Protein Common Interface Database

Domain Clusters with M>=20,SeqId<90 and diff Pfam relation

Pfam Architecture	Cluster#	#CFs/Cluster	#Entries/Cluster	#CFs/Group	#Entries/Group	Minimum Seq Identity	Surface Area	In PDBBA(%)	In PISABA(%)	CFs Cluster/Group(%)
(RNA_polI_A14);(SHS2_Rpb7-N)	1	36	40	36	40	2	723	100	72	100
(RNA_polI_A14);(RPA43_OB)	1	29	33	35	39	70	258	100	67	83
(ATP-synt_A);(VBS)	1	27	27	27	27	51	945	100	89	100
(CarD_CdnL_TRCF);(RNA_pol_Rpb2_1)	1	24	24	24	24	18	483	71	8	100
(Ras);(Xpo1)	1	22	82	23	83	12	436	98	66	96
(SNARE);(Synaptobrevin)	1	27	30	27	31	25	682	97	70	100
(V-set);(V-set_2)	1	309	351	334	377	24	810	97	86	93
(V-set);(WD40)	1	233	233	482	482	59	108	79	1	48
(V-set);(WD40)	2	212	212	482	482	35	283	84	2	44
(V-set);(WD40)	3	203	203	482	482	35	133	86	3	42
(XPG_I);(XPG_N)	1	31	58	31	60	18	2093	100	95	100
(cNMP_binding);(HTH_Crp_2)	1	52	104	68	124	8	368	99	95	76
(cNMP_binding);(Pkinase)	1	21	32	22	33	31	322	91	75	95
(dCache_1);(VWA_N)	1	22	22	22	22	71	598	100	5	100
(dsrm);(MRP-S32)	1	69	70	69	70	68	663	93	11	100
(dsrm);(Ribonuclease_3)	1	21	22	27	28	62	254	91	9	78
(dsrm);(Ribosomal_L13)	1	71	72	78	79	25	159	100	11	91
(eIF-1a);(Ribosom_S12_S23)	1	47	47	55	55	20	336	100	15	85
(eIF-1a);(Ribosomal_S30)	1	30	30	35	35	19	307	100	10	86
(eIF-6);(NOGCT)	1	80	80	80	80	35	704	98	18	100
(eIF-6);(Ribosomal_L14)	1	111	111	116	116	66	737	85	23	96
(eIF-6);(Ribosomal_L24e)	1	88	88	113	113	29	168	90	26	78
(eIF-6);(Ribosomal_L3)	1	99	99	113	113	57	216	98	25	88
(fn3);(IL6Ra-bind)	1	28	28	34	35	10	364	89	57	82
(ig);(Ig_2)	1	20	22	25	30	17	388	100	95	80
(ketoacyl-synt);(Ketoacyl-synt_C)	1	128	198	132	209	11	2015	100	81	97
(ketoacyl-synt);(Ketoacyl-synt_C)	2	112	187	132	209	4	526	96	83	85
(malic);(Malic_M)	1	28	51	28	51	13	1151	100	88	100
(Nrap_D4);(Ribosomal_S3Ae)	1	23	23	24	24	20	503	100	0	96
(Nop14);(Ribosom_S12_S23)	1	25	25	27	27	25	499	100	4	93
(Nop14);(RIBIOP_C)	1	27	27	29	29	25	413	70	4	93
(Utp14);(WD40)	1	25	25	27	27	18	431	100	4	93
(Utp14);(WD40)	2	25	25	27	27	26	341	36	0	93
(Utp14);(WD40)	3	22	22	27	27	23	164	100	5	81
(Sof1);(Utp14)	1	29	29	29	29	26	664	100	3	100
(TPR_14);(Utp14)	1	25	25	26	26	24	548	100	4	96
(U3_assoc_6);(Utp14)	1	20	20	28	28	76	160	100	0	71
(BING4CT);(Utp14)	1	26	26	29	29	26	241	100	4	90
(Ribosomal_S7e);(Utp14)	1	23	23	26	26	24	284	100	4	88
(NOP5NT);(Utp14)	1	25	25	27	27	26	190	100	4	93
(peroxidase);(Peroxidase_ext)	1	24	73	24	73	28	2968	100	100	100
(ribosomal_L24);(Tim44)	1	66	67	66	67	86	361	78	9	100
(ATP-grasp);(PurK_C)	1	20	30	20	32	11	646	100	100	100
(tRNA_anti-codon);(tRNA-synt_2)	1	55	103	55	103	11	319	91	97	100
(tRNA_anti-codon);(tRNA-synt_2)	2	50	97	55	103	11	200	96	96	91
(ubiquitin);(UCH)	1	53	65	55	69	12	1081	97	69	96
(ubiquitin);(UQ_con)	1	52	61	87	102	4	635	97	52	60
(zf-C2H2);(zf-H2C2_2)	1	73	115	75	122	14	618	96	70	97
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_45)	1	152	168	155	186	44	348	98	15	98
(NusG);(RNA_pol_Rpb2_2)	1	48	48	57	57	18	248	100	4	84
(NusG);(RNA_pol_Rpb2_1)	1	31	31	49	49	18	198	100	6	63
(NusG);(RNA_pol_Rpb1_1)	1	58	58	60	60	18	599	100	3	97
(ATP-synt_A);(ATP-synt_B)	1	75	76	75	76	13	806	91	4	100
(ATP-synt_A);(ATP-synt_B)	2	72	73	75	76	16	1151	92	4	96
(ATP-synt_B);(OSCP)	1	49	50	54	55	12	211	98	4	91
(PSP);(RRM_1)	1	30	31	30	31	48	671	55	16	100
(Secretin);(Secretin_N)	1	23	23	24	24	12	469	100	26	96
(Secretin);(Secretin_N)	2	20	20	24	24	12	395	100	30	83
(NADHdh_A3);(Oxidored_q4)	1	158	158	160	160	12	354	98	14	99
(MWFE);(NADHdh)	1	174	174	174	174	20	1501	82	13	100
(MWFE);(Oxidored_q3)	1	159	159	173	173	14	235	94	12	92
(CHCH);(MWFE)	1	173	173	174	174	20	313	75	11	99
(CHCH);(MWFE)	2	57	57	174	174	42	233	46	0	33
(GRIM-19);(MWFE)	1	170	170	170	170	20	264	91	13	100
(NDUFA12);(Oxidored_q6)	1	164	164	167	167	30	156	95	13	98
(NADHdh);(NADHdh_A3)	1	160	160	160	160	12	385	78	13	100
(GRIM-19);(NADHdh_A3)	1	145	145	152	152	15	591	84	14	95
(Complex1_30kDa);(ETC_C1_NDUFA5)	1	168	168	169	169	25	214	73	12	99
(Complex1_30kDa);(Complex1_LYR)	1	165	165	166	166	16	454	87	14	99
(NADH_dh_m_C1);(NDUF_C2)	1	138	138	138	138	53	890	80	9	100
(Complex1_49kDa);(zf-CHCC)	1	169	170	171	171	43	210	99	12	99
(Complex1_49kDa);(GRIM-19)	1	164	164	164	164	36	955	95	12	100
(NDUF_C2);(Ndufs5)	1	130	130	136	136	70	136	92	10	96
(NDUF_C2);(Proton_antipo_M)	1	168	168	169	169	9	170	96	14	99
(NDUF_C2);(Proton_antipo_M)	2	132	132	169	169	70	207	100	11	78
(NADH_dehy_S2_C);(NDUF_C2)	1	144	144	144	144	44	819	93	12	100
(NDUF_C2);(NDUFB10)	1	84	84	139	139	70	741	96	17	60
(2Fe-2S_thioredx);(Fer4_10)	1	26	26	26	26	62	470	100	27	100
(Ndufs5);(Oxidored_q3)	1	154	154	167	167	14	664	92	10	92
(Ndufs5);(Oxidored_q2)	1	167	167	167	167	18	514	72	13	100
(Ndufs5);(Proton_antipo_M)	1	165	165	166	166	16	712	76	13	99
(GRIM-19);(Ndufs5)	1	166	166	166	166	20	1113	78	13	100
(Fer4_10);(NADH_4Fe-4S)	1	26	26	26	26	68	296	96	23	100
(NADH_oxidored);(Oxidored_q5_N)	1	143	143	143	143	54	748	73	10	100
(NADH_oxidored);(NDUFB10)	1	81	81	143	143	71	313	91	15	57
(NADH_oxidored);(NDUFB10)	2	55	55	143	143	84	329	87	0	38
(NADH-G_4Fe-4S_3);(zf-CHCC)	1	169	169	172	172	33	189	78	11	98
(ESSS);(NDUF_B5)	1	143	143	143	143	42	937	71	9	100
(ESSS);(Oxidored_q5_N)	1	156	156	156	156	1	932	70	9	100
(dNK);(ESSS)	1	78	78	123	123	79	159	100	9	63
(ESSS);(NDUFB10)	1	90	90	146	146	49	1063	82	14	62
(CHCH);(NADHdh)	1	138	138	163	163	76	201	100	13	85
(GRIM-19);(NADHdh)	1	174	174	174	174	34	572	93	13	100
(NDUF_B5);(NDUF_B6)	1	138	138	143	143	36	267	88	11	97
(NDUF_B5);(Proton_antipo_M)	1	144	144	144	144	16	553	83	11	100
(NDUF_B5);(Proton_antipo_M)	2	133	133	144	144	51	299	93	11	92
(Fer4_7);(NDUFA12)	1	149	149	163	163	35	174	74	11	91
(Fer4_7);(zf-CHCC)	1	167	167	171	171	40	226	92	11	98
(NDUF_B6);(PP-binding)	1	142	142	143	143	45	323	78	11	99
(GRIM-19);(Oxidored_q3)	1	166	166	173	173	14	460	90	11	96
(NADH5_C);(NDUF_B4)	1	160	160	160	160	13	604	59	8	100
(NDUF_B4);(Proton_antipo_M)	1	166	166	166	166	13	991	93	13	100
(NDUF_B4);(Proton_antipo_M)	2	138	138	166	166	74	236	83	9	83
(Complex1_LYR);(NADH5_C)	1	160	160	165	165	15	403	68	10	97
(Complex1_LYR);(Proton_antipo_M)	1	88	88	168	168	15	124	65	11	52
(NADH5_C);(NDUF_B7)	1	159	159	164	164	16	626	50	8	97
(NDUFB10);(Proton_antipo_M)	1	140	140	156	156	74	384	85	9	90
(NDUFB10);(Proton_antipo_M)	2	101	101	156	156	7	491	85	15	65
(NDUFB10);(Proton_antipo_N)	1	87	87	156	156	53	270	79	14	56
(NDUFB10);(Proton_antipo_N)	2	55	55	156	156	80	242	65	0	35
(NADH5_C);(PP-binding)	1	150	150	164	164	18	127	49	5	91
(NADH5_C);(Tim17)	1	137	137	150	150	46	432	100	12	91
(NADH_dehy_S2_C);(Proton_antipo_M)	1	141	141	144	144	44	452	65	11	98
(Oxidored_q5_N);(Proton_antipo_M)	1	54	54	186	186	5	232	94	7	29
(NDUFB10);(Oxidored_q5_N)	1	85	85	155	155	54	162	84	14	55
(Complex1_LYR);(NDUF_B4)	1	75	75	136	136	74	448	81	12	55
(Complex1_LYR);(NDUF_B4)	2	55	55	136	136	60	261	35	0	40
(NDUF_B4);(NDUFB10)	1	85	85	151	151	73	367	96	20	56
(dNK);(NADH_dehy_S2_C)	1	143	143	144	144	44	423	77	12	99
(Complex1_LYR);(PP-binding)	1	221	226	224	229	9	616	87	15	99
(dNK);(ETC_C1_NDUFA5)	1	45	45	113	113	79	269	96	9	40
(CHCH);(GRIM-19)	1	170	170	173	173	21	197	59	9	98
(CHCH);(GRIM-19)	2	60	60	173	173	21	571	82	13	35
(CHCH);(GRIM-19)	3	41	41	173	173	58	998	22	0	24
(CPSF_A);(DUF382)	1	25	25	31	31	24	391	80	4	81
(MMS1_N);(PHF5)	1	35	39	39	43	27	424	87	23	90
(MMS1_N);(SF3b10)	1	42	46	42	46	24	1182	89	26	100
(CPSF_A);(SF3b10)	1	33	37	39	43	24	393	86	30	85
(ATP_synt_H);(V_ATPase_I)	1	47	47	47	47	22	1593	100	0	100
(RYDR_ITPR);(SPRY)	1	20	20	69	69	74	117	100	0	29
(Nop14);(RTC)	1	20	20	20	20	25	598	100	5	100
(EMG1);(Nop14)	1	25	25	25	25	25	883	100	4	100
(EMG1);(Nop14)	2	21	21	25	25	25	173	100	5	84
(Brix);(Nop14)	1	20	20	20	20	25	473	100	5	100
(CBF);(Nop14)	1	26	26	26	26	25	1414	100	4	100
(CLZ);(cNMP_binding)	1	22	22	22	22	77	393	100	5	100
(ATP-synt_ab_C);(ATP-synt_B)	1	30	30	47	47	12	180	90	3	64
(Complex1_51K);(NDUFV3)	1	136	136	136	136	64	937	93	10	100
(Complex1_51K);(ETC_C1_NDUFA4)	1	168	169	169	169	35	351	97	10	99
(CI-B14_5a);(NADH_4Fe-4S)	1	136	136	139	139	81	217	100	12	98
(2Fe-2S_thioredx);(NDUFV3)	1	136	136	136	136	63	563	77	12	100
(2Fe-2S_thioredx);(ETC_C1_NDUFA4)	1	40	40	165	165	35	199	98	15	24
(Complex1_LYR);(NDUF_B12)	1	104	104	110	110	15	240	88	14	95
(NADH_B2);(NDUF_B12)	1	155	155	157	157	6	734	72	11	99
(NADH5_C);(NDUF_B12)	1	157	157	160	160	18	495	73	10	98
(NDUF_B12);(Proton_antipo_M)	1	161	161	163	163	21	315	91	11	99
(NDUF_B12);(PP-binding)	1	160	160	165	165	38	373	68	10	97
(ETC_C1_NDUFA4);(Molybdopterin)	1	168	168	169	169	30	415	82	9	99
(ETC_C1_NDUFA4);(Molybdop_Fe4S4)	1	97	97	97	97	28	652	88	12	100
(ETC_C1_NDUFA4);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	165	166	168	168	35	188	73	7	98
(ETC_C1_NDUFA4);(Fer2_4)	1	110	111	167	167	35	520	87	14	66
(ETC_C1_NDUFA4);(Fer2_4)	2	55	55	167	167	87	505	71	0	33
(L51_S25_CI-B8);(Molybdopterin)	1	165	166	166	166	30	535	73	12	99
(L51_S25_CI-B8);(NADH_dhqG_C)	1	160	160	164	164	30	375	72	12	98
(CI-B14_5a);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	136	136	139	139	61	366	88	12	98
(CI-B14_5a);(Fer2_4)	1	55	55	128	128	86	194	73	0	43
(Molybdopterin);(NDUFA12)	1	156	156	160	160	3	473	97	12	98
(Molybdop_Fe4S4);(NDUFA12)	1	59	59	89	89	35	139	98	20	66
(NDUF_B4);(NDUF_C2)	1	123	123	134	134	70	141	99	9	92
(NDUF_B5);(NDUF_C2)	1	137	137	137	137	70	510	89	11	100
(CI-B14_5a);(Complex1_49kDa)	1	139	139	139	139	81	1244	87	11	100
(NDUF_B4);(NDUF_B8)	1	153	153	153	153	13	1762	84	7	100
(Complex1_30kDa);(ETC_C1_NDUFA4)	1	167	168	168	168	35	440	85	11	99
(CI-B14_5a);(Complex1_30kDa)	1	139	139	139	139	81	302	86	12	100
(GRIM-19);(NDUF_B5)	1	44	44	135	135	79	113	100	14	33
(CI-B14_5a);(GRIM-19)	1	138	138	139	139	45	343	86	8	99
(NAD_binding_10);(Oxidored_q6)	1	32	32	32	32	32	282	84	22	100
(NDUF_B6);(NDUF_B7)	1	139	139	139	139	57	741	83	9	100
(NDUF_B6);(NDUFB10)	1	139	139	139	139	57	609	86	9	100
(ETC_C1_NDUFA4);(Fer4_7)	1	162	162	164	164	35	157	94	9	99
(NADH_B2);(NDUF_B7)	1	156	156	156	156	6	330	77	9	100
(NDUF_B7);(NDUF_B8)	1	145	145	153	153	22	863	83	7	95
(NDUF_B7);(NDUFB10)	1	87	87	151	151	7	235	93	17	58
(NDUF_B7);(NDUFB10)	2	55	55	151	151	89	222	93	0	36
(NADH_B2);(NADH5_C)	1	156	156	157	157	6	997	96	12	99
(NADH_B2);(Proton_antipo_M)	1	157	157	157	157	6	651	96	11	100
(NADH_B2);(PP-binding)	1	127	127	137	137	62	140	70	9	93
(NDUF_B8);(Proton_antipo_M)	1	153	153	153	153	20	782	96	11	100
(NDUF_B8);(Proton_antipo_M)	2	143	143	153	153	22	295	100	12	93
(NADH5_C);(NDUF_B8)	1	146	146	147	147	18	919	69	4	99
(NDUF_B8);(PP-binding)	1	40	40	153	153	22	112	100	8	26
(NDUF_B5);(Oxidored_q5_N)	1	140	140	141	141	54	432	82	9	99
(dNK);(NADH_dh_m_C1)	1	85	85	102	102	71	169	94	18	83
(NADH_oxidored);(NDUF_B5)	1	140	140	140	140	71	650	77	11	100
(NDUF_B5);(NDUFB10)	1	86	86	141	141	76	1111	88	10	61
(ETC_C1_NDUFA4);(NDUFA12)	1	149	150	159	159	30	151	96	11	94
(NDUF_B5);(Ndufs5)	1	141	141	141	141	71	986	88	10	100
(CI-B14_5a);(ETC_C1_NDUFA5)	1	137	137	139	139	78	237	88	7	99
(CI-B14_5a);(NDUFA12)	1	138	138	139	139	80	399	67	7	99
(RbpA);(RNA_pol_Rpb1_1)	1	21	25	21	26	84	1140	100	28	100
(Methyltransf_25);(PRMT5_C)	1	36	109	36	131	2	671	95	89	100
(Spermine_synt_N);(Spermine_synth)	1	30	65	30	65	12	1028	100	100	100
(Binary_toxB_2);(Binary_toxB_3)	1	39	53	40	54	32	347	96	53	98
(Binary_toxB);(Binary_toxB_3)	1	39	53	40	54	32	564	96	53	98
(Binary_toxB);(Binary_toxB_2)	1	39	53	39	53	32	386	96	53	100
(Binary_toxB);(Binary_toxB_2)	2	20	20	39	53	40	131	95	35	51
(Phage_sheath_1);(Phage_sheath_1C)	1	22	22	28	28	4	901	68	18	79
(Phage_sheath_1);(Phage_sheath_1C)	2	21	21	28	28	8	336	81	10	75
(TAF);(WD40)	1	29	29	34	34	31	160	100	14	85
(SNF5);(SWIRM)	1	20	20	20	20	20	980	95	20	100
(7tm_2);(G-alpha)	1	122	122	123	123	16	366	87	0	99
(7tm_2);(Hormone_2)	1	43	43	43	43	11	1084	79	2	100
(MMR_HSR1);(Ribosom_S12_S23)	1	30	30	34	34	50	183	100	3	88
(Brix);(WD40)	1	27	27	38	38	48	135	100	4	71
(RIBIOP_C);(Ribosom_S12_S23)	1	54	54	56	56	17	555	100	11	96
(ABC_tran);(ABC2_membrane_3)	1	20	20	28	31	54	547	85	5	71
