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PDBfam
Domain Clusters with M>=20,SeqId<90 and diff Pfam relation
Pfam Architecture
Cluster#
#CFs/Cluster
#Entries/Cluster
#CFs/Group
#Entries/Group
Minimum Seq Identity
Surface Area
In PDBBA(%)
In PISABA(%)
CFs Cluster/Group(%)
(FKBP_C);(RYDR_ITPR)
1
58
60
58
60
75
322
100
0
100
(FKBP_C);(SPRY)
1
57
59
58
60
73
267
100
0
98
(FRB_dom);(PI3_PI4_kinase)
1
22
27
23
29
15
242
100
56
96
(FXa_inhibition);(Trypsin)
1
47
269
48
278
22
422
96
99
98
(F_actin_cap_B);(F-actin_cap_A)
1
24
26
26
30
36
3095
100
73
92
(Fapy_DNA_glyco);(H2TH)
1
22
114
22
117
11
545
99
99
100
(Fcf1);(Ribosomal_S4)
1
25
25
27
27
63
298
100
4
93
(Fcf1);(Ribosomal_S8)
1
29
29
31
31
63
236
100
3
94
(Fe_dep_repr_C);(Fe_dep_repress)
1
27
64
27
64
14
625
100
97
100
(Fer2);(Fer2_2)
1
20
79
19
79
24
729
100
100
105
(Fer2_4);(NADH_4Fe-4S)
1
84
90
87
95
24
282
98
33
97
(Fer4_7);(NADH-G_4Fe-4S_3)
1
80
88
85
93
21
165
100
33
94
(Fer4_7);(Oxidored_q6)
1
96
102
98
106
25
378
100
27
98
(Fer4_7);(PSI_PsaE)
1
39
44
39
44
52
511
100
25
100
(Fer4_7);(PsaA_PsaB)
1
38
43
40
45
45
243
100
37
95
(Fer4_7);(PsaD)
1
39
44
39
44
52
1036
100
36
100
(Fibrillarin);(NOP5NT)
1
34
34
34
34
28
343
100
6
100
(Fibrillarin);(Nop)
1
27
27
40
44
46
156
100
4
68
(Fibrillarin);(Nop)
2
23
23
40
44
45
123
96
4
57
(Fibrillarin);(Ribosomal_L7Ae)
1
32
32
38
41
41
333
100
3
84
(Filo_glycop);(TLV_coat)
1
32
52
32
52
29
444
88
69
100
(Filo_glycop);(TLV_coat)
2
32
52
32
52
29
1942
98
71
100
(Filo_glycop);(TLV_coat)
3
23
26
32
52
29
394
81
58
72
(PCI);(RPN7)
1
36
36
64
65
20
129
100
25
56
(HEAT_2);(MitMem_reg)
1
22
22
49
49
51
125
91
14
45
(Fimbrial);(FimH_man-bind)
1
35
76
40
82
20
1125
100
100
88
(Fimbrial);(PapD_C)
1
22
27
22
27
10
292
100
81
100
(Fimbrial);(PapD_N)
1
22
27
22
27
10
1348
100
81
100
(Flagellin_C);(Flagellin_N)
1
36
36
36
36
7
1820
100
50
100
(Flavi_NS2B);(Peptidase_S7)
1
28
55
29
58
23
1811
93
89
97
(Flavi_NS5);(FtsJ)
1
37
81
37
81
20
721
100
99
100
(Flavi_glycop_C);(Flavi_glycoprot)
1
88
94
129
140
14
696
100
47
68
(Flavi_glycop_C);(Flavi_glycoprot)
2
71
76
129
140
27
272
86
39
55
(Flavi_glycop_C);(Flavi_glycoprot)
3
37
38
129
140
29
505
87
3
29
(Flavi_glycop_C);(V-set)
1
20
21
73
79
17
382
100
38
27
(Flavi_glycoprot);(Flavi_M)
1
54
54
55
55
15
683
100
6
98
(Flavi_glycoprot);(Flavi_M)
2
31
31
55
55
15
391
100
0
56
(Flu_PA);(Flu_PB1)
1
68
78
68
78
24
7934
100
73
100
(Flu_PA);(Flu_PB2)
1
64
74
66
76
22
1563
100
74
97
(Flu_PB1);(Flu_PB2)
1
66
77
66
77
22
5757
100
74
100
(Fn3-like);(Glyco_hydro_3)
1
30
61
30
64
14
694
100
100
100
(Fn3-like);(Glyco_hydro_3_C)
1
29
58
30
64
14
555
100
100
97
(Formyl_trans_C);(Formyl_trans_N)
1
26
48
28
52
5
664
100
100
93
(Mt_ATP-synt_B);(Mt_ATP-synt_D)
1
43
43
43
43
18
1302
100
35
100
(Mt_ATP-synt_B);(OSCP)
1
22
22
35
35
86
446
100
18
63
(FtsZ_C);(Tubulin)
1
30
69
32
73
7
485
100
100
94
(FtsZ_C);(Tubulin)
2
20
57
32
73
10
420
2
14
62
(FumaraseC_C);(Lyase_1)
1
25
50
25
54
22
253
100
100
100
(FumaraseC_C);(Lyase_1)
2
23
45
25
54
27
247
98
100
92
(FumaraseC_C);(Lyase_1)
3
23
43
25
54
22
296
98
100
92
(Furin-like);(Recep_L_domain)
1
63
68
74
81
15
990
100
79
85
(G-alpha);(V-set)
1
92
95
159
162
30
836
100
6
58
(ATP-synt_C);(ATP-synt_Eps)
1
33
33
79
79
38
117
100
91
42
(G-alpha);(V-set)
2
65
65
159
162
39
253
100
6
41
(G-alpha);(WD40)
1
207
211
207
211
6
289
100
10
100
(G-gamma);(WD40)
1
232
256
232
256
11
346
100
23
100
(G-gamma);(WD40)
2
219
228
232
256
12
304
100
18
94
(G10);(PRO8NT)
1
34
34
35
35
53
1099
100
9
97
(G10);(PROCN)
1
29
29
34
34
53
222
76
7
85
(RAG1);(RAG2)
1
32
36
32
36
49
1560
100
22
100
(RNA_polI_A14);(SHS2_Rpb7-N)
1
36
40
36
40
2
723
100
72
100
(GAF);(PAS_2)
1
38
77
38
89
14
1881
100
97
100
(GAF);(PHY)
1
25
43
26
51
12
631
100
98
96
(GBP);(GBP_C)
1
22
28
22
28
9
1441
100
93
100
(GFO_IDH_MocA);(GFO_IDH_MocA_C)
1
71
92
71
116
2
1253
100
100
100
(JAB);(MitMem_reg)
1
78
81
85
88
13
247
99
35
92
(JAB);(PC_rep)
1
51
51
57
57
21
179
100
25
89
(JAB);(VWA_2)
1
57
57
57
57
48
614
100
26
100
(GF_recep_IV);(Recep_L_domain)
1
47
55
50
59
29
535
100
87
94
(GHMP_kinases_C);(GHMP_kinases_N)
1
37
71
42
81
5
142
100
97
88
(NusG);(RNA_pol_Rpb2_2)
1
35
35
37
37
18
258
100
6
95
(NusG);(RNA_pol_Rpb2_1)
1
21
21
37
37
18
200
100
10
57
(NusG);(RNA_pol_Rpb1_1)
1
36
36
38
38
18
575
100
6
95
(ATP-synt_A);(Mt_ATP-synt_D)
1
32
32
32
32
21
370
100
19
100
(MitMem_reg);(Rpn9_C)
1
29
29
33
33
33
1063
100
41
88
(IATP);(T3SS_ATPase_C)
1
24
26
24
27
20
430
100
27
100
(RNA_polI_A14);(RPA43_OB)
1
29
33
35
39
70
258
100
67
83
(Proteasome);(RPN6_N)
1
21
21
32
32
24
275
100
24
66
(eIF3m_C_helix);(MitMem_reg)
1
27
27
27
27
3
975
93
11
100
(NUC);(RuvC_1)
1
20
24
25
30
27
966
100
71
80
(ATP-synt_8);(Mt_ATP-synt_D)
1
22
22
25
25
56
280
100
23
88
(ATP-synt_A);(WRW)
1
25
25
25
25
80
470
100
24
100
(ATP-synt_8);(ATP-synt_A)
1
25
25
25
25
56
908
100
24
100
(Prot_ATP_ID_OB);(ZapB)
1
28
28
32
32
2
449
75
29
88
(HEAT_2);(ZapB)
1
23
23
23
23
2
296
100
26
100
(RPN1_RPN2_N);(ZapB)
1
22
22
23
23
2
382
100
27
96
(GMC_oxred_C);(GMC_oxred_N)
1
40
114
40
129
1
4051
100
99
100
(ATP-synt_A);(VBS)
1
27
27
27
27
51
945
100
89
100
(ATP-synt_E);(ATP-synt_G)
1
20
20
20
20
76
646
100
30
100
(ATP-synt_G);(WRW)
1
20
20
20
20
82
233
100
30
100
(ATP-synt_A);(Mit_proteolip)
1
20
20
20
20
80
288
100
30
100
(MitMem_reg);(PCI)
1
53
54
74
75
12
239
100
22
72
(MitMem_reg);(Rpn3_C)
1
40
40
59
59
27
635
100
15
68
(GP120);(GP41)
1
129
153
129
153
51
1203
99
33
100
(GP120);(V-set)
1
113
155
225
285
9
419
99
39
50
(GP120);(V-set)
2
27
39
225
285
17
537
95
44
12
(GP120);(V-set)
3
20
36
225
285
28
282
72
19
9
(JmjC);(JmjN)
1
24
457
25
462
23
682
100
100
96
(Spermine_synt_N);(Spermine_synth)
1
26
60
26
60
12
1006
100
100
100
(MitMem_reg);(RPN6_C_helix)
1
38
38
59
59
10
491
100
34
64
(MitMem_reg);(RPN5_C)
1
44
44
59
59
12
877
82
32
75
(JAB);(RPN5_C)
1
35
35
55
55
40
186
86
34
64
(AAA_lid_3);(Proteasome)
1
51
51
56
56
19
244
88
25
91
(AAA_lid_3);(Proteasome)
2
29
29
56
56
61
245
100
14
52
(GP120);(ig)
1
32
41
34
44
25
1032
95
32
94
(GP41);(V-set)
1
28
40
89
125
8
393
95
70
31
(GST_C);(GST_N)
1
84
101
89
115
5
251
89
92
94
(GST_C);(GST_N)
2
82
102
89
115
6
532
99
99
92
(GST_C);(GST_N_3)
1
26
57
26
58
6
741
100
100
100
(GST_C);(GST_N_3)
2
24
54
26
58
6
375
94
93
92
(GST_C_2);(GST_N)
1
22
44
23
45
5
521
100
100
96
(GST_C_2);(GST_N_3)
1
74
113
74
117
4
581
100
100
100
(GST_C_2);(GST_N_3)
2
37
51
74
117
5
289
88
84
50
(GST_C_3);(GST_N)
1
94
267
96
289
7
756
99
99
98
(GST_C_3);(GST_N)
2
91
264
96
289
7
243
96
95
95
(GTP_EFTU);(GTP_EFTU_D2)
1
96
146
138
232
2
599
100
92
70
(GTP_EFTU);(GTP_EFTU_D3)
1
31
53
60
103
18
573
100
100
52
(GTP_EFTU);(GTP_EFTU_D3)
2
23
35
60
103
4
603
100
89
38
(GTP_EFTU);(LSM)
1
33
33
43
43
14
207
100
15
77
(GTP_EFTU);(PROCN)
1
48
48
50
50
17
560
79
19
96
(GTP_EFTU);(Ribosomal_L6)
1
21
21
73
91
53
140
100
5
29
(GTP_EFTU_D2);(GTP_EFTU_D3)
1
58
92
62
103
2
447
100
93
94
(GTP_EFTU_D2);(Ribosom_S12_S23)
1
24
24
41
43
9
193
100
4
59
(GalKase_gal_bdg);(GHMP_kinases_C)
1
23
46
22
46
2
498
100
98
105
(GalKase_gal_bdg);(GHMP_kinases_N)
1
23
45
22
46
2
1170
100
98
105
(Gal_mutarotas_2);(Glyco_hydro_31)
1
40
126
40
127
9
2092
100
90
100
(Gln-synt_C);(Gln-synt_N)
1
21
45
21
45
11
1083
100
96
100
(ATP-synt);(IATP)
1
24
26
24
27
25
289
100
27
100
(ATP-synt_A);(Mt_ATP-synt_B)
1
40
40
42
42
20
609
100
32
95
(ATP-synt_DE);(ATP-synt_Eps)
1
21
30
21
31
2
427
100
87
100
(ATP-synt_DE_N);(ATP-synt_Eps)
1
96
107
102
113
21
362
100
73
94
(ATP-synt_ab_C);(IATP)
1
23
25
24
27
25
253
100
28
96
(Glyco_hydro_2);(Glyco_hydro_2_C)
1
72
167
72
168
6
822
100
92
100
(Glyco_hydro_2);(Glyco_hydro_2_N)
1
77
168
80
191
6
219
100
93
96
(Glyco_hydro_2_C);(Glyco_hydro_2_N)
1
72
183
74
186
8
1616
100
93
97
(Glyco_hydro_3);(Glyco_hydro_3_C)
1
41
123
41
126
4
1832
100
100
100
(Glyco_hydro_30);(Glyco_hydro_30C)
1
22
62
22
62
6
816
100
89
100
(Glyco_hydro_32C);(Glyco_hydro_32N)
1
22
62
24
69
8
1556
100
100
92
(Glyco_tran_28_C);(Glyco_transf_28)
1
25
32
25
35
2
573
100
100
100
(Glyco_transf_4);(Glycos_transf_1)
1
28
52
28
52
6
672
100
100
100
(Glycos_trans_3N);(Glycos_transf_3)
1
29
89
29
89
6
1048
100
99
100
(Glycos_trans_3N);(Glycos_transf_3)
2
29
88
29
89
6
267
89
95
100
(Gp_dh_C);(Gp_dh_N)
1
95
194
96
195
6
464
91
97
99
(Gp_dh_C);(Gp_dh_N)
2
94
193
96
195
6
234
91
95
98
(Gp_dh_C);(Gp_dh_N)
3
92
189
96
195
6
152
100
100
96
(H2TH);(zf-FPG_IleRS)
1
20
90
19
92
16
603
99
99
105
(HA2);(Helicase_C)
1
20
37
35
59
18
288
100
97
57
(HA2);(OB_NTP_bind)
1
34
57
34
58
11
1088
100
96
100
(HABP4_PAI-RBP1);(KH_2)
1
20
21
26
39
60
122
100
24
77
(HABP4_PAI-RBP1);(Ribosomal_S3_C)
1
30
31
32
45
6
783
100
26
94
(HABP4_PAI-RBP1);(Ribosomal_S5)
1
30
32
31
44
6
232
100
28
97
(HATPase_c);(HSP90)
1
70
397
75
464
2
1094
100
96
93
(HATPase_c);(HisKA)
1
26
36
29
44
12
418
100
100
90
(HH_signal);(Hint)
1
23
28
23
28
20
289
100
71
100
(Anoct_dimer);(Anoctamin)
1
31
32
31
32
3
2025
100
72
100
(HTH_9);(RNA_pol_Rpb1_1)
1
27
27
27
27
27
342
100
56
100
(Helicase_C);(OB_NTP_bind)
1
26
44
32
56
12
295
100
98
81
(Helicase_C);(ResIII)
1
36
45
43
53
10
475
100
89
84
(Helicase_C_2);(Ssl1)
1
32
35
32
35
41
488
100
37
100
(Hexokinase_1);(Hexokinase_2)
1
41
79
41
79
12
3512
100
95
100
(Histone);(Histone_H2A_C)
1
236
390
245
421
11
245
96
60
96
(Histone);(Histone_H2A_C)
2
213
363
245
421
10
612
100
58
87
(Histone);(Histone_H2A_C)
3
49
68
245
421
13
538
100
69
20
(Histone);(TAF)
1
229
400
229
412
5
1355
100
64
100
(Histone_H2A_C);(TAF)
1
198
349
203
378
7
230
100
58
98
(Hormone_2);(HRM)
1
22
30
23
31
5
303
100
37
96
(Hormone_recep);(SRC-1)
1
23
57
25
60
17
457
96
100
92
(Hydrolase_6);(Hydrolase_like)
1
28
41
28
43
11
1204
100
100
100
(1-cysPrx_C);(AhpC-TSA)
1
63
124
63
124
10
258
100
98
100
(2Fe-2S_thioredx);(Complex1_51K)
1
89
109
92
112
17
1266
100
44
97
(2Fe-2S_thioredx);(NADH_4Fe-4S)
1
85
105
90
110
17
345
81
46
94
(2Fe-2S_thioredx);(SLBB)
1
88
108
90
110
14
238
81
44
98
(2OG-FeII_Oxy);(DIOX_N)
1
35
122
35
122
10
1821
100
100
100
(3HCDH);(3HCDH_N)
1
34
72
36
79
13
419
99
90
94
(40S_SA_C);(Ribosomal_S17e)
1
140
140
148
148
20
192
71
9
95
(IBN_N);(Ras)
1
31
91
32
92
5
395
100
69
97
(IBN_N);(Xpo1)
1
20
23
26
35
9
892
100
96
77
(IF-2B);(NTP_transferase)
1
28
28
29
30
32
445
100
21
97
(7tm_1);(G-alpha)
1
141
141
141
141
11
509
99
9
100
(7tm_1);(Phage_lysozyme)
1
22
38
49
87
17
812
100
95
45
(7tm_1);(WD40)
1
20
20
117
117
20
132
100
20
17
(A2M);(A2M_recep)
1
32
36
52
60
33
211
100
94
62
(A2M);(A2M_recep)
2
21
25
52
60
17
524
96
80
40
(AAA);(AAA_2)
1
44
48
48
52
35
248
96
29
92
(AAA);(Lon_C)
1
28
28
29
29
42
305
100
39
97
(AAA);(Vps4_C)
1
56
65
64
77
10
437
100
32
88
(AAA_16);(ORC3_N)
1
24
24
24
24
9
473
96
4
100
(AAA_16);(ORC4_C)
1
25
25
25
25
11
603
88
8
100
(AAA_2);(ClpB_D2-small)
1
80
98
90
109
8
354
82
32
89
(AAA_2);(ClpB_D2-small)
2
69
82
90
109
15
213
100
48
77
(ABC_membrane);(ABC_tran)
1
134
179
135
183
6
516
100
59
99
(ABC_tran);(ABC2_membrane)
1
36
39
36
39
7
965
100
36
100
(ABC_tran);(BCA_ABC_TP_C)
1
21
26
21
26
8
245
100
100
100
(ABC_tran);(BPD_transp_1)
1
22
36
24
38
11
810
100
83
92
(ACP_syn_III);(ACP_syn_III_C)
1
52
106
55
110
10
1259
100
99
95
(IMS);(IMS_C)
1
30
