	734	100	25	88
(Ins145_P3_rec);(MIR)	2	35	35	88	100	16	273	100	6	40
(Ins145_P3_rec);(RIH_assoc)	1	67	69	79	81	73	268	100	3	85
(Ins145_P3_rec);(RYDR_ITPR)	1	62	64	91	103	72	176	100	3	68
(Ins145_P3_rec);(RYDR_ITPR)	2	59	67	91	103	7	166	100	22	65
(Interfer-bind);(Tissue_fac)	1	28	51	34	70	11	462	94	92	82
(Internalin_N);(LRR_4)	1	23	23	38	41	13	464	91	83	61
(Ion_trans);(RR_TM4-6)	1	65	67	65	67	21	429	100	3	100
(Ion_trans);(RR_TM4-6)	2	50	50	65	67	33	1099	100	4	77
(JAB);(Sec63)	1	21	26	24	29	38	183	73	58	88
(KAsynt_C_assoc);(Ketoacyl-synt_C)	1	50	74	50	74	8	2401	99	84	100
(KAsynt_C_assoc);(ketoacyl-synt)	1	50	74	52	76	8	947	99	84	96
(KAsynt_C_assoc);(ketoacyl-synt)	2	41	64	52	76	9	173	95	83	79
(KH_2);(Ribosomal_S10)	1	246	272	631	958	9	148	100	12	39
(KH_2);(Ribosomal_S14)	1	184	442	627	953	12	118	100	17	29
(KH_2);(S10_plectin)	1	228	229	228	241	20	842	100	10	100
(KOW);(Ribosomal_L18A)	1	214	215	218	231	18	246	100	19	98
(KOW);(Ribosomal_L34e)	1	232	233	236	249	23	323	100	15	98
(KOW);(Ribosomal_L6)	1	79	79	86	86	28	170	100	4	92
(KOW);(Ribosomal_L7Ae)	1	227	228	233	246	24	275	100	15	97
(KOW);(Ribosomal_S17_N)	1	24	24	252	265	24	162	58	21	10
(KOW);(Tim44)	1	23	24	52	57	65	109	100	25	44
(CRPV_capsid);(Rhv)	1	27	27	28	28	7	1075	93	37	96
(Calici_coat);(CRPV_capsid)	1	29	30	29	30	12	2544	93	27	100
(Calici_coat);(Rhv)	1	25	25	45	60	4	1106	92	28	56
(Kinesin);(Tubulin)	1	42	42	60	60	25	171	98	29	70
(Kinesin);(Tubulin_C)	1	46	46	61	61	25	122	98	22	75
(Kunitz_BPTI);(Trypsin)	1	40	95	44	99	15	548	100	99	91
(L51_S25_CI-B8);(MRP-63)	1	54	59	54	59	67	185	98	15	100
(L51_S25_CI-B8);(MRP-S26)	1	34	35	34	35	78	372	100	6	100
(L51_S25_CI-B8);(Ribonucleas_3_3)	1	58	63	59	64	15	125	100	16	98
(L51_S25_CI-B8);(Ribosomal_L50)	1	64	69	64	69	12	613	100	16	100
(L51_S25_CI-B8);(Ribosomal_S17)	1	34	35	34	35	56	477	89	3	100
(LRR_4);(LRR_8)	1	135	178	148	200	2	723	99	87	91
(LRR_4);(LRR_8)	2	22	33	148	200	14	160	21	18	15
(LRR_4);(LRR_adjacent)	1	20	20	26	27	22	580	100	90	77
(LRR_8);(LRRCT)	1	40	57	57	93	8	179	96	93	70
(LRR_8);(LRRNT)	1	95	105	124	151	4	703	100	84	77
(LRR_9);(RRM_1)	1	40	40	45	45	26	507	100	15	89
(Ldh_1_C);(Ldh_1_N)	1	136	289	137	290	9	1661	100	98	99
(Ldh_1_C);(Ldh_1_N)	2	135	287	137	290	9	907	97	97	99
(Ldh_1_C);(Ldh_1_N)	3	79	186	137	290	16	238	95	92	58
(Lectin_C);(Ly49)	1	35	66	36	67	5	645	85	82	97
(DSS1_SEM1);(RPN7)	1	34	34	39	39	39	181	100	6	87
(Lig_chan);(Lig_chan-Glu_bd)	1	180	441	199	517	2	343	98	77	90
(Lig_chan);(PMP22_Claudin)	1	21	22	21	22	70	381	100	18	100
(Lig_chan);(SBP_bac_3)	1	23	43	23	48	5	772	100	74	100
(Lig_chan-Glu_bd);(SBP_bac_3)	1	24	49	24	54	14	2502	100	78	100
(Lig_chan-Glu_bd);(SBP_bac_3)	2	20	43	24	54	14	257	98	67	83
(CSN8_PSD8_EIF3K);(PCI)	1	64	65	64	65	13	1007	100	28	100
(M20_dimer);(Peptidase_M20)	1	46	64	49	67	5	1320	100	100	94
(M20_dimer);(Peptidase_M20)	2	34	47	49	67	4	433	98	100	69
(MA3);(U5_2-snRNA_bdg)	1	27	27	28	28	30	408	100	11	96
(MA3);(U6-snRNA_bdg)	1	22	22	26	26	30	144	100	9	85
(MCM);(MCM_OB)	1	32	32	34	34	26	378	97	41	94
(MCM);(MCM_OB)	2	25	25	34	34	23	360	100	44	74
(MCM_N);(MCM_OB)	1	43	44	45	46	11	489	100	57	96
(MCM_N);(MCM_OB)	2	30	30	45	46	15	181	100	37	67
(MCM_N);(Sld5)	1	21	21	21	21	11	460	100	43	100
(MCM_N);(Sld5)	2	21	21	21	21	10	253	100	43	100
(DSS1_SEM1);(PCI)	1	39	39	64	64	18	639	100	18	61
(DSS1_SEM1);(PCI)	2	21	21	64	64	45	226	100	0	33
(MHC_I);(V-set)	1	130	236	155	264	12	383	95	44	84
(MHC_I);(V-set)	2	20	25	155	264	20	419	100	52	13
(MHC_II_alpha);(MHC_II_beta)	1	155	210	157	215	10	928	99	99	99
(MHC_II_alpha);(V-set)	1	49	70	54	76	17	243	94	31	91
(MHC_II_beta);(V-set)	1	51	67	54	76	14	254	94	34	94
(MHC_I_3);(V-set)	1	25	80	28	83	14	375	95	72	89
(MIR);(RYDR_ITPR)	1	73	82	78	89	7	215	100	26	94
(MMS1_N);(WD40)	1	29	31	31	34	13	170	100	68	94
(MRP-63);(Ribosomal_L30)	1	54	59	54	59	67	665	100	15	100
(MRP-63);(Ribosomal_L4)	1	53	58	53	58	69	173	100	16	100
(MRP-63);(Ribosomal_L50)	1	23	23	54	59	69	111	100	13	43
(MRP-L27);(MRP-L47)	1	65	70	65	70	21	1041	100	14	100
(MRP-L27);(Ribosomal_L23)	1	65	70	65	70	14	631	100	14	100
(MRP-L27);(Ribosomal_L34)	1	62	67	63	68	21	442	100	15	98
(MRP-L28);(MRP-L46)	1	62	67	63	68	10	1207	100	16	98
(MRP-L28);(Ribosomal_S10)	1	54	59	54	59	73	1250	100	17	100
(MRP-L47);(Ribosomal_L23)	1	75	80	75	80	14	698	100	14	100
(MRP-L51);(Ribosomal_L27A)	1	53	58	54	59	88	289	100	16	98
(MRP-L51);(Ribosomal_L4)	1	54	59	54	59	88	1670	100	15	100
(MRP-S22);(MRP-S34)	1	34	35	34	35	82	257	100	6	100
(MRP-S22);(Ribosomal_S16)	1	34	35	34	35	88	656	100	6	100
(MRP-S22);(Ribosomal_S18)	1	34	35	34	35	88	404	91	6	100
(MRP-S22);(Ribosomal_S5_C)	1	34	35	34	35	87	268	97	6	100
(MRP-S23);(MRP-S35)	1	34	35	34	35	86	905	100	6	100
(MRP-S23);(Ribosomal_S2)	1	35	36	35	36	13	1678	100	6	100
(MRP-S23);(Ribosomal_S5)	1	35	36	35	36	13	483	100	6	100
(MRP-S24);(MRP-S28)	1	34	35	34	35	76	367	100	6	100
(MRP-S24);(MRP-S31)	1	34	35	34	35	3	276	100	6	100
(MRP-S24);(MRP-S33)	1	33	34	34	35	79	536	100	6	97
(MRP-S24);(Ribosomal_S10)	1	34	35	34	35	88	593	100	6	100
(MRP-S24);(Ribosomal_S14)	1	34	35	34	35	84	986	100	6	100
(MRP-S26);(MRP-S34)	1	34	35	34	35	78	161	86	0	100
(MRP-S26);(Ribosomal_S16)	1	35	36	38	39	19	304	100	6	92
(MRP-S26);(Ribosomal_S18)	1	37	38	37	38	9	445	100	5	100
(MRP-S26);(Ribosomal_S6)	1	37	38	38	39	9	895	100	3	97
(MRP-S27);(MRP-S34)	1	32	33	32	33	78	1303	100	6	100
(MRP-S28);(MRP-S31)	1	29	30	34	35	3	1023	100	7	85
(MRP-S28);(MRP-S33)	1	43	44	43	44	9	662	100	5	100
(MRP-S28);(Ribosomal_S10)	1	42	43	42	43	15	464	98	5	100
(MRP-S31);(MRP-S33)	1	33	34	34	35	3	666	100	6	97
(MRP-S31);(Ribosomal_S10)	1	34	35	34	35	3	250	100	6	100
(MRP-S32);(Ribosomal_L13)	1	53	58	54	59	68	244	100	16	98
(MRP-S32);(Ribosomal_L20)	1	53	58	54	59	68	361	100	16	98
(MRP-S32);(Ribosomal_L21p)	1	53	58	53	58	68	465	100	16	100
(MRP-S33);(Ribosomal_S14)	1	41	42	42	43	15	377	100	5	98
(MRP-S35);(Ribosomal_S2)	1	34	35	34	35	37	1035	100	6	100
(MRP_L53);(Ribosomal_L10)	1	54	59	54	59	68	691	100	15	100
(MR_MLE_C);(MR_MLE_N)	1	167	287	167	288	1	1719	98	98	100
(MR_MLE_C);(MR_MLE_N)	2	92	163	167	288	3	319	80	89	55
(MR_MLE_C);(MR_MLE_N)	3	68	115	167	288	11	129	67	89	41
(MSP);(PSII)	1	31	85	31	86	41	1306	100	31	100
(MSP);(PSII)	2	29	83	31	86	41	627	100	29	94
(MSP);(PSII)	3	22	53	31	86	41	386	81	15	71
(MSP);(Photo_RC)	1	31	85	31	86	46	603	100	25	100
(MSP);(Photo_RC)	2	30	84	31	86	46	573	100	31	97
(MSP);(PsbU)	1	22	76	22	77	32	450	100	30	100
(ADH_N);(ADH_N_assoc)	1	24	32	24	32	4	839	100	100	100
(ADH_N);(ADH_zinc_N)	1	145	288	146	289	1	602	100	98	99
(ADH_N);(ADH_zinc_N)	2	114	249	146	289	4	250	95	96	78
(MaoC_dehydrat_N);(MaoC_dehydratas)	1	27	30	30	35	2	1118	87	63	90
(ADH_N);(ADH_zinc_N_2)	1	28	35	28	35	6	943	100	100	100
(Med11);(Med17)	1	20	20	20	20	11	1014	100	15	100
(Med11);(Med22)	1	21	21	21	21	11	1223	95	19	100
(Metallophos);(STPPase_N)	1	51	73	58	82	14	1910	99	90	88
(ADK);(ADK_lid)	1	40	78	40	78	13	535	100	100	100
(AIRS);(AIRS_C)	1	34	57	35	60	2	1005	100	100	97
(AMP-binding);(AMP-binding_C)	1	119	202	123	206	6	617	100	98	97
(ANF_receptor);(Lig_chan-Glu_bd)	1	43	44	97	115	33	236	100	7	44
(ANF_receptor);(Lig_chan-Glu_bd)	2	30	43	97	115	22	254	100	42	31
(ANF_receptor);(NCD3G)	1	32	35	34	37	29	383	100	31	94
(Mitoc_L55);(MRP-L28)	1	52	57	52	57	67	762	100	16	100
(Mitoc_L55);(MRP-L46)	1	52	57	52	57	67	1112	100	16	100
(Mitoc_L55);(Ribosomal_S10)	1	52	57	52	57	66	857	100	16	100
(Molybdop_Fe4S4);(Molybdopterin)	1	20	37	22	42	13	1393	100	86	91
(Molybdop_Fe4S4);(Molydop_binding)	1	20	37	21	40	10	452	100	84	95
(Molybdopterin);(Molydop_binding)	1	30	60	40	74	10	1897	100	92	75
(Mur_ligase_C);(Mur_ligase_M)	1	40	88	45	97	6	583	100	93	89
(MutS_III);(MutS_IV)	1	22	40	22	40	6	550	100	100	100
(MutS_III);(MutS_V)	1	23	41	23	41	19	893	100	100	100
(Myb_DNA-binding);(RRM_4)	1	35	35	36	36	21	347	100	11	97
(Myb_DNA-binding);(SKIP_SNW)	1	30	30	36	36	21	308	100	7	83
(Myb_DNA-binding);(SKIP_SNW)	2	24	24	36	36	32	365	100	12	67
(Myosin_head);(Myosin_N)	1	93	158	94	161	15	301	100	84	99
(NADH5_C);(Oxidored_q2)	1	65	65	68	68	3	475	98	22	96
(NADH5_C);(Proton_antipo_M)	1	75	75	76	76	3	623	85	23	99
(NADH5_C);(Proton_antipo_M)	2	65	65	76	76	3	942	65	15	86
(NADH_4Fe-4S);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	84	90	89	97	21	423	100	34	94
(NADHdh);(Oxidored_q3)	1	92	97	94	99	12	960	100	25	98
(NADHdh);(Oxidored_q4)	1	94	99	94	99	24	2132	100	24	100
(NADHdh);(Oxidored_q6)	1	88	93	88	93	16	801	100	23	100
(NAD_binding_11);(NAD_binding_2)	1	47	69	47	69	2	504	100	97	100
(NOGCT);(Ribosomal_L24e)	1	26	26	28	28	35	244	100	46	93
(NOGCT);(Ribosomal_L3)	1	30	30	30	30	35	514	100	50	100
(Neur_chan_LBD);(Neur_chan_memb)	1	117	235	122	260	1	362	100	69	96
(Neur_chan_LBD);(Neur_chan_memb)	2	69	71	122	260	3	148	100	28	57
(NiFeSe_Hases);(Oxidored_q6)	1	43	144	45	155	4	1748	100	94	96
(NiFe_hyd_SSU_C);(NiFeSe_Hases)	1	27	114	29	129	6	1228	91	90	93
(NiFe_hyd_SSU_C);(Oxidored_q6)	1	20	58	24	95	32	676	100	97	83
(ERAP1_C);(Peptidase_M1)	1	22	55	25	59	11	1671	100	98	88
(Nop);(Ribosomal_L7Ae)	1	54	57	55	58	18	497	100	30	98
(ORC2);(ORC3_N)	1	25	25	25	25	9	850	100	8	100
(ORC2);(ORC5_C)	1	24	24	24	24	17	676	62	4	100
(ORC3_N);(ORC4_C)	1	23	23	24	24	9	318	26	4	96
(ORC3_N);(ORC5_C)	1	24	24	24	24	9	1057	71	4	100
(ORC4_C);(ORC5_C)	1	25	25	25	25	11	877	100	8	100
(OTCace);(OTCace_N)	1	68	174	69	176	8	2156	100	99	99
(OTCace);(OTCace_N)	2	68	175	69	176	8	468	98	100	99
(C1-set);(V-set)	1	2159	2814	3158	4232	2	182	99	94	68
(C1-set);(V-set)	2	2081	2640	3158	4232	3	255	99	92	66
(C1-set);(V-set)	3	84	99	3158	4232	1	161	0	1	3
(C1-set);(V-set)	4	66	81	3158	4232	18	135	0	4	2
(C1-set);(V-set)	5	63	84	3158	4232	17	142	2	11	2
(C1-set);(V-set)	6	61	73	3158	4232	7	279	8	37	2
(C1-set);(V-set)	7	61	77	3158	4232	15	170	0	4	2
(C1-set);(V-set)	8	51	61	3158	4232	6	147	2	10	2
