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PDBfam
Domain Clusters with M>=20,SeqId<90 and same Pfam relation
Pfam Architecture
Cluster#
#CFs/Cluster
#Entries/Cluster
#CFs/Group
#Entries/Group
Minimum Seq Identity
Surface Area
In PDBBA(%)
In PISABA(%)
CFs Cluster/Group(%)
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1
20
26
20
26
28
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97
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Peripla_BP_3
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39
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V-set
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18
35
12
ubiquitin
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35
35
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0
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11
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168
96
178
9
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77
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93
PKD_channel
1
21
21
21
21
17
2191
95
52
100
Secretin
1
24
24
24
24
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100
25
100
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30
30
30
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0
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36
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19
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43
43
43
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2
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21
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22
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35
83
1
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99
96
97
Homeodomain
1
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2
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13
18
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22
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40
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45
124
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100
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18
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Pannexin_like
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35
35
35
44
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100
14
100
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20
20
20
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40
100
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1
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40
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44
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31
31
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19
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113
140
226
1
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14
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1
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143
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18
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41
45
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32
141
32
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20
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96
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853
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26
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890
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287
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2
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208
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0
0
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20
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1
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Herpes_MCP
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24
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31
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30
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30
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0
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27
28
28
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100
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24
24
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14-3-3
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559
0
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14-3-3
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342
0
0
14
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1
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24
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100
100
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28
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0
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AAA
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AAA
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AAA
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25
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AAA
10
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10
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AAA_16
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26
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22
22
22
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100
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ABC2_membrane
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48
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ABC_membrane
1
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ABC_tran
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100
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84
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58
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ACR_tran
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164
19
3083
98
73
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ACT
1
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50
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4
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88
86
76
ACT_7
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23
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4
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93
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ADH_zinc_N
2
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193
388
10
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77
75
41
ADPrib_exo_Tox
1
22
30
45
78
13
987
97
67
49
AIRS
1
35
56
37
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2
1589
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98
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ANF_receptor
1
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10
954
91
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ANF_receptor
2
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100
48
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ANF_receptor
3
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12