266
46
417
8
429
100
100
65
(IMS);(IMS_HHH)
1
38
208
38
208
9
303
100
100
100
(IN_DBD_C);(rve)
1
24
24
31
32
19
190
100
29
77
(Ig_3);(I-set)
1
53
58
95
104
10
265
100
95
56
(IlvC);(IlvN)
1
38
50
38
51
13
605
100
66
100
(IlvC);(IlvN)
2
36
48
38
51
14
425
96
65
95
(IlvC);(IlvN)
3
20
23
38
51
25
263
83
4
53
(Img2);(MRP-63)
1
55
60
55
60
66
508
100
15
100
(Img2);(Ribosomal_L27A)
1
57
62
71
76
21
114
94
13
80
(Img2);(Ribosomal_L4)
1
57
62
72
77
17
164
100
15
79
(Inhibitor_I29);(Peptidase_C1)
1
21
26
21
26
18
737
100
96
100
(Inhibitor_I9);(Peptidase_S8)
1
35
60
38
69
12
1142
95
100
92
(Ins145_P3_rec);(MIR)
1
77
88
88
100
15
734
100
25
88
(Ins145_P3_rec);(MIR)
2
35
35
88
100
16
273
100
6
40
(Ins145_P3_rec);(RIH_assoc)
1
67
69
79
81
73
268
100
3
85
(Ins145_P3_rec);(RYDR_ITPR)
1
62
64
91
103
72
176
100
3
68
(Ins145_P3_rec);(RYDR_ITPR)
2
59
67
91
103
7
166
100
22
65
(Interfer-bind);(Tissue_fac)
1
28
51
34
70
11
462
94
92
82
(Internalin_N);(LRR_4)
1
23
23
38
41
13
464
91
83
61
(Ion_trans);(RR_TM4-6)
1
65
67
65
67
21
429
100
3
100
(Ion_trans);(RR_TM4-6)
2
50
50
65
67
33
1099
100
4
77
(JAB);(Sec63)
1
21
26
24
29
38
183
73
58
88
(KAsynt_C_assoc);(Ketoacyl-synt_C)
1
50
74
50
74
8
2401
99
84
100
(KAsynt_C_assoc);(ketoacyl-synt)
1
50
74
52
76
8
947
99
84
96
(KAsynt_C_assoc);(ketoacyl-synt)
2
41
64
52
76
9
173
95
83
79
(KH_2);(Ribosomal_S10)
1
246
272
631
958
9
148
100
12
39
(KH_2);(Ribosomal_S14)
1
184
442
627
953
12
118
100
17
29
(KH_2);(S10_plectin)
1
228
229
228
241
20
842
100
10
100
(KOW);(Ribosomal_L18A)
1
214
215
218
231
18
246
100
19
98
(KOW);(Ribosomal_L34e)
1
232
233
236
249
23
323
100
15
98
(KOW);(Ribosomal_L6)
1
79
79
86
86
28
170
100
4
92
(KOW);(Ribosomal_L7Ae)
1
227
228
233
246
24
275
100
15
97
(KOW);(Ribosomal_S17_N)
1
24
24
252
265
24
162
58
21
10
(KOW);(Tim44)
1
23
24
52
57
65
109
100
25
44
(CRPV_capsid);(Rhv)
1
27
27
28
28
7
1075
93
37
96
(Calici_coat);(CRPV_capsid)
1
29
30
29
30
12
2544
93
27
100
(Calici_coat);(Rhv)
1
25
25
45
60
4
1106
92
28
56
(Kinesin);(Tubulin)
1
42
42
60
60
25
171
98
29
70
(Kinesin);(Tubulin_C)
1
46
46
61
61
25
122
98
22
75
(Kunitz_BPTI);(Trypsin)
1
40
95
44
99
15
548
100
99
91
(L51_S25_CI-B8);(MRP-63)
1
54
59
54
59
67
185
98
15
100
(L51_S25_CI-B8);(MRP-S26)
1
34
35
34
35
78
372
100
6
100
(L51_S25_CI-B8);(Ribonucleas_3_3)
1
58
63
59
64
15
125
100
16
98
(L51_S25_CI-B8);(Ribosomal_L50)
1
64
69
64
69
12
613
100
16
100
(L51_S25_CI-B8);(Ribosomal_S17)
1
34
35
34
35
56
477
89
3
100
(LRR_4);(LRR_8)
1
135
178
148
200
2
723
99
87
91
(LRR_4);(LRR_8)
2
22
33
148
200
14
160
21
18
15
(LRR_4);(LRR_adjacent)
1
20
20
26
27
22
580
100
90
77
(LRR_8);(LRRCT)
1
40
57
57
93
8
179
96
93
70
(LRR_8);(LRRNT)
1
95
105
124
151
4
703
100
84
77
(LRR_9);(RRM_1)
1
40
40
45
45
26
507
100
15
89
(Ldh_1_C);(Ldh_1_N)
1
136
289
137
290
9
1661
100
98
99
(Ldh_1_C);(Ldh_1_N)
2
135
287
137
290
9
907
97
97
99
(Ldh_1_C);(Ldh_1_N)
3
79
186
137
290
16
238
95
92
58
(Lectin_C);(Ly49)
1
35
66
36
67
5
645
85
82
97
(DSS1_SEM1);(RPN7)
1
34
34
39
39
39
181
100
6
87
(Lig_chan);(Lig_chan-Glu_bd)
1
180
441
199
517
2
343
98
77
90
(Lig_chan);(PMP22_Claudin)
1
21
22
21
22
70
381
100
18
100
(Lig_chan);(SBP_bac_3)
1
23
43
23
48
5
772
100
74
100
(Lig_chan-Glu_bd);(SBP_bac_3)
1
24
49
24
54
14
2502
100
78
100
(Lig_chan-Glu_bd);(SBP_bac_3)
2
20
43
24
54
14
257
98
67
83
(CSN8_PSD8_EIF3K);(PCI)
1
64
65
64
65
13
1007
100
28
100
(M20_dimer);(Peptidase_M20)
1
46
64
49
67
5
1320
100
100
94
(M20_dimer);(Peptidase_M20)
2
34
47
49
67
4
433
98
100
69
(MA3);(U5_2-snRNA_bdg)
1
27
27
28
28
30
408
100
11
96
(MA3);(U6-snRNA_bdg)
1
22
22
26
26
30
144
100
9
85
(MCM);(MCM_OB)
1
32
32
34
34
26
378
97
41
94
(MCM);(MCM_OB)
2
25
25
34
34
23
360
100
44
74
(MCM_N);(MCM_OB)
1
43
44
45
46
11
489
100
57
96
(MCM_N);(MCM_OB)
2
30
30
45
46
15
181
100
37
67
(MCM_N);(Sld5)
1
21
21
21
21
11
460
100
43
100
(MCM_N);(Sld5)
2
21
21
21
21
10
253
100
43
100
(DSS1_SEM1);(PCI)
1
39
39
64
64
18
639
100
18
61
(DSS1_SEM1);(PCI)
2
21
21
64
64
45
226
100
0
33
(MHC_I);(V-set)
1
130
236
155
264
12
383
95
44
84
(MHC_I);(V-set)
2
20
25
155
264
20
419
100
52
13
(MHC_II_alpha);(MHC_II_beta)
1
155
210
157
215
10
928
99
99
99
(MHC_II_alpha);(V-set)
1
49
70
54
76
17
243
94
31
91
(MHC_II_beta);(V-set)
1
51
67
54
76
14
254
94
34
94
(MHC_I_3);(V-set)
1
25
80
28
83
14
375
95
72
89
(MIR);(RYDR_ITPR)
1
73
82
78
89
7
215
100
26
94
(MMS1_N);(WD40)
1
29
31
31
34
13
170
100
68
94
(MRP-63);(Ribosomal_L30)
1
54
59
54
59
67
665
100
15
100
(MRP-63);(Ribosomal_L4)
1
53
58
53
58
69
173
100
16
100
(MRP-63);(Ribosomal_L50)
1
23
23
54
59
69
111
100
13
43
(MRP-L27);(MRP-L47)
1
65
70
65
70
21
1041
100
14
100
(MRP-L27);(Ribosomal_L23)
1
65
70
65
70
14
631
100
14
100
(MRP-L27);(Ribosomal_L34)
1
62
67
63
68
21
442
100
15
98
(MRP-L28);(MRP-L46)
1
62
67
63
68
10
1207
100
16
98
(MRP-L28);(Ribosomal_S10)
1
54
59
54
59
73
1250
100
17
100
(MRP-L47);(Ribosomal_L23)
1
75
80
75
80
14
698
100
14
100
(MRP-L51);(Ribosomal_L27A)
1
53
58
54
59
88
289
100
16
98
(MRP-L51);(Ribosomal_L4)
1
54
59
54
59
88
1670
100
15
100
(MRP-S22);(MRP-S34)
1
34
35
34
35
82
257
100
6
100
(MRP-S22);(Ribosomal_S16)
1
34
35
34
35
88
656
100
6
100
(MRP-S22);(Ribosomal_S18)
1
34
35
34
35
88
404
91
6
100
(MRP-S22);(Ribosomal_S5_C)
1
34
35
34
35
87
268
97
6
100
(MRP-S23);(MRP-S35)
1
34
35
34
35
86
905
100
6
100
(MRP-S23);(Ribosomal_S2)
1
35
36
35
36
13
1678
100
6
100
(MRP-S23);(Ribosomal_S5)
1
35
36
35
36
13
483
100
6
100
(MRP-S24);(MRP-S28)
1
34
35
34
35
76
367
100
6
100
(MRP-S24);(MRP-S31)
1
34
35
34
35
3
276
100
6
100
(MRP-S24);(MRP-S33)
1
33
34
34
35
79
536
100
6
97
(MRP-S24);(Ribosomal_S10)
1
34
35
34
35
88
593
100
6
100
(MRP-S24);(Ribosomal_S14)
1
34
35
34
35
84
986
100
6
100
(MRP-S26);(MRP-S34)
1
34
35
34
35
78
161
86
0
100
(MRP-S26);(Ribosomal_S16)
1
35
36
38
39
19
304
100
6
92
(MRP-S26);(Ribosomal_S18)
1
37
38
37
38
9
445
100
5
100
(MRP-S26);(Ribosomal_S6)
1
37
38
38
39
9
895
100
3
97
(MRP-S27);(MRP-S34)
1
32
33
32
33
78
1303
100
6
100
(MRP-S28);(MRP-S31)
1
29
30
34
35
3
1023
100
7
85
(MRP-S28);(MRP-S33)
1
43
44
43
44
9
662
100
5
100
(MRP-S28);(Ribosomal_S10)
1
42
43
42
43
15
464
98
5
100
(MRP-S31);(MRP-S33)
1
33
34
34
35
3
666
100
6
97
(MRP-S31);(Ribosomal_S10)
1
34
35
34
35
3
250
100
6
100
(MRP-S32);(Ribosomal_L13)
1
53
58
54
59
68
244
100
16
98
(MRP-S32);(Ribosomal_L20)
1
53
58
54
59
68
361
100
16
98
(MRP-S32);(Ribosomal_L21p)
1
53
58
53
58
68
465
100
16
100
(MRP-S33);(Ribosomal_S14)
1
41
42
42
43
15
377
100
5
98
(MRP-S35);(Ribosomal_S2)
1
34
35
34
35
37
1035
100
6
100
(MRP_L53);(Ribosomal_L10)
1
54
59
54
59
68
691
100
15
100
(MR_MLE_C);(MR_MLE_N)
1
167
287
167
288
1
1719
98
98
100
(MR_MLE_C);(MR_MLE_N)
2
92
163
167
288
3
319
80
89
55
(MR_MLE_C);(MR_MLE_N)
3
68
115
167
288
11
129
67
89
41
(MSP);(PSII)
1
31
85
31
86
41
1306
100
31
100
(MSP);(PSII)
2
29
83
31
86
41
627
100
29
94
(MSP);(PSII)
3
22
53
31
86
41
386
81
15
71
(MSP);(Photo_RC)
1
31
85
31
86
46
603
100
25
100
(MSP);(Photo_RC)
2
30
84
31
86
46
573
100
31
97
(MSP);(PsbU)
1
22
76
22
77
32
450
100
30
100
(ADH_N);(ADH_N_assoc)
1
24
32
24
32
4
839
100
100
100
(ADH_N);(ADH_zinc_N)
1
145
288
146
289
1
602
100
98
99
(ADH_N);(ADH_zinc_N)
2
114
249
146
289
4
250
95
96
78
(MaoC_dehydrat_N);(MaoC_dehydratas)
1
27
30
30
35
2
1118
87
63
90
(ADH_N);(ADH_zinc_N_2)
1
28
35
28
35
6
943
100
100
100
(Med11);(Med17)
1
20
20
20
20
11
1014
100
15
100
(Med11);(Med22)
1
21
21
21
21
11
1223
95
19
100
(Metallophos);(STPPase_N)
1
51
73
58
82
14
1910
99
90
88
(ADK);(ADK_lid)
1
40
78
40
78
13
535
100
100
100
(AIRS);(AIRS_C)
1
34
57
35
60
2
1005
100
100
97
(AMP-binding);(AMP-binding_C)
1
119
202
123
206
6
617
100
98
97
(ANF_receptor);(Lig_chan-Glu_bd)
1
43
44
97
115
33
236
100
7
44
(ANF_receptor);(Lig_chan-Glu_bd)
2
30
43
97
115
22
254
100
42
31
(ANF_receptor);(NCD3G)
1
32
35
34
37
29
383
100
31
94
(Mitoc_L55);(MRP-L28)
1
52
57
52
57
67
762
100
16
100
(Mitoc_L55);(MRP-L46)
1
52
57
52
57
67
1112
100
16
100
(Mitoc_L55);(Ribosomal_S10)
1
52
57
52
57
66
857
100
16
100
(Molybdop_Fe4S4);(Molybdopterin)
1
20
37
22
42
13
1393
100
86
91
(Molybdop_Fe4S4);(Molydop_binding)
1
20
37
21
40
10
452
100
84
95
(Molybdopterin);(Molydop_binding)
1
30
60
40
74
10
1897
100
92
75
(Mur_ligase_C);(Mur_ligase_M)
1
40
88
45
97
6
583
100
93
89
(MutS_III);(MutS_IV)
1
22
40
22
40
6
550
100
100
100
(MutS_III);(MutS_V)
1
23
41
23
41
19
893
100
100
100
(Myb_DNA-binding);(RRM_4)
1
35
35
36
36
21
347
100
11
97
(Myb_DNA-binding);(SKIP_SNW)
1
30
30
36
36
21
308
100
7
83
(Myb_DNA-binding);(SKIP_SNW)
2
24
24
36
36
32
365
100
12
67
(Myosin_head);(Myosin_N)
1
93
158
94
161
15
301
100
84
99
(NADH5_C);(Oxidored_q2)
1
65
65
68
68
3
475
98
22
96
(NADH5_C);(Proton_antipo_M)
1
75
75
76
76
3
623
85
23
99
(NADH5_C);(Proton_antipo_M)
2
65
65
76
76
3
942
65
15
86
(NADH_4Fe-4S);(NADH-G_4Fe-4S_3)
1
84
90
89
97
21
423
100
34
94
(NADHdh);(Oxidored_q3)
1
92
97
94
99
12
960
100
25
98
(NADHdh);(Oxidored_q4)
1
94
99
94
99
24
2132
100
24
100
(NADHdh);(Oxidored_q6)
1
88
93
88
93
16
801
100
23
100
(NAD_binding_11);(NAD_binding_2)
1
47
69
47
69
2
504
100
97
100
(NOGCT);(Ribosomal_L24e)
1
26
26
28
28
35
244
100
46
93
(NOGCT);(Ribosomal_L3)
1
30
30
30
30
35
514
100
50
100
(Neur_chan_LBD);(Neur_chan_memb)
1
117
235
122
260
1
362
100
69
96
(Neur_chan_LBD);(Neur_chan_memb)
2
69
71
122
260
3
148
100
28
57
(NiFeSe_Hases);(Oxidored_q6)
1
43
144
45
155
4
1748
100
94
96
(NiFe_hyd_SSU_C);(NiFeSe_Hases)
1
27
114
29
129
6
1228
91
90
93
(NiFe_hyd_SSU_C);(Oxidored_q6)
1
20
58
24
95
32
676
100
97
83
(ERAP1_C);(Peptidase_M1)
1
22
55
25
59
11
1671
100
98
88
(Nop);(Ribosomal_L7Ae)
1
54
57
55
58
18
497
100
30
98
(ORC2);(ORC3_N)
1
25
25
25
25
9
850
100
8
100
(ORC2);(ORC5_C)
1
24
24
24
24
17
676
62
4
100
(ORC3_N);(ORC4_C)
1
23
23
24
24
9
318
26
4
96
(ORC3_N);(ORC5_C)
1
24
24
24
24
9
1057
71
4
100
(ORC4_C);(ORC5_C)
1
25
25
25
25
11
877
100
8
100
(OTCace);(OTCace_N)
1
68
174
69
176
8
2156
100
99
99
(OTCace);(OTCace_N)
2
68
175
69
176
8
468
98
100
99
(C1-set);(V-set)
1
2159
2814
3158
4232
2
182
99
94
68
(C1-set);(V-set)
2
2081
2640
3158
4232
3
255
99
92
66
(C1-set);(V-set)
3
84
99
3158
4232
1
161
0
1
3
(C1-set);(V-set)
4
66
81
3158
4232
18
135
0
4
2
(C1-set);(V-set)
5
63
84
3158
4232
17
142
2
11
2
(C1-set);(V-set)
6
61
73
3158
4232
7
279
8
37
2
(C1-set);(V-set)
7
61
77
3158
4232
15
170
0
4
2
(C1-set);(V-set)
8
51
61
3158
4232
6
147
2
10
2
(C1-set);(V-set)
9
49
58
3158
4232
20
231
3
10
2
(C1-set);(V-set)
10
48
58
3158
4232
10
168
7
0
2
(C1-set);(V-set)
11
42
48
3158
4232
6
167
0
6
1
(C1-set);(V-set)
12
41
50
3158
4232
5
148
24
22
1
(C1-set);(V-set)
14
39
42
3158
4232
6
180
0
2
1
(C1-set);(V-set)
15
37
42
3158
4232
35
113
0
5
1
(C1-set);(V-set)
16
36
42
3158
4232
17
167
0
0
1
(C1-set);(V-set)
17
36
39
3158
4232
17
199
0
8
1
(C1-set);(V-set)
18
35
48
3158
4232
5
206
0
0
1
(C1-set);(V-set)
19
35
45
3158
4232
3
173
0
0
1
(C1-set);(V-set)
20
34
41
3158
4232
16
173
0
2
1
(C1-set);(V-set)
21
31
41
3158
4232
12
220
0
2
1
(C1-set);(V-set)
22
30
33
3158
4232
17
156
0
0
1
(C1-set);(V-set)
23
28
45
3158
4232
6
196
0
0
1
(C1-set);(V-set)
24
28
34
3158
4232
15
193
0
0
1
(C1-set);(V-set)
25
27
31
3158
4232
16
352
0
3
1
(C1-set);(V-set)
26
27
29
3158
4232
6
147
0
3
1