(C1-set);(V-set)	9	49	58	3158	4232	20	231	3	10	2
(C1-set);(V-set)	10	48	58	3158	4232	10	168	7	0	2
(C1-set);(V-set)	11	42	48	3158	4232	6	167	0	6	1
(C1-set);(V-set)	12	41	50	3158	4232	5	148	24	22	1
(C1-set);(V-set)	14	39	42	3158	4232	6	180	0	2	1
(C1-set);(V-set)	15	37	42	3158	4232	35	113	0	5	1
(C1-set);(V-set)	16	36	42	3158	4232	17	167	0	0	1
(C1-set);(V-set)	17	36	39	3158	4232	17	199	0	8	1
(C1-set);(V-set)	18	35	48	3158	4232	5	206	0	0	1
(C1-set);(V-set)	19	35	45	3158	4232	3	173	0	0	1
(C1-set);(V-set)	20	34	41	3158	4232	16	173	0	2	1
(C1-set);(V-set)	21	31	41	3158	4232	12	220	0	2	1
(C1-set);(V-set)	22	30	33	3158	4232	17	156	0	0	1
(C1-set);(V-set)	23	28	45	3158	4232	6	196	0	0	1
(C1-set);(V-set)	24	28	34	3158	4232	15	193	0	0	1
(C1-set);(V-set)	25	27	31	3158	4232	16	352	0	3	1
(C1-set);(V-set)	26	27	29	3158	4232	6	147	0	3	1
(C1-set);(V-set)	27	26	45	3158	4232	15	274	0	0	1
(C1-set);(V-set)	28	26	37	3158	4232	16	149	0	0	1
(C1-set);(V-set)	29	26	29	3158	4232	18	141	0	3	1
(C1-set);(V-set)	30	26	28	3158	4232	17	146	0	0	1
(C1-set);(V-set)	31	25	26	3158	4232	19	160	0	0	1
(C1-set);(V-set)	32	25	26	3158	4232	7	159	0	15	1
(C1-set);(V-set)	33	24	30	3158	4232	5	202	0	3	1
(C1-set);(V-set)	34	24	41	3158	4232	14	140	0	0	1
(C1-set);(V-set)	35	24	25	3158	4232	15	178	0	4	1
(C1-set);(V-set)	36	24	24	3158	4232	20	164	4	4	1
(C1-set);(V-set)	37	23	39	3158	4232	6	134	0	0	1
(C1-set);(V-set)	38	23	27	3158	4232	6	192	0	0	1
(C1-set);(V-set)	39	23	27	3158	4232	17	157	0	0	1
(C1-set);(V-set)	40	23	27	3158	4232	18	145	4	15	1
(C1-set);(V-set)	41	23	24	3158	4232	19	139	4	12	1
(C1-set);(V-set)	42	23	23	3158	4232	17	180	0	0	1
(C1-set);(V-set)	43	22	34	3158	4232	13	154	0	0	1
(C1-set);(V-set)	44	22	28	3158	4232	7	295	0	0	1
(C1-set);(V-set)	45	22	24	3158	4232	15	167	0	4	1
(C1-set);(V-set)	46	22	25	3158	4232	14	195	0	8	1
(C1-set);(V-set)	47	22	28	3158	4232	17	136	0	0	1
(C1-set);(V-set)	48	22	25	3158	4232	16	140	0	4	1
(C1-set);(V-set)	49	21	31	3158	4232	15	158	0	0	1
(C1-set);(V-set)	50	21	30	3158	4232	7	148	0	0	1
(C1-set);(V-set)	51	20	83	3158	4232	17	149	4	5	1
(C1-set);(V-set)	52	20	34	3158	4232	16	175	0	0	1
(C1-set);(V-set)	53	20	89	3158	4232	3	294	0	1	1
(C1-set);(V-set)	54	20	27	3158	4232	7	206	0	0	1
(C1-set);(V-set)	55	20	22	3158	4232	16	145	5	0	1
(C1-set);(V-set)	56	20	27	3158	4232	16	248	0	0	1
(C1-set);(V-set)	57	20	22	3158	4232	17	206	0	14	1
(C1-set);(V-set)	58	20	24	3158	4232	6	192	4	0	1
(C1-set);(V-set)	59	20	22	3158	4232	15	174	0	5	1
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)	1	626	661	667	703	4	296	100	30	94
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)	2	318	327	667	703	17	300	100	13	48
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)	3	250	256	667	703	65	199	100	11	37
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)	4	22	22	667	703	53	649	100	5	3
(ATP-grasp_2);(Ligase_CoA)	1	28	56	28	56	16	301	100	80	100
(ATP-gua_Ptrans);(ATP-gua_PtransN)	1	27	50	28	51	23	893	100	98	96
(ATP-synt);(ATP-synt_C)	1	95	98	133	137	15	149	100	61	71
(ATP-synt);(ATP-synt_DE_N)	1	167	182	167	182	6	881	100	54	100
(ATP-synt);(ATP-synt_Eps)	1	104	116	104	116	17	952	100	73	100
(ATP-synt);(ATP-synt_ab)	1	147	179	165	197	17	255	100	59	89
(ATP-synt);(ATP-synt_ab_C)	1	144	176	158	190	18	282	100	59	91
(ATP-synt);(ATP-synt_ab_C)	2	31	33	158	190	23	138	100	48	20
(ATP-synt);(ATP-synt_ab_C)	3	25	29	158	190	27	126	100	72	16
(ATP-synt_A);(ATP-synt_C)	1	118	119	128	129	17	376	100	34	92
(ATP-synt_C);(ATP-synt_DE_N)	1	131	135	144	148	6	203	99	45	91
(ATP-synt_C);(ATP-synt_DE_N)	2	22	24	144	148	8	242	100	38	15
(ATP-synt_C);(V_ATPase_I)	1	32	32	40	40	9	426	100	16	80
(ATP-synt_C);(vATP-synt_AC39)	1	40	40	45	45	9	174	100	12	89
(ATP-synt_D);(ATP-synt_F)	1	45	49	46	52	14	1474	100	29	98
(ATP-synt_D);(vATP-synt_AC39)	1	35	35	37	37	14	1009	100	14	95
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_D)	1	32	36	45	51	25	269	100	31	71
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_C)	1	74	103	135	169	20	652	99	55	55
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_N)	1	118	136	200	257	7	125	96	65	59
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_N)	2	69	105	200	257	4	394	98	66	34
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_Xtn)	1	38	47	52	79	24	125	98	51	73
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_Xtn)	2	22	44	52	79	38	1463	100	75	42
(ATP-synt_ab);(vATP-synt_E)	1	31	31	37	37	16	391	100	13	84
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)	1	101	102	147	148	17	376	100	34	69
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)	2	99	99	147	148	8	208	96	43	67
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)	3	21	21	147	148	17	121	100	14	14
(ATP-synt_ab_N);(vATP-synt_E)	1	26	26	38	38	16	170	100	15	68
(Actin);(Gelsolin)	1	22	48	22	50	27	800	100	100	100
(Actin);(Myosin_head)	1	60	60	60	60	29	875	100	38	100
(Acyl-CoA_dh_1);(Acyl-CoA_dh_M)	1	85	127	87	129	8	512	94	99	98
(Acyl-CoA_dh_1);(Acyl-CoA_dh_M)	2	84	124	87	129	6	559	100	100	97
(Acyl-CoA_dh_1);(Acyl-CoA_dh_N)	1	72	111	72	111	7	1077	100	100	100
(Acyl-CoA_dh_M);(Acyl-CoA_dh_N)	1	81	130	82	133	4	908	100	100	99
(Acyl_transf_1);(KAsynt_C_assoc)	1	31	43	31	43	5	494	100	74	100
(Adaptin_N);(Clat_adaptor_s)	1	32	34	37	39	6	1717	100	65	86
(AdoHcyase);(AdoHcyase_NAD)	1	37	60	37	61	20	756	98	100	100
(AdoHcyase);(AdoHcyase_NAD)	2	37	59	37	61	20	734	100	100	100
(AlaDh_PNT_C);(AlaDh_PNT_N)	1	25	42	30	49	23	274	95	98	83
(AlaDh_PNT_C);(AlaDh_PNT_N)	2	23	33	30	49	11	2219	100	97	77
(Ala_racemase_C);(Ala_racemase_N)	1	36	66	36	66	18	728	100	100	100
(Ala_racemase_C);(Ala_racemase_N)	2	35	65	36	66	18	899	100	97	97
(Ald_Xan_dh_C);(Ald_Xan_dh_C2)	1	21	81	21	82	15	2123	100	100	100
(Ald_Xan_dh_C);(Fer2)	1	21	66	20	80	15	300	100	100	105
(Ald_Xan_dh_C);(Fer2_2)	1	22	68	21	82	15	261	100	100	105
(Ald_Xan_dh_C2);(Fer2)	1	21	66	20	71	17	282	100	100	105
(Ald_Xan_dh_C2);(Fer2_2)	1	22	68	21	82	17	1012	100	100	105
(Alpha-amylase);(Alpha-amylase_C)	1	38	178	46	191	2	828	100	100	83
(Alpha-amylase);(CBM_48)	1	30	57	30	87	10	893	98	96	100
(Alpha-amylase);(DUF1939)	1	20	40	20	40	8	406	100	100	100
(Alpha-amylase);(DUF3459)	1	23	38	25	48	6	1347	100	84	92
(Alpha-amylase);(Malt_amylase_C)	1	50	150	50	150	4	884	100	99	100
(Alpha_E1_glycop);(Alpha_E2_glycop)	1	22	22	45	48	33	2991	100	0	49
(Alpha_E1_glycop);(Alpha_E2_glycop)	2	21	23	45	48	32	967	100	30	47
(Alpha_E2_glycop);(Peptidase_S3)	1	20	21	25	26	25	472	100	0	80
(Amidohydro_1);(Urease_alpha)	1	25	54	27	97	9	1266	100	98	93
(Ank);(Ank_2)	1	141	160	155	195	3	650	98	80	91
(Ank_2);(Ank_4)	1	80	91	90	105	4	634	97	49	89
(Ank_2);(Ank_5)	1	44	60	50	66	12	1005	100	92	88
(ApbA);(ApbA_C)	1	20	23	20	23	13	859	100	100	100
(ArgoMid);(Piwi)	1	20	58	20	58	4	1673	100	100	100
(Arm);(Arm_3)	1	65	142	71	156	20	768	100	94	92
(Arm);(IBB)	1	50	111	69	148	15	513	100	95	72
(Arm);(IBB)	2	32	99	69	148	12	212	0	0	46
(Arrestin_C);(Arrestin_N)	1	21	37	22	40	29	1450	100	78	95
(BBE);(FAD_binding_4)	1	35	65	35	70	18	776	100	97	100
(BCAS2);(Prp19)	1	24	24	27	27	15	553	100	12	89
(BCAS2);(Prp19)	2	21	21	27	27	15	390	100	10	78
(Bcl-2);(BH4)	1	70	116	82	123	6	867	93	91	85
(Bcl-2);(BH4)	2	22	33	82	123	18	186	3	12	27
(Bcl-2);(Bclx_interact)	1	32	44	33	45	4	905	95	95	97
(Biotin_carb_C);(Biotin_carb_N)	1	38	82	40	85	19	558	100	100	95
(Biotin_carb_C);(Biotin_carb_N)	2	30	71	40	85	19	370	69	41	75
(Biotin_carb_C);(CPSase_L_D2)	1	39	82	40	85	19	1148	100	100	98
(Biotin_carb_C);(CPSase_L_D2)	2	24	64	40	85	23	196	66	34	60
(Biotin_carb_N);(CPSase_L_D2)	1	39	84	40	85	10	958	100	100	98
(Brix);(Ribosomal_S9)	1	29	29	35	35	48	311	100	3	83
(Bromo_TP);(TFIID_30kDa)	1	26	26	26	26	50	1373	100	15	100
(Bromodomain);(DUF902)	1	31	95	31	96	5	190	98	97	100
(C1-set);(DUF1968)	1	253	416	260	464	2	1208	97	95	97
(C1-set);(MHC_I)	1	550	1042	584	1182	6	692	99	96	94
(C1-set);(MHC_I)	2	204	339	584	1182	14	171	99	99	35
(C1-set);(MHC_I)	3	116	201	584	1182	18	267	0	3	20
(C1-set);(MHC_I)	4	42	123	584	1182	70	521	0	0	7
(C1-set);(MHC_I)	5	39	117	584	1182	70	333	0	0	7
(C1-set);(MHC_I)	6	35	71	584	1182	13	137	0	3	6
(C1-set);(MHC_I)	7	35	38	584	1182	23	391	97	97	6
(C1-set);(MHC_I)	8	33	96	584	1182	20	255	0	0	6
(C1-set);(MHC_I)	9	33	80	584	1182	19	246	0	0	6
(C1-set);(MHC_I)	10	31	181	584	1182	21	159	1	0	5
(C1-set);(MHC_I)	11	31	173	584	1182	20	185	0	0	5
(C1-set);(MHC_I)	12	27	61	584	1182	68	324	0	5	5
(C1-set);(MHC_I)	13	20	60	584	1182	37	207	0	0	3
(C1-set);(MHC_II_alpha)	1	155	210	157	215	18	302	96	97	99
(C1-set);(MHC_II_alpha)	2	121	156	157	215	18	507	100	99	77
(C1-set);(MHC_II_alpha)	3	20	34	157	215	3	179	0	0	13
(C1-set);(MHC_II_beta)	1	155	210	157	215	10	230	97	97	99
(C1-set);(MHC_II_beta)	2	20	35	157	215	28	300	0	0	13
(C1-set);(MHC_I_3)	1	50	133	50	153	35	566	99	98	100
(C1-set);(MHC_I_3)	2	28	46	50	153	37	205	96	91	56
(C1-set);(V-set_2)	1	196	215	251	287	11	164	97	92	78
(C2-set);(ig)	1	33	48	34	49	76	551	98	79	97
(C2-set_2);(V-set)	1	29	34	46	54	9	238	100	94	63
(CAF1C_H4-bd);(WD40)	1	23	34	23	34	35	1144	100	97	100
(CBS);(IMPDH)	1	38	46	43	57	11	397	100	59	88
(CCP_MauG);(Cytochrom_C)	1	21	26	22	32	14	1152	100	100	95
(CDC48_2);(CDC48_N)	1	68	75	72	80	2	568	97	47	94
(CHCH);(Ribosomal_S11)	1	28	29	32	33	60	179	100	0	88
(CHCH);(Ribosomal_S7)	1	37	38	37	38	21	663	100	5	100
(COX1);(COX2)	1	57	153	57	153	15	1294	98	79	100
(COX1);(COX2_TM)	1	50	116	50	116	10	2083	100	73	100
(COX1);(COX3)	1	46	102	46	102	22	1986	100	71	100
(COX1);(COX4)	1	21	74	21	74	15	955	100	80	100
(COX1);(COX5B)	1	22	75	23	76	30	361	100	73	96
(COX1);(COX7C)	1	23	76	23	76	4	980	100	74	100
(COX1);(COX7a)	1	20	73	23	76	20	205	100	78	87
(COX2);(COX6B)	1	23	76	23	76	34	686	100	70	100
(COX2_TM);(COX5A)	1	21	74	21	74	28	280	100	72	100
(COX2_TM);(COX6C)	1	21	74	21	74	16	897	100	76	100
(COX3);(COX5B)	1	23	76	23	76	30	848	100	74	100