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ANF_receptor
4
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22
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ANF_receptor
5
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41
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1
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26
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2
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343
319
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1
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299
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10
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38
72
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1
25
47
31
54
8
1060
100
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81
Abhydrolase_1
1
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222
638
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59
9
Abhydrolase_3
1
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9
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Abhydrolase_3
2
24
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161
22
426
84
75
29
Acetyltransf_1
1
76
102
222
335
6
985
84
88
34
Acetyltransf_1
2
45
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222
335
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330
3
10
20
Acetyltransf_1
3
36
49
222
335
7
216
8
4
16
Acetyltransf_1
4
30
39
222
335
5
256
0
5
14
Acetyltransf_1
5
25
35
222
335
6
394
17
31
11
Acetyltransf_1
6
22
25
222
335
7
262
16
12
10
Actin
1
193
194
351
444
28
685
91
22
55
Actin
2
31
32
351
444
15
1130
94
25
9
Actin
3
21
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351
444
78
254
0
0
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Acyl-CoA_dh_1
1
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139
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91
96
97
Acyl-CoA_dh_1
2
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96
139
4
791
85
94
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Acyl-CoA_dh_N
1
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26
80
132
9
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0
0
25
Adaptin_N
1
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35
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55
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100
46
62
Adeno_knob
1
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48
73
9
947
96
96
100
Adenylsucc_synt
1
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56
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56
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100
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1
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51
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1
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AdoHcyase_NAD
2
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78
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AdoHcyase_NAD
3
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AhpC-TSA
1
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117
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8
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94
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AhpC-TSA
2
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117
204
8
201
4
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AlaDh_PNT_C
1
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44
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18
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Ala_racemase_C
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100
96
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Ald_Xan_dh_C2
1
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18
2060
94
97
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Aldedh
1
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2
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100
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Aldedh
2
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426
11
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Aldedh
3
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Aldo_ket_red
1
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Aldolase
1
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20
26
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100
Aldolase_II
1
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Alpha_E1_glycop
1
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Alpha_E2_glycop
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Amidase
1
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24
Amidohydro_1
3
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314
10
2119
73
100
23
Amidohydro_2
1
35
74
50
99
10
2190
96
88
70
Aminotran_1_2
1
179
392
242
505
7
1887
97
97
74
Aminotran_1_2
2
51
96
242
505
18
2069
93
76
21
Aminotran_3
1
141
316
142
319
10
3697
97
97
99
Aminotran_3
2
33
63
142
319
18
1111
81
78
23
Aminotran_4
1
63
130
69
136
13
1287
98
96
91
Aminotran_4
2
26
46
69
136
18
543
61
63
38
Aminotran_4
3
23
43
69
136
18
389
60
65
33
Aminotran_5
1
108
219
113
225
7
2405
97
99
96
Ank_2
1
226
283
467
576
7
862
97
64
48
Ank_2
2
101
111
467
576
3
693
95
37
22
Annexin
1
59
108
60
109
7
481
100
94
98
Annexin
2
49
86
60
109
4
472
95
88
82
Annexin
3
48
86
60
109
8
253
6
3
80
Annexin
4
25
32
60
109
6
247
12
25
42
Anoctamin
1
46
47
46
47
20
715
85
55
100
Arena_glycoprot
1
20
21
40
43
18
1591
95
19
50
Arginase
1
47
170
53
183
13
641
94
85
89
Arm
1
153
255
185
294
3
818
100
88
83
Arm
2
64
158
185
294
7
244
0
2
35
Arm
3
58
144
185
294
8
141
0
0
31
Arm
4
49
52
185
294
5
155
2
13
26
Arm
5
32
35
185
294
7
158
0
14
17
Arm
6
27
31
185
294
5
139
6
6
15
Arm
7
27
31
185
294
6
149
3
16
15
Arm
8
25
26
185
294
6
200
15
54
14
Arm
9
20
21
185
294
13
142
29
29
11
Arm
10
20
22
185
294
10
162
14
14
11
Arm
11
20
20
185
294
4
144
0
10
11
ArsA_ATPase
1
32
40
35
46
19
1695
90
82
91
AsnC_trans_reg
1
22
43
22
43
9
1067
95
95
100
Asparaginase
1
28
97
44
123
44
724
91
94
64
Asparaginase
2
28
97
44
123
44
886
91
94
64
Autoind_bind
1
22
41
30
51
15
467
93
80
73
Avidin
1
64
343
69
350
6
1563
97
97
93
Avidin
2
46
313
69
350
12
504
96
95
67
Avidin
3
44
311
69
350
13
193
95
96
64
BK_channel_a
1
24
24
24
24
2
1496
100
38
100
BMC
1
69
108
70
109
8
595
100
82
99
BMC
2
64
101
70
109
8
222
21
4
91
BMC
3
20
21
70
109
18
180
71
0
29
BPD_transp_1
1
23
34
25
38
12
1608
94
71
92
BTB
1
71
166
72
172
4
584
89
90
99
BTB
2
26
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72
172
6
585
3
6
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BTB_2
1
61
77
62
79
17
664
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35
98
Bac_DNA_binding
1
28
45
29
46
20
1987
98
78
97
Bac_rhodopsin
1
35
180
86
378
18
701
94
78
41
Bac_rhodopsin
2
24
75
86
378
14
204
0
1
28
Band_3_cyto
1
22
22
22
22
30
1229
100
14
100
Bcl-2
1
70
83
217
335
5
589
37
35
32
Bcl-2
2
67
95
217
335
5
332
12
28
31
Bcl-2
3
50
63
217
335
6
397
10
29
23
Bcl-2
4
36
59
217
335
17
231
0
3
17
Bcl-2
5
34
74
217