(NDUF_B8);(NDUFB10)	1	79	79	136	136	7	138	100	20	58
(Complex1_LYR);(NDUF_B8)	1	53	53	135	135	68	106	100	0	39
(MWFE);(Ndufs5)	1	41	41	42	42	71	153	100	15	98
(Cas_Csy1);(Cas_Csy3)	1	34	34	35	35	7	220	88	3	97
(Cas_Csy2);(Cas_Csy3)	1	35	35	35	35	8	1775	89	3	100
(AAA);(AAA_16)	1	24	24	24	24	18	477	67	4	100
(ABC_tran);(FtsX)	1	31	35	31	35	32	615	100	37	100
(C1_4);(Tfb4)	1	50	53	50	53	26	804	94	28	100
(Complex1_LYR);(RsfS)	1	28	28	28	28	72	605	100	21	100
(BSD);(Ssl1)	1	30	30	38	41	16	308	97	23	79
(TFIIE_alpha);(zf-C3HC4_5)	1	28	29	29	30	71	270	97	31	97
(HBB);(MAT1)	1	36	39	36	39	27	849	95	26	100
(S4);(Sas10)	1	30	30	31	31	56	147	100	3	97
(Ribosom_S12_S23);(Sas10)	1	30	30	34	34	63	177	100	3	88
(RIBIOP_C);(Sas10)	1	30	30	33	33	63	313	100	3	91
(Mpp10);(RIBIOP_C)	1	34	34	34	34	36	1237	68	3	100
(LAMTOR5);(Robl_LC7)	1	23	23	23	23	80	976	78	52	100
(Complex1_51K);(NADH_4Fe-4S)	1	24	25	26	37	30	431	100	48	92
(Complex1_51K);(SLBB)	1	24	25	26	30	35	366	100	48	92
(NADH_4Fe-4S);(SLBB)	1	24	25	26	28	30	397	100	48	92
(Brix);(Ebp2)	1	41	41	41	41	89	2078	76	15	100
(Brix);(Ribosomal_L36e)	1	38	38	41	41	79	398	97	16	93
(Helicase_C);(Ribosomal_L1)	1	37	37	43	43	34	299	100	22	86
(DUF4217);(Ribosomal_L7Ae)	1	21	21	42	42	69	120	100	33	50
(Brix);(Mak16)	1	20	20	20	20	82	1237	100	20	100
(ATP-synt_A);(Mt_ATP-synt_D)	1	70	70	70	70	21	318	100	9	100
(BOP1NT);(Pescadillo_N)	1	44	44	44	44	57	2008	93	18	100
(BOP1NT);(Ribosomal_L7Ae)	1	44	44	46	46	57	639	98	18	96
(IRK);(MTABC_N)	1	32	32	32	32	6	1071	97	0	100
(BOP1NT);(Ribosomal_L30_N)	1	25	25	25	25	49	669	96	12	100
(Methyltr_RsmF_N);(UPF0113)	1	20	20	23	23	78	315	95	10	87
(Ebp2);(Ribosomal_S8e)	1	20	20	20	20	88	498	100	10	100
(Ribosomal_L36e);(Spb1_C)	1	27	27	27	27	74	311	70	11	100
(Asparaginase);(Asparaginase_C)	1	45	124	45	124	11	735	98	100	100
(Asparaginase);(Asparaginase_C)	2	45	124	45	124	11	665	100	100	100
(Asparaginase);(Asparaginase_C)	3	26	94	45	124	31	169	90	94	58
(TFIIF_alpha);(TFIIF_beta_N)	1	23	23	23	23	14	1978	91	9	100
(AAA);(AAA_lid_3)	1	207	236	286	315	8	129	100	44	72
(AAA);(AAA_lid_3)	2	174	175	286	315	15	191	99	17	61
(AAA);(AAA_lid_3)	3	23	23	286	315	25	151	100	0	8
(AAA);(AAA_lid_9)	1	66	67	76	77	30	310	93	21	87
(AAA);(AAA_lid_9)	2	55	56	76	77	30	143	100	41	72
(Big_8);(SdrG_C_C)	1	26	30	26	30	11	551	97	97	100
(ATP-synt_ab);(T3SS_ATPase_C)	1	205	236	281	350	7	242	94	51	73
(ATP-synt_ab);(T3SS_ATPase_C)	2	119	179	281	350	8	888	99	57	42
(TetR_C_24);(TetR_N)	1	40	45	40	45	5	506	100	96	100
(A2M);(A2M_BRD)	1	86	92	86	93	9	2042	98	82	100
(A2M_recep);(TED_complement)	1	26	28	40	42	17	894	100	75	65
(TetR_C_1);(TetR_N)	1	29	75	33	81	9	441	100	99	88
(MG1);(TED_complement)	1	31	32	47	48	18	363	66	62	66
(ATP-synt_ab_C);(T3SS_ATPase_C)	1	145	167	207	231	36	208	95	59	70
(ATP-synt_ab_C);(T3SS_ATPase_C)	2	46	56	207	231	36	258	93	48	22
(IRK);(IRK_C)	1	55	85	55	87	5	600	100	49	100
(IRK);(IRK_C)	2	40	49	55	87	20	320	98	22	73
(MitMem_reg);(Rpn9_C)	1	33	33	37	37	33	1053	97	36	89
(MitMem_reg);(RPN6_C_helix)	1	67	67	85	85	12	413	100	9	79
(MitMem_reg);(RPN6_C_helix)	2	50	50	85	85	46	498	100	20	59
(GP120);(V-set_2)	1	40	50	86	107	9	917	100	44	47
(ATP-synt);(T3SS_ATPase_C)	1	160	183	207	230	18	346	100	56	77
(ATP-synt);(T3SS_ATPase_C)	2	127	144	207	230	18	188	99	64	61
(AAA_lid_3);(CDC48_N)	1	32	35	71	79	21	163	100	37	45
(AAA_lid_3);(CDC48_2)	1	45	47	48	56	29	347	100	38	94
(ETC_C1_NDUFA4);(NDUFV3)	1	65	65	135	135	51	164	97	15	48
(Peptidase_M1);(Peptidase_M1_N)	1	57	266	61	274	10	1329	100	93	93
(DPPIV_rep);(Peptidase_S9)	1	23	123	24	125	27	523	100	100	96
(AAA_lid_9);(ClpB_D2-small)	1	23	24	51	52	28	183	92	4	45
(AAA_2);(AAA_lid_9)	1	49	50	59	60	30	222	100	42	83
(SDH_C);(Shikimate_dh_N)	1	40	53	40	56	15	766	94	92	100
(SDH_C);(Shikimate_DH)	1	24	29	28	37	12	178	93	90	86
(IATP);(T3SS_ATPase_C)	1	25	26	26	27	20	430	96	23	96
(AAA_lid_3);(Vps4_C)	1	68	74	73	79	11	1191	100	26	93
(I-EGF_1);(PSI_integrin)	1	28	70	29	73	32	310	100	63	97
(MG2);(TED_complement)	1	30	32	52	56	6	548	81	59	58
(A2M);(MG2)	1	86	92	86	93	12	642	98	82	100
(A2M);(MG3)	1	68	73	79	85	27	423	97	84	86
(A2M_BRD);(MG2)	1	72	77	73	78	9	438	100	81	99
(MG1);(MG2)	1	49	53	66	70	18	204	100	87	74
(MG2);(MG3)	1	67	71	71	77	20	294	100	80	94
(A2M_BRD);(MG4)	1	64	68	71	77	24	417	100	79	90
(A2M_BRD);(MG1)	1	66	70	68	72	9	645	100	80	97
(MG3);(MG4)	1	62	66	69	73	24	200	100	80	90
(A2M_recep);(MG3)	1	38	42	57	62	46	417	95	86	67
(A2M_BRD);(MG3)	1	44	46	46	48	27	254	100	83	96
(TIP49);(TIP49_C)	1	29	32	29	32	32	804	100	56	100
(AAA_16);(AAA_lid_10)	1	22	22	23	23	18	312	50	5	96
(FeoB_Cyto);(FeoB_N)	1	22	32	22	32	10	1122	100	100	100
(Prp19);(U-box)	1	24	24	26	26	40	279	100	8	92
(GramPos_pilinBB);(SpaA)	1	21	24	22	25	12	271	100	100	95
(Ge1_WD40);(Ribosomal_S4)	1	20	20	20	20	72	624	100	0	100
(RIG-I_C);(RIG-I_C-RD)	1	32	40	33	46	23	588	98	62	97
(Helicase_C);(RIG-I_C)	1	39	50	40	53	26	643	100	72	98
(ATP-synt_D);(T3SS_ATPase_C)	1	47	52	50	57	11	259	100	23	94
(ATP-synt_D);(T3SS_ATPase_C)	2	33	33	50	57	27	173	100	18	66
(Tfb2_C);(Tfb5)	1	59	62	59	62	26	970	98	27	100
(MCM);(MCM_lid)	1	58	58	58	58	25	1692	100	33	100
(MCM);(MCM_lid)	2	57	57	58	58	24	706	96	28	98
(MitMem_reg);(RPN5_C)	1	84	84	85	85	40	891	90	17	99
(AAA_6);(AAA_lid_11)	1	28	30	29	32	20	622	93	37	97
(AAA_7);(Dynein_AAA_lid)	1	27	29	28	31	2	1052	90	31	96
(AAA_7);(AAA_lid_1)	1	24	26	27	30	16	382	96	42	89
(AAA_8);(AAA_lid_1)	1	25	27	28	31	17	658	96	41	89
(GTP_EFTU);(RL10P_insert)	1	24	24	29	29	68	464	100	4	83
(MRPL52);(Ribosomal_L20)	1	66	67	69	70	19	251	94	12	96
(MRPL52);(Ribosomal_L21p)	1	68	69	70	71	22	630	81	10	97
(MRP-63);(MRPL52)	1	66	67	67	68	69	384	90	9	99
(MRPL52);(Ribosomal_L30)	1	67	68	70	71	18	399	82	9	96
(AAA_lid_3);(RPN7)	1	34	34	73	73	39	143	71	21	47
(APG6_N);(Rpn3_C)	1	40	40	46	46	2	272	100	8	87
(JAB);(RPN5_C)	1	70	70	81	81	40	180	93	17	86
(Proteasome);(RPN6_N)	1	40	40	47	47	24	244	100	12	85
(AAA_lid_3);(Proteasome)	1	77	77	80	80	19	227	100	18	96
(AAA_lid_3);(Proteasome)	2	29	29	80	80	51	228	83	7	36
(APG6_N);(Prot_ATP_ID_OB)	1	53	53	59	59	2	388	89	17	90
(APG6_N);(HEAT_2)	1	42	42	52	52	1	302	100	10	81
(APG6_N);(RPN1_RPN2_N)	1	44	44	52	52	1	440	100	9	85
(DASH_Hsk3);(Prot_ATP_ID_OB)	1	25	25	26	26	2	443	96	28	96
(NGP1NT);(NOG1_N)	1	26	26	27	27	43	671	92	15	96
(NOG1_N);(Ribosomal_S8e)	1	53	53	65	65	64	408	89	17	82
(MMPL);(Sterol-sensing)	1	23	23	24	24	9	1634	100	22	96
(Cas9_PI);(RuvC_III)	1	37	75	37	76	56	609	100	65	100
(HNH_4);(RuvC_III)	1	41	79	46	88	15	395	100	72	89
(Csm4_C);(RAMPs)	1	22	22	33	38	80	231	100	5	67
(MRPL52);(PBP)	1	26	26	35	35	63	245	92	12	74
(ORC_WH_C);(ORC2)	1	30	30	30	30	15	1503	87	7	100
(ORC_WH_C);(ORC5_C)	1	26	26	28	28	15	296	27	4	93
(fn3);(Insulin_TMD)	1	26	26	26	26	21	536	100	19	100
(eIF3m_C_helix);(MitMem_reg)	1	51	51	51	51	3	993	90	6	100
(NUC);(RuvC_1)	1	27	32	27	32	27	971	100	59	100
(TFA2_Winged_2);(TFIIE_alpha)	1	46	50	48	52	19	444	98	24	96
(Ca_chan_IQ);(GPHH)	1	20	20	20	20	53	402	100	15	100
(CHCH);(NADHdh_A3)	1	48	48	94	94	16	373	100	12	51
(KH_8);(Ribosomal_S3Ae)	1	40	40	55	55	17	230	100	15	73
(KH_8);(Ribosomal_S11)	1	59	59	66	66	17	363	100	10	89
(ABC_membrane);(MTABC_N)	1	31	31	45	45	6	392	100	0	69
(Bac_export_1);(FliP)	1	20	20	20	20	16	2091	95	35	100
(Bac_export_1);(FliP)	2	20	20	20	20	16	1916	100	40	100
(Bac_export_3);(FliP)	1	20	20	20	20	25	488	100	40	100
(Bac_export_1);(Bac_export_3)	1	20	20	20	20	16	1004	100	40	100
(TFIID-31kDa);(WD40)	1	29	29	30	30	31	464	100	14	97
(TFIID-31kDa);(WD40)	2	28	28	30	30	31	534	100	11	93
(CHCH);(NDUF_B5)	1	45	45	47	47	43	206	100	11	96
(AAA_assoc_2);(DNA_pol3_delta2)	1	31	31	31	31	89	535	100	13	100
(QCR10);(UCR_TM)	1	24	24	24	24	52	210	100	12	100
(QCR10);(UCR_UQCRX_QCR9)	1	24	24	24	24	49	649	25	12	100
(ABC_tran);(MlaE)	1	20	21	21	22	58	782	100	19	95
(Csm2_III-A);(RAMPs)	1	27	27	27	27	15	361	100	4	100
(Fer4_21);(PsaA_PsaB)	1	37	43	37	43	72	272	98	19	100
(Fer4_21);(PsaD)	1	37	43	37	43	52	1160	95	19	100
(Fer4_21);(PSI_PsaE)	1	37	43	37	43	53	485	95	16	100
(AA_permease_2);(SLC3A2_N)	1	20	20	20	20	26	734	100	5	100
(Bromo_TP);(WD40)	1	28	28	28	28	15	117	100	11	100
(TFIID_30kDa);(WD40)	1	28	28	28	28	41	163	100	11	100
(TFIID_30kDa);(WD40)	2	22	22	28	28	41	115	100	14	79
(Bromo_TP);(TFIID-31kDa)	1	27	27	28	28	78	320	96	11	96
(C8);(TIL)	1	22	22	22	22	53	242	100	9	100
(TIL);(VWD)	1	21	21	22	22	84	335	100	5	95
(ABC_tran);(BCA_ABC_TP_C)	1	22	27	22	27	8	244	96	96	100
(Fer2_4);(Molybdop_Fe4S4)	1	22	22	26	26	62	117	100	18	85
(Mt_ATP-synt_B);(WRW)	1	24	24	32	32	57	371	83	21	75
(ATP-synt_8);(Mt_ATP-synt_D)	1	29	29	32	32	56	340	100	17	91
(ATP-synt_A);(WRW)	1	32	32	32	32	80	532	94	19	100
(ATP-synt_8);(ATP-synt_A)	1	32	32	32	32	56	975	78	19	100
(CDC50);(PhoLip_ATPase_C)	1	43	47	43	47	22	2183	100	19	100
(PhoLip_ATPase_C);(PhoLip_ATPase_N)	1	21	21	31	34	22	181	100	0	68
(C1-set);(Ig_J_chain)	1	24	24	24	24	69	383	92	0	100
(C1-set);(Ig_J_chain)	2	24	24	24	24	54	214	92	0	100
(C1-set);(Ig_J_chain)	3	23	23	24	24	69	250	74	0	96
(NmrA);(Oxidored_q6)	1	43	44	47	47	71	280	98	11	91
(AAA_2);(CLP_protease)	1	20	20	20	20	17	515	95	0	100
(TFIID_30kDa);(TFIID-18kDa)	1	23	23	23	23	67	246	100	13	100
(ATP-synt_C);(ATP-synt_S1)	1	39	39	39	39	22	330	100	0	100
(ATP-synt_S1);(vATP-synt_AC39)	1	39	39	39	39	24	271	100	0	100
(ATP-synt_D);(vATP-synt_AC39)	1	49	49	51	51	14	978	100	10	96
(FBPase);(FBPase_C)	1	32	141	32	151	20	1371	97	96	100
(FBPase);(FBPase_C)	2	30	133	32	151	20	215	89	96	94
(Gag_p24);(Gag_p24_C)	1	56	120	141	218	1	415	99	75	40
(Gag_p24);(Gag_p24_C)	2	48	66	141	218	2	276	100	47	34
(Gag_p24);(Gag_p24_C)	3	27	79	141	218	1	407	100	80	19
(EFG_C);(EFG_III)	1	29	50	35	56	15	245	100	92	83
(EFG_III);(GTP_EFTU)	1	24	40	32	53	13	254	100	80	75
(Anticodon_3);(tRNA-synt_1g)	1	22	86	22	86	15	2128	100	97	100
(Choline_bind_1);(Choline_bind_3)	1	20	25	21	26	15	490	100	68	95
(EphA2_TM);(PK_Tyr_Ser-Thr)	1	31	128	31	132	14	503	100	95	100
(NAD_kinase);(NAD_kinase_C)	1	21	85	21	89	10	815	100	96	100
(Helicase_C);(SNF2-rel_dom)	1	49	51	49	51	3	963	92	51	100
(CoV_NSP7);(CoV_NSP8)	1	61	65	63	67	39	700	100	29	97
(bCoV_S1_RBD);(Peptidase_M2)	1	208	230	210	235	46	862	79	17	99
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	1	114	156	777	883	41	336	88	22	15
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	2	111	153	777	883	67	711	89	24	14
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	3	59	59	777	883	66	216	76	15	8
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	4	47	47	777	883	88	449	57	13	6
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	6	34	36	777	883	28	275	67	11	4
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	10	25	31	777	883	66	451	81	26	3
(bCoV_S1_RBD);(V-set)	11	23	24	777	883	42	615	83	0	3
(bCoV_S1_RBD);(C1-set)	1	82	137	168	252	67	554	1	1	49
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)	1	1238	1338	1310	1413	4	296	76	19	95
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)	2	661	661	1310	1413	17	333	73	7	50
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)	3	471	471	1310	1413	65	204	73	7	36
(bCoV_S1_N);(bCoV_S1_RBD)	4	23	23	1310	1413	20	547	83	4	2
(PAP_assoc);(TUTase)	1	26	61	26	61	3	1473	98	98	100
(EFG_III);(Ribosom_S12_S23)	1	75	80	81	89	13	261	100	4	93
(Ribosomal_L15e);(RNase_P_pop3)	1	44	44	44	44	82	513	98	5	100
(Ribosomal_L23eN);(RNase_P_pop3)	1	44	44	44	44	49	139	95	5	100
(bCoV_S1_N);(CoV_S2)	1	794	794	825	825	19	176	75	7	96
(bCoV_S1_RBD);(CoV_S2)	1	675	675	684	684	14	283	73	7	99
(bCoV_S1_RBD);(CoV_S2)	2	170	170	684	684	14	122	64	4	25
(CoV_S1_C);(CoV_S2)	1	837	837	840	840	12	460	76	7	100
(bCoV_S1_N);(CoV_S1_C)	1	870	870	898	899	12	503	75	7	97
(bCoV_S1_N);(CoV_S1_C)	2	835	836	898	899	12	723	75	7	93
(bCoV_S1_RBD);(CoV_S1_C)	1	662	662	706	707	12	227	74	7	94
(Rpn3_C);(ZapB)	1	21	21	25	25	2	296	100	24	84
(Prot_ATP_ID_OB);(ZapB)	1	30	30	37	37	2	447	73	27	81
(HEAT_2);(ZapB)	1	25	25	25	25	2	295	100	24	100
(RPN1_RPN2_N);(ZapB)	1	24	24	25	25	2	380	100	25	96
(bCoV_S1_N);(V-set)	1	32	32	192	197	21	565	88	12	17