(C1-set);(V-set)
27
26
45
3158
4232
15
274
0
0
1
(C1-set);(V-set)
28
26
37
3158
4232
16
149
0
0
1
(C1-set);(V-set)
29
26
29
3158
4232
18
141
0
3
1
(C1-set);(V-set)
30
26
28
3158
4232
17
146
0
0
1
(C1-set);(V-set)
31
25
26
3158
4232
19
160
0
0
1
(C1-set);(V-set)
32
25
26
3158
4232
7
159
0
15
1
(C1-set);(V-set)
33
24
30
3158
4232
5
202
0
3
1
(C1-set);(V-set)
34
24
41
3158
4232
14
140
0
0
1
(C1-set);(V-set)
35
24
25
3158
4232
15
178
0
4
1
(C1-set);(V-set)
36
24
24
3158
4232
20
164
4
4
1
(C1-set);(V-set)
37
23
39
3158
4232
6
134
0
0
1
(C1-set);(V-set)
38
23
27
3158
4232
6
192
0
0
1
(C1-set);(V-set)
39
23
27
3158
4232
17
157
0
0
1
(C1-set);(V-set)
40
23
27
3158
4232
18
145
4
15
1
(C1-set);(V-set)
41
23
24
3158
4232
19
139
4
12
1
(C1-set);(V-set)
42
23
23
3158
4232
17
180
0
0
1
(C1-set);(V-set)
43
22
34
3158
4232
13
154
0
0
1
(C1-set);(V-set)
44
22
28
3158
4232
7
295
0
0
1
(C1-set);(V-set)
45
22
24
3158
4232
15
167
0
4
1
(C1-set);(V-set)
46
22
25
3158
4232
14
195
0
8
1
(C1-set);(V-set)
47
22
28
3158
4232
17
136
0
0
1
(C1-set);(V-set)
48
22
25
3158
4232
16
140
0
4
1
(C1-set);(V-set)
49
21
31
3158
4232
15
158
0
0
1
(C1-set);(V-set)
50
21
30
3158
4232
7
148
0
0
1
(C1-set);(V-set)
51
20
83
3158
4232
17
149
4
5
1
(C1-set);(V-set)
52
20
34
3158
4232
16
175
0
0
1
(C1-set);(V-set)
53
20
89
3158
4232
3
294
0
1
1
(C1-set);(V-set)
54
20
27
3158
4232
7
206
0
0
1
(C1-set);(V-set)
55
20
22
3158
4232
16
145
5
0
1
(C1-set);(V-set)
56
20
27
3158
4232
16
248
0
0
1
(C1-set);(V-set)
57
20
22
3158
4232
17
206
0
14
1
(C1-set);(V-set)
58
20
24
3158
4232
6
192
4
0
1
(C1-set);(V-set)
59
20
22
3158
4232
15
174
0
5
1
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)
1
626
661
667
703
4
296
100
30
94
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)
2
318
327
667
703
17
300
100
13
48
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)
3
250
256
667
703
65
199
100
11
37
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)
4
22
22
667
703
53
649
100
5
3
(ATP-grasp_2);(Ligase_CoA)
1
28
56
28
56
16
301
100
80
100
(ATP-gua_Ptrans);(ATP-gua_PtransN)
1
27
50
28
51
23
893
100
98
96
(ATP-synt);(ATP-synt_C)
1
95
98
133
137
15
149
100
61
71
(ATP-synt);(ATP-synt_DE_N)
1
167
182
167
182
6
881
100
54
100
(ATP-synt);(ATP-synt_Eps)
1
104
116
104
116
17
952
100
73
100
(ATP-synt);(ATP-synt_ab)
1
147
179
165
197
17
255
100
59
89
(ATP-synt);(ATP-synt_ab_C)
1
144
176
158
190
18
282
100
59
91
(ATP-synt);(ATP-synt_ab_C)
2
31
33
158
190
23
138
100
48
20
(ATP-synt);(ATP-synt_ab_C)
3
25
29
158
190
27
126
100
72
16
(ATP-synt_A);(ATP-synt_C)
1
118
119
128
129
17
376
100
34
92
(ATP-synt_C);(ATP-synt_DE_N)
1
131
135
144
148
6
203
99
45
91
(ATP-synt_C);(ATP-synt_DE_N)
2
22
24
144
148
8
242
100
38
15
(ATP-synt_C);(V_ATPase_I)
1
32
32
40
40
9
426
100
16
80
(ATP-synt_C);(vATP-synt_AC39)
1
40
40
45
45
9
174
100
12
89
(ATP-synt_D);(ATP-synt_F)
1
45
49
46
52
14
1474
100
29
98
(ATP-synt_D);(vATP-synt_AC39)
1
35
35
37
37
14
1009
100
14
95
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_D)
1
32
36
45
51
25
269
100
31
71
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_C)
1
74
103
135
169
20
652
99
55
55
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_N)
1
118
136
200
257
7
125
96
65
59
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_N)
2
69
105
200
257
4
394
98
66
34
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_Xtn)
1
38
47
52
79
24
125
98
51
73
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_Xtn)
2
22
44
52
79
38
1463
100
75
42
(ATP-synt_ab);(vATP-synt_E)
1
31
31
37
37
16
391
100
13
84
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)
1
101
102
147
148
17
376
100
34
69
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)
2
99
99
147
148
8
208
96
43
67
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)
3
21
21
147
148
17
121
100
14
14
(ATP-synt_ab_N);(vATP-synt_E)
1
26
26
38
38
16
170
100
15
68
(Actin);(Gelsolin)
1
22
48
22
50
27
800
100
100
100
(Actin);(Myosin_head)
1
60
60
60
60
29
875
100
38
100
(Acyl-CoA_dh_1);(Acyl-CoA_dh_M)
1
85
127
87
129
8
512
94
99
98
(Acyl-CoA_dh_1);(Acyl-CoA_dh_M)
2
84
124
87
129
6
559
100
100
97
(Acyl-CoA_dh_1);(Acyl-CoA_dh_N)
1
72
111
72
111
7
1077
100
100
100
(Acyl-CoA_dh_M);(Acyl-CoA_dh_N)
1
81
130
82
133
4
908
100
100
99
(Acyl_transf_1);(KAsynt_C_assoc)
1
31
43
31
43
5
494
100
74
100
(Adaptin_N);(Clat_adaptor_s)
1
32
34
37
39
6
1717
100
65
86
(AdoHcyase);(AdoHcyase_NAD)
1
37
60
37
61
20
756
98
100
100
(AdoHcyase);(AdoHcyase_NAD)
2
37
59
37
61
20
734
100
100
100
(AlaDh_PNT_C);(AlaDh_PNT_N)
1
25
42
30
49
23
274
95
98
83
(AlaDh_PNT_C);(AlaDh_PNT_N)
2
23
33
30
49
11
2219
100
97
77
(Ala_racemase_C);(Ala_racemase_N)
1
36
66
36
66
18
728
100
100
100
(Ala_racemase_C);(Ala_racemase_N)
2
35
65
36
66
18
899
100
97
97
(Ald_Xan_dh_C);(Ald_Xan_dh_C2)
1
21
81
21
82
15
2123
100
100
100
(Ald_Xan_dh_C);(Fer2)
1
21
66
20
80
15
300
100
100
105
(Ald_Xan_dh_C);(Fer2_2)
1
22
68
21
82
15
261
100
100
105
(Ald_Xan_dh_C2);(Fer2)
1
21
66
20
71
17
282
100
100
105
(Ald_Xan_dh_C2);(Fer2_2)
1
22
68
21
82
17
1012
100
100
105
(Alpha-amylase);(Alpha-amylase_C)
1
38
178
46
191
2
828
100
100
83
(Alpha-amylase);(CBM_48)
1
30
57
30
87
10
893
98
96
100
(Alpha-amylase);(DUF1939)
1
20
40
20
40
8
406
100
100
100
(Alpha-amylase);(DUF3459)
1
23
38
25
48
6
1347
100
84
92
(Alpha-amylase);(Malt_amylase_C)
1
50
150
50
150
4
884
100
99
100
(Alpha_E1_glycop);(Alpha_E2_glycop)
1
22
22
45
48
33
2991
100
0
49
(Alpha_E1_glycop);(Alpha_E2_glycop)
2
21
23
45
48
32
967
100
30
47
(Alpha_E2_glycop);(Peptidase_S3)
1
20
21
25
26
25
472
100
0
80
(Amidohydro_1);(Urease_alpha)
1
25
54
27
97
9
1266
100
98
93
(Ank);(Ank_2)
1
141
160
155
195
3
650
98
80
91
(Ank_2);(Ank_4)
1
80
91
90
105
4
634
97
49
89
(Ank_2);(Ank_5)
1
44
60
50
66
12
1005
100
92
88
(ApbA);(ApbA_C)
1
20
23
20
23
13
859
100
100
100
(ArgoMid);(Piwi)
1
20
58
20
58
4
1673
100
100
100
(Arm);(Arm_3)
1
65
142
71
156
20
768
100
94
92
(Arm);(IBB)
1
50
111
69
148
15
513
100
95
72
(Arm);(IBB)
2
32
99
69
148
12
212
0
0
46
(Arrestin_C);(Arrestin_N)
1
21
37
22
40
29
1450
100
78
95
(BBE);(FAD_binding_4)
1
35
65
35
70
18
776
100
97
100
(BCAS2);(Prp19)
1
24
24
27
27
15
553
100
12
89
(BCAS2);(Prp19)
2
21
21
27
27
15
390
100
10
78
(Bcl-2);(BH4)
1
70
116
82
123
6
867
93
91
85
(Bcl-2);(BH4)
2
22
33
82
123
18
186
3
12
27
(Bcl-2);(Bclx_interact)
1
32
44
33
45
4
905
95
95
97
(Biotin_carb_C);(Biotin_carb_N)
1
38
82
40
85
19
558
100
100
95
(Biotin_carb_C);(Biotin_carb_N)
2
30
71
40
85
19
370
69
41
75
(Biotin_carb_C);(CPSase_L_D2)
1
39
82
40
85
19
1148
100
100
98
(Biotin_carb_C);(CPSase_L_D2)
2
24
64
40
85
23
196
66
34
60
(Biotin_carb_N);(CPSase_L_D2)
1
39
84
40
85
10
958
100
100
98
(Brix);(Ribosomal_S9)
1
29
29
35
35
48
311
100
3
83
(Bromo_TP);(TFIID_30kDa)
1
26
26
26
26
50
1373
100
15
100
(Bromodomain);(DUF902)
1
31
95
31
96
5
190
98
97
100
(C1-set);(DUF1968)
1
253
416
260
464
2
1208
97
95
97
(C1-set);(MHC_I)
1
550
1042
584
1182
6
692
99
96
94
(C1-set);(MHC_I)
2
204
339
584
1182
14
171
99
99
35
(C1-set);(MHC_I)
3
116
201
584
1182
18
267
0
3
20
(C1-set);(MHC_I)
4
42
123
584
1182
70
521
0
0
7
(C1-set);(MHC_I)
5
39
117
584
1182
70
333
0
0
7
(C1-set);(MHC_I)
6
35
71
584
1182
13
137
0
3
6
(C1-set);(MHC_I)
7
35
38
584
1182
23
391
97
97
6
(C1-set);(MHC_I)
8
33
96
584
1182
20
255
0
0
6
(C1-set);(MHC_I)
9
33
80
584
1182
19
246
0
0
6
(C1-set);(MHC_I)
10
31
181
584
1182
21
159
1
0
5
(C1-set);(MHC_I)
11
31
173
584
1182
20
185
0
0
5
(C1-set);(MHC_I)
12
27
61
584
1182
68
324
0
5
5
(C1-set);(MHC_I)
13
20
60
584
1182
37
207
0
0
3
(C1-set);(MHC_II_alpha)
1
155
210
157
215
18
302
96
97
99
(C1-set);(MHC_II_alpha)
2
121
156
157
215
18
507
100
99
77
(C1-set);(MHC_II_alpha)
3
20
34
157
215
3
179
0
0
13
(C1-set);(MHC_II_beta)
1
155
210
157
215
10
230
97
97
99
(C1-set);(MHC_II_beta)
2
20
35
157
215
28
300
0
0
13
(C1-set);(MHC_I_3)
1
50
133
50
153
35
566
99
98
100
(C1-set);(MHC_I_3)
2
28
46
50
153
37
205
96
91
56
(C1-set);(V-set_2)
1
196
215
251
287
11
164
97
92
78
(C2-set);(ig)
1
33
48
34
49
76
551
98
79
97
(C2-set_2);(V-set)
1
29
34
46
54
9
238
100
94
63
(CAF1C_H4-bd);(WD40)
1
23
34
23
34
35
1144
100
97
100
(CBS);(IMPDH)
1
38
46
43
57
11
397
100
59
88
(CCP_MauG);(Cytochrom_C)
1
21
26
22
32
14
1152
100
100
95
(CDC48_2);(CDC48_N)
1
68
75
72
80
2
568
97
47
94
(CHCH);(Ribosomal_S11)
1
28
29
32
33
60
179
100
0
88
(CHCH);(Ribosomal_S7)
1
37
38
37
38
21
663
100
5
100
(COX1);(COX2)
1
57
153
57
153
15
1294
98
79
100
(COX1);(COX2_TM)
1
50
116
50
116
10
2083
100
73
100
(COX1);(COX3)
1
46
102
46
102
22
1986
100
71
100
(COX1);(COX4)
1
21
74
21
74
15
955
100
80
100
(COX1);(COX5B)
1
22
75
23
76
30
361
100
73
96
(COX1);(COX7C)
1
23
76
23
76
4
980
100
74
100
(COX1);(COX7a)
1
20
73
23
76
20
205
100
78
87
(COX2);(COX6B)
1
23
76
23
76
34
686
100
70
100
(COX2_TM);(COX5A)
1
21
74
21
74
28
280
100
72
100
(COX2_TM);(COX6C)
1
21
74
21
74
16
897
100
76
100
(COX3);(COX5B)
1
23
76
23
76
30
848
100
74
100
(COX3);(COX6A)
1
21
74
23
76
34
1575
99
73
91
(COX3);(COX6B)
1
22
75
23
76
34
248
100
69
96
(COX3);(COX7a)
1
23
76
23
76
20
1298
100
75
100
(COX4);(COX5A)
1
21
74
21
74
15
1195
100
76
100
(COX5A);(COX6C)
1
21
74
21
74
16
583
100
70
100
(CPSF_A);(MMS1_N)
1
45
64
52
75
11
1165
100
88
87
(CPSF_A);(WD40)
1
29
30
30
33
12
201
100
67
97
(CR6_interact);(MRP-L51)
1
55
60
55
60
74
426
100
15
100
(CR6_interact);(Ribosomal_L33)
1
53
58
53
58
69
478
100
16
100
(CR6_interact);(Ribosomal_L4)
1
54
59
54
59
74
422
100
15
100
(CTP_synth_N);(GATase)
1
29
40
29
40
40
940
100
30
100
(Cadherin);(Cadherin_2)
1
31
35
31
35
19
175
100
100
100
(Calici_coat);(Calici_coat_C)
1
77
158
79
165
1
3539
98
91
97
(Calici_coat);(Calici_coat_C)
2
73
158
79
165
1
232
92
89
92
(CarD_CdnL_TRCF);(RNA_pol_Rpb2_1)
1
24
24
24
24
18
483
71
8
100
(Catalase);(Catalase-rel)
1
44
141
43
141
7
1334
99
98
102
(Catalase);(Catalase-rel)
2
20
75
43
141
9
116
100
96
47
(Cation_ATPase_C);(E1-E2_ATPase)
1
46
83
49
118
9
775
100
82
94
(Cation_ATPase_C);(Hydrolase)
1
36
75
43
111
13
226
100
81
84
(Cation_ATPase_N);(E1-E2_ATPase)
1
60
99
66
158
10
1724
100
68
91
(Cbl_N);(Cbl_N2)
1
22
35
23
36
27
597
100
100
96
(Cbl_N);(Cbl_N3)
1
22
35
24
37
27
364
100
100
92
(Cbl_N2);(Cbl_N3)
1
22
35
24
38
42
665
100
100
92
(Cdc6_C);(ORC4_C)
1
23
23
23
23
7
821
78
9
100
(Chal_sti_synt_C);(Chal_sti_synt_N)
1
54
97
53
97
2
842
100
99
102
(Chal_sti_synt_C);(Chal_sti_synt_N)
2
54
97
53
97
2
2065
100
99
102
(Chloroa_b-bind);(PSI_PSAK)
1
22
24
30
36
30
350
100
17
73
(Chloroa_b-bind);(PSI_PsaF)
1
29
32
36
42
43
340
100
19
81
(Chloroa_b-bind);(PSI_PsaJ)
1
29
30
35
41
47
141
100
13
83
(Chloroa_b-bind);(PsaA_PsaB)
1
30
33
36
42
23
179
100
18
83
(Complex1_30kDa);(Complex1_49kDa)
1
92
100
93
101
12
1315
100
28
99
(Complex1_30kDa);(Oxidored_q6)
1
96
102
98
106
12
400
100
27
98
(Complex1_49kDa);(Fer4_7)
1
90
96
96
104
25
439
100
29
94
(Complex1_49kDa);(NADH-G_4Fe-4S_3)
1
85
93
85
93
21
769
100
31
100
(Complex1_49kDa);(NADHdh)
1
86
91
88
93
16
816
100
23
98
(Complex1_49kDa);(Oxidored_q6)
1
96
102
98
106
25
563
100
27
98
(Complex1_51K);(Fer2_4)
1
70
70
81
89
24
143
100
26
86
(Creatinase_N);(Peptidase_M24)
1
21
33
24
38
7
490
100
100
88
(Creatinase_N);(Peptidase_M24)
2
20
30
24
38
5
536
100
100