(COX3);(COX6A)	1	21	74	23	76	34	1575	99	73	91
(COX3);(COX6B)	1	22	75	23	76	34	248	100	69	96
(COX3);(COX7a)	1	23	76	23	76	20	1298	100	75	100
(COX4);(COX5A)	1	21	74	21	74	15	1195	100	76	100
(COX5A);(COX6C)	1	21	74	21	74	16	583	100	70	100
(CPSF_A);(MMS1_N)	1	45	64	52	75	11	1165	100	88	87
(CPSF_A);(WD40)	1	29	30	30	33	12	201	100	67	97
(CR6_interact);(MRP-L51)	1	55	60	55	60	74	426	100	15	100
(CR6_interact);(Ribosomal_L33)	1	53	58	53	58	69	478	100	16	100
(CR6_interact);(Ribosomal_L4)	1	54	59	54	59	74	422	100	15	100
(CTP_synth_N);(GATase)	1	29	40	29	40	40	940	100	30	100
(Cadherin);(Cadherin_2)	1	31	35	31	35	19	175	100	100	100
(Calici_coat);(Calici_coat_C)	1	77	158	79	165	1	3539	98	91	97
(Calici_coat);(Calici_coat_C)	2	73	158	79	165	1	232	92	89	92
(CarD_CdnL_TRCF);(RNA_pol_Rpb2_1)	1	24	24	24	24	18	483	71	8	100
(Catalase);(Catalase-rel)	1	44	141	43	141	7	1334	99	98	102
(Catalase);(Catalase-rel)	2	20	75	43	141	9	116	100	96	47
(Cation_ATPase_C);(E1-E2_ATPase)	1	46	83	49	118	9	775	100	82	94
(Cation_ATPase_C);(Hydrolase)	1	36	75	43	111	13	226	100	81	84
(Cation_ATPase_N);(E1-E2_ATPase)	1	60	99	66	158	10	1724	100	68	91
(Cbl_N);(Cbl_N2)	1	22	35	23	36	27	597	100	100	96
(Cbl_N);(Cbl_N3)	1	22	35	24	37	27	364	100	100	92
(Cbl_N2);(Cbl_N3)	1	22	35	24	38	42	665	100	100	92
(Cdc6_C);(ORC4_C)	1	23	23	23	23	7	821	78	9	100
(Chal_sti_synt_C);(Chal_sti_synt_N)	1	54	97	53	97	2	842	100	99	102
(Chal_sti_synt_C);(Chal_sti_synt_N)	2	54	97	53	97	2	2065	100	99	102
(Chloroa_b-bind);(PSI_PSAK)	1	22	24	30	36	30	350	100	17	73
(Chloroa_b-bind);(PSI_PsaF)	1	29	32	36	42	43	340	100	19	81
(Chloroa_b-bind);(PSI_PsaJ)	1	29	30	35	41	47	141	100	13	83
(Chloroa_b-bind);(PsaA_PsaB)	1	30	33	36	42	23	179	100	18	83
(Complex1_30kDa);(Complex1_49kDa)	1	92	100	93	101	12	1315	100	28	99
(Complex1_30kDa);(Oxidored_q6)	1	96	102	98	106	12	400	100	27	98
(Complex1_49kDa);(Fer4_7)	1	90	96	96	104	25	439	100	29	94
(Complex1_49kDa);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	85	93	85	93	21	769	100	31	100
(Complex1_49kDa);(NADHdh)	1	86	91	88	93	16	816	100	23	98
(Complex1_49kDa);(Oxidored_q6)	1	96	102	98	106	25	563	100	27	98
(Complex1_51K);(Fer2_4)	1	70	70	81	89	24	143	100	26	86
(Creatinase_N);(Peptidase_M24)	1	21	33	24	38	7	490	100	100	88
(Creatinase_N);(Peptidase_M24)	2	20	30	24	38	5	536	100	100	83
(Cu-oxidase);(Cu-oxidase_2)	1	77	196	77	228	1	906	100	100	100
(Cu-oxidase);(Cu-oxidase_3)	1	104	379	105	416	1	1142	100	99	99
(Cu-oxidase_2);(Cu-oxidase_3)	1	104	252	104	286	6	952	100	97	100
(Cu_amine_oxid);(Cu_amine_oxidN2)	1	20	144	20	144	8	1123	99	100	100
(Cwf_Cwc_15);(PROCN)	1	33	33	34	34	5	944	100	12	97
(Cwf_Cwc_15);(RRM_4)	1	20	20	31	31	5	149	100	10	65
(Cwf_Cwc_15);(SKIP_SNW)	1	20	20	29	29	6	323	100	5	69
(Cwf_Cwc_15);(WD40)	1	32	32	34	34	5	281	100	9	94
(Cyclin_C);(Cyclin_N)	1	28	82	41	169	6	1381	100	99	68
(Cyclin_N);(Pkinase)	1	68	206	72	230	7	1228	100	92	94
(Cytochrom_B559);(Photo_RC)	1	41	96	41	96	58	374	100	35	100
(Cytochrom_B559);(PsbJ)	1	28	81	29	84	27	348	100	21	97
(Cytochrom_B559);(PsbJ)	2	20	72	29	84	26	390	100	24	69
(Cytochrom_B559a);(Photo_RC)	1	40	94	40	95	44	1134	100	34	100
(Cytochrom_B559a);(Photo_RC)	2	40	94	40	95	44	257	100	33	100
(Cytochrom_B_C);(Rieske)	1	66	96	70	111	11	496	86	58	94
(Cytochrom_B_C);(UCR_14kD)	1	50	80	50	88	25	400	100	66	100
(Cytochrom_B_C);(UcrQ)	1	48	78	48	85	20	682	100	68	100
(Cytochrom_C1);(Cytochrome_B)	1	56	93	60	104	32	546	100	68	93
(Cytochrom_C1);(UCR_14kD)	1	28	64	46	83	37	147	100	89	61
(Cytochrom_C1);(UCR_TM)	1	45	71	47	81	24	510	100	68	96
(Cytochrom_C1);(UCR_UQCRX_QCR9)	1	47	83	50	87	32	849	100	71	94
(Cytochrom_C1);(UCR_hinge)	1	50	80	50	87	25	761	100	66	100
(Cytochrom_C1);(UcrQ)	1	48	84	48	86	20	363	100	70	100
(Cytochrom_C550);(PSII)	1	24	78	24	79	50	930	100	44	100
(Cytochrom_C550);(Photo_RC)	1	24	78	24	79	58	481	100	44	100
(Cytochrom_C550);(PsbU)	1	22	76	22	77	32	636	100	26	100
(Cytochrome_B);(Rieske)	1	44	64	56	97	28	288	89	66	79
(Cytochrome_B);(UCR_14kD)	1	47	77	50	88	25	196	100	69	94
(Cytochrome_B);(UCR_TM)	1	44	63	47	85	24	214	81	59	94
(Cytochrome_B);(UCR_TM)	2	43	69	47	85	24	479	100	70	91
(Cytochrome_B);(UcrQ)	1	44	73	48	85	20	158	100	71	92
(DAP3);(Ribosomal_S7)	1	34	35	42	43	16	697	100	3	81
(DAP3);(Ribosomal_S9)	1	49	50	49	50	5	636	98	4	100
(DEAD);(Helicase_C)	1	96	154	146	218	5	473	100	94	66
(DNA_RNApol_7kD);(RNA_pol_A_bac)	1	93	137	175	306	27	350	100	68	53
(DNA_RNApol_7kD);(RNA_pol_Rpb2_1)	1	174	265	174	305	18	239	100	57	100
(DNA_RNApol_7kD);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	179	269	179	312	31	657	100	58	100
(DNA_gyraseB);(HATPase_c)	1	29	36	31	45	10	492	100	94	94
(DNA_gyraseB_C);(DNA_topoisoIV)	1	29	68	30	70	34	312	96	78	97
(DNA_gyraseB_C);(DNA_topoisoIV)	2	29	64	30	70	35	213	95	75	97
(DNA_gyraseB_C);(Toprim)	1	21	35	23	45	34	1281	100	91	91
(DNA_photolyase);(FAD_binding_7)	1	47	79	47	79	12	1312	100	97	100
(DNA_pol3_beta);(DNA_pol3_beta_2)	1	58	101	60	103	11	627	100	98	97
(DNA_pol3_beta);(DNA_pol3_beta_3)	1	63	106	64	107	11	604	92	87	98
(DNA_pol3_beta_2);(DNA_pol3_beta_3)	1	58	101	60	103	11	675	100	98	97
(DNA_pol_B);(DNA_pol_B_exo1)	1	61	214	60	216	3	1083	100	99	102
(DNA_pol_B_palm);(DNA_pol_B_thumb)	1	39	557	39	623	2	513	100	100	100
(DNA_pol_B_palm);(DNA_pol_lambd_f)	1	32	581	32	609	2	398	100	100	100
(DNA_pol_lambd_f);(HHH_8)	1	23	522	27	583	20	200	100	100	85
(DNA_topoisoIV);(Toprim)	1	38	79	44	94	11	316	96	80	86
(DPPIV_N);(Peptidase_S9)	1	46	164	55	179	16	1537	100	95	84
(DPPIV_N);(Peptidase_S9)	2	43	164	55	179	16	332	85	90	78
(DUF1968);(V-set)	1	87	138	226	412	13	149	96	96	38
(DUF1968);(V-set)	2	26	32	226	412	12	159	0	19	12
(DUF3439);(LRR_8)	1	38	43	53	60	10	637	100	91	72
(DUF4976);(Sulfatase)	1	31	41	31	41	1	1972	100	93	100
(DUF4982);(Glyco_hydro_2_C)	1	20	29	22	32	11	474	100	97	91
(DUF5110);(Glyco_hydro_31)	1	27	104	27	104	1	1154	100	90	100
(DXP_redisom_C);(DXPR_C)	1	24	75	24	75	26	1568	100	100	100
(DXP_redisom_C);(DXP_reductoisom)	1	24	75	24	75	22	588	100	100	100
(DXP_reductoisom);(DXPR_C)	1	24	75	24	75	22	923	100	100	100
(Dala_Dala_lig_C);(Dala_Dala_lig_N)	1	30	56	30	58	10	943	100	100	100
(DapB_C);(DapB_N)	1	22	35	22	35	14	1223	100	100	100
(Dimerisation);(Methyltransf_2)	1	28	67	28	67	15	728	99	100	100
(Dimerisation2);(Methyltransf_2)	1	21	33	21	33	9	1089	76	94	100
(Dynamin_M);(Dynamin_N)	1	34	41	34	42	1	1440	100	85	100
(Dynamin_M);(GED)	1	22	24	22	24	6	2980	100	79	100
(E1-E2_ATPase);(Hydrolase)	1	41	78	68	171	15	722	100	72	60
(E1_dh);(Transket_pyr)	1	24	75	24	75	13	818	100	99	100
(E1_dh);(Transket_pyr)	2	23	73	24	75	13	1247	100	99	96
(EF-hand_1);(EF-hand_7)	1	22	27	67	85	5	409	81	74	33
(EF-hand_1);(S_100)	1	75	176	76	177	4	471	98	65	99
(EF-hand_7);(IQ)	1	81	88	94	106	3	643	99	69	86
(EFG_C);(EFG_IV)	1	26	37	30	43	5	457	100	84	87
(EFG_C);(Ribosomal_L11_N)	1	46	49	55	63	14	220	100	10	84
(EFTUD2);(WD40)	1	34	34	34	34	13	272	100	15	100
(EFTUD2);(WD40)	2	26	26	34	34	20	434	100	12	76
(EIF_2_alpha);(GTP_EFTU_D2)	1	39	39	40	40	21	458	92	36	98
(ELFV_dehydrog);(ELFV_dehydrog_N)	1	47	77	47	77	2	612	100	81	100
(ELFV_dehydrog);(ELFV_dehydrog_N)	2	30	44	47	77	17	233	100	75	64
(EMG1);(Ribosomal_S7)	1	26	26	30	30	70	320	100	4	87
(ERCC3_RAD25_C);(Tfb5)	1	33	36	35	38	27	509	100	36	94
(Endonuclease_NS);(Phosphodiest)	1	25	51	28	64	39	768	100	94	89
(Enolase_C);(Enolase_N)	1	39	87	39	87	40	644	94	99	100
(Enolase_C);(Enolase_N)	2	39	87	39	87	40	1493	100	100	100
(F-box-like);(Skp1)	1	27	37	27	38	13	956	100	86	100
(FAD_binding_2);(Succ_DH_flav_C)	1	22	59	24	93	12	2744	100	97	92
(FAD_binding_5);(Fer2_2)	1	20	61	19	70	16	214	100	100	105
(FAD_binding_6);(NAD_binding_1)	1	50	74	52	85	3	747	100	100	96
(FAT);(PI3_PI4_kinase)	1	70	73	71	79	7	521	100	44	99
(FATC);(PI3_PI4_kinase)	1	75	78	76	84	15	1529	100	44	99
(FERM_C);(FERM_M)	1	37	93	40	96	8	439	100	100	92
(FERM_C);(FERM_N)	1	33	89	38	94	11	289	100	100	87
(FERM_M);(FERM_N)	1	37	93	42	99	8	482	100	100	88
(FG-GAP);(Integrin_alpha2)	1	40	60	40	63	9	229	100	82	100
(FG-GAP);(Integrin_beta)	1	49	80	51	83	27	261	90	74	96
(FGGY_C);(FGGY_N)	1	40	86	40	87	8	1886	99	98	100
(Oxidored_q2);(Oxidored_q3)	1	95	100	95	100	12	2633	100	25	100
(Oxidored_q2);(Oxidored_q4)	1	90	95	93	98	13	402	100	26	97
(Oxidored_q2);(Proton_antipo_M)	1	97	102	97	102	9	1587	100	25	100
(Oxidored_q3);(Oxidored_q4)	1	94	99	95	100	12	1609	100	24	99
(Oxidored_q3);(Proton_antipo_M)	1	90	95	93	98	12	610	100	26	97
(Oxidored_q4);(Oxidored_q6)	1	54	59	60	65	25	367	100	22	90
(PARP);(PARP_reg)	1	26	86	30	96	33	1217	100	97	87
(PBP);(RF-1)	1	44	49	53	58	63	600	100	16	83
(PBP);(Ribosomal_L18p)	1	55	60	55	60	4	473	97	15	100
(PBP_dimer);(Transpeptidase)	1	49	145	50	150	11	958	100	94	98
(PCNA_C);(PCNA_N)	1	90	130	95	135	9	857	98	92	95
(PCNA_C);(PCNA_N)	2	84	123	95	135	11	662	88	70	88
(PDCD9);(Ribosomal_L17)	1	54	59	54	59	75	360	100	15	100
(PDCD9);(Ribosomal_L2)	1	52	57	54	59	73	370	100	16	96
(PDCD9);(Ribosomal_L23)	1	54	59	54	59	75	518	100	15	100
(PDZ_2);(Trypsin_2)	1	24	40	36	67	16	264	100	95	67
(PGM_PMM_I);(PGM_PMM_II)	1	27	74	28	87	10	808	100	96	96
(PGM_PMM_I);(PGM_PMM_III)	1	25	71	27	86	9	473	100	96	93
(PGM_PMM_II);(PGM_PMM_III)	1	25	71	27	86	9	1214	100	96	93
(PGM_PMM_III);(PGM_PMM_IV)	1	25	74	25	78	3	688	100	99	100
(PI3K_C2);(PI3Ka)	1	21	140	23	236	28	811	100	98	91
(PI3_PI4_kinase);(PI3Ka)	1	32	164	35	264	2	1066	99	96	91
(PK);(PK_C)	1	62	123	62	123	12	1402	100	98	100
(PRO8NT);(SKIP_SNW)	1	34	34	36	36	32	262	100	12	94
(PROCN);(SKIP_SNW)	1	37	37	37	37	32	1359	100	11	100
(PROCN);(WD40)	1	31	31	37	37	7	237	100	13	84
(PROCN);(WD40)	2	29	29	37	37	10	187	100	10	78
(PROCT);(Sec63)	1	32	37	34	39	41	888	73	43	94
(PRY);(SPRY)	1	31	37	31	37	13	1208	92	84	100
(PSI);(Sema)	1	40	40	41	41	9	399	100	78	98
(PSII);(Ycf9)	1	36	84	36	91	25	438	100	23	100
(PSII_Ycf12);(Ycf9)	1	27	81	27	82	27	403	100	22	100