(G-gamma);(ZapB)	1	163	163	165	165	7	750	80	1	99
(V-set);(ZapB)	1	25	25	58	58	8	138	100	0	43
(Omp85);(POTRA)	1	28	28	37	37	16	534	96	71	76
(CoV_peptidase);(ubiquitin)	1	20	23	22	25	27	918	100	83	91
(RNA_pol_Rpb2_2);(RPC5)	1	38	38	38	38	20	748	100	39	100
(RNA_POL_M_15KD);(RPC5)	1	38	38	38	38	20	536	92	39	100
(RNA_pol_Rpc4);(RPC5)	1	38	38	38	38	20	2678	97	39	100
(DNAPKcs_CC5);(FAT)	1	40	40	46	46	11	275	100	40	87
(DNAPKcs_CC5);(PI3_PI4_kinase)	1	43	43	46	46	11	390	100	42	93
(DNAPKcs_CC5);(NUC194)	1	38	38	38	38	71	774	100	45	100
(CPSF_A);(SF3a60_Prp9_C)	1	22	22	22	22	24	452	82	5	100
(Histone);(SNF2-rel_dom)	1	24	24	31	31	39	181	83	8	77
(DUF3912);(RNA_pol_Rpb1_2)	1	30	30	30	30	38	170	93	13	100
(DUF3912);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	30	30	30	30	38	356	93	13	100
(DUF3912);(RNA_pol_A_bac)	1	30	30	30	30	38	329	93	13	100
(MMR_HSR1);(Sas10)	1	28	28	30	30	50	356	100	4	93
(bZIP_1);(Homeodomain)	1	21	21	23	23	26	752	71	0	91
(dCache_1);(VWA_3)	1	22	22	22	22	81	421	100	5	100
(CoV_NSP8);(RdRP_1)	1	56	56	57	57	62	399	100	12	98
(ATP-synt_E);(ATP-synt_G)	1	27	27	27	27	76	739	81	22	100
(ATP-synt_G);(Mt_ATP-synt_B)	1	26	26	27	27	82	235	92	19	96
(ATP-synt_G);(WRW)	1	27	27	27	27	82	239	100	22	100
(ATP-synt_A);(Mit_proteolip)	1	27	27	27	27	80	342	89	22	100
(E1-E2_ATPase);(P5-ATPase)	1	20	20	20	20	59	200	100	0	100
(Brix);(Ribosomal_S9)	1	30	30	36	36	48	312	100	3	83
(Cdc6_C);(ORC4_C)	1	27	27	27	27	7	737	67	7	100
(DEAD);(rRNA_proc-arch)	1	21	22	22	23	44	304	91	73	95
(EMG1);(Ribosomal_S7)	1	27	27	31	31	70	323	100	4	87
(Fcf1);(Ribosomal_S4)	1	26	26	28	28	63	297	100	4	93
(Fcf1);(Ribosomal_S8)	1	30	30	32	32	63	238	100	3	94
(Fibrillarin);(NOP5NT)	1	35	35	35	35	28	343	100	6	100
(Glyco_tran_28_C);(Glyco_transf_28)	1	26	33	26	36	2	574	94	94	100
(Hexapep);(NTP_transferase)	1	22	23	23	24	11	294	100	26	96
(IBN_N);(Xpo1)	1	20	23	26	35	9	892	100	96	77
(IF-2B);(NTP_transferase)	1	29	29	30	31	32	448	97	21	97
(Inhibitor_I9);(Peptidase_S8)	1	35	60	38	69	12	1142	95	100	92
(LRR_4);(LRR_adjacent)	1	21	21	29	30	22	545	100	86	72
(RAG1);(RAG2)	1	32	36	32	36	49	1560	100	22	100
(RNA_pol_N);(RNA_polI_A34)	1	20	23	31	35	89	138	100	74	65
(Ribosomal_L7Ae);(S4)	1	31	31	35	35	41	209	100	3	89
(S4);(WD40)	1	32	32	37	37	38	205	100	3	86
(S4);(WD40)	2	23	23	37	37	7	188	100	0	62
(Seryl_tRNA_N);(tRNA-synt_2b)	1	24	41	24	42	10	466	95	90	100
(Synaptobrevin);(Syntaxin)	1	29	32	29	33	4	758	91	66	100
(V-ATPase_C);(V-ATPase_G)	1	28	29	34	35	31	267	100	7	82
(V-ATPase_G);(vATP-synt_E)	1	51	52	51	52	31	1626	100	4	100
(V-ATPase_H_N);(vATP-synt_E)	1	22	22	33	33	17	410	100	0	67
(V_ATPase_I);(V-ATPase_C)	1	37	37	38	38	36	352	100	0	97
(V_ATPase_I);(V-ATPase_H_C)	1	26	26	29	29	34	455	100	0	90
(V_ATPase_I);(V-ATPase_H_N)	1	23	23	32	32	17	383	100	0	72
(Arena_RNA_pol);(ArenaCapSnatch)	1	22	26	23	27	20	1286	85	19	96
(Nrap_D4);(RRP7)	1	31	31	31	31	20	514	100	0	100
(Utp21);(WD40)	1	24	24	32	32	34	198	100	4	75
(Utp13);(WD40)	1	29	29	34	34	37	145	100	3	85
(Fcf1);(Fibrillarin)	1	32	32	33	33	63	395	100	3	97
(RTC_insert);(WD40)	1	29	29	33	33	38	244	100	3	88
(Ribosomal_S7);(WD40)	1	27	27	32	32	37	200	100	4	84
(Mpp10);(S4)	1	24	24	29	29	38	205	100	4	83
(RIBIOP_C);(RTC)	1	33	33	35	35	35	635	100	3	94
(Mpp10);(Ribosomal_S4)	1	31	31	33	33	34	723	100	6	94
(Ribosomal_S28e);(Utp12)	1	34	34	34	34	36	433	100	3	100
(Mpp10);(WD40)	1	32	32	33	33	20	278	100	3	97
(Mpp10);(WD40)	2	24	24	33	33	76	139	100	4	73
(Mpp10);(WD40)	3	20	20	33	33	25	433	100	5	61
(NusA_N);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	21	21	29	29	51	674	100	19	72
(Brix);(Mpp10)	1	34	34	35	35	36	1120	100	6	97
(BING4CT);(Ribosomal_S4)	1	28	28	30	30	46	315	100	4	93
(Fcf2);(Sas10)	1	29	29	31	31	36	289	100	3	94
(Fcf1);(Sas10)	1	25	25	31	31	63	170	100	4	81
(Fibrillarin);(Sas10)	1	31	31	31	31	63	1105	100	3	100
(Ribosomal_S4);(Sas10)	1	27	27	27	27	56	292	100	4	100
(Mpp10);(Utp13)	1	32	32	32	32	36	698	100	3	100
(Fibrillarin);(WD40)	1	31	31	31	31	21	269	100	3	100
(Fcf1);(WD40)	1	25	25	27	27	54	310	100	4	93
(Fcf1);(WD40)	2	22	22	27	27	43	274	100	5	81
(Ribosomal_S7e);(WD40)	1	23	23	25	25	43	189	100	4	92
(NOP5NT);(WD40)	1	25	25	26	26	36	168	100	4	96
(NOP5NT);(Sof1)	1	31	31	31	31	39	305	100	3	100
(Ribosomal_S8);(WD40)	1	23	23	23	23	7	136	100	4	100
(Fibrillarin);(Utp11)	1	29	29	29	29	27	1068	100	3	100
(Nop);(Utp11)	1	26	26	28	28	27	278	100	4	93
(Ribosomal_L7Ae);(Utp11)	1	28	28	29	29	27	528	100	4	97
(RIBIOP_C);(Utp11)	1	31	31	31	31	27	586	100	3	100
(Fcf2);(Fibrillarin)	1	31	31	31	31	36	1063	100	3	100
(Herpes_V23);(Herpes_VP19C)	1	30	30	30	30	9	970	93	0	100
(Herpes_MCP);(Herpes_V23)	1	27	27	27	27	14	733	93	0	100
(Herpes_MCP);(Herpes_V23)	2	26	26	27	27	14	613	92	0	96
(Herpes_MCP);(Herpes_V23)	3	24	24	27	27	14	533	92	0	89
(Herpes_MCP);(Herpes_VP19C)	1	29	29	30	30	9	469	93	0	97
(Herpes_MCP);(Herpes_VP19C)	2	25	25	30	30	9	829	92	0	83
(Herpes_MCP);(Herpes_VP19C)	3	20	20	30	30	9	425	90	0	67
(U3_snoRNA_assoc);(Utp11)	1	25	25	25	25	17	615	100	4	100
(U3_snoRNA_assoc);(WD40)	1	24	24	26	26	17	454	100	4	92
(U3_snoRNA_assoc);(WD40)	2	22	22	26	26	10	170	100	5	85
(U3_snoRNA_assoc);(WD40)	3	22	22	26	26	17	314	100	5	85
(CBF);(WD40)	1	25	25	28	28	40	213	100	4	89
(UTP15_C);(WD40)	1	23	23	30	30	27	190	48	4	77
(Fibrillarin);(U3_snoRNA_assoc)	1	22	22	22	22	17	176	100	5	100
(Utp12);(UTP15_C)	1	30	30	30	30	27	1429	100	3	100
(Utp12);(UTP15_C)	2	30	30	30	30	17	348	100	3	100
(ATP-synt_J);(Fun_ATP-synt_8)	1	38	38	38	38	40	297	100	0	100
(ATP-synt_A);(ATP-synt_J)	1	22	22	38	38	85	302	100	0	58
(NusA_N);(RNA_pol_A_CTD)	1	23	23	23	23	87	412	100	26	100
(Molybdopterin);(NDUFV3)	1	34	34	41	41	71	141	100	6	83
(Lactonase);(WD40)	1	20	20	22	22	5	1335	95	50	91
(Nrap_D4);(RRM_Rrp7)	1	27	27	30	30	18	563	100	0	90
(Nrap_D6);(RRM_Rrp7)	1	30	30	31	31	18	1538	100	0	97
(Csm1_B);(HD)	1	24	28	24	30	66	136	100	32	100
(GCP_C_terminal);(Tubulin)	1	25	25	25	25	16	387	100	4	100
(GCP_C_terminal);(Tubulin_C)	1	25	25	25	25	16	924	100	4	100
(GCP_C_terminal);(Tubulin_C)	2	20	20	25	25	78	259	100	0	80
(Csm1_B);(Csm4_C)	1	21	26	32	37	19	124	100	27	66
(HD);(HD_assoc_2)	1	20	63	20	63	8	2098	100	100	100
(ABC_tran);(ABC2_membrane_7)	1	24	24	24	24	86	1093	92	21	100
(1-cysPrx_C);(AhpC-TSA)	1	72	131	72	131	12	257	99	95	100
(2Fe-2S_thioredx);(Complex1_51K)	1	229	250	233	253	17	1237	91	24	98
(2Fe-2S_thioredx);(NADH_4Fe-4S)	1	224	245	231	251	17	337	82	25	97
(2Fe-2S_thioredx);(SLBB)	1	227	248	230	250	14	242	82	25	99
(2OG-FeII_Oxy);(DIOX_N)	1	43	125	43	138	11	1788	100	93	100
(3HCDH);(3HCDH_N)	1	36	73	38	82	13	418	99	89	95
(40S_SA_C);(Ribosomal_S17e)	1	199	199	210	210	20	197	73	6	95
(7tm_1);(Cytochrom_B562)	1	25	46	41	75	12	421	93	89	61
(7tm_1);(G-alpha)	1	366	366	380	380	11	490	75	3	96
(7tm_1);(Phage_lysozyme)	1	21	37	49	89	17	802	100	95	43
(7tm_1);(WD40)	1	45	45	294	294	29	130	76	9	15
(A2M);(A2M_recep)	1	39	43	69	75	61	211	98	84	57
(A2M);(A2M_recep)	2	31	33	69	75	17	488	97	76	45
(AAA);(AAA_2)	1	57	58	60	61	35	256	97	29	95
(AAA);(AAA_assoc_2)	1	38	38	38	38	65	182	100	11	100
(AAA);(AAA_assoc_2)	2	36	36	38	38	65	345	100	6	95
(AAA);(Lon_C)	1	28	28	29	29	52	305	100	39	97
(AAA);(Prot_ATP_ID_OB)	1	51	51	79	79	14	192	75	16	65
(AAA);(Rep_fac_C)	1	45	45	45	45	86	283	100	13	100
(AAA);(Vps4_C)	1	71	78	80	91	11	430	100	29	89
(AAA_16);(ORC3_N)	1	29	29	29	29	9	483	83	3	100
(AAA_16);(ORC4_C)	1	30	30	30	30	11	615	77	7	100
(AAA_2);(ClpB_D2-small)	1	100	113	110	124	8	350	84	31	91
(AAA_2);(ClpB_D2-small)	2	81	91	110	124	15	211	100	48	74
(AAA_6);(AAA_7)	1	27	29	31	34	16	154	90	38	87
(AAA_6);(DHC_N2)	1	27	29	30	33	17	847	93	38	90
(AAA_6);(Dynein_heavy)	1	27	29	29	32	23	417	93	38	93
(AAA_7);(AAA_8)	1	28	30	30	33	16	584	93	37	93
(AAA_8);(AAA_9)	1	28	30	29	32	21	747	93	37	97
(AAA_8);(MT)	1	28	30	29	32	4	879	93	37	97
(AAA_9);(MT)	1	29	31	29	32	4	1025	94	35	100
(AAA_assoc_2);(Rep_fac_C)	1	36	36	36	36	54	1505	100	6	100
(ABC_membrane);(ABC_tran)	1	250	294	251	298	6	528	89	37	100
(ABC_tran);(ABC2_membrane)	1	46	49	46	49	9	921	84	31	100
(ABC_tran);(BPD_transp_1)	1	23	36	25	38	12	810	100	83	92
(ACP_syn_III);(ACP_syn_III_C)	1	54	107	57	111	10	1262	100	99	95
(ADH_N);(ADH_N_assoc)	1	26	35	26	35	4	833	100	94	100
(ADH_N);(ADH_zinc_N)	1	157	326	157	327	1	615	100	96	100
(ADH_N);(ADH_zinc_N)	2	126	289	157	327	4	254	96	94	80
(ADH_N);(ADH_zinc_N_2)	1	31	39	31	39	6	933	100	90	100
(ADK);(ADK_lid)	1	39	82	39	82	13	517	100	95	100
(AIRS);(AIRS_C)	1	35	56	36	59	2	1034	98	98	97
(AMP-binding);(AMP-binding_C)	1	129	217	133	221	6	637	100	93	97
(ANF_receptor);(Lig_chan-Glu_bd)	1	62	63	126	144	33	225	100	5	49
(ANF_receptor);(Lig_chan-Glu_bd)	2	32	45	126	144	22	252	100	40	25
(ANF_receptor);(NCD3G)	1	49	52	53	56	26	375	98	21	92
(ATP-grasp_2);(Ligase_CoA)	1	36	66	36	66	16	289	95	68	100
(ATP-gua_Ptrans);(ATP-gua_PtransN)	1	31	54	32	55	23	868	96	91	97
(ATP-synt);(ATP-synt_C)	1	124	127	192	195	15	155	96	47	65
(ATP-synt);(ATP-synt_DE)	1	26	26	49	50	33	1066	96	12	53
(ATP-synt);(ATP-synt_DE_N)	1	241	255	242	256	6	822	90	36	100
(ATP-synt);(ATP-synt_Eps)	1	155	166	155	166	17	860	96	50	100
(ATP-synt);(ATP-synt_ab)	1	217	240	261	284	17	235	100	44	83
(ATP-synt);(ATP-synt_ab)	2	216	237	261	284	17	285	100	43	83
(ATP-synt);(ATP-synt_ab_C)	1	213	236	262	285	18	267	99	45	81
(ATP-synt);(ATP-synt_ab_C)	2	40	41	262	285	23	141	98	44	15
(ATP-synt);(IATP)	1	29	30	30	31	25	291	100	23	97
(ATP-synt_A);(ATP-synt_C)	1	144	145	179	180	17	378	100	28	80
(ATP-synt_A);(Mt_ATP-synt_B)	1	78	78	80	80	20	489	100	17	98
(ATP-synt_C);(ATP-synt_DE_N)	1	166	169	215	218	6	204	99	36	77
(ATP-synt_C);(ATP-synt_Eps)	1	33	33	97	97	38	117	100	91	34
(ATP-synt_C);(V_ATPase_I)	1	50	50	58	58	9	415	100	10	86
(ATP-synt_C);(vATP-synt_AC39)	1	54	54	64	64	9	175	100	9	84
(ATP-synt_D);(ATP-synt_F)	1	86	91	87	94	14	1492	100	16	99
(ATP-synt_DE);(ATP-synt_Eps)	1	43	51	52	62	2	308	100	49	83
(ATP-synt_DE_N);(ATP-synt_Eps)	1	116	126	153	163	21	377	98	62	76
(ATP-synt_F);(vATP-synt_AC39)	1	26	26	42	42	15	194	100	15	62
(ATP-synt_F6);(Mt_ATP-synt_B)	1	38	38	40	40	83	771	100	32	95
(ATP-synt_F6);(Mt_ATP-synt_D)	1	24	24	37	37	86	267	100	33	65
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_D)	1	74	79	87	94	25	260	100	15	85
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_C)	1	108	123	238	262	20	726	100	34	45
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_C)	2	95	116	238	262	38	163	91	35	40
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_N)	1	161	180	349	395	8	123	88	52	46
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_N)	2	155	184	349	395	5	391	99	40	44
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_Xtn)	1	80	90	96	122	26	129	99	28	83
(ATP-synt_ab);(ATP-synt_ab_Xtn)	2	57	78	96	122	39	1467	100	44	59
(ATP-synt_ab);(vATP-synt_E)	1	58	58	79	79	16	339	100	7	73
(ATP-synt_ab_C);(ATP-synt_DE)	1	21	21	29	32	36	252	100	10	72
(ATP-synt_ab_C);(IATP)	1	28	29	30	31	25	248	100	24	93
(ATP-synt_ab_N);(ATP-synt_ab_Xtn)	1	51	58	68	92	39	558	100	31	75
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)	1	152	153	217	218	17	341	99	23	70
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)	2	121	121	217	218	8	201	94	36	56
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)	3	33	33	217	218	17	122	100	9	15
(ATP-synt_ab_N);(OSCP)	4	28	28	217	218	16	194	96	18	13
(ATP-synt_ab_N);(vATP-synt_E)	1	68	68	80	80	16	154	100	6	85
(ATP1G1_PLM_MAT8);(Cation_ATPase_C)	1	26	63	26	63	34	777	100	70	100
(ATP1G1_PLM_MAT8);(Na_K-ATPase)	1	25	42	25	61	35	318	100	55	100
(Actin);(Gelsolin)	1	27	62	28	64	44	791	100	98	96
(Actin);(HSA)	1	22	22	22	22	2	622	95	9	100
(Actin);(HSA)	2	21	21	22	22	2	706	95	10	95
(Actin);(Myosin_head)	1	66	66	66	66	34	943	95	35	100
(Actin);(Myosin_head)	2	29	29	66	66	34	353	90	14	44
(Acyl-CoA_dh_1);(Acyl-CoA_dh_M)	1	94	137	96	139	8	516	91	96	98
(Acyl-CoA_dh_1);(Acyl-CoA_dh_M)	2	93	134	96	139	7	565	96	96	97
(Acyl-CoA_dh_1);(Acyl-CoA_dh_N)	1	80	121	80	121	7	1079	96	96	100
(Acyl-CoA_dh_M);(Acyl-CoA_dh_N)	1	90	141	91	144	4	903	96	96	99
(Acyl_transf_1);(KAsynt_C_assoc)	1	41	53	41	53	5	493	96	62	100