83
(Cu-oxidase);(Cu-oxidase_2)
1
77
196
77
228
1
906
100
100
100
(Cu-oxidase);(Cu-oxidase_3)
1
104
379
105
416
1
1142
100
99
99
(Cu-oxidase_2);(Cu-oxidase_3)
1
104
252
104
286
6
952
100
97
100
(Cu_amine_oxid);(Cu_amine_oxidN2)
1
20
144
20
144
8
1123
99
100
100
(Cwf_Cwc_15);(PROCN)
1
33
33
34
34
5
944
100
12
97
(Cwf_Cwc_15);(RRM_4)
1
20
20
31
31
5
149
100
10
65
(Cwf_Cwc_15);(SKIP_SNW)
1
20
20
29
29
6
323
100
5
69
(Cwf_Cwc_15);(WD40)
1
32
32
34
34
5
281
100
9
94
(Cyclin_C);(Cyclin_N)
1
28
82
41
169
6
1381
100
99
68
(Cyclin_N);(Pkinase)
1
68
206
72
230
7
1228
100
92
94
(Cytochrom_B559);(Photo_RC)
1
41
96
41
96
58
374
100
35
100
(Cytochrom_B559);(PsbJ)
1
28
81
29
84
27
348
100
21
97
(Cytochrom_B559);(PsbJ)
2
20
72
29
84
26
390
100
24
69
(Cytochrom_B559a);(Photo_RC)
1
40
94
40
95
44
1134
100
34
100
(Cytochrom_B559a);(Photo_RC)
2
40
94
40
95
44
257
100
33
100
(Cytochrom_B_C);(Rieske)
1
66
96
70
111
11
496
86
58
94
(Cytochrom_B_C);(UCR_14kD)
1
50
80
50
88
25
400
100
66
100
(Cytochrom_B_C);(UcrQ)
1
48
78
48
85
20
682
100
68
100
(Cytochrom_C1);(Cytochrome_B)
1
56
93
60
104
32
546
100
68
93
(Cytochrom_C1);(UCR_14kD)
1
28
64
46
83
37
147
100
89
61
(Cytochrom_C1);(UCR_TM)
1
45
71
47
81
24
510
100
68
96
(Cytochrom_C1);(UCR_UQCRX_QCR9)
1
47
83
50
87
32
849
100
71
94
(Cytochrom_C1);(UCR_hinge)
1
50
80
50
87
25
761
100
66
100
(Cytochrom_C1);(UcrQ)
1
48
84
48
86
20
363
100
70
100
(Cytochrom_C550);(PSII)
1
24
78
24
79
50
930
100
44
100
(Cytochrom_C550);(Photo_RC)
1
24
78
24
79
58
481
100
44
100
(Cytochrom_C550);(PsbU)
1
22
76
22
77
32
636
100
26
100
(Cytochrome_B);(Rieske)
1
44
64
56
97
28
288
89
66
79
(Cytochrome_B);(UCR_14kD)
1
47
77
50
88
25
196
100
69
94
(Cytochrome_B);(UCR_TM)
1
44
63
47
85
24
214
81
59
94
(Cytochrome_B);(UCR_TM)
2
43
69
47
85
24
479
100
70
91
(Cytochrome_B);(UcrQ)
1
44
73
48
85
20
158
100
71
92
(DAP3);(Ribosomal_S7)
1
34
35
42
43
16
697
100
3
81
(DAP3);(Ribosomal_S9)
1
49
50
49
50
5
636
98
4
100
(DEAD);(Helicase_C)
1
96
154
146
218
5
473
100
94
66
(DNA_RNApol_7kD);(RNA_pol_A_bac)
1
93
137
175
306
27
350
100
68
53
(DNA_RNApol_7kD);(RNA_pol_Rpb2_1)
1
174
265
174
305
18
239
100
57
100
(DNA_RNApol_7kD);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
179
269
179
312
31
657
100
58
100
(DNA_gyraseB);(HATPase_c)
1
29
36
31
45
10
492
100
94
94
(DNA_gyraseB_C);(DNA_topoisoIV)
1
29
68
30
70
34
312
96
78
97
(DNA_gyraseB_C);(DNA_topoisoIV)
2
29
64
30
70
35
213
95
75
97
(DNA_gyraseB_C);(Toprim)
1
21
35
23
45
34
1281
100
91
91
(DNA_photolyase);(FAD_binding_7)
1
47
79
47
79
12
1312
100
97
100
(DNA_pol3_beta);(DNA_pol3_beta_2)
1
58
101
60
103
11
627
100
98
97
(DNA_pol3_beta);(DNA_pol3_beta_3)
1
63
106
64
107
11
604
92
87
98
(DNA_pol3_beta_2);(DNA_pol3_beta_3)
1
58
101
60
103
11
675
100
98
97
(DNA_pol_B);(DNA_pol_B_exo1)
1
61
214
60
216
3
1083
100
99
102
(DNA_pol_B_palm);(DNA_pol_B_thumb)
1
39
557
39
623
2
513
100
100
100
(DNA_pol_B_palm);(DNA_pol_lambd_f)
1
32
581
32
609
2
398
100
100
100
(DNA_pol_lambd_f);(HHH_8)
1
23
522
27
583
20
200
100
100
85
(DNA_topoisoIV);(Toprim)
1
38
79
44
94
11
316
96
80
86
(DPPIV_N);(Peptidase_S9)
1
46
164
55
179
16
1537
100
95
84
(DPPIV_N);(Peptidase_S9)
2
43
164
55
179
16
332
85
90
78
(DUF1968);(V-set)
1
87
138
226
412
13
149
96
96
38
(DUF1968);(V-set)
2
26
32
226
412
12
159
0
19
12
(DUF3439);(LRR_8)
1
38
43
53
60
10
637
100
91
72
(DUF4976);(Sulfatase)
1
31
41
31
41
1
1972
100
93
100
(DUF4982);(Glyco_hydro_2_C)
1
20
29
22
32
11
474
100
97
91
(DUF5110);(Glyco_hydro_31)
1
27
104
27
104
1
1154
100
90
100
(DXP_redisom_C);(DXPR_C)
1
24
75
24
75
26
1568
100
100
100
(DXP_redisom_C);(DXP_reductoisom)
1
24
75
24
75
22
588
100
100
100
(DXP_reductoisom);(DXPR_C)
1
24
75
24
75
22
923
100
100
100
(Dala_Dala_lig_C);(Dala_Dala_lig_N)
1
30
56
30
58
10
943
100
100
100
(DapB_C);(DapB_N)
1
22
35
22
35
14
1223
100
100
100
(Dimerisation);(Methyltransf_2)
1
28
67
28
67
15
728
99
100
100
(Dimerisation2);(Methyltransf_2)
1
21
33
21
33
9
1089
76
94
100
(Dynamin_M);(Dynamin_N)
1
34
41
34
42
1
1440
100
85
100
(Dynamin_M);(GED)
1
22
24
22
24
6
2980
100
79
100
(E1-E2_ATPase);(Hydrolase)
1
41
78
68
171
15
722
100
72
60
(E1_dh);(Transket_pyr)
1
24
75
24
75
13
818
100
99
100
(E1_dh);(Transket_pyr)
2
23
73
24
75
13
1247
100
99
96
(EF-hand_1);(EF-hand_7)
1
22
27
67
85
5
409
81
74
33
(EF-hand_1);(S_100)
1
75
176
76
177
4
471
98
65
99
(EF-hand_7);(IQ)
1
81
88
94
106
3
643
99
69
86
(EFG_C);(EFG_IV)
1
26
37
30
43
5
457
100
84
87
(EFG_C);(Ribosomal_L11_N)
1
46
49
55
63
14
220
100
10
84
(EFTUD2);(WD40)
1
34
34
34
34
13
272
100
15
100
(EFTUD2);(WD40)
2
26
26
34
34
20
434
100
12
76
(EIF_2_alpha);(GTP_EFTU_D2)
1
39
39
40
40
21
458
92
36
98
(ELFV_dehydrog);(ELFV_dehydrog_N)
1
47
77
47
77
2
612
100
81
100
(ELFV_dehydrog);(ELFV_dehydrog_N)
2
30
44
47
77
17
233
100
75
64
(EMG1);(Ribosomal_S7)
1
26
26
30
30
70
320
100
4
87
(ERCC3_RAD25_C);(Tfb5)
1
33
36
35
38
27
509
100
36
94
(Endonuclease_NS);(Phosphodiest)
1
25
51
28
64
39
768
100
94
89
(Enolase_C);(Enolase_N)
1
39
87
39
87
40
644
94
99
100
(Enolase_C);(Enolase_N)
2
39
87
39
87
40
1493
100
100
100
(F-box-like);(Skp1)
1
27
37
27
38
13
956
100
86
100
(FAD_binding_2);(Succ_DH_flav_C)
1
22
59
24
93
12
2744
100
97
92
(FAD_binding_5);(Fer2_2)
1
20
61
19
70
16
214
100
100
105
(FAD_binding_6);(NAD_binding_1)
1
50
74
52
85
3
747
100
100
96
(FAT);(PI3_PI4_kinase)
1
70
73
71
79
7
521
100
44
99
(FATC);(PI3_PI4_kinase)
1
75
78
76
84
15
1529
100
44
99
(FERM_C);(FERM_M)
1
37
93
40
96
8
439
100
100
92
(FERM_C);(FERM_N)
1
33
89
38
94
11
289
100
100
87
(FERM_M);(FERM_N)
1
37
93
42
99
8
482
100
100
88
(FG-GAP);(Integrin_alpha2)
1
40
60
40
63
9
229
100
82
100
(FG-GAP);(Integrin_beta)
1
49
80
51
83
27
261
90
74
96
(FGGY_C);(FGGY_N)
1
40
86
40
87
8
1886
99
98
100
(Oxidored_q2);(Oxidored_q3)
1
95
100
95
100
12
2633
100
25
100
(Oxidored_q2);(Oxidored_q4)
1
90
95
93
98
13
402
100
26
97
(Oxidored_q2);(Proton_antipo_M)
1
97
102
97
102
9
1587
100
25
100
(Oxidored_q3);(Oxidored_q4)
1
94
99
95
100
12
1609
100
24
99
(Oxidored_q3);(Proton_antipo_M)
1
90
95
93
98
12
610
100
26
97
(Oxidored_q4);(Oxidored_q6)
1
54
59
60
65
25
367
100
22
90
(PARP);(PARP_reg)
1
26
86
30
96
33
1217
100
97
87
(PBP);(RF-1)
1
44
49
53
58
63
600
100
16
83
(PBP);(Ribosomal_L18p)
1
55
60
55
60
4
473
97
15
100
(PBP_dimer);(Transpeptidase)
1
49
145
50
150
11
958
100
94
98
(PCNA_C);(PCNA_N)
1
90
130
95
135
9
857
98
92
95
(PCNA_C);(PCNA_N)
2
84
123
95
135
11
662
88
70
88
(PDCD9);(Ribosomal_L17)
1
54
59
54
59
75
360
100
15
100
(PDCD9);(Ribosomal_L2)
1
52
57
54
59
73
370
100
16
96
(PDCD9);(Ribosomal_L23)
1
54
59
54
59
75
518
100
15
100
(PDZ_2);(Trypsin_2)
1
24
40
36
67
16
264
100
95
67
(PGM_PMM_I);(PGM_PMM_II)
1
27
74
28
87
10
808
100
96
96
(PGM_PMM_I);(PGM_PMM_III)
1
25
71
27
86
9
473
100
96
93
(PGM_PMM_II);(PGM_PMM_III)
1
25
71
27
86
9
1214
100
96
93
(PGM_PMM_III);(PGM_PMM_IV)
1
25
74
25
78
3
688
100
99
100
(PI3K_C2);(PI3Ka)
1
21
140
23
236
28
811
100
98
91
(PI3_PI4_kinase);(PI3Ka)
1
32
164
35
264
2
1066
99
96
91
(PK);(PK_C)
1
62
123
62
123
12
1402
100
98
100
(PRO8NT);(SKIP_SNW)
1
34
34
36
36
32
262
100
12
94
(PROCN);(SKIP_SNW)
1
37
37
37
37
32
1359
100
11
100
(PROCN);(WD40)
1
31
31
37
37
7
237
100
13
84
(PROCN);(WD40)
2
29
29
37
37
10
187
100
10
78
(PROCT);(Sec63)
1
32
37
34
39
41
888
73
43
94
(PRY);(SPRY)
1
31
37
31
37
13
1208
92
84
100
(PSI);(Sema)
1
40
40
41
41
9
399
100
78
98
(PSII);(Ycf9)
1
36
84
36
91
25
438
100
23
100
(PSII_Ycf12);(Ycf9)
1
27
81
27
82
27
403
100
22
100
(PSI_8);(PSI_PsaH)
1
21
27
21
27
32
314
100
22
100
(PSI_PsaE);(PSI_PsaF)
1
28
33
55
61
36
245
100
24
51
(PSI_PsaF);(PSI_PsaJ)
1
59
70
59
70
28
651
100
33
100
(PapD_C);(PapD_N)
1
32
42
41
52
16
527
100
93
78
(Peptidase_M16);(Peptidase_M16_C)
1
97
166
102
182
7
888
99
74
95
(Peptidase_M16);(Peptidase_M16_M)
1
23
50
26
58
18
1262
100
80
88
(Peptidase_M16);(UCR_14kD)
1
41
60
44
69
25
363
80
60
93
(Peptidase_M16);(UCR_TM)
1
47
79
48
83
22
462
100
68
98
(Peptidase_M16);(Ubiq-Cytc-red_N)
1
27
57
27
58
23
745
100
77
100
(Peptidase_M16_C);(Peptidase_M16_M)
2
23
50
28
60
7
3889
100
80
82
(Peptidase_M16_C);(UCR_TM)
1
42
68
48
83
24
300
100
68
88
(Peptidase_M16_C);(UCR_UQCRX_QCR9)
1
33
50
37
58
13
149
96
62
89
(Peptidase_M16_C);(Ubiq-Cytc-red_N)
1
27
56
27
59
19
679
100
77
100
(Peptidase_M16_C);(Ubiq-Cytc-red_N)
2
21
43
27
59
11
424
100
81
78
(Peptidase_M16_C);(UcrQ)
1
48
85
48
86
10
443
100
71
100
(Peptidase_M27);(Toxin_trans)
1
23
37
25
40
16
1091
100
95
92
(Peptidase_S9);(Peptidase_S9_N)
1
24
68
24
68
9
3361
100
99
100
(Phosphodiest);(Somatomedin_B)
1
23
49
24
52
28
514
100
94
96
(Photo_RC);(PRC)
1
27
153
27
156
31
211
100
88
100
(Photo_RC);(PRC)
2
27
153
27
156
31
166
95
90
100
(Photo_RC);(PRCH)
1
27
153
27
156
34
1584
100
92
100
(Photo_RC);(PRCH)
2
27
153
27
156
34
436
95
90
100
(Photo_RC);(PSII)
1
41
95
41
96
16
2194
100
45
100
(Photo_RC);(PSII)
2
37
91
41
96
54
780
100
48
90
(Photo_RC);(PsbH)
1
38
92
38
93
69
211
100
35
100
(Photo_RC);(PsbI)
1
39
93
39
94
63
724
100
26
100
(Photo_RC);(PsbJ)
1
28
82
29
84
55
146
100
26
97
(Photo_RC);(PsbL)
1
38
92
38
93
77
400
100
27
100
(Photo_RC);(PsbL)
2
38
92
38
93
77
254
100
27
100
(Photo_RC);(PsbM)
1
25
79
34
89
36
171
100
23
74
(Photo_RC);(PsbT)
1
38
92
38
93
44
217
100
28
100
(Photo_RC);(PsbT)
2
38
91
38
93
44
428
100
25
100
(Photo_RC);(PsbX)
1
37
91
37
92
34
218
100
26
100
(Pico_P1A);(Rhv)
1
129
214
135
223
16
390
98
43
96
(Pico_P1A);(Rhv)
2
112
185
135
223
35
543
99
40
83
(Pkinase);(Pkinase_C)
1
38
79
44
94
12
1250
100
100
86
(Pkinase);(Ribonuc_2-5A)
1
22
39
23
40
15
479
100
100
96
(Plug);(TonB_dep_Rec)
1
58
109
58
113
8
3427
100
97
100
(Plug_translocon);(Sec61_beta)
1
36
38
36
38
5
351
95
32
100
(Plug_translocon);(SecE)
1
41
43
42
44
5
277
95
30
98
(Pr_beta_C);(Proteasome)
1
87
379
91
387
20
652
93
77
96
(Pr_beta_C);(Proteasome)
2
24
91
91
387
74
155
100
86
26
(Pre-SET);(SET)
1
23
47
26
52
15
1739
100
100
88
(ProRS-C_1);(tRNA-synt_2b)
1
23
48
23
48
11
961
100
96
100
(Proteasome);(Proteasome_A_N)
1
123
419
124
425
20
227
100
80
99
(Proteasome);(Proteasome_A_N)
2
79
179
124
425
21
476
99
70
64
(Proteasome);(Proteasome_A_N)
3
55
342
124
425
23
156
99
87
44
(Proton_antipo_M);(Proton_antipo_N)
1
89
94
90
95
11
242
81
20
99
(PsaA_PsaB);(PSI_8)
1
59
70
59
70
28
529
100
30
100
(PsaA_PsaB);(PSI_PSAK)
1
56
64
59
70
12
549
100
20
95
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaE)
1
67
78
67
78
45
304
100
23
100
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaE)
2
52
58
67
78
50
365
98
22
78
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaF)
1
61
72
61
72
28
837
100
32
100
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaF)
2
59
70
61
72
28
921
100
34
97
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaH)
1
21
27
21
27
32
728
100
26
100
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaJ)
1
49
57
62
73
32
113
100
33
79
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaJ)
2
44
48
62
73
32
119
100
25
71
(PsaA_PsaB);(PsaD)
1
67
78
67
78
52
789
100
31
100
(PsaA_PsaB);(PsaD)
2
67
78
67
78
52
700
100
32
100
(PsaA_PsaB);(PsaL)
1
62
73
62
73
34
539
100
30
100
(PsaA_PsaB);(PsaL)
2
59
70
62
73
34
300
100
29
95
(PsaA_PsaB);(PsaM)
1
40
45
40
45
34
906
100