(PSI_8);(PSI_PsaH)	1	21	27	21	27	32	314	100	22	100
(PSI_PsaE);(PSI_PsaF)	1	28	33	55	61	36	245	100	24	51
(PSI_PsaF);(PSI_PsaJ)	1	59	70	59	70	28	651	100	33	100
(PapD_C);(PapD_N)	1	32	42	41	52	16	527	100	93	78
(Peptidase_M16);(Peptidase_M16_C)	1	97	166	102	182	7	888	99	74	95
(Peptidase_M16);(Peptidase_M16_M)	1	23	50	26	58	18	1262	100	80	88
(Peptidase_M16);(UCR_14kD)	1	41	60	44	69	25	363	80	60	93
(Peptidase_M16);(UCR_TM)	1	47	79	48	83	22	462	100	68	98
(Peptidase_M16);(Ubiq-Cytc-red_N)	1	27	57	27	58	23	745	100	77	100
(Peptidase_M16_C);(Peptidase_M16_M)	2	23	50	28	60	7	3889	100	80	82
(Peptidase_M16_C);(UCR_TM)	1	42	68	48	83	24	300	100	68	88
(Peptidase_M16_C);(UCR_UQCRX_QCR9)	1	33	50	37	58	13	149	96	62	89
(Peptidase_M16_C);(Ubiq-Cytc-red_N)	1	27	56	27	59	19	679	100	77	100
(Peptidase_M16_C);(Ubiq-Cytc-red_N)	2	21	43	27	59	11	424	100	81	78
(Peptidase_M16_C);(UcrQ)	1	48	85	48	86	10	443	100	71	100
(Peptidase_M27);(Toxin_trans)	1	23	37	25	40	16	1091	100	95	92
(Peptidase_S9);(Peptidase_S9_N)	1	24	68	24	68	9	3361	100	99	100
(Phosphodiest);(Somatomedin_B)	1	23	49	24	52	28	514	100	94	96
(Photo_RC);(PRC)	1	27	153	27	156	31	211	100	88	100
(Photo_RC);(PRC)	2	27	153	27	156	31	166	95	90	100
(Photo_RC);(PRCH)	1	27	153	27	156	34	1584	100	92	100
(Photo_RC);(PRCH)	2	27	153	27	156	34	436	95	90	100
(Photo_RC);(PSII)	1	41	95	41	96	16	2194	100	45	100
(Photo_RC);(PSII)	2	37	91	41	96	54	780	100	48	90
(Photo_RC);(PsbH)	1	38	92	38	93	69	211	100	35	100
(Photo_RC);(PsbI)	1	39	93	39	94	63	724	100	26	100
(Photo_RC);(PsbJ)	1	28	82	29	84	55	146	100	26	97
(Photo_RC);(PsbL)	1	38	92	38	93	77	400	100	27	100
(Photo_RC);(PsbL)	2	38	92	38	93	77	254	100	27	100
(Photo_RC);(PsbM)	1	25	79	34	89	36	171	100	23	74
(Photo_RC);(PsbT)	1	38	92	38	93	44	217	100	28	100
(Photo_RC);(PsbT)	2	38	91	38	93	44	428	100	25	100
(Photo_RC);(PsbX)	1	37	91	37	92	34	218	100	26	100
(Pico_P1A);(Rhv)	1	129	214	135	223	16	390	98	43	96
(Pico_P1A);(Rhv)	2	112	185	135	223	35	543	99	40	83
(Pkinase);(Pkinase_C)	1	38	79	44	94	12	1250	100	100	86
(Pkinase);(Ribonuc_2-5A)	1	22	39	23	40	15	479	100	100	96
(Plug);(TonB_dep_Rec)	1	58	109	58	113	8	3427	100	97	100
(Plug_translocon);(Sec61_beta)	1	36	38	36	38	5	351	95	32	100
(Plug_translocon);(SecE)	1	41	43	42	44	5	277	95	30	98
(Pr_beta_C);(Proteasome)	1	87	379	91	387	20	652	93	77	96
(Pr_beta_C);(Proteasome)	2	24	91	91	387	74	155	100	86	26
(Pre-SET);(SET)	1	23	47	26	52	15	1739	100	100	88
(ProRS-C_1);(tRNA-synt_2b)	1	23	48	23	48	11	961	100	96	100
(Proteasome);(Proteasome_A_N)	1	123	419	124	425	20	227	100	80	99
(Proteasome);(Proteasome_A_N)	2	79	179	124	425	21	476	99	70	64
(Proteasome);(Proteasome_A_N)	3	55	342	124	425	23	156	99	87	44
(Proton_antipo_M);(Proton_antipo_N)	1	89	94	90	95	11	242	81	20	99
(PsaA_PsaB);(PSI_8)	1	59	70	59	70	28	529	100	30	100
(PsaA_PsaB);(PSI_PSAK)	1	56	64	59	70	12	549	100	20	95
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaE)	1	67	78	67	78	45	304	100	23	100
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaE)	2	52	58	67	78	50	365	98	22	78
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaF)	1	61	72	61	72	28	837	100	32	100
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaF)	2	59	70	61	72	28	921	100	34	97
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaH)	1	21	27	21	27	32	728	100	26	100
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaJ)	1	49	57	62	73	32	113	100	33	79
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaJ)	2	44	48	62	73	32	119	100	25	71
(PsaA_PsaB);(PsaD)	1	67	78	67	78	52	789	100	31	100
(PsaA_PsaB);(PsaD)	2	67	78	67	78	52	700	100	32	100
(PsaA_PsaB);(PsaL)	1	62	73	62	73	34	539	100	30	100
(PsaA_PsaB);(PsaL)	2	59	70	62	73	34	300	100	29	95
(PsaA_PsaB);(PsaM)	1	40	45	40	45	34	906	100	31	100
(PsaD);(PSI_PsaE)	1	61	72	63	74	50	146	100	24	97
(PsaD);(PsaL)	1	56	67	57	68	34	433	100	33	98
(PsaL);(PSI_8)	1	59	70	59	70	28	212	100	30	100
(PsaL);(PSI_PsaH)	1	21	27	21	27	32	1519	100	26	100
(PsaM);(PSI_8)	1	35	40	36	41	26	249	100	35	97
(PsbH);(PSII)	1	38	91	38	92	69	1496	100	35	100
(PsbH);(PsbX)	1	36	90	37	92	34	266	100	23	97
(PsbI);(PSII)	1	35	88	36	91	60	440	100	25	97
(PsbJ);(PSII_Ycf12)	1	22	75	22	77	28	159	100	20	100
(PsbJ);(PsbK)	1	29	83	29	84	32	135	100	23	100
(PsbK);(PSII)	1	39	93	39	94	50	738	100	34	100
(PsbK);(PSII_Ycf12)	1	27	80	27	82	31	504	100	24	100
(PsbK);(Ycf9)	1	36	90	36	91	25	264	100	20	100
(PsbL);(PSII)	1	38	92	38	93	72	605	100	28	100
(PsbL);(PsbM)	1	37	91	37	92	31	803	100	27	100
(PsbL);(PsbT)	1	38	92	38	93	31	592	100	25	100
(PsbM);(PsbT)	1	37	91	37	92	28	230	100	16	100
(PsbT);(PSII)	1	29	76	34	89	44	144	84	12	85
(PsbT);(PSII)	2	26	78	34	89	44	149	100	29	76
(PsbU);(PSII)	1	22	74	22	77	32	433	100	32	100
(PsbU);(PSII)	2	22	74	22	77	32	461	100	35	100
(Pyr_redox_2);(Pyr_redox_dim)	1	97	231	98	232	7	604	96	100	99
(Pyr_redox_2);(Pyr_redox_dim)	2	95	228	98	232	7	1155	100	100	97
(RF-1);(Ribosomal_L27A)	1	55	60	55	60	50	308	100	15	100
(RNA_POL_M_15KD);(RNA_pol_Rpb1_7)	1	97	205	98	225	40	319	100	62	99
(RNA_POL_M_15KD);(RNA_pol_Rpb2_2)	1	166	264	167	298	13	494	100	50	99
(RNA_POL_M_15KD);(TFIIF_alpha)	1	24	28	28	32	14	238	100	18	86
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_L)	1	122	148	229	353	22	1375	100	47	53
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_L)	2	30	40	229	353	40	148	100	52	13
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_N)	1	178	270	179	312	27	893	100	62	99
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb1_3)	1	198	255	230	359	14	601	100	36	86
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb1_3)	2	29	83	230	359	81	303	100	93	13
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	230	342	410	671	34	1194	100	51	56
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb2_6)	2	177	269	410	671	27	564	100	62	43
(RNA_pol_I_A49);(RNA_polI_A34)	1	34	38	34	38	42	1000	100	76	100
(RNA_pol_L);(RNA_pol_L_2)	1	37	38	37	38	20	863	100	55	100
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_2)	1	211	317	224	353	49	201	100	51	94
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_3)	1	185	242	229	358	28	185	100	36	81
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_3)	2	29	74	229	358	82	137	99	93	13
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	259	371	267	398	10	421	100	50	97
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb2_6)	2	222	351	267	398	49	246	100	54	83
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb1_2)	1	176	266	178	309	26	225	100	49	99
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb1_3)	1	178	281	179	312	22	538	100	50	99
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	175	267	178	309	26	252	100	62	98
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb8)	1	102	188	155	285	26	162	100	46	66
(RNA_pol_N);(RNA_pol_Rpb2_1)	1	145	234	175	306	20	230	100	66	83
(RNA_pol_N);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	179	269	179	312	33	1345	100	61	100
(RNA_pol_Rbc25);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	25	25	26	26	36	165	100	52	96
(RNA_pol_Rbc25);(RNA_pol_Rpb4)	1	29	29	29	29	28	628	100	59	100
(RNA_pol_Rpa2_4);(RNA_polI_A34)	1	31	35	32	36	89	245	100	74	97
(RNA_pol_Rpa2_4);(RNA_pol_Rpb1_4)	1	37	41	38	42	55	169	100	78	97
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb1_2)	1	72	86	115	156	15	121	100	50	63
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb1_5)	1	85	103	141	239	10	187	100	50	60
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	386	564	407	659	9	390	89	49	95
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	411	589	417	681	8	1543	89	49	99
(RNA_pol_Rpb1_1);(SHS2_Rpb7-N)	1	60	66	116	143	8	215	100	71	52
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r1_2)	1	101	173	101	214	10	325	99	51	100
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r2)	1	112	192	113	238	10	772	100	53	99
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r3)	1	102	174	104	218	10	605	100	51	98
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r4)	1	53	126	92	203	33	140	100	76	58
(RNA_pol_Rpb1_1);(TFIIE_alpha)	1	36	36	47	48	10	883	97	44	77
(RNA_pol_Rpb1_1);(TF_Zn_Ribbon)	1	47	51	51	56	21	272	100	31	92
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb1_3)	1	117	137	121	164	8	658	100	44	97
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb1_5)	1	120	139	132	176	12	216	100	46	91
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	414	596	416	682	19	1278	90	48	100
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	410	596	412	675	19	1398	89	49	100
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb6)	1	392	585	395	657	11	746	100	56	99
(RNA_pol_Rpb1_2);(SHS2_Rpb7-N)	1	37	41	163	223	26	193	100	80	23
(RNA_pol_Rpb1_2);(Sigma70_r3)	1	61	104	98	210	24	130	100	39	62
(RNA_pol_Rpb1_2);(TF_Zn_Ribbon)	1	50	54	50	55	21	459	100	30	100
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb1_4)	1	117	139	124	169	8	746	100	45	94
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb1_5)	1	121	140	130	172	8	218	100	47	93
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	418	595	418	683	8	1031	89	47	100
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb6)	1	165	233	192	312	16	173	100	48	86
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb8)	1	165	256	166	298	28	1427	100	58	99
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb1_5)	1	121	143	133	179	9	514	100	45	91
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_3)	1	214	332	414	674	9	251	99	57	52
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_45)	1	87	112	211	321	17	195	78	49	41
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	142	232	143	275	5	397	100	47	99
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	415	596	419	683	9	484	89	48	99
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb8)	1	30	30	138	268	25	130	100	73	22