(Acyl_transf_1);(MaoC_dehydratas)	1	21	21	22	24	81	166	100	43	95
(Adap_comp_sub);(Adaptin_N)	1	25	25	41	44	41	473	100	16	61
(Adaptin_N);(Clat_adaptor_s)	1	53	56	58	61	6	1360	100	41	91
(AdoHcyase);(AdoHcyase_NAD)	1	42	70	42	70	27	788	91	91	100
(AdoHcyase);(AdoHcyase_NAD)	2	31	47	42	70	39	899	87	85	74
(AlaDh_PNT_C);(AlaDh_PNT_N)	1	29	39	36	55	11	2190	92	90	81
(AlaDh_PNT_C);(AlaDh_PNT_N)	2	28	44	36	55	23	270	95	98	78
(Ala_racemase_C);(Ala_racemase_N)	1	37	69	37	69	18	721	100	99	100
(Ala_racemase_C);(Ala_racemase_N)	2	36	68	37	69	18	892	100	96	97
(Ald_Xan_dh_C);(Ald_Xan_dh_C2)	1	24	85	25	86	15	2127	99	98	96
(Ald_Xan_dh_C);(Fer2)	1	25	72	25	86	15	311	99	97	100
(Ald_Xan_dh_C);(Fer2_2)	1	25	72	25	86	15	261	99	97	100
(Ald_Xan_dh_C2);(CO_deh_flav_C)	1	22	59	23	68	10	642	98	97	96
(Ald_Xan_dh_C2);(Fer2)	1	25	72	25	77	17	284	99	97	100
(Ald_Xan_dh_C2);(Fer2_2)	1	25	72	25	86	17	1009	99	97	100
(Alpha-amylase);(Alpha-amylase_C)	1	41	175	51	194	2	825	100	99	80
(Alpha-amylase);(CBM_48)	1	43	78	43	99	10	884	96	92	100
(Alpha-amylase);(DUF1939)	1	20	40	20	40	8	406	100	100	100
(Alpha-amylase);(DUF3459)	1	37	59	39	61	7	1276	100	75	95
(Alpha-amylase);(Malt_amylase_C)	1	52	154	52	154	4	870	100	98	100
(Alpha_E1_glycop);(Alpha_E2_glycop)	1	41	43	74	76	9	1705	95	16	55
(Alpha_E1_glycop);(Alpha_E2_glycop)	2	30	30	74	76	33	3029	80	0	41
(Alpha_E1_glycop);(Alpha_E2_glycop)	3	20	20	74	76	35	458	85	0	27
(Alpha_E2_glycop);(Peptidase_S3)	1	35	35	40	40	25	499	83	0	88
(Amidohydro_1);(Urease_alpha)	1	26	55	29	103	9	1286	100	96	90
(Ank);(Ank_2)	1	168	188	184	225	3	622	96	71	91
(Ank_2);(Ank_4)	1	102	115	114	131	4	662	99	45	89
(Ank_2);(Ank_5)	1	52	83	62	93	12	995	100	78	84
(Anoct_dimer);(Anoctamin)	1	45	46	45	46	3	2035	85	59	100
(Anticodon_1);(tRNA-synt_1)	1	20	62	21	67	8	888	84	82	95
(ApbA);(ApbA_C)	1	20	23	20	23	13	856	100	100	100
(ArgoMid);(Piwi)	1	22	62	22	62	4	1694	98	95	100
(Arm);(Arm_3)	1	80	167	85	180	20	764	100	87	94
(Arm);(IBB)	1	60	129	77	164	15	513	100	90	78
(Arm);(IBB)	2	38	113	77	164	17	210	0	0	49
(Arrestin_C);(Arrestin_N)	1	31	51	32	54	29	1424	98	59	97
(BBE);(FAD_binding_4)	1	37	66	37	71	18	776	100	95	100
(BCAS2);(Prp19)	1	30	30	32	32	15	549	87	10	94
(BCAS2);(Prp19)	2	27	27	32	32	15	368	85	11	84
(Bcl-2);(BH4)	1	79	136	85	143	6	870	96	80	93
(Bcl-2);(BH4)	2	23	34	85	143	18	183	3	12	27
(Bcl-2);(Bclx_interact)	1	32	44	33	45	4	900	95	95	97
(Biotin_carb_C);(Biotin_carb_N)	1	53	97	53	97	19	457	97	87	100
(Biotin_carb_C);(CPSase_L_D2)	1	50	92	52	96	19	1145	97	89	96
(Biotin_carb_C);(CPSase_L_D2)	2	32	71	52	96	23	196	66	31	62
(Biotin_carb_N);(CPSase_L_D2)	1	50	94	51	95	17	953	97	89	98
(Brix);(RRS1)	1	20	20	20	20	32	2048	85	40	100
(Bromo_TP);(TFIID_30kDa)	1	29	29	29	29	50	1372	100	14	100
(Bromodomain);(DUF902)	1	41	110	41	110	5	194	100	91	100
(C1-set);(DUF1968)	1	292	498	299	550	2	1208	97	87	98
(C1-set);(Ig_2)	1	21	31	40	52	34	369	97	23	52
(C1-set);(MHC_I)	1	631	1208	666	1355	6	694	96	90	95
(C1-set);(MHC_I)	2	206	321	666	1355	14	168	96	92	31
(C1-set);(MHC_I)	3	125	217	666	1355	18	262	0	3	19
(C1-set);(MHC_I)	4	47	126	666	1355	70	521	0	0	7
(C1-set);(MHC_I)	5	45	122	666	1355	70	326	0	0	7
(C1-set);(MHC_I)	6	41	212	666	1355	21	159	0	0	6
(C1-set);(MHC_I)	7	39	202	666	1355	20	187	0	0	6
(C1-set);(MHC_I)	8	36	75	666	1355	13	140	0	3	5
(C1-set);(MHC_I)	9	36	97	666	1355	20	255	0	0	5
(C1-set);(MHC_I)	10	33	84	666	1355	19	247	0	0	5
(C1-set);(MHC_I)	11	30	33	666	1355	23	391	97	97	5
(C1-set);(MHC_I)	12	26	63	666	1355	72	321	0	5	4
(C1-set);(MHC_I)	13	25	35	666	1355	41	241	0	6	4
(C1-set);(MHC_II_alpha)	1	183	241	184	245	19	302	97	92	99
(C1-set);(MHC_II_alpha)	2	146	184	184	245	18	509	100	92	79
(C1-set);(MHC_II_alpha)	3	20	35	184	245	3	181	0	0	11
(C1-set);(MHC_II_beta)	1	183	241	184	245	12	225	98	92	99
(C1-set);(MHC_II_beta)	2	27	44	184	245	28	292	0	0	15
(C1-set);(MHC_II_beta)	3	21	35	184	245	78	318	0	3	11
(C1-set);(MHC_I_3)	1	50	140	50	159	35	567	98	95	100
(C1-set);(MHC_I_3)	2	27	47	50	159	37	208	96	91	54
(C1-set);(V-set)	1	1789	3297	2897	5011	2	179	93	83	62
(C1-set);(V-set)	2	1740	3155	2897	5011	3	253	93	81	60
(C1-set);(V-set)	3	83	122	2897	5011	7	163	0	1	3
(C1-set);(V-set)	4	56	100	2897	5011	18	134	0	3	2
(C1-set);(V-set)	5	56	92	2897	5011	17	141	2	9	2
(C1-set);(V-set)	6	54	85	2897	5011	14	272	7	32	2
(C1-set);(V-set)	7	53	74	2897	5011	15	187	0	0	2
(C1-set);(V-set)	8	49	74	2897	5011	20	218	3	7	2
(C1-set);(V-set)	9	41	66	2897	5011	6	148	3	9	1
(C1-set);(V-set)	10	38	56	2897	5011	6	167	0	0	1
(C1-set);(V-set)	11	38	46	2897	5011	5	146	15	13	1
(C1-set);(V-set)	12	37	51	2897	5011	6	217	0	2	1
(C1-set);(V-set)	13	37	44	2897	5011	17	200	0	7	1
(C1-set);(V-set)	14	36	40	2897	5011	21	359	52	0	1
(C1-set);(V-set)	15	35	42	2897	5011	16	157	0	0	1
(C1-set);(V-set)	16	34	55	2897	5011	6	162	0	5	1
(C1-set);(V-set)	17	33	56	2897	5011	6	142	0	0	1
(C1-set);(V-set)	18	33	41	2897	5011	4	152	0	0	1
(C1-set);(V-set)	19	33	39	2897	5011	11	158	10	0	1
(C1-set);(V-set)	20	32	51	2897	5011	6	146	0	0	1
(C1-set);(V-set)	21	31	50	2897	5011	5	208	0	0	1
(C1-set);(V-set)	22	30	47	2897	5011	35	117	2	4	1
(C1-set);(V-set)	23	30	38	2897	5011	15	187	0	0	1
(C1-set);(V-set)	24	29	43	2897	5011	13	196	0	0	1
(C1-set);(V-set)	25	29	36	2897	5011	2	158	6	0	1
(C1-set);(V-set)	26	28	35	2897	5011	19	172	0	6	1
(C1-set);(V-set)	27	28	35	2897	5011	18	214	3	0	1
(C1-set);(V-set)	28	27	44	2897	5011	17	140	0	0	1
(C1-set);(V-set)	29	26	43	2897	5011	13	153	0	0	1
(C1-set);(V-set)	30	26	40	2897	5011	16	189	0	0	1
(C1-set);(V-set)	31	26	32	2897	5011	18	153	0	0	1
(C1-set);(V-set)	32	26	31	2897	5011	17	183	0	3	1
(C1-set);(V-set)	33	25	31	2897	5011	15	201	0	6	1
(C1-set);(V-set)	34	24	30	2897	5011	14	147	0	3	1
(C1-set);(V-set)	35	24	29	2897	5011	15	214	0	0	1
(C1-set);(V-set)	36	23	32	2897	5011	16	142	3	6	1
(C1-set);(V-set)	37	24	30	2897	5011	2	125	87	80	1
(C1-set);(V-set)	38	23	44	2897	5011	20	198	0	0	1
(C1-set);(V-set)	39	23	40	2897	5011	17	166	0	0	1
(C1-set);(V-set)	40	23	41	2897	5011	16	144	0	0	1
(C1-set);(V-set)	41	23	32	2897	5011	16	354	0	3	1
(C1-set);(V-set)	42	23	37	2897	5011	14	135	0	3	1
(C1-set);(V-set)	43	23	29	2897	5011	6	163	0	3	1
(C1-set);(V-set)	44	23	32	2897	5011	14	187	0	0	1
(C1-set);(V-set)	45	22	28	2897	5011	18	149	7	18	1
(C1-set);(V-set)	46	21	29	2897	5011	17	180	0	0	1
(C1-set);(V-set)	47	21	33	2897	5011	16	144	0	0	1
(C1-set);(V-set)	48	21	24	2897	5011	6	203	8	4	1
(C1-set);(V-set)	49	21	25	2897	5011	12	158	0	0	1
(C1-set);(V-set)	50	21	32	2897	5011	23	197	3	3	1
(C1-set);(V-set)	51	21	24	2897	5011	7	161	33	8	1
(C1-set);(V-set)	52	20	29	2897	5011	31	163	7	3	1
(C1-set);(V-set)	53	20	37	2897	5011	17	155	3	0	1
(C1-set);(V-set)	54	20	25	2897	5011	20	196	4	0	1
(C1-set);(V-set)	55	20	24	2897	5011	51	488	12	0	1
(C1-set);(V-set)	56	20	26	2897	5011	5	200	4	0	1
(C1-set);(V-set)	57	20	29	2897	5011	1	301	0	3	1
(C1-set);(V-set)	58	20	22	2897	5011	5	139	0	5	1
(C1-set);(V-set_2)	1	198	214	254	282	11	163	96	89	78
(C2-set);(ig)	1	34	47	35	49	76	547	98	77	97
(C2-set_2);(V-set)	1	36	41	54	62	9	238	98	80	67
(CAF1C_H4-bd);(WD40)	1	27	39	27	39	35	1148	92	85	100
(CBS);(IMPDH)	1	48	57	54	69	11	427	100	56	89
(CCP_MauG);(Cytochrom_C)	1	20	25	22	32	24	1136	100	100	91
(CDC45);(MCM_N)	1	22	22	22	22	21	387	100	41	100
(CDC45);(MCM_N)	2	21	21	22	22	21	555	100	43	95
(CDC45);(Sld5)	1	22	22	22	22	21	255	100	41	100
(CDC48_2);(CDC48_N)	1	91	99	94	103	2	575	99	39	97
(CHCH);(Ribosomal_S11)	1	39	39	44	44	60	174	87	0	89
(CHCH);(Ribosomal_S7)	1	52	52	52	52	21	661	96	4	100
(COX1);(COX2)	1	78	177	79	190	15	1268	98	63	99
(COX1);(COX2_TM)	1	65	132	66	146	10	2089	99	57	98
(COX1);(COX3)	1	65	122	65	135	22	1932	98	51	100
(COX1);(COX4)	1	32	86	32	99	15	963	100	56	100
(COX1);(COX5B)	1	34	88	35	102	30	356	100	50	97
(COX1);(COX6A)	1	26	80	29	96	35	364	99	51	90
(COX1);(COX6B)	1	24	78	29	96	35	140	99	51	83
(COX1);(COX7C)	1	34	88	34	101	4	986	92	50	100
(COX1);(COX7a)	1	30	84	33	100	20	205	100	56	91
(COX2);(COX4)	1	29	83	32	99	16	530	100	54	91
(COX2);(COX6B)	1	32	86	32	99	34	681	100	48	100
(COX2);(COX6C)	1	28	82	29	96	16	449	98	52	97
(COX2_TM);(COX4)	1	29	83	31	98	16	378	100	54	94
(COX2_TM);(COX5A)	1	32	86	32	99	28	286	99	50	100
(COX2_TM);(COX6C)	1	31	85	31	98	16	903	99	53	100
(COX3);(COX5B)	1	34	88	34	101	30	842	99	52	100
(COX3);(COX6A)	1	30	84	32	99	34	1577	99	51	94
(COX3);(COX6B)	1	31	85	32	99	34	248	100	48	97
(COX3);(COX7a)	1	34	88	34	101	20	1290	94	51	100
(COX4);(COX5A)	1	32	86	32	99	15	1170	92	51	100
(COX4);(COX6C)	1	26	80	30	97	15	377	100	55	87
(COX4);(COX7B)	1	21	75	21	88	79	1429	97	55	100
(COX5A);(COX5B)	1	29	83	29	96	35	189	99	51	100
(COX5A);(COX6C)	1	31	85	31	98	16	579	96	49	100
(COX5B);(COX7a)	1	29	83	31	98	20	169	99	52	94
(COX6A);(COX6B)	1	28	82	29	96	1	208	99	44	97
(COX7C);(COX8)	1	21	75	21	88	42	700	99	55	100
(CO_deh_flav_C);(FAD_binding_5)	1	22	73	23	74	10	959	99	97	96
(CPSF_A);(MMS1_N)	1	69	91	76	102	11	1174	100	66	91
(CPSF_A);(WD40)	1	33	35	34	37	12	194	100	57	97
(CR6_interact);(MRP-L51)	1	69	70	69	70	74	427	89	11	100
(CR6_interact);(Ribosomal_L33)	1	68	69	68	69	42	476	84	9	100
(CR6_interact);(Ribosomal_L4)	1	68	69	68	69	74	425	100	12	100
(CRAL_TRIO);(CRAL_TRIO_N)	1	22	40	22	40	7	433	90	82	100
(CRPV_capsid);(Rhv)	1	28	28	29	29	7	964	93	36	97
(CSN8_PSD8_EIF3K);(PCI)	1	90	91	90	91	13	975	100	20	100
(CTP_synth_N);(GATase)	1	43	52	43	52	42	944	100	42	100
(Cadherin);(Cadherin_2)	1	34	38	34	38	19	173	100	100	100
(Cadherin);(Cadherin_2)	2	21	25	34	38	20	179	88	80	62
(Calici_coat);(CRPV_capsid)	1	25	25	25	25	12	2445	92	40	100
(Calici_coat);(Calici_coat_C)	1	93	179	95	186	1	3597	98	86	98
(Calici_coat);(Calici_coat_C)	2	88	178	95	186	1	235	91	85	93
(Calici_coat);(Rhv)	1	20	20	42	58	4	1123	90	35	48
(Catalase);(Catalase-rel)	1	44	143	44	143	7	1333	99	97	100
(Cation_ATPase_C);(E1-E2_ATPase)	1	85	124	87	156	9	776	100	62	98
(Cation_ATPase_C);(Hydrolase)	1	51	87	61	123	13	218	100	72	84
(Cation_ATPase_C);(Na_K-ATPase)	1	41	86	42	88	28	1842	100	71	98
(Cation_ATPase_N);(E1-E2_ATPase)	1	105	144	109	200	10	1727	100	53	96
(Cbl_N);(Cbl_N2)	1	23	37	24	38	27	596	100	97	96
(Cbl_N);(Cbl_N3)	1	23	37	25	39	27	363	100	97	92
(Cbl_N2);(Cbl_N3)	1	23	37	25	40	42	664	100	97	92
(Cgr1);(GN3L_Grn1)	1	22	22	22	22	78	271	100	14	100
(Chal_sti_synt_C);(Chal_sti_synt_N)	1	66	116	66	116	2	1721	100	97	100
(Chal_sti_synt_C);(Chal_sti_synt_N)	2	37	70	66	116	19	815	96	94	56
(Chloroa_b-bind);(PSI_PSAK)	1	34	36	47	53	30	350	100	11	72
(Chloroa_b-bind);(PSI_PSAK)	2	20	20	47	53	21	214	100	5	43
(Chloroa_b-bind);(PSI_PsaF)	1	41	44	55	61	43	342	100	14	75
(Chloroa_b-bind);(PSI_PsaJ)	1	41	42	52	58	47	149	100	10	79
(Chloroa_b-bind);(PsaA_PsaB)	1	44	47	54	60	22	191	100	13	81
(Citrate_bind);(Ligase_CoA)	1	25	33	25	33	23	765	100	45	100
(Complex1_30kDa);(Complex1_49kDa)	1	201	210	202	210	12	1292	80	18	100
(Complex1_30kDa);(Oxidored_q6)	1	228	235	230	238	12	385	99	17	99
(Complex1_49kDa);(Fer4_7)	1	217	223	224	232	25	455	94	16	97
(Complex1_49kDa);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	211	220	212	220	40	803	100	18	100
(Complex1_49kDa);(NADHdh)	1	195	201	202	207	16	807	86	15	97
(Complex1_49kDa);(Oxidored_q6)	1	225	232	228	236	25	571	89	17	99
(Complex1_51K);(Fer2_4)	1	127	127	221	229	24	143	99	25	57
(Complex1_51K);(Molybdopterin)	1	27	27	33	41	47	284	100	15	82
(Creatinase_N);(Peptidase_M24)	1	21	33	24	38	7	490	100	100	88
(Creatinase_N);(Peptidase_M24)	2	20	30	24	38	5	536	100	100	83
(Cu-oxidase);(Cu-oxidase_2)	1	85	219	85	234	1	917	100	98	100
(Cu-oxidase);(Cu-oxidase_3)	1	116	387	116	432	1	1150	100	97	100
(Cu-oxidase_2);(Cu-oxidase_3)	1	113	269	114	304	8	994	100	95	99
(Cu_amine_oxid);(Cu_amine_oxidN2)	1	21	149	21	149	8	1123	98	98	100
(Cullin);(Skp1_POZ)	1	26	26	27	27	18	523	100	27	96
(Cwf_Cwc_15);(PROCN)	1	39	39	40	40	5	969	92	10	98
(Cwf_Cwc_15);(SKIP_SNW)	1	32	32	35	35	5	279	91	6	91
(Cwf_Cwc_15);(WD40)	1	38	38	40	40	5	289	92	8	95
(Cyclin_C);(Cyclin_N)	1	28	61	44	165	6	1333	100	97	64
(Cyclin_C);(Pkinase)	1	23	109	46	175	12	167	99	97	50
(Cyclin_N);(Pkinase)	1	76	214	80	243	7	1224	99	89	95