335
10
299
1
1
16
Bcl-2
6
29
39
217
335
1
751
41
51
13
Bcl-2
7
22
28
217
335
12
171
0
0
10
Bestrophin
1
30
48
30
48
15
2735
100
38
100
Bet_v_1
1
34
62
52
107
6
467
16
37
65
Beta-APP
1
35
49
36
51
7
671
94
31
97
Beta-lactamase2
1
24
33
167
626
24
354
15
12
14
Beta-lactamase2
2
23
115
167
626
20
229
0
0
14
Binary_toxB
1
31
32
33
34
44
195
94
28
94
Biotin_carb_C
1
36
76
44
88
19
365
68
36
82
Bromodomain
1
36
383
345
2175
22
490
8
88
10
C1-set
1
2802
4689
3777
6661
1
828
84
71
74
C1-set
2
842
1527
3777
6661
10
417
74
70
22
C1-set
3
166
239
3777
6661
1
193
2
5
4
C1-set
4
145
260
3777
6661
2
262
99
84
4
C1-set
5
87
126
3777
6661
8
172
2
0
2
C1-set
6
79
124
3777
6661
17
194
3
3
2
C1-set
7
79
106
3777
6661
3
173
4
7
2
C1-set
8
70
108
3777
6661
17
225
6
24
2
C1-set
9
67
124
3777
6661
15
170
6
6
2
C1-set
10
66
88
3777
6661
9
240
25
14
2
C1-set
11
59
99
3777
6661
5
285
1
0
2
C1-set
12
56
76
3777
6661
4
275
1
1
1
C1-set
13
53
75
3777
6661
7
151
1
4
1
C1-set
14
52
72
3777
6661
20
252
0
6
1
C1-set
15
48
69
3777
6661
4
168
0
1
1
C1-set
16
48
61
3777
6661
15
182
2
7
1
C1-set
17
46
199
3777
6661
10
160
2
2
1
C1-set
18
46
57
3777
6661
12
446
4
2
1
C1-set
19
45
68
3777
6661
12
167
0
6
1
C1-set
20
45
59
3777
6661
6
153
3
5
1
C1-set
21
43
98
3777
6661
18
337
0
1
1
C1-set
22
42
98
3777
6661
24
291
0
1
1
C1-set
23
37
53
3777
6661
18
182
0
4
1
C1-set
24
37
54
3777
6661
4
198
2
7
1
C1-set
25
36
55
3777
6661
12
134
4
5
1
C1-set
26
36
52
3777
6661
14
178
0
0
1
C1-set
27
35
47
3777
6661
12
140
0
0
1
C1-set
28
34
39
3777
6661
12
161
0
3
1
C1-set
29
32
40
3777
6661
3
155
0
0
1
C1-set
30
30
77
3777
6661
19
252
0
0
1
C1-set
31
30
39
3777
6661
14
193
3
3
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C1-set
32
30
35
3777
6661
28
212
14
11
1
C1-set
33
28
33
3777
6661
1
151
3
3
1
C1-set
34
27
34
3777
6661
2
181
0
0
1
C1-set
35
26
35
3777
6661
3
155
6
6
1
C1-set
36
25
38
3777
6661
14
154
3
3
1
C1-set
37
25
34
3777
6661
4
160
0
0
1
C1-set
38
25
27
3777
6661
16
145
0
0
1
C1-set
39
24
95
3777
6661
2
151
1
5
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C1-set
40
24
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3777
6661
3
134
0
0
1
C1-set
41
24
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3777
6661
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194
4
0
1
C1-set
42
23
36
3777
6661
6
255
0
6
1
C1-set
43
23
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3777
6661
13
250
0
4
1
C1-set
44
23
24
3777
6661
14
307
8
8
1
C1-set
45
22
38
3777
6661
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145
5
11
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C1-set
46
22
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6661
14
227
0
4
1
C1-set
47
22
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6661
5
137
0
4
1
C1-set
48
21
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6661
12
169
3
7
1
C1-set
49
21
27
3777
6661
9
173
4
0
1
C1-set
50
20
27
3777
6661
19
232
0
0
1
C1-set
51
20
24
3777
6661
14
359
0
25
1
C1-set
52
20
25
3777
6661
3
145
0
4
1
C1-set
53
20
20
3777
6661
15
142
0
5
1
C1q
1
29
41
29
41
20
895
100
95
100
CARD
1
25
31
51
59
9
383
77
29
49
CARD
2
24
29
51
59
11
445
90
31
47
CARD
3
23
28
51
59
10
203
86
32
45
CBAH
1
24
36
33
48
13
2009
100
97
73
CBAH
2
23
34
33
48
17
372
91
94
70
CBAH
3
23
34
33
48
17
1142
91
94
70
CBFD_NFYB_HMF
1
30
38
32
40
8
1656
87
79
94
CBS
1
175
230
189
253
1
1101
97
83
93
CBS
2
131
175
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90
80
69
CBS
3
20
28
189
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5
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100
11
CH
1
36
47
54
66
7
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85
83
67
CLP_protease
1
67
127
72
135
27
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98
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93
CLP_protease
2
45
96
72
135
27
702
83
71
62
CMD
1
25
28
27
30
5
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89
89
93
CMD
2
25
28
27
30
9
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93
96
93
CM_2
1
27
35
31
42
5
1748
91
100
87
CN_hydrolase
1
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55
109
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97
96
64
COesterase
1
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90
504
20
531
82
78
59
CRISPR_Cas2
1
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912
98
67
97
CTP_synth_N
1
45
54
45
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100
44
100
CTP_synth_N
2
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526
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40
98
CTP_synth_N
3
43
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45
54
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680
100
42
96
CTP_transf_like
1
46
124
80
208
8
244
72
60
57
CTP_transf_like
2
24
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208
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408
83
93
30
CTP_transf_like
3
24
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80
208
30
1055
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67
30
Cadherin
1
108
128
168
199
3
118
98
90
64
Cadherin
2
21
23
168
199
18
445
91
87
12
Calici_coat
1
98
184
115
209
1
659
90
81
85
Calici_coat
2
24
25
115
209
23
875
100
24
21
Calici_coat_C
1
88
172
94
185
27
1014
91
84
94
Calici_coat_C
2
21
60
94
185
29
310
0
0
22
Carboxyl_trans
1
47
79
50
82
12
2769
97
77
94
Cas_Cas1
1
38
44
39
46
3
1583
100
66
97
Catalase
1
44
143
47
147
38
2132
97
96
94
Catalase
2
44
143
47
147
38
3441
99
96
94
CesT
1
22
24
22
24
6
1253
79
92
100
Chal_sti_synt_N
1
66
112
66
116
16
1162
97
96
100
Chloroa_b-bind
1
35
38
81
89
20
252
100
8
43
Chloroa_b-bind
2
28
28
81
89
21
273
96
4
35
Chloroa_b-bind
3
22
22
81
89
20
325
95
5
27
Chromo
1
31
39
56
72
15
250
18
21
55
Citrate_synt
1
72
110
73
111
10
2132
100
86
99
Clp_N
1
53
60
59
69
4
747
97
75
90
Clp_N
2
23
26
59
69
5
251
23
8
39
CoA_trans
1
20
32
20
32
18
920
100
100
100
CoA_transf_3
1
21
40
21
43
19
6083
98
98
100
Cob_adeno_trans
1
27
40
27
40
27
867
100
88
100
Collagen
1
42
79
43
80
1
510
95
89
98
Connexin
1
52
54
52
54
30
810
100
4
100
Copper-bind
1
24
46
104
258
7
446
22
70
23
CorA
1
21
24
27
30
11
1729
96
58
78
Cpn10
1
26
33
26
33
13
729
97
70
100
Cpn60_TCP1
1
132
164
150
189
12
1176
100
51
88
Cpn60_TCP1
2
70
83
150
189
22
649
96
29
47
Creatinase_N
1
30
42
31
44
7
506
83
88
97
Crystall
1
39
61
51
81
18
484
95
80
76
Crystall
2
22
32
51
81
18
250
31
22
43
Crystall
3
21
30
51
81
14
339
27
13
41
Cu-oxidase
1
36
190
87
347
3
842
99
97
41
Cu-oxidase_2
1
45
101
100
234
8
525
95
86
45
Cu_amine_oxid
1
21
148
21
149
11
4820
97
95
100
Cupin_1
1
45
74
49
79
3
1067
95
97
92
Cupin_1
2
24
39
49
79
6
1232
100
97
49
Cupin_2
1
80
125
89
145
1
329
89
91
90
CutA1
1
27
38
27
38
10
1081
92
97
100
Cys_Met_Meta_PP
1
60
141
60
141
14
1442
94
95
100
Cys_Met_Meta_PP
2
60
141
60
141
14
2405
91
91
100
Cys_Met_Meta_PP
3
55
135
60
141
24
864
93
93
92
Cytochrom_B559
1
53
121
53
121
13
506
86
26
100
Cytochrom_B562
1
60
125
98
181
67
425
54
70
61
Cytochrom_B562
2
33
65
98
181
80
160
2
0
34
Cytochrom_B562
3
26
54
98
181
3
177
63
61
27
Cytochrom_C
1
26
38
121
223
9