(RNA_pol_Rpb1_4);(TFIIS_C)	1	97	182	124	256	36	534	95	52	78
(RNA_pol_Rpb1_4);(TFIIS_C)	2	27	31	124	256	24	273	90	48	22
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_3)	1	411	590	417	680	7	618	89	48	99
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_45)	1	220	302	229	356	16	177	78	44	96
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	62	146	142	272	13	207	100	50	44
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	182	281	418	681	19	386	100	53	44
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_6)	2	66	91	418	681	18	125	62	31	16
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	403	583	412	673	7	319	89	49	98
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb5_C)	1	179	291	179	312	27	1379	100	61	100
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb5_N)	1	76	119	163	293	31	124	100	65	47
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb6)	1	363	578	387	642	11	211	100	58	94
(RNA_pol_Rpb1_5);(TFIIS_C)	1	31	35	37	43	30	427	91	54	84
(RNA_pol_Rpb1_6);(RNA_pol_Rpb5_C)	1	98	207	99	227	35	579	100	61	99
(RNA_pol_Rpb1_6);(RNA_pol_Rpb6)	1	81	184	99	225	35	162	100	65	82
(RNA_pol_Rpb1_6);(RNA_pol_Rpb8)	1	46	52	89	205	33	348	100	29	52
(RNA_pol_Rpb1_7);(RNA_pol_Rpb2_2)	1	68	150	95	221	40	160	100	45	72
(RNA_pol_Rpb2_1);(RNA_pol_Rpb2_2)	1	63	75	82	126	14	488	100	32	77
(RNA_pol_Rpb2_1);(RNA_pol_Rpb2_3)	1	70	84	75	101	9	848	100	35	93
(RNA_pol_Rpb2_1);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	69	83	79	106	9	449	100	35	87
(RNA_pol_Rpb2_1);(Sigma70_r3)	1	78	151	90	189	14	326	100	56	87
(RNA_pol_Rpb2_1);(TFIIB)	1	49	53	49	54	12	358	100	26	100
(RNA_pol_Rpb2_2);(RNA_pol_Rpb2_3)	1	73	91	78	118	9	396	100	40	94
(RNA_pol_Rpb2_2);(RNA_pol_Rpb2_45)	1	40	54	51	80	25	141	100	41	78
(RNA_pol_Rpb2_2);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	22	26	23	35	78	139	100	31	96
(RNA_pol_Rpb2_2);(Sigma70_r1_2)	1	32	38	76	167	21	144	97	32	42
(RNA_pol_Rpb2_2);(TFIIF_alpha)	1	30	34	33	37	14	736	100	18	91
(RNA_pol_Rpb2_2);(TFIIS_C)	1	83	169	98	226	36	167	94	42	85
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_4)	1	31	37	33	47	61	370	100	43	94
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	27	33	29	43	34	283	100	42	93
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	45	59	84	126	56	384	100	39	54
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_6)	2	34	40	84	126	22	906	100	48	40
(RNA_pol_Rpb2_4);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	27	33	29	43	33	1114	100	42	93
(RNA_pol_Rpb2_4);(RNA_pol_Rpc4)	1	27	27	27	27	21	284	100	56	100
(RNA_pol_Rpb2_6);(RNA_polI_A34)	1	32	36	32	36	89	632	100	75	100
(RNA_pol_Rpb2_6);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	79	97	85	125	19	419	100	43	93
(RNA_pol_Rpb2_6);(Sigma70_r3)	1	104	184	104	218	14	562	100	54	100
(RNA_pol_Rpb2_6);(Sigma70_r4)	1	101	182	104	217	24	340	100	57	97
(RNA_pol_Rpb2_6);(TFIIB)	1	48	52	49	54	20	309	100	27	98
(RNA_pol_Rpb2_6);(TF_Zn_Ribbon)	1	50	54	50	55	21	663	100	26	100
(RNA_pol_Rpb2_7);(RNA_pol_Rpb6)	1	222	312	390	648	11	209	100	48	57
(RNA_pol_Rpb2_7);(S1)	1	25	27	63	77	25	189	100	41	40
(RNA_pol_Rpb2_7);(SHS2_Rpb7-N)	1	95	104	160	218	7	158	100	59	59
(RNA_pol_Rpb2_7);(Sigma70_r3)	1	94	174	99	212	19	228	100	56	95
(RNA_pol_Rpb4);(S1)	1	108	127	109	166	8	601	100	37	99
(RNA_pol_Rpb4);(SHS2_Rpb7-N)	1	138	153	138	194	8	757	100	41	100
(RNA_pol_Rpb5_C);(RNA_pol_Rpb5_N)	1	37	41	38	42	29	305	100	32	97
(RNA_pol_Rpb6);(SHS2_Rpb7-N)	1	170	191	171	232	7	369	99	49	99
(RNase_H);(RVT_connect)	1	47	318	47	353	32	426	100	97	100
(RNase_H);(RVT_thumb)	1	47	315	47	345	32	607	90	88	100
(RNase_PH);(RNase_PH_C)	1	51	69	51	70	3	499	100	87	100
(RRM_4);(SKIP_SNW)	1	30	30	31	31	32	249	100	10	97
(RVT_1);(RVT_connect)	1	48	319	48	354	38	874	100	97	100
(RVT_1);(RVT_connect)	2	47	317	48	354	37	344	100	97	98
(RVT_1);(RVT_connect)	3	45	313	48	354	37	121	100	98	94
(RVT_1);(RVT_thumb)	1	47	316	48	354	35	242	100	97	98
(RVT_connect);(RVT_thumb)	1	47	326	47	353	35	380	100	97	100
(RVT_connect);(RVT_thumb)	2	28	168	47	353	81	388	100	97	60
(Ras);(RhoGEF)	1	21	35	22	36	16	1154	100	100	95
(Ras);(Xpo1)	1	22	82	23	83	12	436	98	66	96
(RasGEF);(RasGEF_N)	1	20	72	21	80	10	738	100	99	95
(RbpA);(Sigma70_r1_2)	1	21	25	21	26	41	485	100	36	100
(RbpA);(Sigma70_r2)	1	21	25	21	26	77	316	100	36	100
(Rhv);(VP4_2)	1	32	39	35	45	9	379	100	44	91
(Ribonuc_red_lgC);(Ribonuc_red_lgN)	1	23	78	26	86	6	1362	100	95	88
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L18)	1	241	250	246	259	11	954	90	18	98
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L28e)	1	112	112	126	126	14	167	84	9	89
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L30_N)	1	234	235	240	253	8	391	86	17	98
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L6e_N)	1	90	90	94	94	19	313	100	4	96
(Ribosom_S12_S23);(Ribosomal_S17)	1	36	125	77	196	27	217	100	37	47
(Ribosom_S12_S23);(Ribosomal_S30)	1	233	234	238	251	35	417	100	11	98
(Ribosomal_L10);(Ribosomal_L11)	1	162	174	313	330	6	168	100	17	52
(Ribosomal_L10);(Ribosomal_L11)	2	95	95	313	330	39	157	100	13	30
(Ribosomal_L11);(Ribosomal_L37)	1	23	24	23	24	10	982	100	12	100
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L20)	1	496	708	504	729	14	316	100	15	98
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L3)	1	494	706	768	1065	1	146	100	15	64
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L3)	2	237	276	768	1065	4	226	100	13	31
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L35Ae)	1	238	250	247	260	4	226	100	18	96
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L18)	1	206	215	211	224	27	225	100	14	98
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L27A)	1	227	228	228	241	30	1439	100	15	100
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L36e)	1	227	228	227	240	20	538	100	15	100
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L4)	1	234	235	235	248	30	201	100	18	100
(Ribosomal_L14);(Ribosomal_L19)	1	501	722	506	731	15	790	100	14	99
(Ribosomal_L14);(Ribosomal_L24e)	1	263	325	263	337	19	524	100	14	100
(Ribosomal_L14);(Ribosomal_L3)	1	582	833	715	1001	1	216	100	13	81
(Ribosomal_L14e);(Ribosomal_L18A)	1	207	208	248	261	8	122	100	19	83
(Ribosomal_L14e);(Ribosomal_L6e)	1	236	237	245	258	9	483	100	18	96
(Ribosomal_L15e);(Ribosomal_L36e)	1	234	247	243	256	20	527	100	17	96
(Ribosomal_L15e);(Ribosomal_L44)	1	216	256	228	301	25	159	100	23	95
(Ribosomal_L15e);(Ribosomal_L7Ae)	1	215	252	223	296	25	553	100	17	96
(Ribosomal_L16);(Ribosomal_L25p)	1	400	615	404	623	15	481	100	13	99
(Ribosomal_L16);(Ribosomal_L27)	1	90	180	322	505	24	248	100	9	28
(Ribosomal_L16);(Ribosomal_TL5_C)	1	91	195	93	268	15	408	100	13	98
(Ribosomal_L17);(Ribosomal_L22)	1	116	266	502	720	15	127	100	7	23
(Ribosomal_L17);(Ribosomal_L32p)	1	489	709	506	731	12	336	100	15	97
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L27A)	1	239	275	245	318	18	770	100	13	98
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L28e)	1	121	121	122	122	14	222	100	10	99
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L30)	1	214	223	217	230	38	249	100	14	99
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L4)	1	251	318	258	329	18	182	100	14	97
(Ribosomal_L18A);(Ribosomal_L30_N)	1	234	235	244	257	13	170	100	18	96
(Ribosomal_L18p);(Ribosomal_L27)	1	44	49	363	566	80	673	100	16	12
(Ribosomal_L18p);(Ribosomal_L27)	2	43	124	363	566	42	115	100	6	12
(Ribosomal_L19);(Ribosomal_L3)	1	362	417	504	726	1	613	100	18	72
(Ribosomal_L19);(Ribosomal_L3)	2	124	287	504	726	2	717	100	10	25
(Ribosomal_L2);(Ribosomal_L2_C)	1	28	28	30	34	18	1171	100	29	93
(Ribosomal_L2);(Ribosomal_L37ae)	1	241	281	242	315	20	473	100	12	100
(Ribosomal_L20);(Ribosomal_L21p)	1	475	688	503	729	14	967	100	15	94
(Ribosomal_L20);(Ribosomal_L21p)	2	25	33	503	729	44	889	100	6	5
(Ribosomal_L20);(Ribosomal_L32p)	1	171	188	475	694	18	115	100	12	36
(Ribosomal_L21e);(Ribosomal_L29e)	1	208	209	208	221	27	481	100	13	100
(Ribosomal_L21e);(Ribosomal_L5e)	1	227	253	229	302	21	816	100	11	99
(Ribosomal_L22);(Ribosomal_L32p)	1	502	723	504	726	11	468	100	15	100
(Ribosomal_L22);(TGS)	1	55	60	55	60	1	349	100	15	100
(Ribosomal_L22);(Tim44)	1	54	59	55	60	86	187	100	15	98
(Ribosomal_L23);(Ribosomal_L29)	1	681	952	697	988	20	431	100	14	98
(Ribosomal_L23);(Ribosomal_L39)	1	238	297	244	315	31	230	100	12	98
(Ribosomal_L24e);(Ribosomal_L3)	1	251	310	252	325	19	248	100	15	100
(Ribosomal_L26);(Ribosomal_L4)	1	241	242	255	326	31	188	100	19	95
(Ribosomal_L27A);(Ribosomal_L35p)	1	472	680	492	718	18	782	100	13	96
(Ribosomal_L27A);(Ribosomal_L36e)	1	218	219	223	236	28	232	100	15	98
(Ribosomal_L27e);(Ribosomal_L34e)	1	225	226	230	243	22	340	100	15	98
(Ribosomal_L27e);(Ribosomal_L7Ae)	1	224	225	226	239	22	293	100	15	99
(Ribosomal_L28);(Ribosomal_L9_N)	1	390	573	398	584	5	234	100	12	98
(Ribosomal_L28e);(Ribosomal_L32e)	1	126	126	128	128	13	715	100	10	98
(Ribosomal_L28e);(Ribosomal_L4)	1	127	127	128	128	13	716	100	10	99
(Ribosomal_L2_C);(Ribosomal_L37ae)	1	240	280	242	315	30	835	100	12	99
(Ribosomal_L2_C);(Ribosomal_L9_C)	1	148	148	206	213	29	150	100	14	72
(Ribosomal_L2_C);(Ribosomal_S6)	1	32	50	295	461	16	124	100	20	11
(Ribosomal_L3);(Ribosomal_L32p)	1	42	45	54	59	69	127	100	22	78
(Ribosomal_L31);(Ribosomal_L5)	1	248	397	262	424	5	239	100	15	95
(Ribosomal_L31);(Ribosomal_L5_C)	1	237	386	264	426	5	725	100	13	90
(Ribosomal_L31);(Ribosomal_S13)	1	170	311	201	353	18	378	100	14	85
(Ribosomal_L31);(Ribosomal_S19)	1	188	305	206	334	5	401	100	15	91
(Ribosomal_L32p);(TGS)	1	53	58	55	60	1	247	100	16	96
(Ribosomal_L33);(Ribosomal_L35p)	1	324	493	469	665	4	140	100	11	69
(Ribosomal_L34e);(Ribosomal_L7Ae)	1	229	230	231	244	23	224	100	15	99
(Ribosomal_L35Ae);(Ribosomal_L6e)	1	237	238	245	258	10	598	100	18	97
(Ribosomal_L36e);(Ribosomal_L7Ae)	1	196	197	201	214	20	253	100	20	98