31
100
(PsaD);(PSI_PsaE)
1
61
72
63
74
50
146
100
24
97
(PsaD);(PsaL)
1
56
67
57
68
34
433
100
33
98
(PsaL);(PSI_8)
1
59
70
59
70
28
212
100
30
100
(PsaL);(PSI_PsaH)
1
21
27
21
27
32
1519
100
26
100
(PsaM);(PSI_8)
1
35
40
36
41
26
249
100
35
97
(PsbH);(PSII)
1
38
91
38
92
69
1496
100
35
100
(PsbH);(PsbX)
1
36
90
37
92
34
266
100
23
97
(PsbI);(PSII)
1
35
88
36
91
60
440
100
25
97
(PsbJ);(PSII_Ycf12)
1
22
75
22
77
28
159
100
20
100
(PsbJ);(PsbK)
1
29
83
29
84
32
135
100
23
100
(PsbK);(PSII)
1
39
93
39
94
50
738
100
34
100
(PsbK);(PSII_Ycf12)
1
27
80
27
82
31
504
100
24
100
(PsbK);(Ycf9)
1
36
90
36
91
25
264
100
20
100
(PsbL);(PSII)
1
38
92
38
93
72
605
100
28
100
(PsbL);(PsbM)
1
37
91
37
92
31
803
100
27
100
(PsbL);(PsbT)
1
38
92
38
93
31
592
100
25
100
(PsbM);(PsbT)
1
37
91
37
92
28
230
100
16
100
(PsbT);(PSII)
1
29
76
34
89
44
144
84
12
85
(PsbT);(PSII)
2
26
78
34
89
44
149
100
29
76
(PsbU);(PSII)
1
22
74
22
77
32
433
100
32
100
(PsbU);(PSII)
2
22
74
22
77
32
461
100
35
100
(Pyr_redox_2);(Pyr_redox_dim)
1
97
231
98
232
7
604
96
100
99
(Pyr_redox_2);(Pyr_redox_dim)
2
95
228
98
232
7
1155
100
100
97
(RF-1);(Ribosomal_L27A)
1
55
60
55
60
50
308
100
15
100
(RNA_POL_M_15KD);(RNA_pol_Rpb1_7)
1
97
205
98
225
40
319
100
62
99
(RNA_POL_M_15KD);(RNA_pol_Rpb2_2)
1
166
264
167
298
13
494
100
50
99
(RNA_POL_M_15KD);(TFIIF_alpha)
1
24
28
28
32
14
238
100
18
86
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_L)
1
122
148
229
353
22
1375
100
47
53
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_L)
2
30
40
229
353
40
148
100
52
13
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_N)
1
178
270
179
312
27
893
100
62
99
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb1_3)
1
198
255
230
359
14
601
100
36
86
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb1_3)
2
29
83
230
359
81
303
100
93
13
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
230
342
410
671
34
1194
100
51
56
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb2_6)
2
177
269
410
671
27
564
100
62
43
(RNA_pol_I_A49);(RNA_polI_A34)
1
34
38
34
38
42
1000
100
76
100
(RNA_pol_L);(RNA_pol_L_2)
1
37
38
37
38
20
863
100
55
100
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_2)
1
211
317
224
353
49
201
100
51
94
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_3)
1
185
242
229
358
28
185
100
36
81
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_3)
2
29
74
229
358
82
137
99
93
13
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
259
371
267
398
10
421
100
50
97
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb2_6)
2
222
351
267
398
49
246
100
54
83
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb1_2)
1
176
266
178
309
26
225
100
49
99
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb1_3)
1
178
281
179
312
22
538
100
50
99
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
175
267
178
309
26
252
100
62
98
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb8)
1
102
188
155
285
26
162
100
46
66
(RNA_pol_N);(RNA_pol_Rpb2_1)
1
145
234
175
306
20
230
100
66
83
(RNA_pol_N);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
179
269
179
312
33
1345
100
61
100
(RNA_pol_Rbc25);(RNA_pol_Rpb2_7)
1
25
25
26
26
36
165
100
52
96
(RNA_pol_Rbc25);(RNA_pol_Rpb4)
1
29
29
29
29
28
628
100
59
100
(RNA_pol_Rpa2_4);(RNA_polI_A34)
1
31
35
32
36
89
245
100
74
97
(RNA_pol_Rpa2_4);(RNA_pol_Rpb1_4)
1
37
41
38
42
55
169
100
78
97
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb1_2)
1
72
86
115
156
15
121
100
50
63
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb1_5)
1
85
103
141
239
10
187
100
50
60
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
386
564
407
659
9
390
89
49
95
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb2_7)
1
411
589
417
681
8
1543
89
49
99
(RNA_pol_Rpb1_1);(SHS2_Rpb7-N)
1
60
66
116
143
8
215
100
71
52
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r1_2)
1
101
173
101
214
10
325
99
51
100
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r2)
1
112
192
113
238
10
772
100
53
99
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r3)
1
102
174
104
218
10
605
100
51
98
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r4)
1
53
126
92
203
33
140
100
76
58
(RNA_pol_Rpb1_1);(TFIIE_alpha)
1
36
36
47
48
10
883
97
44
77
(RNA_pol_Rpb1_1);(TF_Zn_Ribbon)
1
47
51
51
56
21
272
100
31
92
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb1_3)
1
117
137
121
164
8
658
100
44
97
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb1_5)
1
120
139
132
176
12
216
100
46
91
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
414
596
416
682
19
1278
90
48
100
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb2_7)
1
410
596
412
675
19
1398
89
49
100
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb6)
1
392
585
395
657
11
746
100
56
99
(RNA_pol_Rpb1_2);(SHS2_Rpb7-N)
1
37
41
163
223
26
193
100
80
23
(RNA_pol_Rpb1_2);(Sigma70_r3)
1
61
104
98
210
24
130
100
39
62
(RNA_pol_Rpb1_2);(TF_Zn_Ribbon)
1
50
54
50
55
21
459
100
30
100
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb1_4)
1
117
139
124
169
8
746
100
45
94
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb1_5)
1
121
140
130
172
8
218
100
47
93
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
418
595
418
683
8
1031
89
47
100
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb6)
1
165
233
192
312
16
173
100
48
86
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb8)
1
165
256
166
298
28
1427
100
58
99
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb1_5)
1
121
143
133
179
9
514
100
45
91
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_3)
1
214
332
414
674
9
251
99
57
52
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_45)
1
87
112
211
321
17
195
78
49
41
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_5)
1
142
232
143
275
5
397
100
47
99
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
415
596
419
683
9
484
89
48
99
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb8)
1
30
30
138
268
25
130
100
73
22
(RNA_pol_Rpb1_4);(TFIIS_C)
1
97
182
124
256
36
534
95
52
78
(RNA_pol_Rpb1_4);(TFIIS_C)
2
27
31
124
256
24
273
90
48
22
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_3)
1
411
590
417
680
7
618
89
48
99
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_45)
1
220
302
229
356
16
177
78
44
96
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_5)
1
62
146
142
272
13
207
100
50
44
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
182
281
418
681
19
386
100
53
44
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_6)
2
66
91
418
681
18
125
62
31
16
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_7)
1
403
583
412
673
7
319
89
49
98
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb5_C)
1
179
291
179
312
27
1379
100
61
100
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb5_N)
1
76
119
163
293
31
124
100
65
47
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb6)
1
363
578
387
642
11
211
100
58
94
(RNA_pol_Rpb1_5);(TFIIS_C)
1
31
35
37
43
30
427
91
54
84
(RNA_pol_Rpb1_6);(RNA_pol_Rpb5_C)
1
98
207
99
227
35
579
100
61
99
(RNA_pol_Rpb1_6);(RNA_pol_Rpb6)
1
81
184
99
225
35
162
100
65
82
(RNA_pol_Rpb1_6);(RNA_pol_Rpb8)
1
46
52
89
205
33
348
100
29
52
(RNA_pol_Rpb1_7);(RNA_pol_Rpb2_2)
1
68
150
95
221
40
160
100
45
72
(RNA_pol_Rpb2_1);(RNA_pol_Rpb2_2)
1
63
75
82
126
14
488
100
32
77
(RNA_pol_Rpb2_1);(RNA_pol_Rpb2_3)
1
70
84
75
101
9
848
100
35
93
(RNA_pol_Rpb2_1);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
69
83
79
106
9
449
100
35
87
(RNA_pol_Rpb2_1);(Sigma70_r3)
1
78
151
90
189
14
326
100
56
87
(RNA_pol_Rpb2_1);(TFIIB)
1
49
53
49
54
12
358
100
26
100
(RNA_pol_Rpb2_2);(RNA_pol_Rpb2_3)
1
73
91
78
118
9
396
100
40
94
(RNA_pol_Rpb2_2);(RNA_pol_Rpb2_45)
1
40
54
51
80
25
141
100
41
78
(RNA_pol_Rpb2_2);(RNA_pol_Rpb2_5)
1
22
26
23
35
78
139
100
31
96
(RNA_pol_Rpb2_2);(Sigma70_r1_2)
1
32
38
76
167
21
144
97
32
42
(RNA_pol_Rpb2_2);(TFIIF_alpha)
1
30
34
33
37
14
736
100
18
91
(RNA_pol_Rpb2_2);(TFIIS_C)
1
83
169
98
226
36
167
94
42
85
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_4)
1
31
37
33
47
61
370
100
43
94
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_5)
1
27
33
29
43
34
283
100
42
93
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_6)
1
45
59
84
126
56
384
100
39
54
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_6)
2
34
40
84
126
22
906
100
48
40
(RNA_pol_Rpb2_4);(RNA_pol_Rpb2_5)
1
27
33
29
43
33
1114
100
42
93
(RNA_pol_Rpb2_4);(RNA_pol_Rpc4)
1
27
27
27
27
21
284
100
56
100
(RNA_pol_Rpb2_6);(RNA_polI_A34)
1
32
36
32
36
89
632
100
75
100
(RNA_pol_Rpb2_6);(RNA_pol_Rpb2_7)
1
79
97
85
125
19
419
100
43
93
(RNA_pol_Rpb2_6);(Sigma70_r3)
1
104
184
104
218
14
562
100
54
100
(RNA_pol_Rpb2_6);(Sigma70_r4)
1
101
182
104
217
24
340
100
57
97
(RNA_pol_Rpb2_6);(TFIIB)
1
48
52
49
54
20
309
100
27
98
(RNA_pol_Rpb2_6);(TF_Zn_Ribbon)
1
50
54
50
55
21
663
100
26
100
(RNA_pol_Rpb2_7);(RNA_pol_Rpb6)
1
222
312
390
648
11
209
100
48
57
(RNA_pol_Rpb2_7);(S1)
1
25
27
63
77
25
189
100
41
40
(RNA_pol_Rpb2_7);(SHS2_Rpb7-N)
1
95
104
160
218
7
158
100
59
59
(RNA_pol_Rpb2_7);(Sigma70_r3)
1
94
174
99
212
19
228
100
56
95
(RNA_pol_Rpb4);(S1)
1
108
127
109
166
8
601
100
37
99
(RNA_pol_Rpb4);(SHS2_Rpb7-N)
1
138
153
138
194
8
757
100
41
100
(RNA_pol_Rpb5_C);(RNA_pol_Rpb5_N)
1
37
41
38
42
29
305
100
32
97
(RNA_pol_Rpb6);(SHS2_Rpb7-N)
1
170
191
171
232
7
369
99
49
99
(RNase_H);(RVT_connect)
1
47
318
47
353
32
426
100
97
100
(RNase_H);(RVT_thumb)
1
47
315
47
345
32
607
90
88
100
(RNase_PH);(RNase_PH_C)
1
51
69
51
70
3
499
100
87
100
(RRM_4);(SKIP_SNW)
1
30
30
31
31
32
249
100
10
97
(RVT_1);(RVT_connect)
1
48
319
48
354
38
874
100
97
100
(RVT_1);(RVT_connect)
2
47
317
48
354
37
344
100
97
98
(RVT_1);(RVT_connect)
3
45
313
48
354
37
121
100
98
94
(RVT_1);(RVT_thumb)
1
47
316
48
354
35
242
100
97
98
(RVT_connect);(RVT_thumb)
1
47
326
47
353
35
380
100
97
100
(RVT_connect);(RVT_thumb)
2
28
168
47
353
81
388
100
97
60
(Ras);(RhoGEF)
1
21
35
22
36
16
1154
100
100
95
(Ras);(Xpo1)
1
22
82
23
83
12
436
98
66
96
(RasGEF);(RasGEF_N)
1
20
72
21
80
10
738
100
99
95
(RbpA);(Sigma70_r1_2)
1
21
25
21
26
41
485
100
36
100
(RbpA);(Sigma70_r2)
1
21
25
21
26
77
316
100
36
100
(Rhv);(VP4_2)
1
32
39
35
45
9
379
100
44
91
(Ribonuc_red_lgC);(Ribonuc_red_lgN)
1
23
78
26
86
6
1362
100
95
88
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L18)
1
241
250
246
259
11
954
90
18
98
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L28e)
1
112
112
126
126
14
167
84
9
89
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L30_N)
1
234
235
240
253
8
391
86
17
98
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L6e_N)
1
90
90
94
94
19
313
100
4
96
(Ribosom_S12_S23);(Ribosomal_S17)
1
36
125
77
196
27
217
100
37
47
(Ribosom_S12_S23);(Ribosomal_S30)
1
233
234
238
251
35
417
100
11
98
(Ribosomal_L10);(Ribosomal_L11)
1
162
174
313
330
6
168
100
17
52
(Ribosomal_L10);(Ribosomal_L11)
2
95
95
313
330
39
157
100
13
30
(Ribosomal_L11);(Ribosomal_L37)
1
23
24
23
24
10
982
100
12
100
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L20)
1
496
708
504
729
14
316
100
15
98
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L3)
1
494