392
11
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Cytochrom_C
2
24
55
121
223
9
265
9
11
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Cytochrom_C
3
20
31
121
223
12
347
10
13
17
Cytochrom_C1
1
67
93
76
107
58
295
86
44
88
Cytochrome_B
1
101
131
103
145
28
757
76
42
98
DAHP_synth_1
1
38
140
38
140
11
1430
98
99
100
DAHP_synth_1
2
24
89
38
140
21
198
91
99
63
DHDPS
1
107
257
108
258
11
1333
98
95
99
DHDPS
2
71
167
108
258
14
985
81
81
66
DHQ_synthase
1
23
33
23
33
21
1295
70
91
100
DHquinase_I
1
30
49
31
54
15
973
80
84
97
DHquinase_II
1
28
76
28
76
37
702
97
96
100
DJ-1_PfpI
1
30
117
62
167
6
876
92
98
48
DMRL_synthase
1
30
56
30
56
14
444
98
80
100
DNA_gyraseB
1
21
29
30
41
13
319
93
93
70
DNA_topoisoIV
1
70
121
70
121
11
1450
98
82
100
DPPIV_N
1
51
172
62
191
16
535
90
92
82
Csm2_III-A
1
23
23
24
24
29
544
91
4
96
DUF4162
1
21
21
21
21
63
661
100
48
100
DXPR_C
1
27
75
27
75
26
420
100
100
100
Dala_Dala_lig_C
1
30
58
32
60
20
321
84
93
94
Dala_Dala_lig_N
1
31
57
32
60
10
593
84
93
97
DapB_C
1
24
37
24
37
16
1168
92
97
100
DapB_C
2
21
33
24
37
20
1490
91
91
88
DegT_DnrJ_EryC1
1
43
79
43
79
17
2290
94
99
100
Dimerisation2
1
43
67
44
69
9
618
87
96
98
DnaB
1
24
27
29
32
26
313
96
41
83
DnaB_C
1
41
47
47
54
16
791
94
43
87
Dynamin_N
1
24
30
43
56
13
759
87
63
56
Dynein_light
1
40
57
42
59
14
852
91
54
95
Dyp_perox
1
37
84
45
108
16
1563
82
90
82
E1_dh
1
25
76
25
76
13
793
99
97
100
EAL
1
25
38
49
69
16
915
82
84
51
EB1
1
26
30
26
30
35
1072
97
97
100
ECH_1
1
164
225
183
271
4
1483
96
96
90
ECH_1
2
40
53
183
271
15
542
75
92
22
EF-hand_1
1
71
156
136
244
3
248
90
58
52
EF-hand_1
2
35
45
136
244
3
663
93
91
26
EF-hand_1
3
26
40
136
244
6
213
30
32
19
EF-hand_7
1
86
145
440
697
7
357
97
81
20
EF-hand_7
2
37
55
440
697
6
457
2
15
8
EF-hand_7
3
35
49
440
697
6
361
41
39
8
EF-hand_7
4
29
55
440
697
15
210
2
4
7
EF-hand_7
5
29
49
440
697
22
489
2
37
7
EF-hand_7
6
25
43
440
697
10
311
0
0
6
EF-hand_7
7
21
32
440
697
5
175
78
59
5
ELFV_dehydrog
1
39
64
50
80
8
496
97
77
78
ELFV_dehydrog_N
1
48
74
48
78
14
454
95
78
100
EMG1
1
40
43
42
45
23
1115
100
21
95
Enolase_C
1
50
104
51
105
41
654
94
91
98
Enolase_C
2
20
34
51
105
46
358
62
65
39
Enolase_N
1
20
36
43
86
50
223
58
69
47
Epimerase
1
50
86
89
147
9
1287
86
94
56
Epimerase_2
1
20
25
20
25
16
1368
92
100
100
FAA_hydrolase
1
32
41
38
54
13
1598
93
95
84
FBPase
1
32
129
32
151
23
930
95
95
100
FCD
1
22
25
22
25
10
730
88
76
100
FCH
1
31
35
31
35
9
1298
100
100
100
FG-GAP
1
57
110
57
111
8
475
100
65
100
FGGY_C
1
32
65
41
87
13
977
75
98
78
FKBP_C
1
38
84
139
250
23
274
0
0
27
FKBP_C
2
38
56
139
250
14
400
21
48
27
FKBP_C
3
28
39
139
250
18
336
18
41
20
FKBP_C
4
22
28
139
250
16
265
7
14
16
FMN_dh
1
29
126
31
130
5
1211
86
93
94
FMN_red
1
45
66
46
67
3
1029
80
88
98
FMN_red
2
38
55
46
67
3
380
76
76
83
FMN_red
3
36
53
46
67
3
601
79
81
78
FUR
1
31
37
35
41
16
1154
89
76
89
F_bP_aldolase
1
27
59
27
59
22
2108
97
97
100
FabA
1
27
59
29
61
13
1285
90
88
93
Fe-ADH
1
49
63
51
65
13
911
87
84
96
Fe_dep_repr_C
1
27
64
27
64
19
906
94
94
100
Fer4_NifH
1
24
54
26
57
33
1464
100
89
92
Ferritin
1
151
637
171
676
4
525
99
87
88
Ferritin
2
68
203
171
676
6
724
100
93
40
Ferritin
3
43
108
171
676
7
473
100
95
25
Ferritin
4
20
44
171
676
4
151
0
0
12
Fib_alpha
1
20
40
21
42
1
986
100
95
95
Filament
1
26
30
30
34
2
1925
87
97
87
Flagellin_C
1
23
23
37
37
50
318
65
4
62
Flagellin_C
2
22
22
37
37
50
312
68
5
59
Flagellin_C
3
22
22
37
37
50
140
68
5
59
Flagellin_N
1
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30
42
42
13
765
50
3
71
Flagellin_N
2
23
23
42
42
45
406
65
4
55
Flagellin_N
3
22
22
42
42
45
272
68
5
52
Flavi_M
1
40
40
49
49
15
940
100
0
82
Flavi_NS1
1
21
23
22
24
42
1450
87
74
95
Flavi_glycoprot
1
109
117
137
149
37
766
87
26
80
Flavi_glycoprot
2
64
65
137
149
38
651
91
2
47
Flavin_Reduct
1
35
50
35
50
13
1993
98
100
100
Flavodoxin_2
1
45
135
45
137
9
1640
95
96
100
Flavoprotein
1
25
33
25
44
7
626
97
94
100
Formyl_trans_N
1
23
53
65
120
13
584
25
79
35
Fungal_lectin
1
21
59
41
86
25
690
92
90
51
Fungal_lectin
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Fusion_gly
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2
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Fusion_gly
2
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GP120
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100
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24
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8
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IF-2B
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IL17
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IL8
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IL8
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IL8
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0
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IMPDH
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40
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IN_DBD_C
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36
47
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19
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69
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66
IQ
1
28
28
54
55
2
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96
68
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IRK
1
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99
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100
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18
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Ku
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1
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100
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28
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14
806
95
67
75
Lectin_C
1
33
49
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382
17
1863
94
96
16
Lectin_C
2
24
33
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382
12
276
18
24
12
Lectin_C
3
23
30
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12
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30
11
Lectin_legB
1
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28
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92
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Lectin_legB
2
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44
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29
Lectin_legB
3
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326
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86
87
23
Lectin_legB
4
20
76
93
326
31
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89
64
22
Levi_coat
1
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60
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92
28
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Levi_coat
2
23
58
32
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13
2372
78
28
72
Lig_chan
1
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188
193
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1
1231
95
18
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Lig_chan-Glu_bd