(Ribosomal_L37ae);(Ribosomal_L7Ae)	1	227	240	232	245	26	161	100	15	98
(Ribosomal_L37ae);(Ribosomal_S3Ae)	1	33	35	44	57	59	131	100	20	75
(Ribosomal_L37e);(Ribosomal_L39)	1	227	288	237	310	33	191	100	11	96
(Ribosomal_L4);(Ribosomal_L50)	1	62	67	63	68	12	201	100	15	98
(Ribosomal_L40e);(Ribosomal_L6)	1	205	206	206	219	2	384	100	15	100
(Ribosomal_L5);(Stm1_N)	1	26	27	26	39	42	450	100	30	100
(Ribosomal_L5_C);(Ribosomal_L5e)	1	235	268	244	318	28	218	100	13	96
(Ribosomal_L5_C);(Ribosomal_S13)	1	237	391	502	709	24	264	100	11	47
(Ribosomal_L5_C);(Ribosomal_S13)	2	103	128	502	709	15	232	100	9	21
(Ribosomal_L5_C);(Ribosomal_S13)	3	78	78	502	709	34	156	100	1	16
(Ribosomal_L7Ae);(Ribosomal_S13_N)	1	52	52	93	93	31	119	100	0	56
(Ribosomal_L7Ae);(Ribosomal_S15)	1	85	85	137	137	1	230	100	1	62
(Ribosomal_L7Ae);(Ribosomal_S27)	1	224	225	229	242	20	535	100	12	98
(Ribosomal_L7Ae);(S10_plectin)	1	77	77	214	227	24	184	100	10	36
(Ribosomal_L7Ae);(S4)	1	30	30	34	34	41	210	100	3	88
(Ribosomal_L7Ae);(WD40)	1	29	29	43	43	43	217	100	3	67
(Ribosomal_L7Ae);(WD40)	2	22	22	43	43	48	186	100	5	51
(Ribosomal_L9_C);(Ribosomal_S6)	1	117	121	167	173	27	164	100	16	70
(Ribosomal_S10);(Ribosomal_S14)	1	697	1016	704	1036	8	779	100	15	99
(Ribosomal_S10);(Ribosomal_S9)	1	577	873	696	1014	11	153	100	11	83
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S18)	1	256	535	397	691	48	265	100	8	64
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S21)	1	311	347	322	364	12	1035	100	14	97
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S26e)	1	220	233	220	233	38	1089	100	11	100
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S28e)	1	134	134	141	141	30	262	100	7	95
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S3Ae)	1	273	282	275	288	22	731	100	12	99
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S7)	1	483	757	614	922	17	209	100	14	79
(Ribosomal_S13);(Ribosomal_S19)	1	644	957	669	998	12	384	100	11	96
(Ribosomal_S13);(Ribosomal_S19e)	1	247	260	254	267	20	434	100	13	97
(Ribosomal_S13);(Ribosomal_S25)	1	222	235	239	252	19	189	100	12	93
(Ribosomal_S13);(Stm1_N)	1	24	25	26	39	66	314	100	32	92
(Ribosomal_S13_N);(Ribosomal_S27e)	1	269	278	273	286	26	482	100	12	99
(Ribosomal_S13_N);(Ribosomal_S7e)	1	247	248	260	273	10	184	100	12	95
(Ribosomal_S13_N);(Ribosomal_S8)	1	254	255	265	278	24	187	100	11	96
(Ribosomal_S14);(Ribosomal_S19)	1	268	302	306	356	25	151	100	14	88
(Ribosomal_S14);(S10_plectin)	1	221	234	226	239	20	289	100	11	98
(Ribosomal_S17);(Ribosomal_S8)	1	386	674	689	1000	20	136	100	14	56
(Ribosomal_S17);(Ribosomal_S8)	2	152	153	689	1000	24	128	100	14	22
(Ribosomal_S17);(Ribosomal_S8e)	1	205	206	268	281	26	135	97	12	76
(Ribosomal_S17_N);(Ribosomal_S8e)	1	262	263	267	280	33	265	100	11	98
(Ribosomal_S17e);(Ribosomal_S2)	1	222	231	225	238	27	671	100	12	99
(Ribosomal_S17e);(WD40)	1	218	219	220	233	9	136	100	12	99
(Ribosomal_S18);(Ribosomal_S21)	1	146	155	315	355	12	184	100	10	46
(Ribosomal_S18);(Ribosomal_S21)	2	135	144	315	355	37	204	100	17	43
(Ribosomal_S18);(Ribosomal_S6)	1	471	770	477	789	10	803	100	11	99
(Ribosomal_S19);(Stm1_N)	1	25	26	26	39	51	165	100	27	96
(Ribosomal_S19e);(Ribosomal_S9)	1	243	256	255	268	18	206	100	13	95
(Ribosomal_S2);(Ribosomal_S21e)	1	225	234	226	239	3	1198	100	12	100
(Ribosomal_S2);(Ribosomal_S8)	1	94	355	138	406	40	260	100	6	68
(Ribosomal_S21e);(Ribosomal_S5)	1	231	232	233	246	7	220	100	12	99
(Ribosomal_S21e);(Ribosomal_S5_C)	1	236	237	236	249	7	526	100	12	100
(Ribosomal_S21e);(Ribosomal_S8)	1	228	241	235	248	7	248	100	13	97
(Ribosomal_S24e);(S4)	1	263	276	276	289	9	181	94	12	95
(Ribosomal_S24e);(S4)	2	154	155	276	289	17	172	100	10	56
(Ribosomal_S25);(Ribosomal_S7)	1	238	251	239	252	19	589	100	12	100
(Ribosomal_S26e);(Ribosomal_S28e)	1	132	138	204	217	35	141	100	12	65
(Ribosomal_S26e);(Ribosomal_S3Ae)	1	216	225	220	233	32	244	100	12	98
(Ribosomal_S28e);(Ribosomal_S7)	1	283	284	285	298	30	982	100	12	99
(Ribosomal_S30);(Ribosomal_S4)	1	209	209	209	209	34	380	100	11	100
(Ribosomal_S30);(S4)	1	222	223	228	241	35	155	100	13	97
(Ribosomal_S3_C);(Ribosomal_S5)	1	165	183	592	904	19	133	100	12	28
(Ribosomal_S4);(Ribosomal_S5_C)	1	305	597	651	960	12	143	100	18	47
(Ribosomal_S4);(Ribosomal_S5_C)	2	213	213	651	960	31	220	70	8	33
(Ribosomal_S4);(Ribosomal_S6)	1	30	76	36	119	27	150	1	0	83
(Ribosomal_S4);(Ribosomal_S8)	1	80	80	198	198	34	121	74	9	40
(Ribosomal_S4);(S4)	1	41	41	44	46	7	631	100	46	93
(Ribosomal_S5_C);(Ribosomal_S8)	1	437	741	694	1016	16	466	100	15	63
(Ribosomal_S5_C);(Ribosomal_S8)	2	241	242	694	1016	24	342	100	13	35
(Ribosomal_S7);(Ribosomal_S9)	1	702	1007	727	1055	17	308	100	13	97
(Ribosomal_S7e);(Ribosomal_S8)	1	270	283	270	283	10	471	100	11	100
(Ribosomal_S9);(WD40)	1	224	225	264	277	10	255	100	12	85
(Ribosomal_S9);(WD40)	2	29	29	264	277	40	294	100	3	11
(Ricin_B_lectin);(RIP)	1	21	48	21	50	19	377	100	98	100
(Rieske);(Ring_hydroxyl_A)	1	22	39	22	65	12	1187	100	100	100
(RuBisCO_large);(RuBisCO_large_N)	1	48	108	50	110	11	1516	99	89	96
(RuBisCO_large);(RuBisCO_large_N)	2	38	88	50	110	11	1132	100	95	76
(RuBisCO_large);(RuBisCO_small)	1	24	62	24	62	26	1357	98	82	100
(RuBisCO_large);(RuBisCO_small)	2	22	60	24	62	26	837	93	80	92
(RuBisCO_large_N);(RuBisCO_small)	1	23	61	24	62	26	327	95	80	96
(S-AdoMet_synt_C);(S-AdoMet_synt_M)	1	31	83	31	83	30	305	100	99	100
(S-AdoMet_synt_C);(S-AdoMet_synt_M)	2	31	83	31	83	30	1768	100	99	100
(S-AdoMet_synt_C);(S-AdoMet_synt_N)	1	31	83	31	83	36	453	100	99	100
(S-AdoMet_synt_C);(S-AdoMet_synt_N)	2	31	83	31	83	36	1588	100	99	100
(S-AdoMet_synt_M);(S-AdoMet_synt_N)	1	31	83	31	83	30	151	100	99	100
(S-AdoMet_synt_M);(S-AdoMet_synt_N)	2	31	83	31	83	30	922	100	99	100
(S1);(TF_Zn_Ribbon)	1	32	36	32	36	29	513	100	31	100
(S4);(WD40)	1	31	31	36	36	38	207	100	3	86
(S4);(WD40)	2	22	22	36	36	7	185	100	0	61
(SKIP_SNW);(WD40)	1	34	34	35	35	32	247	97	12	97
(SNARE);(Synaptobrevin)	1	27	30	27	31	25	682	97	70	100
(SRP54);(SRP54_N)	1	45	69	49	73	8	764	100	97	92
(SSL_OB);(Stap_Strp_tox_C)	1	34	39	36	41	11	1128	97	97	94
(Sec61_beta);(SecE)	1	20	20	34	36	17	147	100	25	59
(Sec61_beta);(SecY)	1	36	38	36	38	17	460	95	32	100
(SecE);(SecY)	1	55	57	57	59	7	1311	96	39	96
(Semialdhyde_dh);(Semialdhyde_dhC)	1	41	80	41	81	7	903	100	100	100
(Shikimate_DH);(Shikimate_dh_N)	1	25	34	25	34	12	270	97	97	100
(Sigma70_r1_2);(Sigma70_r2)	1	42	55	43	60	27	734	100	58	98
(Sigma70_r2);(Sigma70_r3)	1	26	28	38	54	51	135	100	39	68
(Skp1);(Skp1_POZ)	1	37	49	38	54	27	135	100	82	97
(Skp1_POZ);(VHL_C)	1	22	61	23	63	30	122	100	90	96
(Skp1_POZ);(ubiquitin)	1	46	88	47	90	22	667	98	78	98
(Sld5);(SLD5_C)	1	23	24	23	24	26	493	100	50	100
(Sod_Fe_C);(Sod_Fe_N)	1	90	180	90	180	5	267	96	89	100
(Sod_Fe_C);(Sod_Fe_N)	2	81	171	90	180	12	1158	100	98	90
(Spt4);(Spt5-NGN)	1	22	22	22	22	19	862	100	50	100
(Ssl1);(Tfb4)	1	26	29	32	35	28	491	100	41	81
(Stap_Strp_tox_C);(Stap_Strp_toxin)	1	51	77	56	86	6	1150	99	94	91
(SusD_RagB);(SusD-like_3)	1	41	47	41	47	1	2941	100	91	100
(Synaptobrevin);(Syntaxin)	1	27	30	27	31	4	763	97	70	100
(TAF);(TFIID-31kDa)	1	28	28	28	28	39	1655	100	18	100
(TAF4);(TFIID_20kDa)	1	21	21	21	21	15	1834	100	10	100
(TBP);(TFIIB)	1	48	54	49	55	5	346	100	39	98
(TBP);(TFIIB)	2	33	37	49	55	84	254	100	41	67
(TFIIA);(TFIIA_gamma_C)	1	25	31	28	34	10	1129	100	32	89
(TFIIA);(TFIIA_gamma_N)	1	28	34	28	34	9	1167	100	38	100
(TFIIE_beta);(TFIIF_beta)	1	24	28	30	34	65	393	100	32	80
(THF_DHG_CYH);(THF_DHG_CYH_C)	1	21	42	21	42	17	1616	100	100	100
(TNF);(TNFR_c6)	1	26	31	29	37	7	341	87	81	90
(TNF);(TNFR_c6)	2	25	30	29	37	7	263	83	77	86
(TPP_enzyme_C);(TPP_enzyme_M)	1	67	179	68	180	9	685	100	98	99
(TPP_enzyme_C);(TPP_enzyme_N)	1	75	208	75	208	10	876	99	98	100
(TPP_enzyme_M);(TPP_enzyme_N)	1	66	169	68	180	9	313	100	98	97
(TPP_enzyme_M);(TPP_enzyme_N)	2	32	106	68	180	12	318	98	99	47
(TPR_1);(TPR_11)	1	31	41	39	50	4	344	98	90	79
(Terpene_synth);(Terpene_synth_C)	1	26	78	26	78	15	1032	100	100	100
(TetR_C_6);(TetR_N)	1	25	41	26	42	6	405	100	100	96
(Tfb2);(Tfb4)	1	26	29	31	34	20	1145	100	41	84
(Thiolase_C);(Thiolase_N)	1	67	139	67	141	2	2772	99	97	100
(Thiolase_C);(Thiolase_N)	2	62	132	67	141	2	398	99	98	93
(Thrombin_light);(Trypsin)	1	121	470	121	483	66	987	100	98	100
(Topoisom_bac);(Toprim)	1	22	37	22	40	17	1515	100	100	100
(Toxin_R_bind_C);(Toxin_R_bind_N)	1	58	95	64	101	12	1190	100	95	91
(Transket_pyr);(Transketolase_C)	1	41	118	41	123	7	303	99	98	100
(Transket_pyr);(Transketolase_C)	2	37	87	41	123	8	1141	100	99	90
(Transket_pyr);(Transketolase_N)	1	20	65	20	70	22	875	98	100	100
(Transket_pyr);(Transketolase_N)	2	20	65	20	70	22	1610	100	100	100
(Transketolase_C);(Transketolase_N)	1	20	65	20	70	8	247	98	100	100
(Tubulin);(Tubulin_C)	1	214	460	217	463	1	586	100	67	99
(UCR_14kD);(UcrQ)	1	45	81	45	82	20	448	100	73	100
(UCR_TM);(UCR_UQCRX_QCR9)	1	46	72	47	82	24	603	100	67	98
(UCR_TM);(UcrQ)	1	47	73	48	83	20	558	100	66	98
(UCR_hinge);(UcrQ)	1	44	74	45	82	20	220	100	70	98
(UDPG_MGDP_dh);(UDPG_MGDP_dh_C)	1	27	43	27	43	12	472	100	100	100
(UDPG_MGDP_dh);(UDPG_MGDP_dh_N)	1	27	43	27	43	19	788	100	100	100
(UDPG_MGDP_dh);(UDPG_MGDP_dh_N)	2	25	40	27	43	20	262	98	100	93
(UDPG_MGDP_dh_C);(UDPG_MGDP_dh_N)	1	24	34	27	43	13	275	100	100	89
(UQ_con);(zf-RING_2)	1	20	20	20	20	19	524	95	30	100
(Utp12);(Utp13)	1	36	36	36	36	36	1692	56	8	100
(Utp12);(Utp13)	2	30	30	36	36	31	320	80	7	83
(Utp12);(Utp21)	1	35	35	35	35	31	1683	54	6	100
(Utp12);(Utp21)	2	30	30	35	35	34	227	77	7	86
(Utp13);(Utp21)	1	34	34	35	35	34	359	56	6	97
(UvrD_C);(UvrD-helicase)	1	26	35	27	37	11	1951	100	83	96
(V-ATPase_C);(V-ATPase_G)	1	20	21	24	25	31	298	100	10	83
(V-ATPase_G);(vATP-synt_E)	1	32	33	32	33	31	1566	100	6	100
(V-set);(V-set_2)	1	305	355	327	377	14	810	99	88	93
(V-set);(WD40)	1	97	100	173	176	35	290	100	6	56
(V-set);(WD40)	2	92	95	173	176	62	133	100	6	53
(V-set);(WD40)	3	65	65	173	176	26	108	100	6	38