706
768
1065
1
146
100
15
64
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L3)
2
237
276
768
1065
4
226
100
13
31
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L35Ae)
1
238
250
247
260
4
226
100
18
96
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L18)
1
206
215
211
224
27
225
100
14
98
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L27A)
1
227
228
228
241
30
1439
100
15
100
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L36e)
1
227
228
227
240
20
538
100
15
100
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L4)
1
234
235
235
248
30
201
100
18
100
(Ribosomal_L14);(Ribosomal_L19)
1
501
722
506
731
15
790
100
14
99
(Ribosomal_L14);(Ribosomal_L24e)
1
263
325
263
337
19
524
100
14
100
(Ribosomal_L14);(Ribosomal_L3)
1
582
833
715
1001
1
216
100
13
81
(Ribosomal_L14e);(Ribosomal_L18A)
1
207
208
248
261
8
122
100
19
83
(Ribosomal_L14e);(Ribosomal_L6e)
1
236
237
245
258
9
483
100
18
96
(Ribosomal_L15e);(Ribosomal_L36e)
1
234
247
243
256
20
527
100
17
96
(Ribosomal_L15e);(Ribosomal_L44)
1
216
256
228
301
25
159
100
23
95
(Ribosomal_L15e);(Ribosomal_L7Ae)
1
215
252
223
296
25
553
100
17
96
(Ribosomal_L16);(Ribosomal_L25p)
1
400
615
404
623
15
481
100
13
99
(Ribosomal_L16);(Ribosomal_L27)
1
90
180
322
505
24
248
100
9
28
(Ribosomal_L16);(Ribosomal_TL5_C)
1
91
195
93
268
15
408
100
13
98
(Ribosomal_L17);(Ribosomal_L22)
1
116
266
502
720
15
127
100
7
23
(Ribosomal_L17);(Ribosomal_L32p)
1
489
709
506
731
12
336
100
15
97
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L27A)
1
239
275
245
318
18
770
100
13
98
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L28e)
1
121
121
122
122
14
222
100
10
99
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L30)
1
214
223
217
230
38
249
100
14
99
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L4)
1
251
318
258
329
18
182
100
14
97
(Ribosomal_L18A);(Ribosomal_L30_N)
1
234
235
244
257
13
170
100
18
96
(Ribosomal_L18p);(Ribosomal_L27)
1
44
49
363
566
80
673
100
16
12
(Ribosomal_L18p);(Ribosomal_L27)
2
43
124
363
566
42
115
100
6
12
(Ribosomal_L19);(Ribosomal_L3)
1
362
417
504
726
1
613
100
18
72
(Ribosomal_L19);(Ribosomal_L3)
2
124
287
504
726
2
717
100
10
25
(Ribosomal_L2);(Ribosomal_L2_C)
1
28
28
30
34
18
1171
100
29
93
(Ribosomal_L2);(Ribosomal_L37ae)
1
241
281
242
315
20
473
100
12
100
(Ribosomal_L20);(Ribosomal_L21p)
1
475
688
503
729
14
967
100
15
94
(Ribosomal_L20);(Ribosomal_L21p)
2
25
33
503
729
44
889
100
6
5
(Ribosomal_L20);(Ribosomal_L32p)
1
171
188
475
694
18
115
100
12
36
(Ribosomal_L21e);(Ribosomal_L29e)
1
208
209
208
221
27
481
100
13
100
(Ribosomal_L21e);(Ribosomal_L5e)
1
227
253
229
302
21
816
100
11
99
(Ribosomal_L22);(Ribosomal_L32p)
1
502
723
504
726
11
468
100
15
100
(Ribosomal_L22);(TGS)
1
55
60
55
60
1
349
100
15
100
(Ribosomal_L22);(Tim44)
1
54
59
55
60
86
187
100
15
98
(Ribosomal_L23);(Ribosomal_L29)
1
681
952
697
988
20
431
100
14
98
(Ribosomal_L23);(Ribosomal_L39)
1
238
297
244
315
31
230
100
12
98
(Ribosomal_L24e);(Ribosomal_L3)
1
251
310
252
325
19
248
100
15
100
(Ribosomal_L26);(Ribosomal_L4)
1
241
242
255
326
31
188
100
19
95
(Ribosomal_L27A);(Ribosomal_L35p)
1
472
680
492
718
18
782
100
13
96
(Ribosomal_L27A);(Ribosomal_L36e)
1
218
219
223
236
28
232
100
15
98
(Ribosomal_L27e);(Ribosomal_L34e)
1
225
226
230
243
22
340
100
15
98
(Ribosomal_L27e);(Ribosomal_L7Ae)
1
224
225
226
239
22
293
100
15
99
(Ribosomal_L28);(Ribosomal_L9_N)
1
390
573
398
584
5
234
100
12
98
(Ribosomal_L28e);(Ribosomal_L32e)
1
126
126
128
128
13
715
100
10
98
(Ribosomal_L28e);(Ribosomal_L4)
1
127
127
128
128
13
716
100
10
99
(Ribosomal_L2_C);(Ribosomal_L37ae)
1
240
280
242
315
30
835
100
12
99
(Ribosomal_L2_C);(Ribosomal_L9_C)
1
148
148
206
213
29
150
100
14
72
(Ribosomal_L2_C);(Ribosomal_S6)
1
32
50
295
461
16
124
100
20
11
(Ribosomal_L3);(Ribosomal_L32p)
1
42
45
54
59
69
127
100
22
78
(Ribosomal_L31);(Ribosomal_L5)
1
248
397
262
424
5
239
100
15
95
(Ribosomal_L31);(Ribosomal_L5_C)
1
237
386
264
426
5
725
100
13
90
(Ribosomal_L31);(Ribosomal_S13)
1
170
311
201
353
18
378
100
14
85
(Ribosomal_L31);(Ribosomal_S19)
1
188
305
206
334
5
401
100
15
91
(Ribosomal_L32p);(TGS)
1
53
58
55
60
1
247
100
16
96
(Ribosomal_L33);(Ribosomal_L35p)
1
324
493
469
665
4
140
100
11
69
(Ribosomal_L34e);(Ribosomal_L7Ae)
1
229
230
231
244
23
224
100
15
99
(Ribosomal_L35Ae);(Ribosomal_L6e)
1
237
238
245
258
10
598
100
18
97
(Ribosomal_L36e);(Ribosomal_L7Ae)
1
196
197
201
214
20
253
100
20
98
(Ribosomal_L37ae);(Ribosomal_L7Ae)
1
227
240
232
245
26
161
100
15
98
(Ribosomal_L37ae);(Ribosomal_S3Ae)
1
33
35
44
57
59
131
100
20
75
(Ribosomal_L37e);(Ribosomal_L39)
1
227
288
237
310
33
191
100
11
96
(Ribosomal_L4);(Ribosomal_L50)
1
62
67
63
68
12
201
100
15
98
(Ribosomal_L40e);(Ribosomal_L6)
1
205
206
206
219
2
384
100
15
100
(Ribosomal_L5);(Stm1_N)
1
26
27
26
39
42
450
100
30
100
(Ribosomal_L5_C);(Ribosomal_L5e)
1
235
268
244
318
28
218
100
13
96
(Ribosomal_L5_C);(Ribosomal_S13)
1
237
391
502
709
24
264
100
11
47
(Ribosomal_L5_C);(Ribosomal_S13)
2
103
128
502
709
15
232
100
9
21
(Ribosomal_L5_C);(Ribosomal_S13)
3
78
78
502
709
34
156
100
1
16
(Ribosomal_L7Ae);(Ribosomal_S13_N)
1
52
52
93
93
31
119
100
0
56
(Ribosomal_L7Ae);(Ribosomal_S15)
1
85
85
137
137
1
230
100
1
62
(Ribosomal_L7Ae);(Ribosomal_S27)
1
224
225
229
242
20
535
100
12
98
(Ribosomal_L7Ae);(S10_plectin)
1
77
77
214
227
24
184
100
10
36
(Ribosomal_L7Ae);(S4)
1
30
30
34
34
41
210
100
3
88
(Ribosomal_L7Ae);(WD40)
1
29
29
43
43
43
217
100
3
67
(Ribosomal_L7Ae);(WD40)
2
22
22
43
43
48
186
100
5
51
(Ribosomal_L9_C);(Ribosomal_S6)
1
117
121
167
173
27
164
100
16
70
(Ribosomal_S10);(Ribosomal_S14)
1
697
1016
704
1036
8
779
100
15
99
(Ribosomal_S10);(Ribosomal_S9)
1
577
873
696
1014
11
153
100
11
83
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S18)
1
256
535
397
691
48
265
100
8
64
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S21)
1
311
347
322
364
12
1035
100
14
97
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S26e)
1
220
233
220
233
38
1089
100
11
100
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S28e)
1
134
134
141
141
30
262
100
7
95
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S3Ae)
1
273
282
275
288
22
731
100
12
99
(Ribosomal_S11);(Ribosomal_S7)
1
483
757
614
922
17
209
100
14
79
(Ribosomal_S13);(Ribosomal_S19)
1
644
957
669
998
12
384
100
11
96
(Ribosomal_S13);(Ribosomal_S19e)
1
247
260
254
267
20
434
100
13
97
(Ribosomal_S13);(Ribosomal_S25)
1
222
235
239
252
19
189
100
12
93
(Ribosomal_S13);(Stm1_N)
1
24
25
26
39
66
314
100
32
92
(Ribosomal_S13_N);(Ribosomal_S27e)
1
269
278
273
286
26
482
100
12
99
(Ribosomal_S13_N);(Ribosomal_S7e)
1
247
248
260
273
10
184
100
12
95
(Ribosomal_S13_N);(Ribosomal_S8)
1
254
255
265
278
24
187
100
11
96
(Ribosomal_S14);(Ribosomal_S19)
1
268
302
306
356
25
151
100
14
88
(Ribosomal_S14);(S10_plectin)
1
221
234
226
239
20
289
100
11
98
(Ribosomal_S17);(Ribosomal_S8)
1
386
674
689
1000
20
136
100
14
56
(Ribosomal_S17);(Ribosomal_S8)
2
152
153
689
1000
24
128
100
14
22
(Ribosomal_S17);(Ribosomal_S8e)
1
205
206
268
281
26
135
97
12
76
(Ribosomal_S17_N);(Ribosomal_S8e)
1
262
263
267
280
33
265
100
11
98
(Ribosomal_S17e);(Ribosomal_S2)
1
222
231
225
238
27
671
100
12
99
(Ribosomal_S17e);(WD40)
1
218
219
220
233
9
136
100
12
99
(Ribosomal_S18);(Ribosomal_S21)
1
146
155
315
355
12
184
100
10
46
(Ribosomal_S18);(Ribosomal_S21)
2
135
144
315
355
37
204
100
17
43
(Ribosomal_S18);(Ribosomal_S6)
1
471
770
477
789
10
803
100
11
99
(Ribosomal_S19);(Stm1_N)
1
25
26
26
39
51
165
100
27
96
(Ribosomal_S19e);(Ribosomal_S9)
1
243
256
255
268
18
206
100
13
95
(Ribosomal_S2);(Ribosomal_S21e)
1
225
234
226
239
3
1198
100
12
100
(Ribosomal_S2);(Ribosomal_S8)
1
94
355
138
406
40
260
100
6
68
(Ribosomal_S21e);(Ribosomal_S5)
1
231
232
233
246
7
220
100
12
99
(Ribosomal_S21e);(Ribosomal_S5_C)
1
236
237
236
249
7
526
100
12
100
(Ribosomal_S21e);(Ribosomal_S8)
1
228
241
235
248
7
248
100
13
97
(Ribosomal_S24e);(S4)
1
263
276
276
289
9
181
94
12
95
(Ribosomal_S24e);(S4)
2
154
155
276
289
17
172
100
10
56
(Ribosomal_S25);(Ribosomal_S7)
1
238
251
239
252
19
589
100
12
100
(Ribosomal_S26e);(Ribosomal_S28e)
1
132
138
204
217
35
141
100
12
65
(Ribosomal_S26e);(Ribosomal_S3Ae)
1
216
225
220
233
32
244
100
12
98
(Ribosomal_S28e);(Ribosomal_S7)
1
283
284
285
298
30
982
100
12
99
(Ribosomal_S30);(Ribosomal_S4)
1
209
209
209
209
34
380
100
11
100
(Ribosomal_S30);(S4)
1
222
223
228
241
35
155
100
13
97
(Ribosomal_S3_C);(Ribosomal_S5)
1
165
183
592
904
19
133
100
12
28
(Ribosomal_S4);(Ribosomal_S5_C)
1
305
597
651
960
12
143
100
18
47
(Ribosomal_S4);(Ribosomal_S5_C)
2
213
213
651
960
31
220
70
8
33
(Ribosomal_S4);(Ribosomal_S6)
1
30
76
36
119
27
150
1
0
83
(Ribosomal_S4);(Ribosomal_S8)
1
80
80
198
198
34
121
74
9
40
(Ribosomal_S4);(S4)
1
41
41
44
46
7
631
100
46
93
(Ribosomal_S5_C);(Ribosomal_S8)
1
437
741
694
1016
16
466
100
15
63
(Ribosomal_S5_C);(Ribosomal_S8)
2
241
242
694
1016
24
342
100
13
35
(Ribosomal_S7);(Ribosomal_S9)
1
702
1007
727
1055
17
308
100
13
97
(Ribosomal_S7e);(Ribosomal_S8)
1
270
283
270
283
10
471
100
11
100
(Ribosomal_S9);(WD40)
1
224
225
264
277
10
255
100
12
85
(Ribosomal_S9);(WD40)
2
29
29
264
277
40
294
100
3
11
(Ricin_B_lectin);(RIP)
1
21
48
21
50
19
377
100
98
100
(Rieske);(Ring_hydroxyl_A)
1
22
39
22
65
12
1187
100
100
100
(RuBisCO_large);(RuBisCO_large_N)
1
48
108
50
110
11
1516
99
89
96
(RuBisCO_large);(RuBisCO_large_N)
2
38
88
50
110
11
1132
100
95
76
(RuBisCO_large);(RuBisCO_small)
1
24
62
24
62
26
1357
98
82
100
(RuBisCO_large);(RuBisCO_small)
2
22
60
24
62
26
837
93
80
92
(RuBisCO_large_N);(RuBisCO_small)
1
23
61
24
62
26
327
95
80
96
(S-AdoMet_synt_C);(S-AdoMet_synt_M)
1
31
83
31
83
30
305
100
99
100
(S-AdoMet_synt_C);(S-AdoMet_synt_M)
2
31
83
31
83
30
1768
100
99
100
(S-AdoMet_synt_C);(S-AdoMet_synt_N)
1
31
83
31
83
36
453
100
99
100
(S-AdoMet_synt_C);(S-AdoMet_synt_N)
2
31
83
31
83
36
1588
100
99
100
(S-AdoMet_synt_M);(S-AdoMet_synt_N)
1
31
83
31
83
30
151
100
99
100
(S-AdoMet_synt_M);(S-AdoMet_synt_N)
2
31
83
31
83
30
922
100
99
100
(S1);(TF_Zn_Ribbon)
1
32
36
32
36
29
513
100
31
100
(S4);(WD40)
1
31
31
36
36
38
207
100
3
86
(S4);(WD40)
2
22
22
36
36
7
185
100
0
61
(SKIP_SNW);(WD40)
1
34
34
35
35
32
247
97
12
97
(SNARE);(Synaptobrevin)
1
27
30
27
31
25
682
97
70
100
(SRP54);(SRP54_N)
1
45
69
49
73
8
764
100
97
92
(SSL_OB);(Stap_Strp_tox_C)
1
34
39
36
41
11
1128
97
97
94
(Sec61_beta);(SecE)
1
20
20
34
36
17
147
100
25
59
(Sec61_beta);(SecY)
1
36
38
36
38
17
460
95
32
100
(SecE);(SecY)
1
55
57
57
59
7
1311
96
39
96
(Semialdhyde_dh);(Semialdhyde_dhC)
1
41
80
41
81
7
903
100
100
100
(Shikimate_DH);(Shikimate_dh_N)
1
25
34
25
34
12
270
97
97
100
(Sigma70_r1_2);(Sigma70_r2)
1
42
55
43
60
27
734
100
58
98
(Sigma70_r2);(Sigma70_r3)
1
26
28
38
54
51
135
100
39
68
(Skp1);(Skp1_POZ)
1
37
49
38
54
27
135
100
82
97
(Skp1_POZ);(VHL_C)
1
22
61
23
63
30
122
100
90
96
(Skp1_POZ);(ubiquitin)
1
46
88
47
90
22
667
98
78
98
(Sld5);(SLD5_C)
1
23
24
23
24
26
493
100
50
100
(Sod_Fe_C);(Sod_Fe_N)
1
90
180
90
180
5
267
96
89
100
(Sod_Fe_C);(Sod_Fe_N)
2
81
171
90
180
12
1158
100
98
90
(Spt4);(Spt5-NGN)
1