1
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450
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1
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3
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9
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Lipocalin
2
23
83
229
907
17
404
5
2
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Lon_C
1
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27
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85
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Lyase_1
1
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124
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10
900
96
98
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Lyase_1
2
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126
10
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97
99
99
Lyase_aromatic
1
20
47
20
47
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100
Lyase_aromatic
2
20
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98
98
100
LysR_substrate
1
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100
154
5
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93
98
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M20_dimer
1
45
62
49
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6
1497
97
97
92
MACPF
1
20
20
36
37
10
648
95
30
56
MATH
1
22
28
49
77
12
221
71
82
45
MCM
1
56
56
60
60
40
902
98
29
93
MCM_OB
1
65
66
70
71
23
568
97
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93
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1
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0
0
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MHC_I
2
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0
0
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MHC_I
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0
0
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MHC_I
4
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314
0
0
6
MHC_I
5
22
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562
1158
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0
0
4
MHC_II_alpha
1
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96
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8
20
25
MHC_II_beta
1
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MIF
1
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98
98
100
MIP
1
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1496
94
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100
MR_MLE_C
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9
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MR_MLE_C
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MR_MLE_C
3
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10
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4
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MR_MLE_C
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302
11
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2
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MR_MLE_N
1
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MR_MLE_N
2
127
233
161
282
2
834
80
87
79
MS_channel
1
35
40
35
40
12
1896
88
38
100
Metallophos
1
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10
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63
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Methyltransf_3
1
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159
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85
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MitMem_reg
1
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63
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90
11
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98
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Mst1_SARAH
1
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21
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100
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MutS_V
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2208
96
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1
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22
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NAD_binding_11
1
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NAD_synthase
1
24
43
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70
15
1908
86
100
69
NAP
1
20
24
27
28
13
1938
92
88
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NDK
1
72
178
72
178
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93
95
100
NDK
2
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147
72
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68
NGF
1
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24
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96
96
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NHL
1
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NTF2
1
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97
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NTP_transferase
1
33
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74
132
19
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84
96
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NUDIX
1
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44
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13
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84
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18
Neur
1
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250
72
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18
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Neur_chan_LBD
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93
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Neur_chan_LBD
3
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1
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0
0
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Neur_chan_memb
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100
59
98
Nitroreductase
1
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142
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99
94
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Nop
1
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47
49
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30
990
94
26
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OEP
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28
37
29
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9
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100
89
97
OMPdecase
1
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257
58
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95
97
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OTCace_N
1
73
185
73
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15
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98
98
100
OmpA
1
21
28
57
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16
646
54
71
37
OsmC
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36
29
36
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100