(Cytochrom_B559);(Photo_RC)	1	53	121	53	121	58	354	92	27	100
(Cytochrom_B559);(PsbJ)	1	38	104	39	107	25	343	95	16	97
(Cytochrom_B559);(PsbJ)	2	23	87	39	107	26	365	97	18	59
(Cytochrom_B559a);(Cytochrom_C550)	1	21	89	27	95	70	234	100	37	78
(Cytochrom_B559a);(Photo_RC)	1	52	119	52	120	44	1136	91	27	100
(Cytochrom_B559a);(Photo_RC)	2	52	119	52	120	44	250	97	26	100
(Cytochrom_B_C);(Cytochrome_B)	1	48	56	51	67	28	1794	100	38	94
(Cytochrom_B_C);(Rieske)	1	99	130	108	151	11	507	88	45	92
(Cytochrom_B_C);(UCR_14kD)	1	79	111	79	119	25	414	100	49	100
(Cytochrom_B_C);(UcrQ)	1	73	105	73	112	20	688	100	51	100
(Cytochrom_C1);(Cytochrome_B)	1	90	129	98	144	32	542	98	52	92
(Cytochrom_C1);(UCR_14kD)	1	33	70	75	114	37	146	100	81	44
(Cytochrom_C1);(UCR_Fe-S_N)	1	25	32	26	33	8	429	97	41	96
(Cytochrom_C1);(UCR_TM)	1	69	96	71	106	24	514	100	50	97
(Cytochrom_C1);(UCR_UQCRX_QCR9)	1	77	115	80	119	32	844	98	52	96
(Cytochrom_C1);(UCR_hinge)	1	83	116	84	123	25	747	99	47	99
(Cytochrom_C1);(UcrQ)	1	73	111	73	113	20	360	100	54	100
(Cytochrom_C550);(PSII)	1	30	97	30	98	50	934	100	35	100
(Cytochrom_C550);(Photo_RC)	1	30	97	30	98	58	472	100	35	100
(Cytochrom_C550);(PsbU)	1	28	95	28	96	32	615	98	21	100
(Cytochrome_B);(Rieske)	1	67	87	90	133	28	289	90	52	74
(Cytochrome_B);(UCR_14kD)	1	76	108	79	119	25	210	100	50	96
(Cytochrome_B);(UCR_Fe-S_N)	1	32	49	33	49	5	378	98	51	97
(Cytochrome_B);(UCR_Fe-S_N)	2	32	48	33	49	5	219	100	52	97
(Cytochrome_B);(UCR_TM)	1	68	88	71	111	24	214	84	42	96
(Cytochrome_B);(UCR_TM)	2	67	94	71	111	24	476	98	51	94
(Cytochrome_B);(UcrQ)	1	69	100	73	112	20	158	100	53	95
(DAP3);(Ribosomal_S7)	1	60	60	70	70	16	684	92	2	86
(DAP3);(Ribosomal_S9)	1	79	79	82	82	5	648	99	3	96
(DEAD);(Helicase_C)	1	132	186	195	268	5	479	100	81	68
(DNA_RNApol_7kD);(RNA_pol_A_bac)	1	120	164	234	363	27	343	100	57	51
(DNA_RNApol_7kD);(RNA_pol_Rpb2_1)	1	236	329	236	365	18	237	99	47	100
(DNA_RNApol_7kD);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	241	333	241	372	31	652	99	48	100
(DNA_gyraseB);(HATPase_c)	1	32	40	34	48	10	497	100	95	94
(DNA_gyraseB_C);(DNA_topoisoIV)	1	38	76	39	78	34	314	97	78	97
(DNA_gyraseB_C);(DNA_topoisoIV)	2	36	72	39	78	35	214	96	74	92
(DNA_gyraseB_C);(Toprim)	1	30	43	31	53	34	1300	100	88	97
(DNA_photolyase);(FAD_binding_7)	1	51	109	51	111	12	1312	100	88	100
(DNA_pol3_beta);(DNA_pol3_beta_2)	1	61	107	64	110	11	620	100	95	95
(DNA_pol3_beta);(DNA_pol3_beta_3)	1	67	113	68	114	11	602	93	85	99
(DNA_pol3_beta_2);(DNA_pol3_beta_3)	1	61	107	64	110	11	669	100	95	95
(DNA_pol_A);(DNA_pol_A_exo1)	1	24	158	24	162	4	639	100	97	100
(DNA_pol_B);(DNA_pol_B_exo1)	1	65	224	65	226	3	1096	100	95	100
(DNA_pol_B_palm);(DNA_pol_B_thumb)	1	47	652	47	694	2	515	97	96	100
(DNA_pol_B_palm);(DNA_pol_lambd_f)	1	39	635	39	679	2	400	97	96	100
(DNA_pol_B_thumb);(HHH_8)	1	23	395	33	648	12	215	97	96	70
(DNA_pol_lambd_f);(HHH_8)	1	29	574	33	651	20	197	96	96	88
(DNA_topoisoIV);(Toprim)	1	47	87	54	103	11	313	97	78	87
(DPPIV_N);(Peptidase_S9)	1	50	175	59	189	16	1347	100	94	85
(DPPIV_N);(Peptidase_S9)	2	41	146	59	189	16	333	88	93	69
(DSS1_SEM1);(PCI)	1	66	66	90	91	45	261	100	11	73
(DSS1_SEM1);(PCI)	2	49	49	90	91	77	718	100	31	54
(DSS1_SEM1);(PCI)	3	33	33	90	91	18	585	100	0	37
(DSS1_SEM1);(RPN7)	1	55	55	61	61	39	174	100	4	90
(DUF1968);(V-set)	1	86	146	256	472	13	149	97	95	34
(DUF3364);(Oxidored_nitro)	1	29	68	29	68	45	1572	94	75	100
(DUF3439);(LRR_8)	1	41	46	55	62	14	641	100	89	75
(DUF3591);(TAFII55_N)	1	21	21	21	21	28	2753	95	14	100
(DUF4976);(Sulfatase)	1	40	52	40	52	1	2025	100	79	100
(DUF4982);(Glyco_hydro_2_C)	1	22	31	24	34	11	469	100	97	92
(DUF5110);(Glyco_hydro_31)	1	32	116	33	117	1	1123	100	89	97
(DXP_redisom_C);(DXPR_C)	1	27	75	27	75	26	1569	100	100	100
(DXP_redisom_C);(DXPR_C)	2	23	57	27	75	26	166	100	100	85
(DXP_redisom_C);(DXP_reductoisom)	1	27	75	27	75	22	588	100	100	100
(DXP_reductoisom);(DXPR_C)	1	27	75	27	75	22	923	100	100	100
(Dala_Dala_lig_C);(Dala_Dala_lig_N)	1	32	58	32	60	10	941	98	98	100
(DapB_C);(DapB_N)	1	24	37	24	37	14	1211	97	97	100
(Dimerisation);(Methyltransf_2)	1	30	71	30	71	15	751	99	100	100
(Dimerisation2);(Methyltransf_2)	1	43	67	43	67	9	1006	87	96	100
(DnaB);(DnaB_C)	1	24	26	27	30	24	237	92	46	89
(Dynamin_M);(Dynamin_N)	1	34	41	34	42	1	1435	100	85	100
(Dynamin_M);(GED)	1	22	24	22	24	6	2977	100	79	100
(E1-E2_ATPase);(Hydrolase)	1	65	100	99	195	15	700	100	58	66
(E1_dh);(Transket_pyr)	1	25	76	25	76	13	818	99	97	100
(E1_dh);(Transket_pyr)	2	24	74	25	76	13	1245	99	97	96
(ECR1_N);(RNase_PH)	1	20	24	23	28	31	199	96	71	87
(EF-hand_1);(EF-hand_7)	1	25	29	69	87	9	404	86	69	36
(EF-hand_1);(S_100)	1	78	187	80	189	5	480	100	63	98
(EF-hand_1);(S_100)	2	26	38	80	189	14	173	16	18	32
(EF-hand_7);(IQ)	1	88	93	104	115	4	606	97	65	85
(EF-hand_7);(KCNQ_channel)	1	28	30	29	31	3	501	100	27	97
(EFG_C);(EFG_IV)	1	29	40	34	47	5	435	100	78	85
(EFG_C);(GTP_EFTU)	1	20	29	33	53	19	435	100	83	61
(EFG_C);(Ribosomal_L11_N)	1	61	62	71	75	14	220	100	8	86
(EFG_IV);(Ribosomal_S30)	1	21	21	28	28	51	229	100	5	75
(EFTUD2);(WD40)	1	40	40	40	40	13	270	92	12	100
(EFTUD2);(WD40)	2	32	32	40	40	20	437	91	9	80
(EGF);(Recep_L_domain)	1	21	25	21	25	24	366	100	48	100
(EIF_2_alpha);(GTP_EFTU_D2)	1	41	41	42	42	21	453	90	32	98
(ELFV_dehydrog);(ELFV_dehydrog_N)	1	58	88	58	88	2	532	98	73	100
(ERAP1_C);(Peptidase_M1)	1	33	71	35	74	11	1680	100	82	94
(ERCC3_RAD25_C);(Tfb5)	1	53	56	56	59	27	518	98	23	95
(Endonuclease_NS);(Phosphodiest)	1	29	69	29	74	11	766	91	83	100
(Enolase_C);(Enolase_N)	1	50	104	51	105	41	639	94	91	98
(Enolase_C);(Enolase_N)	2	49	103	51	105	41	1478	100	93	96
(Exonuc_V_gamma);(UvrD-helicase)	1	21	23	21	23	16	1587	100	74	100
(F-box-like);(Skp1)	1	40	51	40	52	13	932	94	65	100
(FAD_binding_1);(NAD_binding_1)	1	21	53	22	54	19	862	94	89	95
(FAD_binding_2);(Fer2_3)	1	20	73	21	85	30	892	100	89	95
(FAD_binding_2);(Succ_DH_flav_C)	1	24	62	26	96	12	2755	100	94	92
(FAD_binding_5);(Fer2)	1	23	65	23	74	16	904	98	97	100
(FAD_binding_5);(Fer2_2)	1	23	65	23	74	16	209	98	97	100
(FAD_binding_6);(NAD_binding_1)	1	70	100	73	112	3	720	100	79	96
(FAT);(PI3_PI4_kinase)	1	91	92	92	98	7	517	100	42	99
(FATC);(PI3_PI4_kinase)	1	95	96	97	103	15	1542	100	43	98
(FERM_C);(FERM_M)	1	38	95	41	99	8	444	100	97	93
(FERM_C);(FERM_N)	1	35	92	40	98	11	285	100	97	88
(FERM_M);(FERM_N)	1	38	95	43	102	9	484	100	97	88
(FG-GAP);(Integrin_alpha2)	1	48	91	48	92	8	228	100	58	100
(FG-GAP);(Integrin_alpha2)	2	23	28	48	92	16	167	100	82	48
(FG-GAP);(Integrin_beta)	1	56	104	58	111	29	268	99	61	97
(FGGY_C);(FGGY_N)	1	41	86	41	87	8	1883	99	98	100
(FKBP_C);(RYDR_ITPR)	1	90	90	90	90	75	326	100	0	100
(FKBP_C);(SPRY)	1	89	89	90	90	73	258	100	0	99
(FRB_dom);(PI3_PI4_kinase)	1	25	30	26	32	15	242	100	50	96
(FXa_inhibition);(Trypsin)	1	52	261	53	281	22	415	95	97	98
(F_actin_cap_B);(F-actin_cap_A)	1	28	30	30	34	36	3034	93	63	93
(Fapy_DNA_glyco);(H2TH)	1	23	110	24	119	11	545	98	97	96
(Fe_dep_repr_C);(Fe_dep_repress)	1	27	64	27	64	15	625	100	97	100
(Fe_hyd_lg_C);(Fe_hyd_SSU)	1	30	50	30	52	27	2050	94	74	100
(Fer2);(Fer2_2)	1	24	85	24	85	24	753	99	98	100
(Fer2_3);(Succ_DH_flav_C)	1	20	73	21	85	27	471	99	89	95
(Fer2_4);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	46	60	46	63	53	386	100	53	100
(Fer2_4);(NADH_4Fe-4S)	1	169	176	227	235	24	285	90	25	74
(Fer2_4);(NADH_4Fe-4S)	2	55	55	227	235	82	573	100	0	24
(Fer4_7);(Molybdop_Fe4S4)	1	27	27	126	134	36	114	100	15	21
(Fer4_7);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	206	214	216	224	42	167	80	19	95
(Fer4_7);(Oxidored_q6)	1	225	232	228	236	25	378	87	16	99
(Fer4_7);(PSI_PsaE)	1	55	60	56	61	52	506	100	17	98
(Fer4_7);(PsaA_PsaB)	1	54	59	58	63	44	246	100	25	93
(Fer4_7);(PsaD)	1	56	61	56	61	52	1048	98	25	100
(Fibrillarin);(Nop)	1	28	28	43	46	46	158	100	4	65
(Fibrillarin);(Nop)	2	24	24	43	46	45	124	96	4	56
(Fibrillarin);(Ribosomal_L7Ae)	1	33	33	39	42	41	334	100	3	85
(Filo_glycop);(TLV_coat)	1	36	56	36	56	29	435	88	64	100
(Filo_glycop);(TLV_coat)	2	36	56	36	56	29	1945	96	66	100
(Fimbrial);(FimH_man-bind)	1	37	80	42	88	20	1122	99	92	88
(Fimbrial);(PapD_C)	1	21	27	21	27	12	292	100	81	100
(Fimbrial);(PapD_N)	1	21	27	21	27	12	1344	100	81	100
(Flagellin_C);(Flagellin_N)	1	46	46	46	46	7	1889	83	39	100
(Flagellin_C);(Flagellin_N)	2	26	26	46	46	8	706	62	4	57
(Flagellin_C);(Flagellin_N)	3	24	24	46	46	40	1014	67	4	52
(Flagellin_C);(Flagellin_N)	4	22	22	46	46	45	266	68	5	48
(Flavi_DEAD);(Helicase_C)	1	23	59	27	74	14	728	100	93	85
(Flavi_NS2B);(Peptidase_S7)	1	28	88	29	91	23	1838	95	86	97
(Flavi_NS5);(FtsJ)	1	40	92	40	92	13	711	100	98	100
(Flavi_glycop_C);(Flavi_glycoprot)	1	96	109	143	161	9	703	100	40	67
(Flavi_glycop_C);(Flavi_glycoprot)	2	80	88	143	161	27	270	84	35	56
(Flavi_glycop_C);(Flavi_glycoprot)	3	43	44	143	161	29	503	89	2	30
(Flavi_glycop_C);(V-set)	1	20	21	76	82	17	383	100	38	26
(Flavi_glycoprot);(Flavi_M)	1	60	60	61	61	15	695	95	5	98
(Flavi_glycoprot);(Flavi_M)	2	36	36	61	61	15	387	97	0	59
(Flavi_glycoprot);(Flavi_propep)	1	24	25	24	25	32	435	100	16	100
(Flu_PA);(Flu_PB1)	1	78	91	78	91	24	7983	100	71	100
(Flu_PA);(Flu_PB2)	1	74	87	76	89	22	1502	100	72	97
(Flu_PB1);(Flu_PB2)	1	76	90	76	90	22	5646	98	70	100
(Fn3-like);(Glyco_hydro_3)	1	41	74	41	77	14	705	100	100	100
(Fn3-like);(Glyco_hydro_3_C)	1	41	69	41	77	14	561	100	100	100
(Formyl_trans_C);(Formyl_trans_N)	1	26	48	28	52	5	664	100	100	93
(FtsZ_C);(Tubulin)	1	33	89	34	93	7	495	100	99	97
(FtsZ_C);(Tubulin)	2	21	77	34	93	10	425	1	10	62
(FumaraseC_C);(Lyase_1)	1	26	52	26	56	22	253	98	98	100
(FumaraseC_C);(Lyase_1)	2	24	47	26	56	27	251	96	98	92
(FumaraseC_C);(Lyase_1)	3	24	45	26	56	22	297	96	98	92
(Furin-like);(Recep_L_domain)	1	103	108	120	127	15	1070	100	55	86
(Furin-like);(Recep_L_domain)	2	48	50	120	127	22	314	100	28	40
(G-alpha);(V-set)	1	224	224	416	416	39	238	79	1	54
(G-alpha);(V-set)	2	171	171	416	416	30	812	90	4	41
(G-alpha);(WD40)	1	505	506	525	526	11	326	82	4	96
(G-alpha);(WD40)	2	496	497	525	526	6	556	81	4	94
(G-alpha);(WD40)	3	423	423	525	526	6	147	81	4	81
(G-alpha);(WD40)	4	241	241	525	526	19	131	86	4	46
(G-alpha);(WD40)	5	148	149	525	526	6	194	93	7	28
(G-alpha);(WD40)	6	20	20	525	526	35	554	80	0	4
(G-gamma);(Myc-LZ)	1	40	42	66	76	4	611	100	38	61
(G-gamma);(Myc-LZ)	2	23	23	66	76	37	465	100	9	35
(G-gamma);(WD40)	1	579	599	583	604	12	347	81	10	99
(G-gamma);(WD40)	2	578	596	583	604	12	345	81	9	99
(G-gamma);(WD40)	3	555	573	583	604	12	301	80	9	95
(G10);(PRO8NT)	1	40	40	41	41	53	1120	92	8	98
(G10);(PROCN)	1	35	35	40	40	53	218	69	6	88
(G6PD_C);(G6PD_N)	1	28	49	28	49	27	2137	100	76	100
(G6PD_C);(G6PD_N)	2	24	40	28	49	30	204	92	75	86
(GAF);(PAS_2)	1	45	84	45	97	14	1877	99	93	100
(GAF);(PHY)	1	32	48	33	57	12	637	98	94	97
(GBP);(GBP_C)	1	23	29	23	29	9	1448	97	90	100
(GFO_IDH_MocA);(GFO_IDH_MocA_C)	1	75	99	75	121	1	1245	97	97	100
(GF_recep_IV);(Recep_L_domain)	1	51	59	55	64	29	538	100	83	93
(GHMP_kinases_C);(GHMP_kinases_N)	1	37	75	43	85	5	138	97	92	86
(GMC_oxred_C);(GMC_oxred_N)	1	51	132	51	147	1	4055	100	89	100
(GN3L_Grn1);(Ribosomal_L18A)	1	30	30	30	30	85	390	93	10	100
(GP120);(GP41)	1	150	169	150	169	52	1302	99	27	100
(GP120);(GP41)	2	25	29	150	169	67	166	97	28	17
(GP120);(V-set)	1	108	131	251	308	9	296	99	43	43
(GP120);(V-set)	2	53	65	251	308	2	885	97	45	21
(GP120);(V-set)	3	47	64	251	308	20	305	95	16	19
(GP120);(V-set)	4	32	44	251	308	17	527	98	45	13
(GP120);(ig)	1	34	42	36	46	26	1034	95	29	94
(GP41);(V-set)	1	29	40	116	147	8	382	92	75	25
(GST_C);(GST_N)	1	85	103	92	119	5	265	88	92	92
(GST_C);(GST_N)	2	85	106	92	119	6	537	99	97	92
(GST_C);(GST_N_3)	1	29	60	29	61	6	800	100	100	100
(GST_C);(GST_N_3)	2	26	56	29	61	6	378	95	93	90
(GST_C_2);(GST_N)	1	26	51	30	62	5	535	100	92	87
(GST_C_2);(GST_N)	2	22	48	30	62	11	349	92	94	73
(GST_C_2);(GST_N_3)	1	81	124	82	133	4	585	100	97	99
(GST_C_2);(GST_N_3)	2	38	54	82	133	5	300	91	87	46
(GST_C_3);(GST_N)	1	102	275	106	302	7	760	99	97	96
(GST_C_3);(GST_N)	2	99	273	106	302	7	244	96	94	93
(GTP_EFTU);(GTP_EFTU_D2)	1	111	163	154	248	2	591	100	85	72
(GTP_EFTU);(GTP_EFTU_D3)	1	33	56	64	107	18	578	98	96	52