22
22
22
22
19
862
100
50
100
(Ssl1);(Tfb4)
1
26
29
32
35
28
491
100
41
81
(Stap_Strp_tox_C);(Stap_Strp_toxin)
1
51
77
56
86
6
1150
99
94
91
(SusD_RagB);(SusD-like_3)
1
41
47
41
47
1
2941
100
91
100
(Synaptobrevin);(Syntaxin)
1
27
30
27
31
4
763
97
70
100
(TAF);(TFIID-31kDa)
1
28
28
28
28
39
1655
100
18
100
(TAF4);(TFIID_20kDa)
1
21
21
21
21
15
1834
100
10
100
(TBP);(TFIIB)
1
48
54
49
55
5
346
100
39
98
(TBP);(TFIIB)
2
33
37
49
55
84
254
100
41
67
(TFIIA);(TFIIA_gamma_C)
1
25
31
28
34
10
1129
100
32
89
(TFIIA);(TFIIA_gamma_N)
1
28
34
28
34
9
1167
100
38
100
(TFIIE_beta);(TFIIF_beta)
1
24
28
30
34
65
393
100
32
80
(THF_DHG_CYH);(THF_DHG_CYH_C)
1
21
42
21
42
17
1616
100
100
100
(TNF);(TNFR_c6)
1
26
31
29
37
7
341
87
81
90
(TNF);(TNFR_c6)
2
25
30
29
37
7
263
83
77
86
(TPP_enzyme_C);(TPP_enzyme_M)
1
67
179
68
180
9
685
100
98
99
(TPP_enzyme_C);(TPP_enzyme_N)
1
75
208
75
208
10
876
99
98
100
(TPP_enzyme_M);(TPP_enzyme_N)
1
66
169
68
180
9
313
100
98
97
(TPP_enzyme_M);(TPP_enzyme_N)
2
32
106
68
180
12
318
98
99
47
(TPR_1);(TPR_11)
1
31
41
39
50
4
344
98
90
79
(Terpene_synth);(Terpene_synth_C)
1
26
78
26
78
15
1032
100
100
100
(TetR_C_6);(TetR_N)
1
25
41
26
42
6
405
100
100
96
(Tfb2);(Tfb4)
1
26
29
31
34
20
1145
100
41
84
(Thiolase_C);(Thiolase_N)
1
67
139
67
141
2
2772
99
97
100
(Thiolase_C);(Thiolase_N)
2
62
132
67
141
2
398
99
98
93
(Thrombin_light);(Trypsin)
1
121
470
121
483
66
987
100
98
100
(Topoisom_bac);(Toprim)
1
22
37
22
40
17
1515
100
100
100
(Toxin_R_bind_C);(Toxin_R_bind_N)
1
58
95
64
101
12
1190
100
95
91
(Transket_pyr);(Transketolase_C)
1
41
118
41
123
7
303
99
98
100
(Transket_pyr);(Transketolase_C)
2
37
87
41
123
8
1141
100
99
90
(Transket_pyr);(Transketolase_N)
1
20
65
20
70
22
875
98
100
100
(Transket_pyr);(Transketolase_N)
2
20
65
20
70
22
1610
100
100
100
(Transketolase_C);(Transketolase_N)
1
20
65
20
70
8
247
98
100
100
(Tubulin);(Tubulin_C)
1
214
460
217
463
1
586
100
67
99
(UCR_14kD);(UcrQ)
1
45
81
45
82
20
448
100
73
100
(UCR_TM);(UCR_UQCRX_QCR9)
1
46
72
47
82
24
603
100
67
98
(UCR_TM);(UcrQ)
1
47
73
48
83
20
558
100
66
98
(UCR_hinge);(UcrQ)
1
44
74
45
82
20
220
100
70
98
(UDPG_MGDP_dh);(UDPG_MGDP_dh_C)
1
27
43
27
43
12
472
100
100
100
(UDPG_MGDP_dh);(UDPG_MGDP_dh_N)
1
27
43
27
43
19
788
100
100
100
(UDPG_MGDP_dh);(UDPG_MGDP_dh_N)
2
25
40
27
43
20
262
98
100
93
(UDPG_MGDP_dh_C);(UDPG_MGDP_dh_N)
1
24
34
27
43
13
275
100
100
89
(UQ_con);(zf-RING_2)
1
20
20
20
20
19
524
95
30
100
(Utp12);(Utp13)
1
36
36
36
36
36
1692
56
8
100
(Utp12);(Utp13)
2
30
30
36
36
31
320
80
7
83
(Utp12);(Utp21)
1
35
35
35
35
31
1683
54
6
100
(Utp12);(Utp21)
2
30
30
35
35
34
227
77
7
86
(Utp13);(Utp21)
1
34
34
35
35
34
359
56
6
97
(UvrD_C);(UvrD-helicase)
1
26
35
27
37
11
1951
100
83
96
(V-ATPase_C);(V-ATPase_G)
1
20
21
24
25
31
298
100
10
83
(V-ATPase_G);(vATP-synt_E)
1
32
33
32
33
31
1566
100
6
100
(V-set);(V-set_2)
1
305
355
327
377
14
810
99
88
93
(V-set);(WD40)
1
97
100
173
176
35
290
100
6
56
(V-set);(WD40)
2
92
95
173
176
62
133
100
6
53
(V-set);(WD40)
3
65
65
173
176
26
108
100
6
38
(V_ATPase_I);(V-ATPase_C)
1
23
23
24
24
36
390
100
0
96
(XPG_I);(XPG_N)
1
30
49
30
51
16
2084
100
96
100
(cNMP_binding);(HTH_Crp_2)
1
47
96
62
114
8
368
99
98
76
(dsrm);(MRP-S32)
1
55
60
55
60
68
658
100
17
100
(dsrm);(Ribosomal_L13)
1
57
62
64
69
25
158
100
15
89
(eIF-1a);(Ribosom_S12_S23)
1
36
36
42
42
20
351
100
22
86
(eIF-1a);(Ribosomal_S30)
1
22
22
25
25
19
314
100
18
88
(eIF-6);(NOGCT)
1
30
30
30
30
35
751
100
50
100
(eIF-6);(Ribosomal_L14)
1
51
51
55
55
66
743
100
49
93
(eIF-6);(Ribosomal_L24e)
1
41
41
51
51
29
179
100
56
80
(eIF-6);(Ribosomal_L3)
1
48
48
54
54
57
214
100
52
89
(ketoacyl-synt);(Ketoacyl-synt_C)
1
104
174
108
183
11
2026
99
88
96
(ketoacyl-synt);(Ketoacyl-synt_C)
2
91
164
108
183
4
526
96
90
84
(malic);(Malic_M)
1
21
41
21
41
13
1165
100
100
100
(peroxidase);(Peroxidase_ext)
1
23
73
23
73
28
2975
100
100
100
(ribosomal_L24);(Tim44)
1
53
58
53
58
86
358
100
16
100
(tRNA_anti-codon);(tRNA-synt_2)
1
55
98
55
98
11
322
93
99
100
(tRNA_anti-codon);(tRNA-synt_2)
2
51
93
55
98
11
202
97
97
93
(ubiquitin);(UCH)
1
37
45
40
50
12
1034
98
91
92
(ubiquitin);(UQ_con)
1
50
58
83
97
25
622
97
55
60
(zf-C2H2);(zf-H2C2_2)
1
54
90
56
97
11
647
86
77
96
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_45)
1
45
59
48
76
44
348
100
39
94
(ATP-synt_A);(ATP-synt_B)
1
54
55
54
55
13
824
100
5
100
(ATP-synt_A);(ATP-synt_B)
2
51
52
54
55
16
1190
100
6
94
(ATP-synt_B);(OSCP)
1
28
29
39
40
16
161
100
7
72
(ATP-synt_B);(OSCP)
2
24
24
39
40
13
269
100
4
62
(PSP);(RRM_1)
1
24
24
24
24
35
688
67
21
100
(Secretin);(Secretin_N)
1
22
22
23
23
12
469
100
27
96
(NADHdh_A3);(Oxidored_q4)
1
65
65
67
67
12
319
100
18
97
(MWFE);(NADHdh)
1
70
70
70
70
20
1500
100
17
100
(MWFE);(Oxidored_q3)
1
60
60
69
69
14
238
100
15
87
(CHCH);(MWFE)
1
69
69
70
70
20
307
99
14
99
(GRIM-19);(MWFE)
1
66
66
66
66
20
291
100
18
100
(NDUFA12);(Oxidored_q6)
1
61
61
64
64
30
165
100
20
95
(NADHdh);(NADHdh_A3)
1
67
67
67
67
12
387
100
18
100
(GRIM-19);(NADHdh_A3)
1
57
57
63
63
15
546
100
21
90
(Complex1_30kDa);(ETC_C1_NDUFA5)
1
65
65
66
66
25
218
98
18
98
(Complex1_30kDa);(Complex1_LYR)
1
65
65
66
66
16
455
100
20
98
(NADH_dh_m_C1);(NDUF_C2)
1
51
51
51
51
57
844
100
18
100
(Complex1_49kDa);(zf-CHCC)
1
67
67
68
68
43
208
100
18
99
(Complex1_49kDa);(GRIM-19)
1
64
64
64
64
36
919
100
16
100
(NDUF_C2);(Ndufs5)
1
44
44
49
49
70
134
100
14
90
(NDUF_C2);(Proton_antipo_M)
1
65
65
66
66
9
182
100
18
98
(NDUF_C2);(Proton_antipo_M)
2
41
41
66
66
70
213
100
12
62
(NADH_dehy_S2_C);(NDUF_C2)
1
53
53
53
53
44
791
96
15
100
(NDUF_C2);(NDUFB10)
1
48
48
48
48
70
739
100
10
100
(2Fe-2S_thioredx);(Fer4_10)
1
20
20
20
20
62
458
100
35
100
(Ndufs5);(Oxidored_q3)
1
62
62
70
70
14
710
100
18
89
(Ndufs5);(Oxidored_q2)
1
70
70
70
70
18
478
100
17
100
(Ndufs5);(Proton_antipo_M)
1
68
68
68
68
16
692
100
18
100
(GRIM-19);(Ndufs5)
1
69
69
69
69
20
1129
100
17
100
(Fer4_10);(NADH_4Fe-4S)
1
20
20
20
20
68
303
95
30
100
(NADH_oxidored);(Oxidored_q5_N)
1
52
52
52
52
54
723
100
17
100
(NADH_oxidored);(NDUFB10)
1
45
45
52
52
71
317
100
11
87
(NADH-G_4Fe-4S_3);(zf-CHCC)
1
66
66
68
68
34
190
100
18
97
(ESSS);(NDUF_B5)
1
52
52
52
52
42
862
100
17
100
(ESSS);(Oxidored_q5_N)
1
55
55
55
55
1
943
100
16
100
(dNK);(ESSS)
1
35
35
45
45
79
145
100
11
78
(ESSS);(NDUFB10)
1
52
52
53
53
76
1058
100
17
98
(CHCH);(NADHdh)
1
51
51
66
66
76
225
100
18
77
(GRIM-19);(NADHdh)
1
70
70
70
70
34
563
100
17
100
(NDUF_B5);(NDUF_B6)
1
47
47
52
52
36
249
100
13
90
(NDUF_B5);(Proton_antipo_M)
1
53
53
53
53
16
508
100
17
100
(NDUF_B5);(Proton_antipo_M)
2
44
44
53
53
51
298
100
14
83
(Fer4_7);(NDUFA12)
1
55
55
65
65
35
167
82
22
85
(Fer4_7);(zf-CHCC)
1
65
65
68
68
40
227
100
18
96
(NDUF_B6);(PP-binding)
1
51
51
52
52
46
397
100
16
98
(GRIM-19);(Oxidored_q3)
1
66
66
69
69
14
470
100
18
96
(NADH5_C);(NDUF_B4)
1
64
64
65
65
13
590
89
14
98
(NDUF_B4);(Proton_antipo_M)
1
65
65
65
65
13
1021
100
18
100
(NDUF_B4);(Proton_antipo_M)
2
48
48
65
65
74
248
100
19
74
(Complex1_LYR);(NADH5_C)
1
64
64
68
68
15
511
100
19
94
(Complex1_LYR);(Proton_antipo_M)
1
48
48
65
65
15
124
79
12
74
(NADH5_C);(NDUF_B7)
1
62
62
67
67
16
643
53
13
93
(NDUFB10);(Proton_antipo_M)
1
63
63
63
63
7
479
100
19
100
(NDUFB10);(Proton_antipo_M)
2
47
47
63
63
74
472
100
19
75
(NDUFB10);(Proton_antipo_N)
1
49
49
63
63
58
278
100
18
78
(NADH5_C);(PP-binding)
1
56
56
67
67
18
129
50
7
84
(NADH5_C);(Tim17)
1
44
44
57
57
46
447
100
18
77
(NADH_dehy_S2_C);(Proton_antipo_M)
1
50
50
53
53
44
447
100
18
94
(NDUFB10);(Oxidored_q5_N)
1
49
49
63
63
54
164
100
18
78
(Complex1_LYR);(NDUF_B4)
1
49
49
49
49
74
466
100
12
100
(NDUF_B4);(NDUFB10)
1
49
49
60
60
73
376
100
18
82
(dNK);(NADH_dehy_S2_C)
1
52
52
53
53
44
403
100
15
98
(Complex1_LYR);(PP-binding)
1
99
107
102
110
9
603
100
23
97
(CHCH);(GRIM-19)
1
66
66
69
69
21
229
83
18
96
(CHCH);(GRIM-19)
2
23
23
69
69
16
442
100
26
33
(MMS1_N);(PHF5)
1
26
30
30
34
27
425
100
30
87
(MMS1_N);(SF3b10)
1
32
36
32
36
24
1145
100
33
100
(CPSF_A);(SF3b10)
1
24
28
29
33
24
391
100
39
83
(ATP_synt_H);(V_ATPase_I)
1
29
29
29
29
22
1618
100
0
100
(Complex1_51K);(NDUFV3)
1
47
47
47
47
64
906
100
15
100
(Complex1_51K);(ETC_C1_NDUFA4)
1
65
65
65
65
35
379
100
14
100
(CI-B14_5a);(NADH_4Fe-4S)
1
45
45
48
48
81
222
100
16
94
(2Fe-2S_thioredx);(NDUFV3)
1
47
47
47
47
63
623
100
15
100
(2Fe-2S_thioredx);(ETC_C1_NDUFA4)
1
27
27
61
61
35
217
100
19
44
(Complex1_LYR);(NDUF_B12)
1
57
57
62
62
15
250
100
14
92
(NADH_B2);(NDUF_B12)
1
59
59
60
60
6
702
100
14
98
(NADH5_C);(NDUF_B12)
1
61
61
63
63
18
476
95
10
97
(NDUF_B12);(Proton_antipo_M)
1
59
59
60
60
21
311
100
14
98
(NDUF_B12);(PP-binding)
1
58
58
62
62
38
377
100
14
94
(ETC_C1_NDUFA4);(Molybdopterin)
1
65
65
65
65
30
425
100
14
100
(ETC_C1_NDUFA4);(Molybdop_Fe4S4)
1
63
63
63
63
28
667
100
14
100
(ETC_C1_NDUFA4);(NADH-G_4Fe-4S_3)
1
62
62
64
64
35
180
79
11
97
(ETC_C1_NDUFA4);(Fer2_4)
1
62
62
63
63
35
536
100
15
98
(L51_S25_CI-B8);(Molybdopterin)
1
66
66
66
66
30
527
95
15
100
(L51_S25_CI-B8);(NADH_dhqG_C)
1
61
61
65
65
30
396
95
16
94
(CI-B14_5a);(NADH-G_4Fe-4S_3)
1
45
45
48
48
61
366
100
16
94
(Molybdopterin);(NDUFA12)
1
61
61
61
61
3
526
100
15
100
(Molybdop_Fe4S4);(NDUFA12)
1
36
36
59
59
35
144
100
17
61
(NDUF_B4);(NDUF_C2)
1
38
38
47
47
70
151
100
5
81
(NDUF_B5);(NDUF_C2)
1
46
46
46
46
70
521
100
13
100
(CI-B14_5a);(Complex1_49kDa)
1
48
48
48
48
81
1191
100
15
100
(NDUF_B4);(NDUF_B8)
1
56
56
56
56
13
1645
100
14
100
(Complex1_30kDa);(ETC_C1_NDUFA4)
1
65
65
65
65
35
440
100
14
100
(CI-B14_5a);(Complex1_30kDa)
1
48
48
48
48
81
297
100
15
100
(GRIM-19);(NDUF_B5)
1
28
28
48
48
79
117
100
14
58
(CI-B14_5a);(GRIM-19)
1
47
47
48
48
45
340
100
15
98
(NAD_binding_10);(Oxidored_q6)
1
23
23
23
23
32
287
96
26
100
(NDUF_B6);(NDUF_B7)
1
48
48
48
48
57
747
100
10
100
(NDUF_B6);(NDUFB10)
1
48
48
48
48
57
563
100
10
100
(ETC_C1_NDUFA4);(Fer4_7)
1
61
61
62
62
35
155
100
15
98
(NADH_B2);(NDUF_B7)
1
59
59
59
59
6
316
100
14
100
(NDUF_B7);(NDUF_B8)
1
54
54
56
56
22
818
100
13
96
(NDUF_B7);(NDUFB10)
1
55
55
58
58
7
241
100
15
95
(NADH_B2);(NADH5_C)
1
59
59
60
60
6
960
100
14
98
(NADH_B2);(Proton_antipo_M)
1
60
60
60
60
6
640
100
13
100
(NADH_B2);(PP-binding)
1
44
44
52
52
63
139
100
11
85
(NDUF_B8);(Proton_antipo_M)
1
56
56
56
56
20
773
100
14
100
(NDUF_B8);(Proton_antipo_M)
2
52
52
56
56
22
282
100
15
93
(NADH5_C);(NDUF_B8)
1
55
55
56
56
18
925
49
5
98
(NDUF_B8);(PP-binding)
1
33
33
56
56
22
112
100
6
59
(NDUF_B5);(Oxidored_q5_N)
1
49
49
50
50
54
467
100
12
98
(dNK);(NADH_dh_m_C1)
1
46
46
48
48
71
181
100
13
96
(NADH_oxidored);(NDUF_B5)
1
49
49
49
49
71
639
100
12
100
(NDUF_B5);(NDUFB10)
1
50
50
50
50
76
1084
100
12
100
(ETC_C1_NDUFA4);(NDUFA12)
1
55
55
60
60
30
159
100
13
92
(NDUF_B5);(Ndufs5)
1
50
50
50
50
71
954
100
12
100
(CI-B14_5a);(ETC_C1_NDUFA5)
1
46
46
48
48
78
294
100
15
96
(CI-B14_5a);(NDUFA12)
1
47
47
48
48
80
381
100
15
98
(Methyltransf_25);(PRMT5_C)
1
32
111
32
120
2
719
95
94
100
(Binary_toxB_2);(Binary_toxB_3)
1
34
48
35
49
28
357
98
58
97
(Binary_toxB);(Binary_toxB_3)
1
34
48
35
49
27
621
98
58
97
(Binary_toxB);(Binary_toxB_2)
1
34
48
34
48
30
386
98
58