97
100
Oxidored_nitro
1
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38
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93
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100
Oxidored_nitro
2
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1882
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100
Oxidored_nitro
3
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100
P-II
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55
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99
96
100
P-II
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20
24
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P53
1
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180
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28
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P53
2
20
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53
180
53
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93
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38
PA28_beta
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27
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PALP
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PALP
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PARP
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PAS
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58
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PAS_9
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PCI
1
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PDCD9
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13
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PDZ
2
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PEP-utilizers_C
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20
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PEP_mutase
1
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20
32
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97
100
100
PFK
1
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PFK
2
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PGI
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29
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PHD
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PIN
1
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PK
1
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PK_C
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PNP_UDP_1
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POTRA
1
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1
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PPR_2
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23
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9
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100
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PQQ
1
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25
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PQQ_3
1
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PS-DH
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9
601
84
56
78
PTE
1
26
150
34
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26
1486
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99
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PUF
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28
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571
99
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100
Parvo_coat
1
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66
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Parvo_coat
2
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66
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1991
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19
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Parvo_coat
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Pectate_lyase_3
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PemK_toxin
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50
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100
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Peptidase_C1
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0
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0
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Peptidase_S24
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24
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0
0
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0
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0
0
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Peptidase_S8
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0
0
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Peptidase_S8
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0
0
21
Peptidase_S9
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PfkB
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10
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PfkB
2
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1042
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Phage_capsid
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6
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Phage_lysozyme
1
29
466
151
803
80
440
1
5
19
Phage_lysozyme
2
21
27
151
803
83
211
0
0
14
Phospholip_A2_1
1
68
129
102
303
2
499
54
70
67
Phospholip_A2_1
2
34
69
102
303
2
312
3
4
33
Phospholip_A2_1
3
32
73
102
303
29
337
14
33
31
Phospholip_A2_1
4
28
68
102
303
2
213
1
0
27
Phospholip_A2_1
5
23
61
102
303
2
406
10
2
23
Phospholip_A2_1
6
22
55
102
303
29
259
2
11
22
Photo_RC
1
99
311
99
311
15
3983
99
62
100
Phycobilisome
1
43
102
57
124
19
1316
100
78
75
Phycobilisome
2
40
99
57
124
22
445
91
76
70
Phycobilisome
3
30
72
57
124
21
431
76
69
53
Phycobilisome
4
21
39
57
124
22
215
41
8
37
Pkinase
1
61
149
1061
4422
14
1426
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Pkinase
2
39
78
1061
4422
16
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24
4
Pkinase
3
38
133
1061
4422
16
276
2
9
4
Pkinase
4
31
52
1061
4422
20
433
4
17
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Pkinase
5
26
143
1061
4422
23
515
1
0
2
Polyketide_cyc2
1
22
43
62
117
7
777
49
72
35
Polyoma_coat
1
42
99
42
99
26
2227
96
78
100
Porin_1
1
42
91
42
91
12
1456
95
90
100
Prenyltrans
1
21
115
21
120
2
683
100
97
100
Prenyltransf
1
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98
37
101
6
1691
98
97
100
Pribosyltran
1
115
208
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235
6
974
93
96
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Pribosyltran
2
33
52
136
235
12
691
63
60
24
Pribosyltran
3
28
44
136
235
5
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70
66
21
Pribosyltran
4
25
52
136
235
8
407
2
0
18
Pribosyltran
5
20
31
136
235
12
704
45
23
15
Pribosyltran_N
1
31
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31
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Pro_CA
1
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Pro_CA
2
22
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Pro_isomerase
1
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0