(GTP_EFTU);(GTP_EFTU_D3)	2	26	38	64	107	2	623	100	87	41
(GTP_EFTU);(LSM)	1	39	39	49	49	14	204	92	13	80
(GTP_EFTU);(PROCN)	1	54	54	56	56	17	569	76	17	96
(GTP_EFTU);(Ribosomal_L6)	1	24	24	94	108	56	140	100	4	26
(GTP_EFTU_D2);(GTP_EFTU_D3)	1	61	96	65	106	2	449	99	92	94
(GTP_EFTU_D2);(Ribosom_S12_S23)	1	26	26	51	53	9	186	100	4	51
(Gag_p17);(Gag_p24)	1	20	33	21	34	10	1390	100	45	95
(GalKase_gal_bdg);(GHMP_kinases_C)	1	22	48	22	48	2	496	96	94	100
(GalKase_gal_bdg);(GHMP_kinases_N)	1	22	47	22	48	2	1170	96	94	100
(Gal_mutarotas_2);(Glyco_hydro_31)	1	44	134	45	136	9	2086	100	88	98
(Gln-synt_C);(Gln-synt_N)	1	39	65	39	65	4	1084	100	71	100
(Gln-synt_C);(Gln-synt_N)	2	27	40	39	65	21	1033	100	57	69
(Gly_radical);(PFL-like)	1	20	34	21	35	14	2785	94	94	95
(Glyco_hydro_2);(Glyco_hydro_2_C)	1	77	174	77	175	6	821	99	91	100
(Glyco_hydro_2);(Glyco_hydro_2_N)	1	83	179	85	198	6	223	98	91	98
(Glyco_hydro_20);(Glyco_hydro_20b)	1	27	54	27	55	11	748	100	96	100
(Glyco_hydro_2_C);(Glyco_hydro_2_N)	1	75	188	77	191	9	1610	99	92	97
(Glyco_hydro_2_C);(Glyco_hydro_2_N)	2	21	50	77	191	19	434	98	98	27
(Glyco_hydro_3);(Glyco_hydro_3_C)	1	54	135	54	145	4	1865	100	96	100
(Glyco_hydro_30);(Glyco_hydro_30C)	1	24	66	24	67	6	835	95	86	100
(Glyco_hydro_32C);(Glyco_hydro_32N)	1	26	68	28	75	8	1519	97	93	93
(Glyco_transf_4);(Glycos_transf_1)	1	33	55	33	55	6	745	96	93	100
(Glycos_trans_3N);(Glycos_transf_3)	1	32	92	32	92	6	1048	100	96	100
(Glycos_trans_3N);(Glycos_transf_3)	2	32	91	32	92	6	269	88	92	100
(Gp_dh_C);(Gp_dh_N)	1	110	208	111	209	6	458	91	94	99
(Gp_dh_C);(Gp_dh_N)	2	109	207	111	209	6	230	92	93	98
(Gp_dh_C);(Gp_dh_N)	3	107	203	111	209	6	150	100	98	96
(H2TH);(zf-FPG_IleRS)	1	20	89	20	93	16	602	98	98	100
(HA2);(Helicase_C)	1	21	38	36	60	18	286	100	97	58
(HA2);(OB_NTP_bind)	1	35	59	35	59	11	1086	100	97	100
(HABP4_PAI-RBP1);(KH_2)	1	24	27	32	43	64	120	96	22	75
(HABP4_PAI-RBP1);(Ribosomal_S3_C)	1	40	46	44	55	8	733	96	20	91
(HABP4_PAI-RBP1);(Ribosomal_S5)	1	41	48	43	54	8	241	98	21	95
(HABP4_PAI-RBP1);(S10_plectin)	1	27	33	34	45	7	188	97	24	79
(HATPase_c);(HSP90)	1	91	384	96	496	2	1113	100	91	95
(HATPase_c);(HisKA)	1	34	44	39	54	12	435	100	82	87
(HEAT_2);(MitMem_reg)	1	42	42	75	75	51	126	83	7	56
(HGTP_anticodon);(tRNA-synt_2b)	1	24	40	69	140	7	125	98	90	35
(HHH_5);(Rad51)	1	29	45	29	45	17	256	49	20	100
(HH_signal);(Hint)	1	27	31	27	31	20	289	97	68	100
(HMGL-like);(PYC_OADA)	1	28	41	28	47	18	2538	93	68	100
(HMGL-like);(PYC_OADA)	2	21	31	28	47	18	141	94	74	75
(HRM);(Parathyroid)	1	20	22	22	24	15	496	86	14	91
(HTH_9);(RNA_pol_3_Rpc31)	1	30	30	38	38	17	695	90	37	79
(HTH_9);(RNA_pol_Rpb1_1)	1	39	39	39	39	27	339	100	38	100
(Helicase_C);(OB_NTP_bind)	1	27	46	33	57	12	295	100	98	82
(Helicase_C);(RecQ_Zn_bind)	1	22	31	22	31	16	650	100	90	100
(Helicase_C);(ResIII)	1	49	58	57	67	10	444	100	71	86
(Helicase_C_2);(Ssl1)	1	53	56	53	56	41	508	98	23	100
(Hexokinase_1);(Hexokinase_2)	1	43	81	43	81	12	3508	98	93	100
(Histone);(Histone_H2A_C)	1	401	522	413	589	11	243	76	39	97
(Histone);(Histone_H2A_C)	2	372	491	413	589	10	607	88	37	90
(Histone);(Histone_H2A_C)	3	52	62	413	589	27	516	92	63	13
(Histone);(TAF)	1	389	518	390	567	7	1361	88	43	100
(Histone_H2A_C);(TAF)	1	343	455	357	526	7	229	86	38	96
(Hormone_2);(HRM)	1	41	46	42	47	5	310	93	22	98
(Hormone_recep);(SRC-1)	1	24	58	26	61	17	473	97	100	92
(Hydrolase_6);(Hydrolase_like)	1	28	41	28	43	12	1223	100	100	100
(IBN_N);(Ras)	1	35	95	36	96	5	400	99	66	97
(IF-2);(Ribosom_S12_S23)	1	22	22	22	22	19	416	100	14	100
(IMS);(IMS_C)	1	30	304	47	472	8	405	100	100	64
(IMS);(IMS_HHH)	1	39	199	39	208	9	303	100	100	100
(IN_DBD_C);(Integrase_Zn)	1	24	24	28	28	38	203	100	25	86
(IN_DBD_C);(rve)	1	29	29	42	45	19	190	100	21	69
(Ig_3);(I-set)	1	60	65	104	114	3	272	100	91	58
(Ig_3);(V-set)	1	21	26	66	73	20	487	85	77	32
(IlvC);(IlvN)	1	46	64	46	64	14	462	98	72	100
(IlvC);(IlvN)	2	36	52	46	64	19	608	100	65	78
(IlvC);(IlvN)	3	22	26	46	64	25	257	77	4	48
(Img2);(MRP-63)	1	69	70	69	70	63	510	89	10	100
(Img2);(Ribosomal_L27A)	1	71	72	85	86	21	113	83	11	84
(Img2);(Ribosomal_L4)	1	69	70	86	87	17	166	86	11	80
(Inhibitor_I29);(Peptidase_C1)	1	22	28	22	28	22	739	100	96	100
(Ins145_P3_rec);(MIR)	1	104	115	128	139	15	749	100	19	81
(Ins145_P3_rec);(MIR)	2	49	49	128	139	16	280	100	4	38
(Ins145_P3_rec);(RIH_assoc)	1	105	105	124	124	73	259	100	2	85
(Ins145_P3_rec);(RYDR_ITPR)	1	100	100	136	146	72	201	100	2	74
(Ins145_P3_rec);(RYDR_ITPR)	2	80	88	136	146	7	166	100	17	59
(Insulin);(Recep_L_domain)	1	23	23	52	55	30	259	96	13	44
(Integrase_Zn);(rve)	1	22	23	30	31	24	138	100	39	73
(Interfer-bind);(Tissue_fac)	1	29	52	35	71	11	462	94	92	83
(Internalin_N);(LRR_4)	1	24	24	43	46	15	474	96	79	56
(Ion_trans);(RR_TM4-6)	1	114	114	114	114	21	424	100	2	100
(Ion_trans);(RR_TM4-6)	2	82	82	114	114	33	1095	100	2	72
(Ion_trans);(V-set)	1	29	29	41	42	49	236	100	3	71
(Ion_trans);(V-set)	2	28	28	41	42	49	182	100	4	68
(Ion_trans);(V-set)	3	26	26	41	42	12	225	100	0	63
(JAB);(MitMem_reg)	1	104	107	113	116	13	244	98	26	92
(JAB);(PC_rep)	1	73	73	82	82	21	187	100	18	89
(JAB);(Prot_ATP_ID_OB)	1	28	28	80	80	67	299	57	11	35
(JAB);(Prot_ATP_ID_OB)	2	25	25	80	80	26	123	68	8	31
(JAB);(Sec63)	1	23	37	27	41	38	180	73	57	85
(JAB);(VWA_2)	1	83	83	83	83	48	596	96	18	100
(JmjC);(JmjN)	1	29	458	30	466	23	682	99	99	97
(KAsynt_C_assoc);(Ketoacyl-synt_C)	1	69	93	69	93	9	2409	100	71	100
(KAsynt_C_assoc);(ketoacyl-synt)	1	69	93	71	95	9	935	100	71	97
(KAsynt_C_assoc);(ketoacyl-synt)	2	57	80	71	95	9	166	95	69	80
(KH_1);(Ribosomal_S11)	1	33	33	40	40	62	288	100	15	82
(KH_2);(Ribosomal_S10)	1	362	383	848	1186	12	149	94	9	43
(KH_2);(Ribosomal_S14)	1	231	513	840	1176	12	117	98	14	28
(KH_2);(Ribosomal_S3_C)	1	29	36	30	37	18	239	97	8	97
(KH_2);(S10_plectin)	1	313	319	313	324	20	837	91	8	100
(KOW);(Ribosomal_L14e)	1	24	24	45	45	33	1342	100	17	53
(KOW);(Ribosomal_L18A)	1	293	299	297	308	18	243	89	14	99
(KOW);(Ribosomal_L34e)	1	353	359	356	367	23	324	89	10	99
(KOW);(Ribosomal_L6)	1	81	81	89	89	33	173	98	2	91
(KOW);(Ribosomal_L7Ae)	1	304	310	341	352	24	277	94	11	89
(KOW);(Ribosomal_S17_N)	1	27	27	343	354	24	171	63	19	8
(KOW);(Tim44)	1	26	26	65	66	65	109	69	12	40
(Kinesin);(Tubulin)	1	57	57	75	75	26	184	98	26	76
(Kinesin);(Tubulin_C)	1	58	58	76	76	25	123	98	22	76
(Ku);(Ku_C)	1	34	35	34	35	15	1654	100	37	100
(Kunitz_BPTI);(Trypsin)	1	37	95	40	102	30	548	100	99	92
(L51_S25_CI-B8);(MRP-63)	1	68	69	68	69	64	185	97	12	100
(L51_S25_CI-B8);(MRP-S26)	1	60	60	60	60	78	375	92	3	100
(L51_S25_CI-B8);(Ribonucleas_3_3)	1	72	73	73	74	15	125	89	10	99
(L51_S25_CI-B8);(Ribosomal_L50)	1	78	79	78	79	12	615	92	10	100
(L51_S25_CI-B8);(Ribosomal_S17)	1	60	60	60	60	56	480	73	2	100
(LHC);(PRCH)	1	31	33	31	34	37	232	97	18	100
(LHC);(PRCH)	2	29	31	31	34	38	178	100	23	94
(LHC);(PRCH)	3	26	28	31	34	37	162	100	21	84
(LHC);(Photo_RC)	1	31	32	32	35	24	346	100	16	97
(LRR_4);(LRR_8)	1	176	223	190	246	2	721	99	75	93
(LRR_8);(LRRCT)	1	45	62	61	96	8	178	97	92	74
(LRR_8);(LRRNT)	1	108	118	137	164	4	651	98	75	79
(LRR_8);(LRRNT_2)	1	22	29	42	52	14	790	100	90	52
(LRR_9);(RRM_1)	1	45	45	53	53	26	521	91	11	85
(Laminin_EGF);(Laminin_N)	1	21	21	21	21	23	719	100	76	100
(Ldh_1_C);(Ldh_1_N)	1	146	298	148	300	9	1654	100	97	99
(Ldh_1_C);(Ldh_1_N)	2	145	297	148	300	9	908	97	96	98
(Ldh_1_C);(Ldh_1_N)	3	84	191	148	300	16	228	95	91	57
(Lectin_C);(Ly49)	1	37	69	38	70	5	640	86	81	97
(Lig_chan);(Lig_chan-Glu_bd)	1	223	474	247	563	2	327	98	70	90
(Lig_chan);(PMP22_Claudin)	1	35	35	35	35	46	494	100	11	100
(Lig_chan);(PMP22_Claudin)	2	23	23	35	35	70	371	100	9	66
(Lig_chan);(SBP_bac_3)	1	29	48	29	53	5	828	100	67	100
(Lig_chan-Glu_bd);(SBP_bac_3)	1	30	54	30	59	14	2513	100	70	100
(Lig_chan-Glu_bd);(SBP_bac_3)	2	26	48	30	59	14	259	98	60	87
(Lipoprotein_18);(SmpA_OmlA)	1	49	50	57	58	57	138	100	58	86
(Lipoprotein_18);(YfiO)	1	54	55	58	59	89	1878	100	55	93
(M20_dimer);(Peptidase_M20)	1	48	66	51	69	6	1269	100	98	94
(M20_dimer);(Peptidase_M20)	2	35	48	51	69	6	429	98	98	69
(MA3);(U5_2-snRNA_bdg)	1	33	33	34	34	30	409	91	9	97
(MA3);(U6-snRNA_bdg)	1	28	28	32	32	30	145	89	7	88
(MCM);(MCM_OB)	1	52	52	55	55	26	398	98	29	95
(MCM);(MCM_OB)	2	48	48	55	55	23	312	100	29	87
(MCM_N);(MCM_OB)	1	64	65	65	66	11	475	100	40	98
(MCM_N);(MCM_OB)	2	41	41	65	66	15	178	100	29	63
(MCM_N);(Sld5)	1	23	23	23	23	11	446	100	39	100
(MCM_N);(Sld5)	2	22	22	23	23	20	277	100	41	96
(MHC_I);(V-set)	1	170	290	201	342	12	389	96	44	85
(MHC_I);(V-set)	2	38	50	201	342	17	373	100	36	19
(MHC_II_alpha);(MHC_II_beta)	1	183	241	184	245	12	917	99	94	99
(MHC_II_alpha);(V-set)	1	56	78	62	85	17	244	94	29	90
(MHC_II_beta);(V-set)	1	58	74	62	85	14	257	93	32	94
(MHC_I_3);(V-set)	1	24	81	28	87	14	374	94	72	86
(MIR);(RYDR_ITPR)	1	100	109	106	117	7	211	100	19	94
(MMS1_N);(WD40)	1	33	35	35	38	11	167	100	57	94
(MRP-63);(Ribosomal_L30)	1	68	69	68	69	63	669	84	10	100
(MRP-63);(Ribosomal_L4)	1	67	68	67	68	69	174	97	12	100
(MRP-63);(Ribosomal_L50)	1	29	29	68	69	69	111	100	10	43
(MRP-L27);(MRP-L47)	1	82	83	82	83	21	1039	81	10	100
(MRP-L27);(Ribosomal_L23)	1	82	83	82	83	14	634	90	8	100
(MRP-L27);(Ribosomal_L34)	1	79	80	80	81	21	436	92	11	99
(MRP-L28);(MRP-L46)	1	75	76	76	77	10	1212	84	11	99
(MRP-L28);(NUDIX)	1	20	20	21	21	79	1185	60	5	95
(MRP-L28);(Ribosomal_S10)	1	66	67	66	67	73	1305	81	10	100
(MRP-L47);(Ribosomal_L23)	1	93	94	93	94	14	703	84	9	100
(MRP-L51);(Ribosomal_L27A)	1	66	67	67	68	88	290	91	12	99
(MRP-L51);(Ribosomal_L4)	1	68	69	68	69	88	1676	81	12	100
(MRP-S22);(MRP-S34)	1	60	60	60	60	82	263	100	3	100
(MRP-S22);(Ribosomal_S16)	1	60	60	60	60	88	675	82	3	100
(MRP-S22);(Ribosomal_S18)	1	60	60	60	60	88	404	82	3	100
(MRP-S22);(Ribosomal_S5_C)	1	60	60	60	60	87	271	97	3	100
(MRP-S23);(MRP-S35)	1	60	60	60	60	86	909	72	3	100
(MRP-S23);(Ribosomal_S2)	1	58	58	58	58	13	1668	84	3	100
(MRP-S23);(Ribosomal_S5)	1	62	62	62	62	13	475	100	3	100
(MRP-S24);(MRP-S28)	1	60	60	60	60	76	372	83	3	100
(MRP-S24);(MRP-S31)	1	60	60	60	60	3	288	100	3	100
(MRP-S24);(MRP-S33)	1	57	57	60	60	79	524	81	4	95
(MRP-S24);(Ribosomal_S10)	1	60	60	60	60	88	585	97	3	100
(MRP-S24);(Ribosomal_S14)	1	60	60	60	60	84	972	80	3	100
(MRP-S26);(MRP-S34)	1	60	60	64	64	78	183	85	0	94
(MRP-S26);(Ribosomal_S16)	1	62	62	68	68	19	306	81	3	91
(MRP-S26);(Ribosomal_S18)	1	67	67	67	67	9	447	94	3	100
(MRP-S26);(Ribosomal_S6)	1	67	67	68	68	9	906	90	1	99
(MRP-S27);(MRP-S34)	1	58	58	58	58	78	1307	84	3	100
(MRP-S28);(MRP-S31)	1	53	53	60	60	3	1040	100	4	88
(MRP-S28);(MRP-S33)	1	74	74	74	74	9	664	96	3	100
(MRP-S28);(Ribosomal_S10)	1	70	70	73	73	15	450	80	3	96
(MRP-S31);(MRP-S33)	1	57	57	60	60	3	663	100	4	95
(MRP-S31);(Ribosomal_S10)	1	60	60	60	60	3	248	98	3	100
(MRP-S32);(Ribosomal_L13)	1	67	68	68	69	68	243	96	10	99
(MRP-S32);(Ribosomal_L20)	1	67	68	68	69	68	363	79	10	99
(MRP-S32);(Ribosomal_L21p)	1	67	68	67	68	68	468	85	12	100
(MRP-S33);(Ribosomal_S14)	1	70	70	70	70	15	379	86	3	100
(MRP-S34);(Ribosomal_S16)	1	22	22	58	58	85	105	95	9	38
(MRP-S35);(Ribosomal_S2)	1	56	56	56	56	37	1036	77	4	100
(MRP_L53);(Ribosomal_L10)	1	64	65	66	67	68	694	91	12	97
(MR_MLE_C);(MR_MLE_N)	1	166	287	166	288	1	1720	98	98	100
(MR_MLE_C);(MR_MLE_N)	2	91	163	166	288	3	319	80	89	55
(MR_MLE_C);(MR_MLE_N)	3	68	115	166	288	11	130	67	89	41
(MSP);(PSII)	1	43	110	43	111	41	1292	91	24	100
(MSP);(PSII)	2	40	107	43	111	41	636	100	22	93
(MSP);(PSII)	3	28	69	43	111	48	366	87	10	65
(MSP);(Photo_RC)	1	43	110	43	111	46	601	99	19	100
(MSP);(Photo_RC)	2	41	108	43	111	46	582	100	24	95
(MSP);(PsbU)	1	28	95	28	96	32	443	99	24	100
(MaoC_dehydrat_N);(MaoC_dehydratas)	1	31	34	34	39	2	1144	85	59	91
(Med11);(Med17)	1	28	28	28	28	11	1188	93	11	100
(Med11);(Med22)	1	29	29	29	29	11	1289	83	14	100
(Med17);(Med22)	1	28	28	28	28	4	1107	93	11	100
(Med17);(Med6)	1	26	26	27	27	12	583	96	8	96
(Med18);(Med20)	1	27	27	27	27	8	1382	85	19	100
(Med21);(Med7)	1	21	22	22	23	18	1610	95	14	95
(Med22);(Med6)	1	23	23	27	27	11	410	100	9	85
(Med22);(Med8)	1	24	24	27	27	11	705	88	8	89
(Med31);(Med7)	1	20	21	20	21	25	1033	100	14	100
(Med6);(Med8)	1	25	25	27	27	12	1125	76	8	93