(V_ATPase_I);(V-ATPase_C)	1	23	23	24	24	36	390	100	0	96
(XPG_I);(XPG_N)	1	30	49	30	51	16	2084	100	96	100
(cNMP_binding);(HTH_Crp_2)	1	47	96	62	114	8	368	99	98	76
(dsrm);(MRP-S32)	1	55	60	55	60	68	658	100	17	100
(dsrm);(Ribosomal_L13)	1	57	62	64	69	25	158	100	15	89
(eIF-1a);(Ribosom_S12_S23)	1	36	36	42	42	20	351	100	22	86
(eIF-1a);(Ribosomal_S30)	1	22	22	25	25	19	314	100	18	88
(eIF-6);(NOGCT)	1	30	30	30	30	35	751	100	50	100
(eIF-6);(Ribosomal_L14)	1	51	51	55	55	66	743	100	49	93
(eIF-6);(Ribosomal_L24e)	1	41	41	51	51	29	179	100	56	80
(eIF-6);(Ribosomal_L3)	1	48	48	54	54	57	214	100	52	89
(ketoacyl-synt);(Ketoacyl-synt_C)	1	104	174	108	183	11	2026	99	88	96
(ketoacyl-synt);(Ketoacyl-synt_C)	2	91	164	108	183	4	526	96	90	84
(malic);(Malic_M)	1	21	41	21	41	13	1165	100	100	100
(peroxidase);(Peroxidase_ext)	1	23	73	23	73	28	2975	100	100	100
(ribosomal_L24);(Tim44)	1	53	58	53	58	86	358	100	16	100
(tRNA_anti-codon);(tRNA-synt_2)	1	55	98	55	98	11	322	93	99	100
(tRNA_anti-codon);(tRNA-synt_2)	2	51	93	55	98	11	202	97	97	93
(ubiquitin);(UCH)	1	37	45	40	50	12	1034	98	91	92
(ubiquitin);(UQ_con)	1	50	58	83	97	25	622	97	55	60
(zf-C2H2);(zf-H2C2_2)	1	54	90	56	97	11	647	86	77	96
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_45)	1	45	59	48	76	44	348	100	39	94
(ATP-synt_A);(ATP-synt_B)	1	54	55	54	55	13	824	100	5	100
(ATP-synt_A);(ATP-synt_B)	2	51	52	54	55	16	1190	100	6	94
(ATP-synt_B);(OSCP)	1	28	29	39	40	16	161	100	7	72
(ATP-synt_B);(OSCP)	2	24	24	39	40	13	269	100	4	62
(PSP);(RRM_1)	1	24	24	24	24	35	688	67	21	100
(Secretin);(Secretin_N)	1	22	22	23	23	12	469	100	27	96
(NADHdh_A3);(Oxidored_q4)	1	65	65	67	67	12	319	100	18	97
(MWFE);(NADHdh)	1	70	70	70	70	20	1500	100	17	100
(MWFE);(Oxidored_q3)	1	60	60	69	69	14	238	100	15	87
(CHCH);(MWFE)	1	69	69	70	70	20	307	99	14	99
(GRIM-19);(MWFE)	1	66	66	66	66	20	291	100	18	100
(NDUFA12);(Oxidored_q6)	1	61	61	64	64	30	165	100	20	95
(NADHdh);(NADHdh_A3)	1	67	67	67	67	12	387	100	18	100
(GRIM-19);(NADHdh_A3)	1	57	57	63	63	15	546	100	21	90
(Complex1_30kDa);(ETC_C1_NDUFA5)	1	65	65	66	66	25	218	98	18	98
(Complex1_30kDa);(Complex1_LYR)	1	65	65	66	66	16	455	100	20	98
(NADH_dh_m_C1);(NDUF_C2)	1	51	51	51	51	57	844	100	18	100
(Complex1_49kDa);(zf-CHCC)	1	67	67	68	68	43	208	100	18	99
(Complex1_49kDa);(GRIM-19)	1	64	64	64	64	36	919	100	16	100
(NDUF_C2);(Ndufs5)	1	44	44	49	49	70	134	100	14	90
(NDUF_C2);(Proton_antipo_M)	1	65	65	66	66	9	182	100	18	98
(NDUF_C2);(Proton_antipo_M)	2	41	41	66	66	70	213	100	12	62
(NADH_dehy_S2_C);(NDUF_C2)	1	53	53	53	53	44	791	96	15	100
(NDUF_C2);(NDUFB10)	1	48	48	48	48	70	739	100	10	100
(2Fe-2S_thioredx);(Fer4_10)	1	20	20	20	20	62	458	100	35	100
(Ndufs5);(Oxidored_q3)	1	62	62	70	70	14	710	100	18	89
(Ndufs5);(Oxidored_q2)	1	70	70	70	70	18	478	100	17	100
(Ndufs5);(Proton_antipo_M)	1	68	68	68	68	16	692	100	18	100
(GRIM-19);(Ndufs5)	1	69	69	69	69	20	1129	100	17	100
(Fer4_10);(NADH_4Fe-4S)	1	20	20	20	20	68	303	95	30	100
(NADH_oxidored);(Oxidored_q5_N)	1	52	52	52	52	54	723	100	17	100
(NADH_oxidored);(NDUFB10)	1	45	45	52	52	71	317	100	11	87
(NADH-G_4Fe-4S_3);(zf-CHCC)	1	66	66	68	68	34	190	100	18	97
(ESSS);(NDUF_B5)	1	52	52	52	52	42	862	100	17	100
(ESSS);(Oxidored_q5_N)	1	55	55	55	55	1	943	100	16	100
(dNK);(ESSS)	1	35	35	45	45	79	145	100	11	78
(ESSS);(NDUFB10)	1	52	52	53	53	76	1058	100	17	98
(CHCH);(NADHdh)	1	51	51	66	66	76	225	100	18	77
(GRIM-19);(NADHdh)	1	70	70	70	70	34	563	100	17	100
(NDUF_B5);(NDUF_B6)	1	47	47	52	52	36	249	100	13	90
(NDUF_B5);(Proton_antipo_M)	1	53	53	53	53	16	508	100	17	100
(NDUF_B5);(Proton_antipo_M)	2	44	44	53	53	51	298	100	14	83
(Fer4_7);(NDUFA12)	1	55	55	65	65	35	167	82	22	85
(Fer4_7);(zf-CHCC)	1	65	65	68	68	40	227	100	18	96
(NDUF_B6);(PP-binding)	1	51	51	52	52	46	397	100	16	98
(GRIM-19);(Oxidored_q3)	1	66	66	69	69	14	470	100	18	96
(NADH5_C);(NDUF_B4)	1	64	64	65	65	13	590	89	14	98
(NDUF_B4);(Proton_antipo_M)	1	65	65	65	65	13	1021	100	18	100
(NDUF_B4);(Proton_antipo_M)	2	48	48	65	65	74	248	100	19	74
(Complex1_LYR);(NADH5_C)	1	64	64	68	68	15	511	100	19	94
(Complex1_LYR);(Proton_antipo_M)	1	48	48	65	65	15	124	79	12	74
(NADH5_C);(NDUF_B7)	1	62	62	67	67	16	643	53	13	93
(NDUFB10);(Proton_antipo_M)	1	63	63	63	63	7	479	100	19	100
(NDUFB10);(Proton_antipo_M)	2	47	47	63	63	74	472	100	19	75
(NDUFB10);(Proton_antipo_N)	1	49	49	63	63	58	278	100	18	78
(NADH5_C);(PP-binding)	1	56	56	67	67	18	129	50	7	84
(NADH5_C);(Tim17)	1	44	44	57	57	46	447	100	18	77
(NADH_dehy_S2_C);(Proton_antipo_M)	1	50	50	53	53	44	447	100	18	94
(NDUFB10);(Oxidored_q5_N)	1	49	49	63	63	54	164	100	18	78
(Complex1_LYR);(NDUF_B4)	1	49	49	49	49	74	466	100	12	100
(NDUF_B4);(NDUFB10)	1	49	49	60	60	73	376	100	18	82
(dNK);(NADH_dehy_S2_C)	1	52	52	53	53	44	403	100	15	98
(Complex1_LYR);(PP-binding)	1	99	107	102	110	9	603	100	23	97
(CHCH);(GRIM-19)	1	66	66	69	69	21	229	83	18	96
(CHCH);(GRIM-19)	2	23	23	69	69	16	442	100	26	33
(MMS1_N);(PHF5)	1	26	30	30	34	27	425	100	30	87
(MMS1_N);(SF3b10)	1	32	36	32	36	24	1145	100	33	100
(CPSF_A);(SF3b10)	1	24	28	29	33	24	391	100	39	83
(ATP_synt_H);(V_ATPase_I)	1	29	29	29	29	22	1618	100	0	100
(Complex1_51K);(NDUFV3)	1	47	47	47	47	64	906	100	15	100
(Complex1_51K);(ETC_C1_NDUFA4)	1	65	65	65	65	35	379	100	14	100
(CI-B14_5a);(NADH_4Fe-4S)	1	45	45	48	48	81	222	100	16	94
(2Fe-2S_thioredx);(NDUFV3)	1	47	47	47	47	63	623	100	15	100
(2Fe-2S_thioredx);(ETC_C1_NDUFA4)	1	27	27	61	61	35	217	100	19	44
(Complex1_LYR);(NDUF_B12)	1	57	57	62	62	15	250	100	14	92
(NADH_B2);(NDUF_B12)	1	59	59	60	60	6	702	100	14	98
(NADH5_C);(NDUF_B12)	1	61	61	63	63	18	476	95	10	97
(NDUF_B12);(Proton_antipo_M)	1	59	59	60	60	21	311	100	14	98
(NDUF_B12);(PP-binding)	1	58	58	62	62	38	377	100	14	94
(ETC_C1_NDUFA4);(Molybdopterin)	1	65	65	65	65	30	425	100	14	100
(ETC_C1_NDUFA4);(Molybdop_Fe4S4)	1	63	63	63	63	28	667	100	14	100
(ETC_C1_NDUFA4);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	62	62	64	64	35	180	79	11	97
(ETC_C1_NDUFA4);(Fer2_4)	1	62	62	63	63	35	536	100	15	98
(L51_S25_CI-B8);(Molybdopterin)	1	66	66	66	66	30	527	95	15	100
(L51_S25_CI-B8);(NADH_dhqG_C)	1	61	61	65	65	30	396	95	16	94
(CI-B14_5a);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	45	45	48	48	61	366	100	16	94
(Molybdopterin);(NDUFA12)	1	61	61	61	61	3	526	100	15	100
(Molybdop_Fe4S4);(NDUFA12)	1	36	36	59	59	35	144	100	17	61
(NDUF_B4);(NDUF_C2)	1	38	38	47	47	70	151	100	5	81
(NDUF_B5);(NDUF_C2)	1	46	46	46	46	70	521	100	13	100
(CI-B14_5a);(Complex1_49kDa)	1	48	48	48	48	81	1191	100	15	100
(NDUF_B4);(NDUF_B8)	1	56	56	56	56	13	1645	100	14	100
(Complex1_30kDa);(ETC_C1_NDUFA4)	1	65	65	65	65	35	440	100	14	100
(CI-B14_5a);(Complex1_30kDa)	1	48	48	48	48	81	297	100	15	100
(GRIM-19);(NDUF_B5)	1	28	28	48	48	79	117	100	14	58
(CI-B14_5a);(GRIM-19)	1	47	47	48	48	45	340	100	15	98
(NAD_binding_10);(Oxidored_q6)	1	23	23	23	23	32	287	96	26	100
(NDUF_B6);(NDUF_B7)	1	48	48	48	48	57	747	100	10	100
(NDUF_B6);(NDUFB10)	1	48	48	48	48	57	563	100	10	100
(ETC_C1_NDUFA4);(Fer4_7)	1	61	61	62	62	35	155	100	15	98
(NADH_B2);(NDUF_B7)	1	59	59	59	59	6	316	100	14	100
(NDUF_B7);(NDUF_B8)	1	54	54	56	56	22	818	100	13	96
(NDUF_B7);(NDUFB10)	1	55	55	58	58	7	241	100	15	95
(NADH_B2);(NADH5_C)	1	59	59	60	60	6	960	100	14	98
(NADH_B2);(Proton_antipo_M)	1	60	60	60	60	6	640	100	13	100
(NADH_B2);(PP-binding)	1	44	44	52	52	63	139	100	11	85
(NDUF_B8);(Proton_antipo_M)	1	56	56	56	56	20	773	100	14	100
(NDUF_B8);(Proton_antipo_M)	2	52	52	56	56	22	282	100	15	93
(NADH5_C);(NDUF_B8)	1	55	55	56	56	18	925	49	5	98
(NDUF_B8);(PP-binding)	1	33	33	56	56	22	112	100	6	59
(NDUF_B5);(Oxidored_q5_N)	1	49	49	50	50	54	467	100	12	98
(dNK);(NADH_dh_m_C1)	1	46	46	48	48	71	181	100	13	96
(NADH_oxidored);(NDUF_B5)	1	49	49	49	49	71	639	100	12	100
(NDUF_B5);(NDUFB10)	1	50	50	50	50	76	1084	100	12	100
(ETC_C1_NDUFA4);(NDUFA12)	1	55	55	60	60	30	159	100	13	92
(NDUF_B5);(Ndufs5)	1	50	50	50	50	71	954	100	12	100
(CI-B14_5a);(ETC_C1_NDUFA5)	1	46	46	48	48	78	294	100	15	96
(CI-B14_5a);(NDUFA12)	1	47	47	48	48	80	381	100	15	98
(Methyltransf_25);(PRMT5_C)	1	32	111	32	120	2	719	95	94	100
(Binary_toxB_2);(Binary_toxB_3)	1	34	48	35	49	28	357	98	58	97
(Binary_toxB);(Binary_toxB_3)	1	34	48	35	49	27	621	98	58	97
(Binary_toxB);(Binary_toxB_2)	1	34	48	34	48	30	386	98	58	100
(Arena_RNA_pol);(ArenaCapSnatch)	1	22	26	23	27	20	1286	85	19	96
(Nrap_D4);(RRP7)	1	30	30	30	30	20	523	100	0	100
(TAF);(WD40)	1	26	26	30	30	31	161	100	15	87
(7tm_2);(G-alpha)	1	49	51	49	52	16	375	92	0	100
(7tm_2);(Hormone_2)	1	24	26	24	26	11	1088	77	4	100
(Utp21);(WD40)	1	23	23	31	31	34	198	100	4	74
(Utp13);(WD40)	1	28	28	33	33	37	144	100	4	85
(Fcf1);(Fibrillarin)	1	31	31	32	32	63	395	100	3	97
(MMR_HSR1);(Ribosom_S12_S23)	1	29	29	33	33	50	182	100	3	88
(RTC_insert);(WD40)	1	28	28	32	32	38	244	100	4	88
(Brix);(WD40)	1	26	26	33	33	48	135	100	4	79
(Ribosomal_S7);(WD40)	1	26	26	31	31	37	199	100	4	84
(Nrap_D4);(Ribosomal_S3Ae)	1	23	23	24	24	20	503	100	0	96
(Mpp10);(S4)	1	23	23	28	28	38	206	100	4	82
(RIBIOP_C);(Ribosom_S12_S23)	1	40	40	42	42	17	631	100	15	95
(RIBIOP_C);(RTC)	1	32	32	34	34	35	634	100	3	94
(Mpp10);(Ribosomal_S4)	1	30	30	32	32	34	723	100	7	94
(Ribosomal_S28e);(Utp12)	1	33	33	33	33	36	428	100	3	100
(Mpp10);(WD40)	1	25	25	32	32	20	283	100	0	78
(NDUF_B8);(NDUFB10)	1	53	53	55	55	7	143	100	13	96
(MWFE);(Ndufs5)	1	33	33	34	34	71	155	100	9	97
(Cas_Csy1);(Cas_Csy3)	1	24	24	25	25	7	227	100	4	96
(Cas_Csy2);(Cas_Csy3)	1	25	25	25	25	8	1736	100	4	100
(C1_4);(Tfb4)	1	29	32	29	32	26	795	100	47	100
(Brix);(Mpp10)	1	33	33	34	34	36	1115	100	6	97
(Complex1_LYR);(RsfS)	1	22	25	22	25	72	612	100	24	100
(Ribosomal_L14);(RsfS)	1	29	32	29	32	23	846	100	31	100
(Ribosomal_L19);(RsfS)	1	23	26	25	28	23	236	100	31	92
(BSD);(Ssl1)	1	20	20	23	26	16	296	100	35	87
(HBB);(MAT1)	1	22	25	22	25	27	853	100	40	100
(BING4CT);(Ribosomal_S4)	1	27	27	29	29	46	319	100	4	93