0
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Pro_racemase
1
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20
28
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100
Prot_ATP_ID_OB
1
104
105
104
105
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97
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100
Proteasome
1
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100
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Proteasome
2
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Proteasome
3
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Proteasome
4
20
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100
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385
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132
99
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64
Proteasome_A_N
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171
464
20
152
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Proton_antipo_M
1
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236
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Prp19
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33
33
33
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Prp19
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22
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PsaA_PsaB
1
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PsaL
1
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PsbM
1
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629
85
22
100
Pterin_bind
1
44
122
50
131
9
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80
92
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Pyr_redox_2
1
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17
1006
99
99
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Pyr_redox_2
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Pyr_redox_dim
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113
257
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100
Putative_PNPOx
1
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64
41
65
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97
100
Pyridoxal_deC
1
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78
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97
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1
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Pyrophosphatase
2
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Pyrophosphatase
3
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QRPTase_C
1
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100
100
RAMPs
1
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RCC1
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RHD_dimer
1
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RHH_1
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RHS_repeat
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21
21
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9
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100
67
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RIIa
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3
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RNase_T
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968
73
100
41
ROK
1
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1708
87
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RRM_1
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23
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39
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RVP
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0
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73
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Rad51
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55
28
64
Ras
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330
2
18
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Ras
2
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29
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Ras
3
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34
512
936
21
218
0
0
5
Ras
4
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42
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936
33
300
0
0
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Redoxin
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Rep_fac_C
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45
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Response_reg
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Response_reg
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Response_reg
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Response_reg
4
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20
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1
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Rhodanese
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Rhv
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1
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Rhv
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479
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Rhv
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365
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97
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RibD_C
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37
17
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81
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Ribonuc_L-PSP
1
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55
52
55
4
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93
96
100
Ribonuc_L-PSP
2
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25
52
55
14
251
4
8
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Ribonuc_L-PSP
3
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21
52
55
4
265
0
14
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Ribonuc_red_lgC
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Ribonuc_red_sm
1
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92
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Ribonucleas_3_3
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30
35
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100
Ribonuclease_3
1
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Ribosomal_L6
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100
23
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Ring_hydroxyl_B
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56
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100
RnaseA
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222
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Robl_LC7
1
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41
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RuBisCO_large
1
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125
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125
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100
RuBisCO_large
2
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125
36