(Metallophos);(STPPase_N)	1	58	81	65	90	14	1909	100	89	89
(MitMem_reg);(PCI)	1	90	91	102	103	12	235	99	16	88
(MitMem_reg);(Prot_ATP_ID_OB)	1	46	46	80	80	20	255	87	17	57
(MitMem_reg);(Prot_ATP_ID_OB)	2	24	24	80	80	51	136	100	12	30
(MitMem_reg);(Rpn3_C)	1	68	68	85	85	27	662	100	10	80
(Mitoc_L55);(MRP-L28)	1	64	65	64	65	67	808	88	12	100
(Mitoc_L55);(MRP-L46)	1	64	65	64	65	67	1123	86	12	100
(Mitoc_L55);(Ribosomal_S10)	1	64	65	64	65	66	881	82	9	100
(Molybdop_Fe4S4);(Molybdopterin)	1	45	66	47	71	13	1386	100	61	96
(Molybdop_Fe4S4);(Molydop_binding)	1	40	61	41	64	14	443	100	62	98
(Molybdopterin);(Molydop_binding)	1	37	73	63	103	11	1965	97	85	59
(Mt_ATP-synt_B);(Mt_ATP-synt_D)	1	85	85	85	85	18	1115	98	18	100
(Mt_ATP-synt_B);(OSCP)	1	53	53	70	70	20	335	100	9	76
(Mur_ligase_C);(Mur_ligase_M)	1	52	98	59	109	6	573	92	84	88
(MutS_I);(MutS_II)	1	23	39	24	40	12	487	100	90	96
(MutS_I);(MutS_III)	1	23	38	24	40	21	273	100	89	96
(MutS_II);(MutS_III)	1	23	39	27	43	12	665	100	90	85
(MutS_III);(MutS_IV)	1	30	47	30	47	6	552	100	85	100
(MutS_III);(MutS_V)	1	34	51	34	51	19	888	96	80	100
(Myb_DNA-binding);(RRM_4)	1	41	41	42	42	21	323	93	10	98
(Myb_DNA-binding);(SKIP_SNW)	1	36	36	42	42	21	309	92	6	86
(Myb_DNA-binding);(SKIP_SNW)	2	27	27	42	42	32	365	89	7	64
(Myosin_head);(Myosin_N)	1	99	164	100	167	15	302	99	81	99
(NADH5_C);(Oxidored_q2)	1	172	172	175	175	8	510	99	13	98
(NADH5_C);(Oxidored_q3)	1	34	34	76	76	8	310	97	18	45
(NADH5_C);(Proton_antipo_M)	1	192	192	197	197	9	597	71	14	97
(NADH5_C);(Proton_antipo_M)	2	173	173	197	197	8	1007	77	8	88
(NADH_4Fe-4S);(NADH-G_4Fe-4S_3)	1	224	231	230	238	25	430	100	22	97
(NADHdh);(Oxidored_q3)	1	221	226	223	228	12	955	82	14	99
(NADHdh);(Oxidored_q4)	1	226	232	227	232	25	2149	82	15	100
(NADHdh);(Oxidored_q6)	1	204	210	205	210	16	798	89	12	100
(NAD_binding_11);(NAD_binding_2)	1	55	78	55	78	5	517	95	90	100
(NGP1NT);(NOG1)	1	27	27	27	27	43	400	93	15	100
(NMT);(NMT_C)	1	25	143	26	144	33	1769	97	94	96
(NOG1);(Ribosomal_L11_N)	1	35	35	35	35	36	190	97	0	100
(NOGCT);(Ribosomal_L24e)	1	74	74	78	78	35	240	93	16	95
(NOGCT);(Ribosomal_L3)	1	80	80	80	80	35	534	100	19	100
(Neur_chan_LBD);(Neur_chan_memb)	1	165	275	174	305	1	356	100	59	95
(Neur_chan_LBD);(Neur_chan_memb)	2	93	96	174	305	3	147	99	24	53
(NiFeSe_Hases);(Oxidored_q6)	1	46	145	48	159	4	1737	98	92	96
(NiFe_hyd_SSU_C);(NiFeSe_Hases)	1	28	113	30	131	6	1228	87	86	93
(NiFe_hyd_SSU_C);(Oxidored_q6)	1	26	75	30	101	32	698	99	91	87
(Nop);(Ribosomal_L7Ae)	1	55	58	56	59	18	499	100	29	98
(ORC2);(ORC3_N)	1	30	30	30	30	9	882	87	7	100
(ORC2);(ORC5_C)	1	29	29	29	29	17	693	55	3	100
(ORC3_N);(ORC4_C)	1	28	28	29	29	9	341	25	4	97
(ORC3_N);(ORC5_C)	1	29	29	29	29	9	1065	62	3	100
(ORC4_C);(ORC5_C)	1	30	30	30	30	11	928	87	7	100
(OTCace);(OTCace_N)	1	73	184	74	188	8	2142	100	98	99
(OTCace);(OTCace_N)	2	73	185	74	188	8	470	98	98	99
(Oxidored_q2);(Oxidored_q3)	1	224	229	224	229	12	2634	70	13	100
(Oxidored_q2);(Oxidored_q4)	1	219	224	222	227	13	415	85	16	99
(Oxidored_q2);(Proton_antipo_M)	1	227	232	227	232	9	1662	71	13	100
(Oxidored_q3);(Oxidored_q4)	1	223	228	224	229	12	1656	85	15	100
(Oxidored_q3);(Proton_antipo_M)	1	219	224	222	227	12	598	92	16	99
(Oxidored_q4);(Oxidored_q6)	1	122	128	161	166	25	396	90	13	76
(PARP);(PARP_reg)	1	25	90	29	99	33	1191	100	93	86
(PAZ);(Ribonuclease_3)	1	27	27	27	27	54	353	100	7	100
(PBP);(RF-1)	1	56	57	67	68	63	601	96	12	84
(PBP);(Ribosomal_L18p)	1	67	68	69	70	4	492	81	10	97
(PBP_dimer);(Transpeptidase)	1	58	159	59	176	14	952	100	82	98
(PCI);(RPN7)	1	47	47	90	91	20	129	100	19	52
(PCNA_C);(PCNA_N)	1	116	166	122	172	9	863	99	78	95
(PCNA_C);(PCNA_N)	2	111	158	122	172	11	666	90	59	91
(PDCD9);(Ribosomal_L17)	1	68	69	68	69	75	360	96	12	100
(PDCD9);(Ribosomal_L2)	1	65	66	68	69	73	370	92	12	96
(PDCD9);(Ribosomal_L23)	1	68	69	68	69	75	518	97	12	100
(PDZ_2);(Trypsin_2)	1	34	62	45	88	16	263	100	66	76
(PGM_PMM_I);(PGM_PMM_II)	1	31	81	32	94	10	791	94	88	97
(PGM_PMM_I);(PGM_PMM_III)	1	29	78	31	93	9	469	94	87	94
(PGM_PMM_II);(PGM_PMM_III)	1	29	78	31	93	9	1228	94	87	94
(PGM_PMM_III);(PGM_PMM_IV)	1	29	81	29	85	3	689	94	90	100
(PI3K_C2);(PI3Ka)	1	43	179	46	271	28	813	100	89	93
(PI3K_P85_iSH2);(PI3K_p85B)	1	20	67	20	68	36	766	99	90	100
(PI3K_rbd);(PI3Ka)	1	25	80	45	259	25	130	100	86	56
(PI3_PI4_kinase);(PI3K_rbd)	1	37	120	47	272	24	250	100	85	79
(PI3_PI4_kinase);(PI3Ka)	1	54	240	58	299	2	883	85	75	93
(PI3_PI4_kinase);(WD40)	1	22	28	25	31	10	202	100	36	88
(PK);(PK_C)	1	73	187	73	187	12	1394	100	96	100
(POTRA);(SmpA_OmlA)	1	57	58	57	58	74	339	100	53	100
(POTRA);(YfiO)	1	58	59	58	59	25	749	100	54	100
(PQQ_2);(PQQ_3)	1	54	58	56	60	2	421	98	69	96
(PQQ_2);(PQQ_3)	2	49	50	56	60	77	1168	100	64	88
(PRO8NT);(SKIP_SNW)	1	40	40	42	42	32	268	92	10	95
(PROCN);(SKIP_SNW)	1	43	43	43	43	32	1419	93	9	100
(PROCN);(WD40)	1	37	37	43	43	7	239	92	11	86
(PROCN);(WD40)	2	32	32	43	43	7	180	91	9	74
(PROCN);(WD40)	3	20	20	43	43	65	185	85	5	47
(PROCT);(Sec63)	1	37	51	39	53	41	879	69	43	95
(PRY);(SPRY)	1	56	67	56	67	13	1189	96	64	100
(PSI);(Sema)	1	47	47	48	48	9	402	96	66	98
(PSII);(Ycf9)	1	47	113	47	115	25	433	100	17	100
(PSII_Ycf12);(Ycf9)	1	38	105	38	106	27	394	88	17	100
(PSI_8);(PSI_PsaH)	1	29	35	29	35	32	317	100	17	100
(PSI_PsaE);(PSI_PsaF)	1	36	41	80	86	36	244	100	20	45
(PSI_PsaF);(PSI_PsaJ)	1	83	94	83	94	28	634	97	23	100
(PapD_C);(PapD_N)	1	29	37	39	48	16	527	97	89	74
(Peptidase_M16);(Peptidase_M16_C)	1	133	208	139	224	7	878	99	62	96
(Peptidase_M16);(Peptidase_M16_M)	1	26	54	28	61	18	1272	100	80	93
(Peptidase_M16);(UCR_14kD)	1	71	91	74	100	25	355	86	40	96
(Peptidase_M16);(UCR_TM)	1	67	100	72	108	22	452	100	54	93
(Peptidase_M16);(Ubiq-Cytc-red_N)	1	32	64	32	65	23	741	100	70	100
(Peptidase_M16_C);(Peptidase_M16_M)	2	26	54	33	66	7	3988	100	80	79
(Peptidase_M16_C);(UCR_6-4kD)	1	20	32	20	33	63	189	100	56	100
(Peptidase_M16_C);(UCR_TM)	1	68	95	72	108	24	288	99	48	94
(Peptidase_M16_C);(UCR_TM)	2	40	49	72	108	24	147	98	29	56
(Peptidase_M16_C);(UCR_UQCRX_QCR9)	1	54	72	58	80	30	145	97	43	93
(Peptidase_M16_C);(Ubiq-Cytc-red_N)	1	32	62	32	66	19	646	100	69	100
(Peptidase_M16_C);(Ubiq-Cytc-red_N)	2	26	49	32	66	11	397	100	71	81
(Peptidase_M16_C);(UcrQ)	1	73	112	73	113	10	431	100	54	100
(Peptidase_M27);(Toxin_trans)	1	26	40	28	43	16	1095	98	88	93
(Peptidase_M28);(TFR_dimer)	1	20	104	20	104	21	785	99	93	100
(Peptidase_M4);(Peptidase_M4_C)	1	22	233	26	244	20	1280	99	98	85
(Peptidase_S9);(Peptidase_S9_N)	1	32	71	32	80	9	3327	97	86	100
(Phosphodiest);(Somatomedin_B)	1	25	59	26	62	28	532	90	80	96
(Photo_RC);(PRC)	1	45	186	45	189	31	210	100	80	100
(Photo_RC);(PRC)	2	44	185	45	189	31	165	96	82	98
(Photo_RC);(PRCH)	1	41	182	45	189	34	1592	100	85	91
(Photo_RC);(PRCH)	2	41	182	45	189	34	434	96	84	91
(Photo_RC);(PSII)	1	53	120	53	121	16	2205	100	36	100
(Photo_RC);(PSII)	2	49	116	53	121	17	771	100	38	92
(Photo_RC);(PsbH)	1	50	117	50	118	69	211	99	27	100
(Photo_RC);(PsbI)	1	51	118	51	119	63	726	99	20	100
(Photo_RC);(PsbJ)	1	38	105	39	107	56	146	100	20	97
(Photo_RC);(PsbL)	1	50	117	50	118	77	403	100	21	100
(Photo_RC);(PsbL)	2	50	117	50	118	77	251	99	21	100
(Photo_RC);(PsbM)	1	30	97	41	109	36	168	100	19	73
(Photo_RC);(PsbT)	1	50	117	50	118	44	215	100	22	100
(Photo_RC);(PsbT)	2	50	117	50	118	44	422	97	21	100
(Photo_RC);(PsbX)	1	49	116	49	117	34	213	88	21	100
(Pico_P1A);(Rhv)	1	178	269	184	278	16	400	97	35	97
(Pico_P1A);(Rhv)	2	159	240	184	278	35	529	98	30	86
(Pico_P1A);(Rhv)	3	77	121	184	278	43	394	100	33	42
(Pkinase);(Pkinase_C)	1	42	84	48	99	12	1285	99	94	88
(Plug);(TonB_dep_Rec)	1	67	121	67	123	8	3382	99	91	100
(Plug_translocon);(Sec61_beta)	1	49	51	49	51	5	349	94	24	100
(Plug_translocon);(SecE)	1	57	59	58	60	5	282	95	22	98
(Pr_beta_C);(Proteasome)	1	133	417	136	425	20	633	88	66	98
(Pr_beta_C);(Proteasome)	2	55	144	136	425	30	595	96	66	40
(Pr_beta_C);(Proteasome)	3	33	75	136	425	74	151	100	71	24
(Pre-SET);(SET)	1	26	54	29	59	15	1746	98	98	90
(ProRS-C_1);(tRNA-synt_2b)	1	35	75	35	81	11	970	100	96	100
(Proteasome);(Proteasome_A_N)	1	171	461	172	465	26	227	100	74	99
(Proteasome);(Proteasome_A_N)	2	101	224	172	465	22	473	100	69	59
(Proteasome);(Proteasome_A_N)	3	97	381	172	465	22	152	98	78	56
(Proteasome);(Proteasome_A_N)	4	26	27	172	465	28	157	100	33	15
(Proton_antipo_M);(Proton_antipo_N)	1	221	226	225	230	11	253	84	11	98
(PsaA_PsaB);(PSI_8)	1	82	93	82	93	29	518	96	22	100
(PsaA_PsaB);(PSI_PSAK)	1	79	90	80	91	12	591	98	17	99
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaE)	1	91	102	93	104	45	292	99	17	98
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaE)	2	74	75	93	104	50	347	99	13	80
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaF)	1	86	97	86	97	28	857	99	23	100
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaF)	2	84	95	86	97	28	913	100	24	98
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaH)	1	29	35	29	35	32	771	100	20	100
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaJ)	1	70	78	85	96	32	113	100	24	82
(PsaA_PsaB);(PSI_PsaJ)	2	66	70	85	96	30	118	97	17	78
(PsaA_PsaB);(PsaD)	1	93	104	93	104	52	792	100	22	100
(PsaA_PsaB);(PsaD)	2	93	104	93	104	52	712	98	23	100
(PsaA_PsaB);(PsaL)	1	85	96	85	96	34	531	100	22	100
(PsaA_PsaB);(PsaL)	2	82	93	85	96	34	296	98	22	96
(PsaA_PsaB);(PsaM)	1	56	61	56	61	34	900	95	21	100
(PsaD);(PSI_PsaE)	1	84	95	87	98	50	147	99	17	97
(PsaD);(PSI_PsaH)	1	23	26	23	26	35	562	100	15	100
(PsaD);(PsaL)	1	79	90	80	91	34	413	99	23	99
(PsaL);(PSI_8)	1	81	92	81	92	29	215	98	22	100
(PsaL);(PSI_PsaH)	1	29	35	29	35	32	1620	100	20	100
(PsaM);(PSI_8)	1	47	52	51	56	26	240	94	25	92
(PsbH);(PSII)	1	50	116	50	117	69	1469	98	27	100
(PsbH);(PsbX)	1	48	115	49	117	34	267	97	18	98
(PsbI);(PSII)	1	47	111	48	116	60	424	99	19	98
(PsbJ);(PSII_Ycf12)	1	32	98	32	100	28	155	98	15	100
(PsbJ);(PsbK)	1	39	105	39	107	17	137	100	18	100
(PsbK);(PSII)	1	51	116	51	119	50	737	99	27	100
(PsbK);(PSII_Ycf12)	1	38	104	38	106	31	503	91	18	100
(PsbK);(Ycf9)	1	47	112	47	115	25	260	95	16	100
(PsbL);(PSII)	1	50	117	50	118	72	607	96	22	100
(PsbL);(PsbM)	1	49	116	49	117	8	793	86	22	100
(PsbL);(PsbT)	1	50	117	50	118	31	590	92	20	100
(PsbM);(PsbT)	1	49	116	49	117	7	227	87	13	100
(PsbT);(PSII)	1	40	100	46	114	44	148	86	8	87
(PsbT);(PSII)	2	33	95	46	114	44	148	89	23	72
(PsbU);(PSII)	1	28	94	28	96	32	432	100	26	100
(PsbU);(PSII)	2	27	93	28	96	32	473	100	28	96
(Pyr_redox_2);(Pyr_redox_dim)	1	112	254	113	257	7	596	96	98	99
(Pyr_redox_2);(Pyr_redox_dim)	2	110	251	113	257	7	1156	100	98	97
(RF-1);(Ribosomal_L27A)	1	69	70	69	70	50	310	89	11	100
(RNA_POL_M_15KD);(RNA_pol_Rpb1_7)	1	140	247	141	266	40	317	100	53	99
(RNA_POL_M_15KD);(RNA_pol_Rpb2_2)	1	224	323	228	357	13	490	100	42	98
(RNA_POL_M_15KD);(TFIIF_alpha)	1	43	47	48	52	14	260	98	13	90
(RNA_pol);(RPOL_N)	1	21	29	21	29	11	1197	97	66	100
(RNA_pol_3_Rpc31);(RNA_pol_Rpc34)	1	22	22	38	38	86	559	100	32	58
(RNA_pol_3_Rpc31);(TFIIE_alpha)	1	23	23	25	25	72	184	87	35	92
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_L)	1	234	264	354	476	22	1307	99	28	66
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_L)	2	57	68	354	476	40	162	100	34	16
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_N)	1	240	334	241	372	27	886	98	51	100
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb1_3)	1	307	360	349	475	14	605	99	26	88
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb1_3)	2	36	91	349	475	81	303	100	88	10
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	348	457	590	846	34	1180	99	39	59
(RNA_pol_A_bac);(RNA_pol_Rpb2_6)	2	239	333	590	846	27	563	100	52	41
(RNA_pol_I_A49);(RNA_polI_A34)	1	38	42	38	42	42	1002	100	69	100
(RNA_pol_L);(RNA_pol_L_2)	1	47	48	47	48	20	858	90	44	100
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_2)	1	296	399	311	437	49	202	99	42	95
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_3)	1	282	335	348	474	28	187	99	27	81
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_3)	2	35	81	348	474	82	136	99	89	10
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb1_3)	3	21	31	348	474	84	112	100	45	6
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	387	496	396	524	10	421	99	39	98