(Nop14);(Ribosom_S12_S23)	1	25	25	27	27	25	499	100	4	93
(Nop14);(RIBIOP_C)	1	27	27	29	29	25	413	70	4	93
(Fcf2);(Sas10)	1	28	28	30	30	36	289	100	4	93
(Fcf1);(Sas10)	1	24	24	30	30	63	173	100	4	80
(Fibrillarin);(Sas10)	1	30	30	30	30	63	1102	100	3	100
(S4);(Sas10)	1	28	28	29	29	56	147	100	4	97
(Ribosomal_S4);(Sas10)	1	26	26	26	26	56	291	100	4	100
(Ribosom_S12_S23);(Sas10)	1	28	28	32	32	63	176	100	4	88
(RIBIOP_C);(Sas10)	1	28	28	31	31	63	313	100	4	90
(Mpp10);(Utp13)	1	31	31	31	31	36	696	100	3	100
(Mpp10);(RIBIOP_C)	1	32	32	32	32	36	1254	66	3	100
(Fibrillarin);(WD40)	1	30	30	30	30	21	265	100	3	100
(Utp14);(WD40)	1	25	25	27	27	18	431	100	4	93
(Utp14);(WD40)	2	25	25	27	27	26	341	36	0	93
(Utp14);(WD40)	3	22	22	27	27	23	164	100	5	81
(Sof1);(Utp14)	1	29	29	29	29	26	664	100	3	100
(Fcf1);(WD40)	1	24	24	26	26	54	311	100	4	92
(Fcf1);(WD40)	2	21	21	26	26	43	273	100	5	81
(Ribosomal_S7e);(WD40)	1	22	22	24	24	43	189	100	5	92
(NOP5NT);(WD40)	1	24	24	25	25	36	166	100	4	96
(NOP5NT);(Sof1)	1	30	30	30	30	39	303	100	3	100
(Ribosomal_S8);(WD40)	1	22	22	22	22	7	136	100	5	100
(TPR_14);(Utp14)	1	25	25	26	26	24	548	100	4	96
(U3_assoc_6);(Utp14)	1	20	20	28	28	76	160	100	0	71
(BING4CT);(Utp14)	1	26	26	29	29	26	241	100	4	90
(Fibrillarin);(Utp11)	1	28	28	28	28	27	1053	100	4	100
(Nop);(Utp11)	1	25	25	27	27	27	277	100	4	93
(Ribosomal_L7Ae);(Utp11)	1	27	27	28	28	27	520	100	4	96
(RIBIOP_C);(Utp11)	1	30	30	30	30	27	586	100	3	100
(Ribosomal_S7e);(Utp14)	1	23	23	26	26	24	284	100	4	88
(NOP5NT);(Utp14)	1	25	25	27	27	26	190	100	4	93
(Fcf2);(Fibrillarin)	1	30	30	30	30	36	1062	100	3	100
(Herpes_V23);(Herpes_VP19C)	1	28	28	28	28	9	998	100	0	100
(Herpes_MCP);(Herpes_V23)	1	25	25	25	25	14	762	100	0	100
(Herpes_MCP);(Herpes_V23)	2	24	24	25	25	14	604	100	0	96
(Herpes_MCP);(Herpes_V23)	3	22	22	25	25	14	537	100	0	88
(Herpes_MCP);(Herpes_VP19C)	1	27	27	28	28	9	463	100	0	96
(Herpes_MCP);(Herpes_VP19C)	2	23	23	28	28	9	881	100	0	82
(U3_snoRNA_assoc);(Utp11)	1	24	24	24	24	17	610	100	4	100
(U3_snoRNA_assoc);(WD40)	1	23	23	25	25	17	452	100	4	92
(U3_snoRNA_assoc);(WD40)	2	21	21	25	25	10	170	100	5	84
(U3_snoRNA_assoc);(WD40)	3	21	21	25	25	17	313	100	5	84
(CBF);(WD40)	1	24	24	27	27	40	172	100	4	89
(CBF);(WD40)	2	24	24	27	27	35	262	100	4	89
(UTP15_C);(WD40)	1	22	22	29	29	27	190	45	5	76
(Fibrillarin);(U3_snoRNA_assoc)	1	21	21	21	21	17	174	100	5	100
(Utp12);(UTP15_C)	1	29	29	29	29	17	345	100	3	100
(Utp12);(UTP15_C)	2	29	29	29	29	27	1407	100	3	100
(Asparaginase);(Asparaginase_C)	1	41	115	41	115	11	741	97	100	100
(Asparaginase);(Asparaginase_C)	2	41	115	41	115	11	670	100	100	100
(Asparaginase);(Asparaginase_C)	3	25	88	41	115	31	170	90	93	61
(AAA);(AAA_lid_3)	1	161	190	215	244	8	132	100	51	75
(AAA);(AAA_lid_3)	2	125	125	215	244	15	189	99	22	58
(AAA);(AAA_lid_9)	1	54	58	64	68	30	312	91	19	84
(AAA);(AAA_lid_9)	2	49	53	64	68	30	142	100	38	77
(Big_8);(SdrG_C_C)	1	26	30	26	30	11	554	97	97	100
(ATP-synt_ab);(T3SS_ATPase_C)	1	162	202	203	281	7	249	93	59	80
(ATP-synt_ab);(T3SS_ATPase_C)	2	47	110	203	281	8	1052	98	84	23
(TetR_C_24);(TetR_N)	1	39	44	39	44	4	501	100	95	100
(A2M);(A2M_BRD)	1	59	69	59	70	8	2056	97	88	100
(A2M_recep);(TED_complement)	1	21	25	29	35	17	876	100	84	72
(ATP-grasp);(PurK_C)	1	20	30	20	32	11	646	100	100	100
(TetR_C_1);(TetR_N)	1	29	75	33	81	9	441	100	99	88
(MG1);(TED_complement)	1	25	26	33	36	17	360	73	77	76
(ATP-synt_ab_C);(T3SS_ATPase_C)	1	130	164	155	189	36	219	96	63	84
(ATP-synt_ab_C);(T3SS_ATPase_C)	2	33	37	155	189	36	181	97	43	21
(IRK);(IRK_C)	1	38	70	38	72	5	606	100	60	100
(IRK);(IRK_C)	2	26	36	38	72	20	345	97	28	68
(GP120);(V-set_2)	1	41	51	88	113	9	926	100	43	47
(ATP-synt);(T3SS_ATPase_C)	1	141	173	153	185	18	346	100	59	92
(ATP-synt);(T3SS_ATPase_C)	2	117	140	153	185	18	188	100	66	76
(AAA_lid_3);(CDC48_N)	1	22	25	54	62	21	163	100	52	41
(AAA_lid_3);(CDC48_2)	1	29	31	33	41	29	320	100	45	88
(ETC_C1_NDUFA4);(NDUFV3)	1	42	42	46	46	51	195	100	12	91
(Molybdopterin);(NDUFV3)	1	33	33	39	39	71	141	100	6	85
(Peptidase_M1);(Peptidase_M1_N)	1	47	242	49	247	10	1353	100	98	96
(DPPIV_rep);(Peptidase_S9)	1	22	122	23	124	27	524	100	100	96
(AAA_2);(AAA_lid_9)	1	45	47	52	56	30	229	100	38	87
(SDH_C);(Shikimate_dh_N)	1	37	49	37	53	15	770	98	98	100
(SDH_C);(Shikimate_DH)	1	21	26	25	34	12	184	100	100	84
(AAA_lid_3);(Vps4_C)	1	51	58	56	63	10	1192	100	26	91
(I-EGF_1);(PSI_integrin)	1	26	46	27	49	33	301	100	93	96
(MG2);(TED_complement)	1	24	28	33	41	5	552	93	71	73
(A2M);(MG2)	1	59	68	59	70	8	636	97	88	100
(A2M);(MG3)	1	37	42	53	62	18	481	95	93	70
(A2M_BRD);(MG2)	1	48	56	49	57	8	433	100	89	98
(MG1);(MG2)	1	34	39	43	49	15	218	100	97	79
(MG2);(MG3)	1	44	50	48	56	18	152	100	90	92
(A2M_BRD);(MG4)	1	41	47	48	56	16	437	100	89	85
(A2M_BRD);(MG1)	1	43	49	45	51	6	643	100	90	96
(MG3);(MG4)	1	40	46	46	52	16	175	100	91	87
(A2M_recep);(MG3)	1	31	35	50	57	30	416	94	94	62
(A2M_BRD);(MG3)	1	28	31	30	34	18	261	100	94	93
(FeoB_Cyto);(FeoB_N)	1	21	31	21	31	10	1122	100	100	100
(GramPos_pilinBB);(SpaA)	1	21	24	21	24	8	271	100	100	100
(RIG-I_C);(RIG-I_C-RD)	1	22	31	23	37	23	577	97	81	96
(Helicase_C);(RIG-I_C)	1	29	40	30	44	26	655	100	88	97
(ATP-synt_D);(T3SS_ATPase_C)	1	22	26	25	31	7	253	100	42	88
(ATP-synt_D);(T3SS_ATPase_C)	2	20	24	25	31	7	182	100	38	80
(Tfb2_C);(Tfb5)	1	38	41	38	41	26	983	100	41	100
(MCM);(MCM_lid)	1	35	35	36	36	24	661	94	40	97
(MCM);(MCM_lid)	2	35	35	36	36	25	1577	100	49	97
(GTP_EFTU);(RL10P_insert)	1	24	24	27	27	17	461	100	4	89
(MRPL52);(Ribosomal_L20)	1	54	59	55	60	19	252	100	15	98
(MRPL52);(Ribosomal_L21p)	1	56	61	56	61	22	630	100	15	100
(MRP-63);(MRPL52)	1	54	59	55	60	69	383	100	15	98
(MRPL52);(Ribosomal_L30)	1	55	60	56	61	18	399	100	15	98
(MMPL);(Sterol-sensing)	1	23	23	24	24	9	1634	100	22	96
(AWS);(SET)	1	20	37	20	38	23	509	100	92	100
(HNH_4);(RuvC_III)	1	20	44	23	50	15	399	100	93	87
(Nrap_D4);(RRM_Rrp7)	1	26	26	29	29	18	571	100	0	90
(Nrap_D6);(RRM_Rrp7)	1	29	29	30	30	18	1548	100	0	97
(MRPL52);(PBP)	1	20	20	27	27	63	244	100	15	74
(ORC_WH_C);(ORC2)	1	25	25	25	25	15	1380	100	8	100
(ORC_WH_C);(ORC5_C)	1	21	21	23	23	15	271	29	5	91
(TFA2_Winged_2);(TFIIE_alpha)	1	33	37	35	39	19	449	100	32	94
(CHCH);(NADHdh_A3)	1	26	26	32	32	16	386	100	23	81
(KH_8);(Ribosomal_S3Ae)	1	29	29	37	37	17	259	100	21	78
(KH_8);(Ribosomal_S11)	1	28	28	47	47	17	355	100	21	60
(Nop14);(RTC)	1	20	20	20	20	25	598	100	5	100
(EMG1);(Nop14)	1	25	25	25	25	25	883	100	4	100
(EMG1);(Nop14)	2	21	21	25	25	25	173	100	5	84
(Brix);(Nop14)	1	20	20	20	20	25	473	100	5	100
(CBF);(Nop14)	1	26	26	26	26	25	1414	100	4	100
(TFIID-31kDa);(WD40)	1	26	26	27	27	31	463	100	15	96
(TFIID-31kDa);(WD40)	2	25	25	27	27	31	528	100	12	93
(CHCH);(NDUF_B5)	1	23	23	25	25	43	192	100	22	92
(Csm2_III-A);(RAMPs)	1	21	21	21	21	15	389	100	5	100
(Fer4_21);(PsaA_PsaB)	1	28	34	28	34	72	275	100	24	100
(Fer4_21);(PsaD)	1	28	34	28	34	52	1149	100	24	100
(Fer4_21);(PSI_PsaE)	1	28	34	28	34	53	488	100	21	100
(Bromo_TP);(WD40)	1	25	25	25	25	15	117	100	12	100
(TFIID_30kDa);(WD40)	1	25	25	25	25	41	162	100	12	100
(Bromo_TP);(TFIID-31kDa)	1	24	24	25	25	78	315	100	12	96
(CDC50);(PhoLip_ATPase_C)	1	30	36	30	36	21	2163	100	22	100
(NmrA);(Oxidored_q6)	1	36	36	39	39	71	281	100	8	92
(TFIID_30kDa);(TFIID-18kDa)	1	20	20	20	20	67	247	100	15	100
(ATP-synt_C);(ATP-synt_S1)	1	25	25	25	25	22	331	100	0	100
(ATP-synt_S1);(vATP-synt_AC39)	1	25	25	25	25	24	283	100	0	100
(FBPase);(FBPase_C)	1	27	135	27	145	20	1365	100	100	100
(FBPase);(FBPase_C)	2	26	128	27	145	20	213	92	100	96
(Gag_p24);(Gag_p24_C)	1	39	86	110	170	1	414	99	85	35
(Gag_p24);(Gag_p24_C)	2	31	80	110	170	1	393	99	79	28
(EFG_C);(EFG_III)	1	26	47	31	52	15	241	100	98	84
(EFG_III);(GTP_EFTU)	1	21	37	28	49	13	233	100	86	75
(EphA2_TM);(PK_Tyr_Ser-Thr)	1	28	121	28	122	14	509	100	100	100
(Helicase_C);(SNF2-rel_dom)	1	36	37	36	37	3	978	100	62	100
(CoV_NSP7);(CoV_NSP8)	1	27	44	35	52	39	1330	100	30	77
(bCoV_S1_RBD);(Peptidase_M2)	1	102	115	102	115	46	868	100	22	100
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	1	57	76	371	399	41	333	99	29	15
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	2	54	73	371	399	65	709	99	32	15
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	3	37	37	371	399	20	199	100	19	10
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	4	23	23	371	399	69	224	100	30	6
(bCoV_S1_RBD);(C1-set)	1	52	74	118	142	67	559	1	3	44
(HD);(HD_assoc_2)	1	21	63	22	63	8	2098	100	100	95
(PAP_assoc);(TUTase)	1	23	58	23	58	3	1477	100	100	100
(EFG_III);(Ribosom_S12_S23)	1	57	66	61	73	13	264	100	5	93
(Ribosomal_L15e);(RNase_P_pop3)	1	37	37	37	37	82	513	100	3	100
(Ribosomal_L23eN);(RNase_P_pop3)	1	37	37	37	37	49	138	95	3	100
(bCoV_S1_N);(CoV_S2)	1	403	413	423	433	19	167	100	12	95
(bCoV_S1_RBD);(CoV_S2)	1	346	356	355	365	14	288	100	13	97
(bCoV_S1_RBD);(CoV_S2)	2	72	73	355	365	14	121	100	7	20
(CoV_S1_C);(CoV_S2)	1	429	439	432	442	12	445	100	12	99
(bCoV_S1_N);(CoV_S1_C)	1	446	456	456	467	12	497	100	12	98
(bCoV_S1_N);(CoV_S1_C)	2	418	429	456	467	12	722	100	12	92
(bCoV_S1_RBD);(CoV_S1_C)	1	334	343	357	367	12	232	100	13	94
(bCoV_S1_N);(V-set)	1	22	22	93	94	21	570	100	18	24
(G-gamma);(ZapB)	1	50	50	52	52	7	745	100	4	96
(ABC_tran);(ABC2_membrane_7)	1	22	22	22	22	86	1103	100	23	100
(RNA_pol_Rpb2_2);(RPC5)	1	27	27	27	27	20	713	100	56	100
(RNA_POL_M_15KD);(RPC5)	1	27	27	27	27	20	527	100	56	100
(RNA_pol_Rpc4);(RPC5)	1	27	27	27	27	20	2519	100	56	100
(Prp19);(U-box)	1	24	24	26	26	40	279	100	8	92
(DNAPKcs_CC5);(FAT)	1	29	29	35	36	11	247	100	31	83
(DNAPKcs_CC5);(PI3_PI4_kinase)	1	32	33	35	36	11	386	100	33	91
(DNAPKcs_CC5);(NUC194)	1	27	28	27	28	71	764	100	36	100
(Histone);(SNF2-rel_dom)	1	20	20	27	27	39	186	90	10	74
(MMR_HSR1);(Sas10)	1	27	27	29	29	50	355	100	4	93
(Ge1_WD40);(Ribosomal_S4)	1	20	20	20	20	72	624	100	0	100
(CoV_NSP8);(RdRP_1)	1	28	41	29	42	62	400	100	17	97