100
(Arena_RNA_pol);(ArenaCapSnatch)
1
22
26
23
27
20
1286
85
19
96
(Nrap_D4);(RRP7)
1
30
30
30
30
20
523
100
0
100
(TAF);(WD40)
1
26
26
30
30
31
161
100
15
87
(7tm_2);(G-alpha)
1
49
51
49
52
16
375
92
0
100
(7tm_2);(Hormone_2)
1
24
26
24
26
11
1088
77
4
100
(Utp21);(WD40)
1
23
23
31
31
34
198
100
4
74
(Utp13);(WD40)
1
28
28
33
33
37
144
100
4
85
(Fcf1);(Fibrillarin)
1
31
31
32
32
63
395
100
3
97
(MMR_HSR1);(Ribosom_S12_S23)
1
29
29
33
33
50
182
100
3
88
(RTC_insert);(WD40)
1
28
28
32
32
38
244
100
4
88
(Brix);(WD40)
1
26
26
33
33
48
135
100
4
79
(Ribosomal_S7);(WD40)
1
26
26
31
31
37
199
100
4
84
(Nrap_D4);(Ribosomal_S3Ae)
1
23
23
24
24
20
503
100
0
96
(Mpp10);(S4)
1
23
23
28
28
38
206
100
4
82
(RIBIOP_C);(Ribosom_S12_S23)
1
40
40
42
42
17
631
100
15
95
(RIBIOP_C);(RTC)
1
32
32
34
34
35
634
100
3
94
(Mpp10);(Ribosomal_S4)
1
30
30
32
32
34
723
100
7
94
(Ribosomal_S28e);(Utp12)
1
33
33
33
33
36
428
100
3
100
(Mpp10);(WD40)
1
25
25
32
32
20
283
100
0
78
(NDUF_B8);(NDUFB10)
1
53
53
55
55
7
143
100
13
96
(MWFE);(Ndufs5)
1
33
33
34
34
71
155
100
9
97
(Cas_Csy1);(Cas_Csy3)
1
24
24
25
25
7
227
100
4
96
(Cas_Csy2);(Cas_Csy3)
1
25
25
25
25
8
1736
100
4
100
(C1_4);(Tfb4)
1
29
32
29
32
26
795
100
47
100
(Brix);(Mpp10)
1
33
33
34
34
36
1115
100
6
97
(Complex1_LYR);(RsfS)
1
22
25
22
25
72
612
100
24
100
(Ribosomal_L14);(RsfS)
1
29
32
29
32
23
846
100
31
100
(Ribosomal_L19);(RsfS)
1
23
26
25
28
23
236
100
31
92
(BSD);(Ssl1)
1
20
20
23
26
16
296
100
35
87
(HBB);(MAT1)
1
22
25
22
25
27
853
100
40
100
(BING4CT);(Ribosomal_S4)
1
27
27
29
29
46
319
100
4
93
(Nop14);(Ribosom_S12_S23)
1
25
25
27
27
25
499
100
4
93
(Nop14);(RIBIOP_C)
1
27
27
29
29
25
413
70
4
93
(Fcf2);(Sas10)
1
28
28
30
30
36
289
100
4
93
(Fcf1);(Sas10)
1
24
24
30
30
63
173
100
4
80
(Fibrillarin);(Sas10)
1
30
30
30
30
63
1102
100
3
100
(S4);(Sas10)
1
28
28
29
29
56
147
100
4
97
(Ribosomal_S4);(Sas10)
1
26
26
26
26
56
291
100
4
100
(Ribosom_S12_S23);(Sas10)
1
28
28
32
32
63
176
100
4
88
(RIBIOP_C);(Sas10)
1
28
28
31
31
63
313
100
4
90
(Mpp10);(Utp13)
1
31
31
31
31
36
696
100
3
100
(Mpp10);(RIBIOP_C)
1
32
32
32
32
36
1254
66
3
100
(Fibrillarin);(WD40)
1
30
30
30
30
21
265
100
3
100
(Utp14);(WD40)
1
25
25
27
27
18
431
100
4
93
(Utp14);(WD40)
2
25
25
27
27
26
341
36
0
93
(Utp14);(WD40)
3
22
22
27
27
23
164
100
5
81
(Sof1);(Utp14)
1
29
29
29
29
26
664
100
3
100
(Fcf1);(WD40)
1
24
24
26
26
54
311
100
4
92
(Fcf1);(WD40)
2
21
21
26
26
43
273
100
5
81
(Ribosomal_S7e);(WD40)
1
22
22
24
24
43
189
100
5
92
(NOP5NT);(WD40)
1
24
24
25
25
36
166
100
4
96
(NOP5NT);(Sof1)
1
30
30
30
30
39
303
100
3
100
(Ribosomal_S8);(WD40)
1
22
22
22
22
7
136
100
5
100
(TPR_14);(Utp14)
1
25
25
26
26
24
548
100
4
96
(U3_assoc_6);(Utp14)
1
20
20
28
28
76
160
100
0
71
(BING4CT);(Utp14)
1
26
26
29
29
26
241
100
4
90
(Fibrillarin);(Utp11)
1
28
28
28
28
27
1053
100
4
100
(Nop);(Utp11)
1
25
25
27
27
27
277
100
4
93
(Ribosomal_L7Ae);(Utp11)
1
27
27
28
28
27
520
100
4
96
(RIBIOP_C);(Utp11)
1
30
30
30
30
27
586
100
3
100
(Ribosomal_S7e);(Utp14)
1
23
23
26
26
24
284
100
4
88
(NOP5NT);(Utp14)
1
25
25
27
27
26
190
100
4
93
(Fcf2);(Fibrillarin)
1
30
30
30
30
36
1062
100
3
100
(Herpes_V23);(Herpes_VP19C)
1
28
28
28
28
9
998
100
0
100
(Herpes_MCP);(Herpes_V23)
1
25
25
25
25
14
762
100
0
100
(Herpes_MCP);(Herpes_V23)
2
24
24
25
25
14
604
100
0
96
(Herpes_MCP);(Herpes_V23)
3
22
22
25
25
14
537
100
0
88
(Herpes_MCP);(Herpes_VP19C)
1
27
27
28
28
9
463
100
0
96
(Herpes_MCP);(Herpes_VP19C)
2
23
23
28
28
9
881
100
0
82
(U3_snoRNA_assoc);(Utp11)
1
24
24
24
24
17
610
100
4
100
(U3_snoRNA_assoc);(WD40)
1
23
23
25
25
17
452
100
4
92
(U3_snoRNA_assoc);(WD40)
2
21
21
25
25
10
170
100
5
84
(U3_snoRNA_assoc);(WD40)
3
21
21
25
25
17
313
100
5
84
(CBF);(WD40)
1
24
24
27
27
40
172
100
4
89
(CBF);(WD40)
2
24
24
27
27
35
262
100
4
89
(UTP15_C);(WD40)
1
22
22
29
29
27
190
45
5
76
(Fibrillarin);(U3_snoRNA_assoc)
1
21
21
21
21
17
174
100
5
100
(Utp12);(UTP15_C)
1
29
29
29
29
17
345
100
3
100
(Utp12);(UTP15_C)
2
29
29
29
29
27
1407
100
3
100
(Asparaginase);(Asparaginase_C)
1
41
115
41
115
11
741
97
100
100
(Asparaginase);(Asparaginase_C)
2
41
115
41
115
11
670
100
100
100
(Asparaginase);(Asparaginase_C)
3
25
88
41
115
31
170
90
93
61
(AAA);(AAA_lid_3)
1
161
190
215
244
8
132
100
51
75
(AAA);(AAA_lid_3)
2
125
125
215
244
15
189
99
22
58
(AAA);(AAA_lid_9)
1
54
58
64
68
30
312
91
19
84
(AAA);(AAA_lid_9)
2
49
53
64
68
30
142
100
38
77
(Big_8);(SdrG_C_C)
1
26
30
26
30
11
554
97
97
100
(ATP-synt_ab);(T3SS_ATPase_C)
1
162
202
203
281
7
249
93
59
80
(ATP-synt_ab);(T3SS_ATPase_C)
2
47
110
203
281
8
1052
98
84
23
(TetR_C_24);(TetR_N)
1
39
44
39
44
4
501
100
95
100
(A2M);(A2M_BRD)
1
59
69
59
70
8
2056
97
88
100
(A2M_recep);(TED_complement)
1
21
25
29
35
17
876
100
84
72
(ATP-grasp);(PurK_C)
1
20
30
20
32
11
646
100
100
100
(TetR_C_1);(TetR_N)
1
29
75
33
81
9
441
100
99
88
(MG1);(TED_complement)
1
25
26
33
36
17
360
73
77
76
(ATP-synt_ab_C);(T3SS_ATPase_C)
1
130
164
155
189
36
219
96
63
84
(ATP-synt_ab_C);(T3SS_ATPase_C)
2
33
37
155
189
36
181
97
43
21
(IRK);(IRK_C)
1
38
70
38
72
5
606
100
60
100
(IRK);(IRK_C)
2
26
36
38
72
20
345
97
28
68
(GP120);(V-set_2)
1
41
51
88
113
9
926
100
43
47
(ATP-synt);(T3SS_ATPase_C)
1
141
173
153
185
18
346
100
59
92
(ATP-synt);(T3SS_ATPase_C)
2
117
140
153
185
18
188
100
66
76
(AAA_lid_3);(CDC48_N)
1
22
25
54
62
21
163
100
52
41
(AAA_lid_3);(CDC48_2)
1
29
31
33
41
29
320
100
45
88
(ETC_C1_NDUFA4);(NDUFV3)
1
42
42
46
46
51
195
100
12
91
(Molybdopterin);(NDUFV3)
1
33
33
39
39
71
141
100
6
85
(Peptidase_M1);(Peptidase_M1_N)
1
47
242
49
247
10
1353
100
98
96
(DPPIV_rep);(Peptidase_S9)
1
22
122
23
124
27
524
100
100
96
(AAA_2);(AAA_lid_9)
1
45
47
52
56
30
229
100
38
87
(SDH_C);(Shikimate_dh_N)
1
37
49
37
53
15
770
98
98
100
(SDH_C);(Shikimate_DH)
1
21
26
25
34
12
184
100
100
84
(AAA_lid_3);(Vps4_C)
1
51
58
56
63
10
1192
100
26
91
(I-EGF_1);(PSI_integrin)
1
26
46
27
49
33
301
100
93
96
(MG2);(TED_complement)
1
24
28
33
41
5
552
93
71
73
(A2M);(MG2)
1
59
68
59
70
8
636
97
88
100
(A2M);(MG3)
1
37
42
53
62
18
481
95
93
70
(A2M_BRD);(MG2)
1
48
56
49
57
8
433
100
89
98
(MG1);(MG2)
1
34
39
43
49
15
218
100
97
79
(MG2);(MG3)
1
44
50
48
56
18
152
100
90
92
(A2M_BRD);(MG4)
1
41
47
48
56
16
437
100
89
85
(A2M_BRD);(MG1)
1
43
49
45
51
6
643
100
90
96
(MG3);(MG4)
1
40
46
46
52
16
175
100
91
87
(A2M_recep);(MG3)
1
31
35
50
57
30
416
94
94
62
(A2M_BRD);(MG3)
1
28
31
30
34
18
261
100
94
93
(FeoB_Cyto);(FeoB_N)
1
21
31
21
31
10
1122
100
100
100
(GramPos_pilinBB);(SpaA)
1
21
24
21
24
8
271
100
100
100
(RIG-I_C);(RIG-I_C-RD)
1
22
31
23
37
23
577
97
81
96
(Helicase_C);(RIG-I_C)
1
29
40
30
44
26
655
100
88
97
(ATP-synt_D);(T3SS_ATPase_C)
1
22
26
25
31
7
253
100
42
88
(ATP-synt_D);(T3SS_ATPase_C)
2
20
24
25
31
7
182
100
38
80
(Tfb2_C);(Tfb5)
1
38
41
38
41
26
983
100
41
100
(MCM);(MCM_lid)
1
35
35
36
36
24
661
94
40
97
(MCM);(MCM_lid)
2
35
35
36
36
25
1577
100
49
97
(GTP_EFTU);(RL10P_insert)
1
24
24
27
27
17
461
100
4
89
(MRPL52);(Ribosomal_L20)
1
54
59
55
60
19
252
100
15
98
(MRPL52);(Ribosomal_L21p)
1
56
61
56
61
22
630
100
15
100
(MRP-63);(MRPL52)
1
54
59
55
60
69
383
100
15
98
(MRPL52);(Ribosomal_L30)
1
55
60
56
61
18
399
100
15
98
(MMPL);(Sterol-sensing)
1
23
23
24
24
9
1634
100
22
96
(AWS);(SET)
1
20
37
20
38
23
509
100
92
100
(HNH_4);(RuvC_III)
1
20
44
23
50
15
399
100
93
87
(Nrap_D4);(RRM_Rrp7)
1
26
26
29
29
18
571
100
0
90
(Nrap_D6);(RRM_Rrp7)
1
29
29
30
30
18
1548
100
0
97
(MRPL52);(PBP)
1
20
20
27
27
63
244
100
15
74
(ORC_WH_C);(ORC2)
1
25
25
25
25
15
1380
100
8
100
(ORC_WH_C);(ORC5_C)
1
21
21
23
23
15
271
29
5
91
(TFA2_Winged_2);(TFIIE_alpha)
1
33
37
35
39
19
449
100
32
94
(CHCH);(NADHdh_A3)
1
26
26
32
32
16
386
100
23
81
(KH_8);(Ribosomal_S3Ae)
1
29
29
37
37
17
259
100
21
78
(KH_8);(Ribosomal_S11)
1
28
28
47
47
17
355
100
21
60
(Nop14);(RTC)
1
20
20
20
20
25
598
100
5
100
(EMG1);(Nop14)
1
25
25
25
25
25
883
100
4
100
(EMG1);(Nop14)
2
21
21
25
25
25
173
100
5
84
(Brix);(Nop14)
1
20
20
20
20
25
473
100
5
100
(CBF);(Nop14)
1
26
26
26
26
25
1414
100
4
100
(TFIID-31kDa);(WD40)
1
26
26
27
27
31
463
100
15
96
(TFIID-31kDa);(WD40)
2
25
25
27
27
31
528
100
12
93
(CHCH);(NDUF_B5)
1
23
23
25
25
43
192
100
22
92
(Csm2_III-A);(RAMPs)
1
21
21
21
21
15
389
100
5
100
(Fer4_21);(PsaA_PsaB)
1
28
34
28
34
72
275
100
24
100
(Fer4_21);(PsaD)
1
28
34
28
34
52
1149
100
24
100
(Fer4_21);(PSI_PsaE)
1
28
34
28
34
53
488
100
21
100
(Bromo_TP);(WD40)
1
25
25
25
25
15
117
100
12
100
(TFIID_30kDa);(WD40)
1
25
25
25
25
41
162
100
12
100
(Bromo_TP);(TFIID-31kDa)
1
24
24
25
25
78
315
100
12
96
(CDC50);(PhoLip_ATPase_C)
1
30
36
30
36
21
2163
100
22
100
(NmrA);(Oxidored_q6)
1
36
36
39
39
71
281
100
8
92
(TFIID_30kDa);(TFIID-18kDa)
1
20
20
20
20
67
247
100
15
100
(ATP-synt_C);(ATP-synt_S1)
1
25
25
25
25
22
331
100
0
100
(ATP-synt_S1);(vATP-synt_AC39)
1
25
25
25
25
24
283
100
0
100
(FBPase);(FBPase_C)
1
27
135
27
145
20
1365
100
100
100
(FBPase);(FBPase_C)
2
26
128
27
145
20
213
92
100
96
(Gag_p24);(Gag_p24_C)
1
39
86
110
170
1
414
99
85
35
(Gag_p24);(Gag_p24_C)
2
31
80
110
170
1
393
99
79
28
(EFG_C);(EFG_III)
1
26
47
31
52
15
241
100
98
84
(EFG_III);(GTP_EFTU)
1
21
37
28
49
13
233
100
86
75
(EphA2_TM);(PK_Tyr_Ser-Thr)
1
28
121
28
122
14
509
100
100
100
(Helicase_C);(SNF2-rel_dom)
1
36
37
36
37
3
978
100
62
100
(CoV_NSP7);(CoV_NSP8)
1
27
44
35
52
39
1330
100
30
77
(bCoV_S1_RBD);(Peptidase_M2)
1
102
115
102
115
46
868
100
22
100
(bCoV_S1_RBD);(V-set)
1
57
76
371
399
41
333
99
29
15
(bCoV_S1_RBD);(V-set)
2
54
73
371
399
65
709
99
32
15
(bCoV_S1_RBD);(V-set)
3
37
37
371
399
20
199
100
19
10
(bCoV_S1_RBD);(V-set)
4
23
23
371
399
69
224
100
30
6
(bCoV_S1_RBD);(C1-set)
1
52
74
118
142
67
559
1
3
44
(HD);(HD_assoc_2)
1
21
63
22
63
8
2098
100
100
95
(PAP_assoc);(TUTase)
1
23
58
23
58
3
1477
100
100
100
(EFG_III);(Ribosom_S12_S23)
1
57
66
61
73
13
264
100
5
93
(Ribosomal_L15e);(RNase_P_pop3)
1
37
37
37
37
82
513
100
3
100
(Ribosomal_L23eN);(RNase_P_pop3)
1
37
37
37
37
49
138
95
3
100
(bCoV_S1_N);(CoV_S2)
1
403
413
423
433
19
167
100
12
95
(bCoV_S1_RBD);(CoV_S2)
1
346
356
355
365
14
288
100
13
97
(bCoV_S1_RBD);(CoV_S2)
2
72
73
355
365
14
121
100
7
20
(CoV_S1_C);(CoV_S2)
1
429
439
432
442
12
445
100
12
99
(bCoV_S1_N);(CoV_S1_C)
1
446
456
456
467
12
497
100
12
98
(bCoV_S1_N);(CoV_S1_C)
2
418
429
456
467
12
722
100
12
92
(bCoV_S1_RBD);(CoV_S1_C)
1
334
343
357
367
12
232
100
13
94
(bCoV_S1_N);(V-set)
1
22
22
93
94
21
570
100
18
24
(G-gamma);(ZapB)
1
50
50
52
52
7
745
100
4
96
(ABC_tran);(ABC2_membrane_7)
1
22
22
22
22
86
1103
100
23
100
(RNA_pol_Rpb2_2);(RPC5)
1
27
27
27
27
20
713
100
56
100
(RNA_POL_M_15KD);(RPC5)
1
27
27
27
27
20
527
100
56
100
(RNA_pol_Rpc4);(RPC5)
1
27
27
27
27
20
2519
100
56
100
(Prp19);(U-box)
1
24
24
26
26
40
279
100
8
92
(DNAPKcs_CC5);(FAT)
1
29
29
35
36
11
247
100
31
83
(DNAPKcs_CC5);(PI3_PI4_kinase)
1
32
33
35
36
11
386
100
33
91
(DNAPKcs_CC5);(NUC194)
1
27
28
27
28
71
764
100
36
100
(Histone);(SNF2-rel_dom)
1
20
20
27
27
39
186
90
10
74
(MMR_HSR1);(Sas10)
1
27
27
29
29
50
355
100
4
93
(Ge1_WD40);(Ribosomal_S4)
1
20
20
20
20
72
624
100
0
100
(CoV_NSP8);(RdRP_1)
1
28
41
29
42
62
400
100
17
97