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96
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RuBisCO_large_N
1
43
84
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RyR
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97
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100
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S-AdoMet_synt_C
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S-AdoMet_synt_N
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S-AdoMet_synt_N
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3
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SAM_1
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SDF
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SH3_1
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SH3_1
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SH3_1
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SH3_9
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SH3_9
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SHMT
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SIS
1
46
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100
SIS
2
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SIS
3
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87
SMC_N
1
23
24
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1
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27
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19
SPRY
2
26
26
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SSB
1
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50
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SSB
2
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50
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77
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SSB
3
26
39
50
79
2
265
3
0
52
STAS
1
29
29
55
63
11
329
100
7
53
SWIB
1
57
114
79
163
49
347
8
31
72
SWIB
2
24
67
79
163
49
214
1
15
30
SWIB
3
22
40
79
163
58
248
0
8
28
SWIB
4
22
38
79
163
59
337
3
5
28
SWIB
5
20
25
79
163
57
292
0
4
25
S_100
1
73
169
82
180
2
645
98
63
89
Secretin_N
1
34
35
42
43
1
479
91
26
81
Sel1
1
25
25
25
25
2
369
96
72
100
Sema
1
21
21
44
44
10
1078
86
67
48
Semialdhyde_dhC
1
43
83
43
83
7
2373
89
99
100
Semialdhyde_dhC
2
22
32
43
83
7
630
72
91
51
Septin
1
22
29
23
30
24
1364
66
93
96
Serum_albumin
1
44
193
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14
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100
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Serum_albumin
2
44
152
51
206
14
666
100
88
86
Sld5
1
26
27
26
27
5
246
100
48
100
SnoaL_2
1
52
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99
186
4
578
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90
53
SnoaL_2
2
34
110
99
186
13
596
91
92
34
SnoaL_2
3
24
89
99
186
7
358
0
11
24
SnoaL_2
4
23
37
99
186
9
300
3
19
23
SnoaL_4
1
25
29
25
29
12
745
90
86
100
Sod_Cu
1
69
184
98
233
11
507
93
88
70
Sod_Fe_C
1
97
187
99
189
16
502
95
89
98
Spectrin
1
20
22
43
45
9
386
91
86
47
Spermine_synth
1
30
65
32
67
12
370
100
98
94
SpoU_methylase
1
44
53
45
54
12
990
85
83
98
Sulfotransfer_1
1
27
53
46
83
21
370
11
0
59
Sushi
1
76
106
124
162
7
187
91
67
61
Synuclein
1
78
79
78
79
55
2568
97
6
100
T2SSE
1
37
46
39
48
13
1195
91
65
95
TBP
1
39
56
41
59
28
794
96
84
95
TENA_THI-4
1
21
31
23
33
8
849
65
90
91
TFR_dimer
1
20
104
20
104
21
395
97
86
100
TGF_beta
1
109
132
115
138
14
1232
95
81
95
TGF_beta
2
29
35
115
138
19
276
3
6
25
THF_DHG_CYH_C
1
21
41
21
41
32
1379
93
95
100
TIM
1
103
223
115
250
4
1497
96
100
90
TIP49
1
29
32
29
32
34
1333
100
56
100
TLV_coat
1
50
70
53
75
6
1031
90
70
94
TMEM173
1
38
111
39
112
11
1763
98
83
97
TNF
1
94
131
98
135
1
809
89
89
96
TNFR_c6
1
76
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81
97
5
301
68
64
94
TPP_enzyme_C
1
91
240
91
242
6
739
98
98
100
TPP_enzyme_N
1
81
218
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220
10
656
98
98
100
TPP_enzyme_N
2
54
150
81
220
13
522
88
99
67
TPR_1
1
94
122
136
177
3
435
89
81
69
TPR_11
1
90
125
100
136
3
648
94
78
90
TPR_12
1
51
54
82
109
5
493
91
69
62
TPR_12
2
21
23
82
109
5
368
26
26
26
TPR_2
1
24
30
47
63
4
497
97
87
51
TP_methylase
1
44
153
45
155
6
1885
97
95
98
TRAPP
1
26
29
26
29
12
801
69
62
100
TRPM_tetra
1
24
24
24
24
24
620
100
4
100
TauD
1
25
37
51
125
27
910
76
89
49
TauD
2
24
36
51
125
27
631
81
94
47
Tautomerase
1
22
40
23
42
10
416
90
95
96
Tautomerase
2
22
41
23
42
10
473
93
98
96
TetR_C_6
1
27
50
27
50
6
1434
100
98
100
TetR_N
1
62
95
231
365
6
215
2
26
27
TetR_N
2
36
63
231
365
13
154
44
67
16
TetR_N
3
26
45
231
365
14
198
2
2
11
TetR_N
4
20
48
231
365
17
235
0
27
9
ThiF
1
57
81
67
93
2
2066
96
88
85
Thiolase_N
1
71
144
76
152
8
1866
99
94
93
Thiolase_N
2
38
89
76
152
32
310
92
96
50
Thiolase_N
3
37
85
76
152
32
648
91
95
49
Thioredoxin
1
33
56
200
270
13
570
39
73
16
Thrombin_light
1
27
77
57
369
27
215
0
5
47
Thymidylat_synt
1
80
338
80
338
16
2142
94
97
100
Thymidylat_synt
2
20
49
80
338
38
348
0
2
25
Thymidylate_kin
1
32
99
39
120
16
948
81
99
82
Toxin_TOLIP
1
29
34
58
77
10
428
38
24
50
Toxin_TOLIP
2
25
30
58
77
13
274
17
27
43
Transferrin
1
34
73
58
200
35
307
95
79
59
Transket_pyr
1
60
168
61
169
9
789
98
96
98
Transketolase_C
1
48
131
48
137
7
549
98
96
100
Transketolase_N
1
22
72
22
77
26
688
99
100
100
Transpeptidase
1
37
158
165
547
16
994
64
66
22
Transthyretin
1
30
364
36
404
19
859
100
93
83
Transthyretin
2
28
362
36
404
19
341
95
89
78
Transthyretin
3
28
362
36
404
19
333
93
88
78
TrkA_C
1
37
56
46
72
11
355
98
79
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TrkA_N
1
44
67
56
86
8
594
90
46
79
TrkA_N
2
37
60
56
86
11
236
95
78
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Tropomyosin
1
36
38
42
44
1
2420
95
45
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Trypsin
1
29
304
637
2412
13
542
0
0
5
Trypsin
2
25
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2412
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319
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4
Trypsin_2
1
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75
58
Tubulin
1
227
522
292
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1
210
95
60
78
Tubulin-binding
1
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83
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9
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100
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100
Tubulin-binding
2
21
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20
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90
14
25
U-box
1
33
33
38
39
19
354
94
30
87
UDPG_MGDP_dh
1
27
43
27
43
19
2121
98
100
100
UQ_con
1
32
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365
0
0
15
UQ_con
2
31
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376
0
8
14
UQ_con
3
27
33
218
263
15
339
12
15
12
UbiD
1
20
47
20
74
21
1160
96
96
100
Usp
1
29
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30
37
8
954
92
86
97
Utp12
1
32
32
37
37
12
351
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Utp12
2
26
26
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17
324
54
4
70