(RNA_pol_L);(RNA_pol_Rpb2_6)	2	340	466	396	524	49	241	99	42	86
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb1_2)	1	238	330	240	369	26	223	100	41	99
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb1_3)	1	240	344	241	372	22	536	100	42	100
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	237	331	240	369	26	253	99	51	99
(RNA_pol_L_2);(RNA_pol_Rpb8)	1	152	240	216	344	26	160	99	37	70
(RNA_pol_N);(RNA_pol_Rpb2_1)	1	191	280	237	366	20	231	98	56	81
(RNA_pol_N);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	241	333	241	372	33	1345	98	51	100
(RNA_pol_Rbc25);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	37	37	38	38	36	173	89	35	97
(RNA_pol_Rbc25);(RNA_pol_Rpb4)	1	41	41	41	41	28	671	90	41	100
(RNA_pol_Rpa2_4);(RNA_polI_A34)	1	35	39	36	40	89	240	100	67	97
(RNA_pol_Rpa2_4);(RNA_pol_Rpb1_4)	1	41	45	42	46	55	171	100	71	98
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb1_2)	1	109	131	181	227	15	117	100	34	60
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb1_5)	1	129	154	203	305	10	186	100	35	64
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	558	737	587	836	8	387	91	39	95
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	592	772	598	859	8	1551	91	38	99
(RNA_pol_Rpb1_1);(RNA_pol_Rpb5_C)	1	33	34	68	77	20	197	100	44	49
(RNA_pol_Rpb1_1);(SHS2_Rpb7-N)	1	77	83	154	181	8	226	98	57	50
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r1_2)	1	142	213	142	254	10	319	99	44	100
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r2)	1	157	236	158	281	10	760	100	46	99
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r3)	1	134	205	137	250	10	604	100	45	98
(RNA_pol_Rpb1_1);(Sigma70_r4)	1	70	142	126	236	33	139	100	70	56
(RNA_pol_Rpb1_1);(Spt5-NGN)	1	29	29	29	29	25	286	100	14	100
(RNA_pol_Rpb1_1);(TFIIE_alpha)	1	50	50	63	64	14	974	88	32	79
(RNA_pol_Rpb1_1);(TF_Zn_Ribbon)	1	67	71	74	79	21	267	97	24	91
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb1_3)	1	189	214	193	239	8	661	100	29	98
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb1_5)	1	185	211	195	242	12	219	100	32	95
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	568	749	570	831	19	1271	92	40	100
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	560	746	562	822	19	1401	91	40	100
(RNA_pol_Rpb1_2);(RNA_pol_Rpb6)	1	539	731	542	799	11	740	100	46	99
(RNA_pol_Rpb1_2);(SHS2_Rpb7-N)	1	40	44	222	280	26	193	100	75	18
(RNA_pol_Rpb1_2);(Sigma70_r3)	1	74	115	125	236	25	131	99	37	59
(RNA_pol_Rpb1_2);(TF_Zn_Ribbon)	1	73	77	73	78	21	470	97	22	100
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb1_4)	1	191	218	199	247	8	749	100	30	96
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb1_5)	1	188	214	197	244	8	216	100	32	95
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	596	773	599	859	8	1033	91	38	99
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb6)	1	238	302	278	395	16	168	99	38	86
(RNA_pol_Rpb1_3);(RNA_pol_Rpb8)	1	227	320	228	358	28	1440	99	48	100
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb1_5)	1	193	220	201	251	9	547	100	30	96
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_2)	1	25	26	239	385	29	126	100	35	10
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_3)	1	284	405	589	844	9	250	99	49	48
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_4)	1	21	22	170	298	34	113	100	36	12
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_45)	1	132	158	320	427	17	183	84	37	41
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	189	281	190	320	5	402	100	41	99
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	595	776	599	858	8	486	91	38	99
(RNA_pol_Rpb1_4);(RNA_pol_Rpb8)	1	39	40	189	317	25	131	100	55	21
(RNA_pol_Rpb1_4);(TFIIS_C)	1	140	227	175	305	36	533	88	44	80
(RNA_pol_Rpb1_4);(TFIIS_C)	2	37	41	175	305	24	273	80	37	21
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_3)	1	588	767	591	849	7	623	91	38	99
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_45)	1	336	416	344	468	16	180	84	33	98
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	91	179	186	314	13	208	100	44	49
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	244	344	594	852	19	386	100	44	41
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_6)	2	101	127	594	852	18	123	72	23	17
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	580	762	586	844	7	318	91	38	99
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb5_C)	1	238	351	238	369	26	1390	100	52	100
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb5_N)	1	95	139	224	352	31	124	100	56	42
(RNA_pol_Rpb1_5);(RNA_pol_Rpb6)	1	526	741	559	809	11	204	99	46	94
(RNA_pol_Rpb1_5);(TFIIS_C)	1	40	44	54	60	30	458	82	43	74
(RNA_pol_Rpb1_6);(RNA_pol_Rpb5_C)	1	141	249	142	268	35	579	100	52	99
(RNA_pol_Rpb1_6);(RNA_pol_Rpb6)	1	119	222	142	266	35	161	100	55	84
(RNA_pol_Rpb1_6);(RNA_pol_Rpb8)	1	61	65	132	246	33	358	97	25	46
(RNA_pol_Rpb1_7);(RNA_pol_Rpb2_2)	1	85	149	137	261	40	165	100	46	62
(RNA_pol_Rpb2_1);(RNA_pol_Rpb2_2)	1	185	203	210	258	14	485	99	14	88
(RNA_pol_Rpb2_1);(RNA_pol_Rpb2_3)	1	199	219	203	233	9	850	99	16	98
(RNA_pol_Rpb2_1);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	195	213	207	238	9	381	99	15	94
(RNA_pol_Rpb2_1);(Sigma70_r3)	1	98	169	121	218	14	322	100	52	81
(RNA_pol_Rpb2_1);(TFIIB)	1	69	73	69	74	12	365	97	21	100
(RNA_pol_Rpb2_2);(RNA_pol_Rpb2_3)	1	207	230	212	255	9	381	99	17	98
(RNA_pol_Rpb2_2);(RNA_pol_Rpb2_45)	1	127	143	158	190	25	138	99	17	80
(RNA_pol_Rpb2_2);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	42	49	44	56	78	133	100	18	95
(RNA_pol_Rpb2_2);(Sigma70_r1_2)	1	47	51	105	196	21	146	98	24	45
(RNA_pol_Rpb2_2);(TFIIF_alpha)	1	50	54	52	56	14	761	100	13	96
(RNA_pol_Rpb2_2);(TFIIS_C)	1	126	214	141	267	36	165	87	35	89
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_4)	1	55	64	57	71	61	359	100	27	96
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	48	57	50	64	34	264	100	26	96
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_6)	1	151	165	218	263	56	382	98	14	69
(RNA_pol_Rpb2_3);(RNA_pol_Rpb2_6)	2	61	70	218	263	22	892	100	29	28
(RNA_pol_Rpb2_4);(RNA_pol_Rpb2_5)	1	48	57	50	64	33	1098	100	26	96
(RNA_pol_Rpb2_4);(RNA_pol_Rpc4)	1	38	38	38	38	21	277	97	39	100
(RNA_pol_Rpb2_6);(RNA_polI_A34)	1	36	40	36	40	89	621	100	68	100
(RNA_pol_Rpb2_6);(RNA_pol_Rpb2_7)	1	212	235	219	264	19	425	99	18	97
(RNA_pol_Rpb2_6);(Sigma70_r3)	1	136	215	137	250	14	557	100	48	99
(RNA_pol_Rpb2_6);(Sigma70_r4)	1	135	215	138	250	24	340	100	50	98
(RNA_pol_Rpb2_6);(TFIIB)	1	68	72	69	74	20	312	97	21	99
(RNA_pol_Rpb2_6);(TFIIS_C)	1	27	31	33	38	30	262	81	42	82
(RNA_pol_Rpb2_6);(TF_Zn_Ribbon)	1	73	77	73	78	21	648	97	19	100
(RNA_pol_Rpb2_7);(RNA_pol_Rpb6)	1	337	421	565	820	11	210	100	36	60
(RNA_pol_Rpb2_7);(S1)	1	48	50	99	113	72	183	100	24	48
(RNA_pol_Rpb2_7);(SHS2_Rpb7-N)	1	129	138	217	275	7	163	97	44	59
(RNA_pol_Rpb2_7);(Sigma70_r3)	1	125	204	131	243	20	226	100	50	95
(RNA_pol_Rpb4);(S1)	1	152	173	153	208	8	599	96	29	99
(RNA_pol_Rpb4);(SHS2_Rpb7-N)	1	194	211	194	248	8	758	95	31	100
(RNA_pol_Rpb5_C);(RNA_pol_Rpb5_N)	1	63	65	65	68	29	340	100	20	97
(RNA_pol_Rpb6);(SHS2_Rpb7-N)	1	229	252	230	289	7	367	98	38	100
(RNA_pol_Rpc34);(RNA_pol_Rpc82)	1	29	29	39	39	11	500	100	48	74
(RNase_H);(RVT_connect)	1	54	361	54	393	32	425	100	94	100
(RNase_H);(RVT_thumb)	1	54	360	55	386	32	611	91	86	98
(RNase_PH);(RNase_PH_C)	1	52	69	52	70	3	492	100	87	100
(RRM_4);(SKIP_SNW)	1	36	36	37	37	32	250	92	8	97
(RVT_1);(RVT_connect)	1	55	362	55	394	38	875	100	94	100
(RVT_1);(RVT_connect)	2	54	360	55	394	37	343	100	94	98
(RVT_1);(RVT_connect)	3	51	357	55	394	37	121	100	95	93
(RVT_1);(RVT_thumb)	1	55	360	56	395	35	243	100	94	98
(RVT_connect);(RVT_thumb)	1	54	368	54	393	35	385	100	94	100
(Ras);(RhoGEF)	1	24	93	25	94	17	1225	99	98	96
(RbpA);(Sigma70_r1_2)	1	23	27	23	28	41	486	100	33	100
(RbpA);(Sigma70_r2)	1	23	27	23	28	77	318	100	33	100
(Rep_fac_C);(RFC1)	1	26	26	26	26	79	1087	100	4	100
(Rhv);(VP4_2)	1	33	41	36	46	8	339	98	46	92
(Ribonuc_red_lgC);(Ribonuc_red_lgN)	1	25	80	28	88	6	1365	99	94	89
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L18)	1	381	390	386	397	15	959	80	12	99
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L28e)	1	157	157	211	211	14	165	73	6	74
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L30_N)	1	366	372	381	392	18	389	73	12	96
(Ribos_L4_asso_C);(Ribosomal_L6e_N)	1	148	148	152	152	50	316	99	4	97
(Ribosom_S12_S23);(Ribosomal_S17)	1	36	111	84	187	27	217	100	37	43
(Ribosom_S12_S23);(Ribosomal_S30)	1	320	326	328	339	40	410	95	8	98
(Ribosomal_L1);(Ribosomal_L36e)	1	20	20	35	35	24	234	100	5	57
(Ribosomal_L1);(Ribosomal_L7Ae)	1	54	54	61	61	38	131	100	13	89
(Ribosomal_L10);(Ribosomal_L11)	1	240	247	418	430	6	177	98	13	57
(Ribosomal_L10);(Ribosomal_L11)	2	102	102	418	430	39	157	100	12	24
(Ribosomal_L11);(Ribosomal_L11_N)	1	29	37	35	44	14	306	86	24	83
(Ribosomal_L11);(Ribosomal_L37)	1	24	24	24	24	10	950	71	8	100
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L20)	1	675	894	684	915	14	316	98	13	99
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L3)	1	668	887	1074	1375	1	146	99	13	62
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L3)	2	348	385	1074	1375	4	225	96	10	32
(Ribosomal_L13);(Ribosomal_L35Ae)	1	379	389	387	398	4	216	99	13	98
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L18)	1	292	301	308	319	30	219	97	11	95
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L27A)	1	338	344	340	351	31	1407	87	10	99
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L36e)	1	360	366	365	376	24	535	94	10	99
(Ribosomal_L13e);(Ribosomal_L4)	1	373	374	374	385	30	198	98	12	100
(Ribosomal_L14);(Ribosomal_L19)	1	677	905	683	914	15	787	98	13	99
(Ribosomal_L14);(Ribosomal_L24e)	1	399	466	401	473	20	527	94	11	100
(Ribosomal_L14);(Ribosomal_L3)	1	794	1069	965	1261	1	221	99	11	82
(Ribosomal_L14e);(Ribosomal_L18A)	1	328	334	381	392	8	121	84	13	86
(Ribosomal_L14e);(Ribosomal_L6e)	1	363	369	370	381	9	481	97	13	98
(Ribosomal_L15e);(Ribosomal_L36e)	1	376	387	384	395	24	527	90	12	98
(Ribosomal_L15e);(Ribosomal_L44)	1	309	347	326	397	25	159	97	18	95
(Ribosomal_L15e);(Ribosomal_L7Ae)	1	349	386	356	427	25	550	89	12	98
(Ribosomal_L16);(Ribosomal_L25p)	1	504	730	510	739	15	450	98	12	99
(Ribosomal_L16);(Ribosomal_L27)	1	145	237	432	632	24	248	98	7	34
(Ribosomal_L16);(Ribosomal_TL5_C)	1	113	218	115	306	15	396	99	10	98
(Ribosomal_L17);(Ribosomal_L22)	1	134	310	678	903	15	127	99	6	20
(Ribosomal_L17);(Ribosomal_L32p)	1	668	895	682	913	11	337	99	13	98
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L27A)	1	350	386	367	438	18	790	97	10	95
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L28e)	1	208	208	209	209	14	217	96	7	100
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L30)	1	326	335	328	339	38	250	99	11	99
(Ribosomal_L18);(Ribosomal_L4)	1	391	452	398	467	18	179	98	11	98
(Ribosomal_L18A);(Ribosomal_L30_N)	1	375	381	384	395	13	169	97	12	98
(Ribosomal_L18p);(Ribosomal_L27)	1	56	57	464	677	69	674	91	11	12
(Ribosomal_L18p);(Ribosomal_L27)	2	44	148	464	677	4	116	99	5	9
(Ribosomal_L19);(Ribosomal_L3)	1	496	532	674	902	1	599	96	17	74
(Ribosomal_L19);(Ribosomal_L3)	2	127	303	674	902	20	720	100	8	19
(Ribosomal_L2);(Ribosomal_L2_C)	1	100	100	104	108	18	1176	100	14	96
(Ribosomal_L2);(Ribosomal_L37ae)	1	349	387	350	421	20	477	97	10	100
(Ribosomal_L2);(Ribosomal_L9_C)	1	20	20	36	36	79	166	100	10	56
(Ribosomal_L20);(Ribosomal_L21p)	1	654	873	682	914	12	960	93	12	96
(Ribosomal_L20);(Ribosomal_L21p)	2	25	34	682	914	44	895	97	6	4
(Ribosomal_L20);(Ribosomal_L32p)	1	225	238	650	875	18	114	100	11	35
(Ribosomal_L21e);(Ribosomal_L29e)	1	301	307	301	312	27	487	94	10	100
(Ribosomal_L21e);(Ribosomal_L5e)	1	327	358	328	399	21	833	95	9	100
(Ribosomal_L22);(Ribosomal_L32p)	1	695	923	699	927	6	465	98	13	99
(Ribosomal_L22);(TGS)	1	69	70	69	70	1	349	96	11	100
(Ribosomal_L22);(Tim44)	1	68	69	69	70	86	186	94	12	99
(Ribosomal_L23);(Ribosomal_L29)	1	966	1252	981	1280	21	419	96	12	98
(Ribosomal_L23);(Ribosomal_L39)	1	352	416	357	42